CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = noncoding : Mut = G29778T

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
noncoding29778G29778TnoncodingGT19651965129778-29778

Details of the mutation G29778T within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
noncoding29778G29778TGT19651965All0.000376
noncoding29778G29778TGT529529B.1.1600.016498
noncoding29778G29778TGT408408B.1.617.20.001536
noncoding29778G29778TGT297297AY.40.000462
noncoding29778G29778TGT156156P.1.150.036245
noncoding29778G29778TGT108108B.1.1.70.000097
noncoding29778G29778TGT4949AY.1180.00307
noncoding29778G29778TGT3838AY.5.40.010515
noncoding29778G29778TGT2424AY.340.002327
noncoding29778G29778TGT1818AY.1030.000112
noncoding29778G29778TGT1818B.10.000165
noncoding29778G29778TGT1717B.1.617.10.002192
noncoding29778G29778TGT1616AY.430.000071
noncoding29778G29778TGT1515AY.660.016043
noncoding29778G29778TGT1414AY.480.006512
noncoding29778G29778TGT1212AY.390.000297
noncoding29778G29778TGT1111AY.1020.000292
noncoding29778G29778TGT1010AY.260.000283
noncoding29778G29778TGT1010AY.50.000206
noncoding29778G29778TGT99AY.440.000055
noncoding29778G29778TGT88AY.200.000311
noncoding29778G29778TGT88AY.470.000249
noncoding29778G29778TGT77AY.1060.002344
noncoding29778G29778TGT77AY.330.000467
noncoding29778G29778TGT77B.1.10.000127
noncoding29778G29778TGT77P.10.00011
noncoding29778G29778TGT66AY.250.000036
noncoding29778G29778TGT66AY.290.000095
noncoding29778G29778TGT66B.1.1.5190.000238
noncoding29778G29778TGT55AY.30.00005
noncoding29778G29778TGT55AY.450.000608
noncoding29778G29778TGT55AY.610.000524
noncoding29778G29778TGT55AY.910.003652
noncoding29778G29778TGT55B.1.1.2140.000277
noncoding29778G29778TGT55B.1.1.3060.002192
noncoding29778G29778TGT44AY.46.60.000289
noncoding29778G29778TGT44AY.690.000747
noncoding29778G29778TGT44B.1.1770.000053
noncoding29778G29778TGT44B.1.177.600.000874
noncoding29778G29778TGT44B.1.3510.000119
noncoding29778G29778TGT44B.1.5260.000094
noncoding29778G29778TGT33AY.750.000168
noncoding29778G29778TGT33B.1.1.2840.000322
noncoding29778G29778TGT33B.1.2430.000209
noncoding29778G29778TGT33R.10.00027
noncoding29778G29778TGT22AY.1000.000092
noncoding29778G29778TGT22AY.1200.000074
noncoding29778G29778TGT22AY.230.000139
noncoding29778G29778TGT22AY.460.000208
noncoding29778G29778TGT22AY.710.00095
noncoding29778G29778TGT22B.1.1.2190.01
noncoding29778G29778TGT22B.1.1.3010.002358
noncoding29778G29778TGT22B.1.20.000018
noncoding29778G29778TGT22B.1.2210.000142
noncoding29778G29778TGT22B.1.2580.000133
noncoding29778G29778TGT22B.1.3110.000549
noncoding29778G29778TGT22B.1.6210.000177
noncoding29778G29778TGT22C.370.000232
noncoding29778G29778TGT22N.90.011905
noncoding29778G29778TGT22P.1.100.000539
noncoding29778G29778TGT11AY.1050.000643
noncoding29778G29778TGT11AY.1090.00074
noncoding29778G29778TGT11AY.1100.000113
noncoding29778G29778TGT11AY.1130.000142
noncoding29778G29778TGT11AY.1140.000231
noncoding29778G29778TGT11AY.1190.000035
noncoding29778G29778TGT11AY.160.00038
noncoding29778G29778TGT11AY.34.10.00051
noncoding29778G29778TGT11AY.4.20.000022
noncoding29778G29778TGT11AY.4.2.10.000149
noncoding29778G29778TGT11AY.420.00004
noncoding29778G29778TGT11AY.46.10.001027
noncoding29778G29778TGT11AY.46.50.000198
noncoding29778G29778TGT11AY.820.001357
noncoding29778G29778TGT11AY.90.000068
noncoding29778G29778TGT11AY.930.000273
noncoding29778G29778TGT11AY.950.000761
noncoding29778G29778TGT11AY.960.002075
noncoding29778G29778TGT11AY.980.000079
noncoding29778G29778TGT11AY.99.20.000092
noncoding29778G29778TGT11B0.000128
noncoding29778G29778TGT11B.1.1.280.000311
noncoding29778G29778TGT11B.1.1.3260.001761
noncoding29778G29778TGT11B.1.1.4050.083333
noncoding29778G29778TGT11B.1.1570.002985
noncoding29778G29778TGT11B.1.177.80.000752
noncoding29778G29778TGT11B.1.351.20.000303
noncoding29778G29778TGT11B.1.36.180.00042
noncoding29778G29778TGT11B.1.4090.000781
noncoding29778G29778TGT11B.1.4160.001269
noncoding29778G29778TGT11B.1.4260.001009
noncoding29778G29778TGT11B.1.4270.00005
noncoding29778G29778TGT11B.1.4480.002625
noncoding29778G29778TGT11B.1.4700.001404
noncoding29778G29778TGT11B.1.4710.002732
noncoding29778G29778TGT11B.1.5250.000113
noncoding29778G29778TGT11B.1.5610.000397
noncoding29778G29778TGT11B.1.5670.003333
noncoding29778G29778TGT11B.1.5770.000687
noncoding29778G29778TGT11C.160.00106
noncoding29778G29778TGT11C.20.016129
noncoding29778G29778TGT11C.350.000774
noncoding29778G29778TGT11C.360.000911
noncoding29778G29778TGT11P.1.10.000318
noncoding29778G29778TGT11P.1.140.000048
noncoding29778G29778TGT11P.1.20.001156
noncoding29778G29778TGT11P.20.000187
noncoding29778G29778TGT11Q.10.000126