CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = noncoding : Mut = A29694-

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
noncoding29694A29694-noncodingA-400400129694-29694

Details of the mutation A29694- within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
noncoding29694A29694-A-400400All0.000077
noncoding29694A29694-A-4444B.1.1.70.000039
noncoding29694A29694-A-4141AY.1030.000255
noncoding29694A29694-A-4040AY.250.000241
noncoding29694A29694-A-2020AY.440.000122
noncoding29694A29694-A-1515AY.40.000023
noncoding29694A29694-A-1313AY.30.000129
noncoding29694A29694-A-1313AY.470.000404
noncoding29694A29694-A-1010AY.750.00056
noncoding29694A29694-A-1010B.1.617.20.000038
noncoding29694A29694-A-99AY.430.00004
noncoding29694A29694-A-99B.1.1770.000119
noncoding29694A29694-A-88B.1.6210.000708
noncoding29694A29694-A-77B.10.000064
noncoding29694A29694-A-77B.1.1.460.030568
noncoding29694A29694-A-77B.1.2100.014925
noncoding29694A29694-A-66B.1.20.000053
noncoding29694A29694-A-66B.1.621.10.003035
noncoding29694A29694-A-66P.10.000095
noncoding29694A29694-A-55AY.390.000124
noncoding29694A29694-A-44AY.1190.000141
noncoding29694A29694-A-44AY.200.000155
noncoding29694A29694-A-44AY.480.00186
noncoding29694A29694-A-44B.1.10.000073
noncoding29694A29694-A-44B.1.1.1940.019802
noncoding29694A29694-A-44B.1.2580.000266
noncoding29694A29694-A-33AY.1090.002219
noncoding29694A29694-A-33AY.1100.000338
noncoding29694A29694-A-33AY.1180.000188
noncoding29694A29694-A-33AY.130.000483
noncoding29694A29694-A-33AY.260.000085
noncoding29694A29694-A-33AY.290.000047
noncoding29694A29694-A-33AY.3.10.000256
noncoding29694A29694-A-33AY.370.000948
noncoding29694A29694-A-33AY.50.000062
noncoding29694A29694-A-33B.1.1.3060.001315
noncoding29694A29694-A-33B.1.160.330.013274
noncoding29694A29694-A-33B.1.2210.000213
noncoding29694A29694-A-33B.1.3510.000089
noncoding29694A29694-A-33C.370.000348
noncoding29694A29694-A-22AY.1020.000053
noncoding29694A29694-A-22AY.140.000176
noncoding29694A29694-A-22AY.450.000243
noncoding29694A29694-A-22AY.46.60.000144
noncoding29694A29694-A-22AY.770.002255
noncoding29694A29694-A-22B.1.36.80.002
noncoding29694A29694-A-22B.1.617.30.00597
noncoding29694A29694-A-11A.10.000282
noncoding29694A29694-A-11AD.20.000219
noncoding29694A29694-A-11AY.1110.000183
noncoding29694A29694-A-11AY.1170.000085
noncoding29694A29694-A-11AY.340.000097
noncoding29694A29694-A-11AY.350.000233
noncoding29694A29694-A-11AY.400.000964
noncoding29694A29694-A-11AY.5.30.000337
noncoding29694A29694-A-11AY.540.000095
noncoding29694A29694-A-11AY.610.000105
noncoding29694A29694-A-11AY.620.000436
noncoding29694A29694-A-11AY.730.000665
noncoding29694A29694-A-11AY.75.10.00018
noncoding29694A29694-A-11AY.910.00073
noncoding29694A29694-A-11AZ.20.000821
noncoding29694A29694-A-11B.1.1.1970.037037
noncoding29694A29694-A-11B.1.1.2180.007692
noncoding29694A29694-A-11B.1.1.2220.000204
noncoding29694A29694-A-11B.1.1.2690.001353
noncoding29694A29694-A-11B.1.1.2770.000759
noncoding29694A29694-A-11B.1.1.3050.003861
noncoding29694A29694-A-11B.1.1.330.000421
noncoding29694A29694-A-11B.1.1.3480.000796
noncoding29694A29694-A-11B.1.1.4090.002833
noncoding29694A29694-A-11B.1.1600.000031
noncoding29694A29694-A-11B.1.177.230.003236
noncoding29694A29694-A-11B.1.2400.000216
noncoding29694A29694-A-11B.1.258.160.001637
noncoding29694A29694-A-11B.1.2980.002114
noncoding29694A29694-A-11B.1.4290.000024
noncoding29694A29694-A-11B.1.438.10.000107
noncoding29694A29694-A-11B.1.4430.004673
noncoding29694A29694-A-11B.1.5170.000427
noncoding29694A29694-A-11B.1.5260.000024
noncoding29694A29694-A-11B.1.5750.000303
noncoding29694A29694-A-11B.1.5820.000491
noncoding29694A29694-A-11B.1.6300.005236
noncoding29694A29694-A-11B.1.6370.000073
noncoding29694A29694-A-11B.580.010204
noncoding29694A29694-A-11B.60.00091
noncoding29694A29694-A-11D.20.000075
noncoding29694A29694-A-11P.1.100.000269
noncoding29694A29694-A-11P.1.150.000232
noncoding29694A29694-A-11P.1.170.000162