CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = noncoding : Mut = C29835-

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
noncoding29835C29835-noncodingC-10291029129835-29835

Details of the mutation C29835- within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
noncoding29835C29835-C-10291029All0.000197
noncoding29835C29835-C-405405B.1.1.70.000363
noncoding29835C29835-C-4040B.1.617.20.000151
noncoding29835C29835-C-3838AY.250.000229
noncoding29835C29835-C-3838AY.470.001182
noncoding29835C29835-C-3838B.1.1.3170.015644
noncoding29835C29835-C-3434C.370.003946
noncoding29835C29835-C-3131AY.430.000137
noncoding29835C29835-C-2323B.1.10.000417
noncoding29835C29835-C-1818AY.1030.000112
noncoding29835C29835-C-1818AY.260.00051
noncoding29835C29835-C-1818AY.440.00011
noncoding29835C29835-C-1515B.1.20.000132
noncoding29835C29835-C-1515B.1.3690.004278
noncoding29835C29835-C-1313AY.50.000268
noncoding29835C29835-C-1313B.10.000119
noncoding29835C29835-C-1212AY.390.000297
noncoding29835C29835-C-1212AY.40.000019
noncoding29835C29835-C-1212B.1.1.5190.000477
noncoding29835C29835-C-1111AY.1020.000292
noncoding29835C29835-C-99P.10.000142
noncoding29835C29835-C-88B.1.1770.000105
noncoding29835C29835-C-77P.20.001306
noncoding29835C29835-C-66AY.30.00006
noncoding29835C29835-C-66AY.98.10.000291
noncoding29835C29835-C-66AY.99.20.000553
noncoding29835C29835-C-66B.1.2210.000426
noncoding29835C29835-C-55B.1.1600.000156
noncoding29835C29835-C-55B.1.5260.000118
noncoding29835C29835-C-55B.1.6370.000365
noncoding29835C29835-C-55C.10.011962
noncoding29835C29835-C-44AY.360.000593
noncoding29835C29835-C-44AY.840.00175
noncoding29835C29835-C-44AZ.20.003284
noncoding29835C29835-C-44B.1.2580.000266
noncoding29835C29835-C-33AY.200.000117
noncoding29835C29835-C-33AY.90.000203
noncoding29835C29835-C-33B.1.1.2180.023077
noncoding29835C29835-C-33B.1.1.3060.001315
noncoding29835C29835-C-33B.1.1.4480.006098
noncoding29835C29835-C-33B.1.3510.000089
noncoding29835C29835-C-33B.1.4290.000071
noncoding29835C29835-C-33B.6.60.002667
noncoding29835C29835-C-33C.36.30.001702
noncoding29835C29835-C-220.111111
noncoding29835C29835-C-22A0.000774
noncoding29835C29835-C-22AY.1000.000092
noncoding29835C29835-C-22AY.1070.000932
noncoding29835C29835-C-22AY.1170.000169
noncoding29835C29835-C-22AY.4.20.000043
noncoding29835C29835-C-22AY.4.40.000818
noncoding29835C29835-C-22AY.540.000191
noncoding29835C29835-C-22AY.610.00021
noncoding29835C29835-C-22AY.750.000112
noncoding29835C29835-C-22AY.75.10.000361
noncoding29835C29835-C-22AY.9.20.000073
noncoding29835C29835-C-22B0.000256
noncoding29835C29835-C-22B.1.1.1660.066667
noncoding29835C29835-C-22B.1.1.2220.000408
noncoding29835C29835-C-22B.1.1.280.000622
noncoding29835C29835-C-22B.1.1.3480.001592
noncoding29835C29835-C-22B.1.1.4130.013793
noncoding29835C29835-C-22B.1.1.460.008734
noncoding29835C29835-C-22B.1.177.860.000367
noncoding29835C29835-C-22B.1.2100.004264
noncoding29835C29835-C-22B.1.2430.000139
noncoding29835C29835-C-22B.1.36.290.001035
noncoding29835C29835-C-22B.1.4270.000101
noncoding29835C29835-C-22B.1.4970.00063
noncoding29835C29835-C-22B.1.5960.000174
noncoding29835C29835-C-22B.1.6210.000177
noncoding29835C29835-C-22C.360.001821
noncoding29835C29835-C-22P.1.10.000635
noncoding29835C29835-C-22P.1.140.000096
noncoding29835C29835-C-22P.1.150.000465
noncoding29835C29835-C-11A.20.000662
noncoding29835C29835-C-11AD.20.000219
noncoding29835C29835-C-11AY.10.000396
noncoding29835C29835-C-11AY.1060.000335
noncoding29835C29835-C-11AY.1190.000035
noncoding29835C29835-C-11AY.1210.000135
noncoding29835C29835-C-11AY.160.00038
noncoding29835C29835-C-11AY.3.10.000085
noncoding29835C29835-C-11AY.300.000396
noncoding29835C29835-C-11AY.330.000067
noncoding29835C29835-C-11AY.420.00004
noncoding29835C29835-C-11AY.46.60.000072
noncoding29835C29835-C-11AY.5.40.000277
noncoding29835C29835-C-11AY.60.000041
noncoding29835C29835-C-11AY.620.000436
noncoding29835C29835-C-11AY.7.20.000559
noncoding29835C29835-C-11AY.9.10.000084
noncoding29835C29835-C-11AY.940.000443
noncoding29835C29835-C-11AY.950.000761
noncoding29835C29835-C-11B.1.1.1350.004695
noncoding29835C29835-C-11B.1.1.1390.022727
noncoding29835C29835-C-11B.1.1.1970.037037
noncoding29835C29835-C-11B.1.1.1980.001468
noncoding29835C29835-C-11B.1.1.2360.006897
noncoding29835C29835-C-11B.1.1.2770.000759
noncoding29835C29835-C-11B.1.1.3180.000302
noncoding29835C29835-C-11B.1.1.330.000421
noncoding29835C29835-C-11B.1.1.3720.000689
noncoding29835C29835-C-11B.1.1.5150.02
noncoding29835C29835-C-11B.1.1.5170.006803
noncoding29835C29835-C-11B.1.1.540.003021
noncoding29835C29835-C-11B.1.1.990.02381
noncoding29835C29835-C-11B.1.177.180.00116
noncoding29835C29835-C-11B.1.177.330.001645
noncoding29835C29835-C-11B.1.177.70.000165
noncoding29835C29835-C-11B.1.177.750.001041
noncoding29835C29835-C-11B.1.1800.05
noncoding29835C29835-C-11B.1.2340.000132
noncoding29835C29835-C-11B.1.3490.000715
noncoding29835C29835-C-11B.1.351.20.000303
noncoding29835C29835-C-11B.1.4260.001009
noncoding29835C29835-C-11B.1.5250.000113
noncoding29835C29835-C-11B.1.6090.000479
noncoding29835C29835-C-11B.1.617.10.000129
noncoding29835C29835-C-11B.1.617.30.002985
noncoding29835C29835-C-11B.1.6270.00202
noncoding29835C29835-C-11B.1.6300.005236
noncoding29835C29835-C-11C.260.007353
noncoding29835C29835-C-11P.1.120.000484
noncoding29835C29835-C-11P.1.170.000162
noncoding29835C29835-C-11P.1.70.000319
noncoding29835C29835-C-11Q.30.000145