CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = noncoding : CodonNum = 29835 & Codon = T

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
noncoding29835C29835TnoncodingCT63546354129835-29835

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
noncoding29835C29835TCT63546354All0.001215
noncoding29835C29835TCT27622762AY.40.004299
noncoding29835C29835TCT642642B.1.1.70.000575
noncoding29835C29835TCT463463B.1.1.2220.094451
noncoding29835C29835TCT200200AY.430.000886
noncoding29835C29835TCT197197B.10.001804
noncoding29835C29835TCT190190B.1.617.20.000715
noncoding29835C29835TCT175175B.1.177.210.013382
noncoding29835C29835TCT132132AY.4.10.097345
noncoding29835C29835TCT9292AY.1030.000571
noncoding29835C29835TCT8484B.1.1.470.449198
noncoding29835C29835TCT8383B.1.1770.001093
noncoding29835C29835TCT7777Q.20.047239
noncoding29835C29835TCT6464AY.390.001582
noncoding29835C29835TCT5050B.1.20.00044
noncoding29835C29835TCT5050B.1.4290.001176
noncoding29835C29835TCT4848AY.200.001866
noncoding29835C29835TCT4545AY.250.000271
noncoding29835C29835TCT4141AY.230.00286
noncoding29835C29835TCT4141B.1.10.000744
noncoding29835C29835TCT3838AY.30.000378
noncoding29835C29835TCT3838AY.440.000231
noncoding29835C29835TCT3232R.10.00288
noncoding29835C29835TCT3131AY.1020.000822
noncoding29835C29835TCT3131B.1.2580.002063
noncoding29835C29835TCT2828AY.1200.001041
noncoding29835C29835TCT2828B.1.1.5190.001112
noncoding29835C29835TCT2323B.1.1600.000717
noncoding29835C29835TCT2323B.1.2430.0016
noncoding29835C29835TCT2323P.10.000362
noncoding29835C29835TCT2020AY.290.000315
noncoding29835C29835TCT1919B.1.1.3960.863636
noncoding29835C29835TCT1717AY.1190.0006
noncoding29835C29835TCT1717AY.260.000481
noncoding29835C29835TCT1717B.1.3500.049853
noncoding29835C29835TCT1616C.36.30.009075
noncoding29835C29835TCT1515B.1.1.3300.9375
noncoding29835C29835TCT1313AY.10.005144
noncoding29835C29835TCT1313P.20.002426
noncoding29835C29835TCT1111AY.330.000735
noncoding29835C29835TCT1111B.1.1.3480.008758
noncoding29835C29835TCT1111B.1.3510.000327
noncoding29835C29835TCT1010AY.50.000206
noncoding29835C29835TCT1010B.1.360.001459
noncoding29835C29835TCT1010B.1.6370.000731
noncoding29835C29835TCT99AY.5.40.00249
noncoding29835C29835TCT99AY.9.10.000754
noncoding29835C29835TCT99B.1.5950.002349
noncoding29835C29835TCT88AY.1110.001465
noncoding29835C29835TCT88AY.420.000322
noncoding29835C29835TCT88AY.60.000329
noncoding29835C29835TCT88B.1.177.860.001468
noncoding29835C29835TCT88B.1.3690.002282
noncoding29835C29835TCT88B.1.595.20.32
noncoding29835C29835TCT88D.20.0006
noncoding29835C29835TCT77AY.690.001307
noncoding29835C29835TCT77AY.920.002011
noncoding29835C29835TCT77B.1.177.170.005747
noncoding29835C29835TCT77B.1.4270.000353
noncoding29835C29835TCT66AY.1000.000276
noncoding29835C29835TCT66AY.530.001725
noncoding29835C29835TCT66AY.610.000629
noncoding29835C29835TCT66AY.90.000406
noncoding29835C29835TCT66B.1.1.2910.004454
noncoding29835C29835TCT66B.1.1.3180.001811
noncoding29835C29835TCT55B.1.1.4090.014164
noncoding29835C29835TCT55B.1.177.40.001055
noncoding29835C29835TCT55B.1.177.810.000947
noncoding29835C29835TCT55B.1.5650.004052
noncoding29835C29835TCT55B.1.5860.054945
noncoding29835C29835TCT55B.1.6060.03012
noncoding29835C29835TCT55C.370.00058
noncoding29835C29835TCT55P.1.70.001596
noncoding29835C29835TCT44AY.980.000316
noncoding29835C29835TCT44B.1.1.700.001364
noncoding29835C29835TCT44B.1.36.290.002069
noncoding29835C29835TCT44B.1.5450.057971
noncoding29835C29835TCT33AY.1180.000188
noncoding29835C29835TCT33AY.120.10.000963
noncoding29835C29835TCT33AY.470.000093
noncoding29835C29835TCT33AY.5.30.001012
noncoding29835C29835TCT33AY.540.000286
noncoding29835C29835TCT33AY.750.000168
noncoding29835C29835TCT33AY.98.10.000145
noncoding29835C29835TCT33AZ.30.004559
noncoding29835C29835TCT33B.1.1.5260.010638
noncoding29835C29835TCT33B.1.1.630.001157
noncoding29835C29835TCT33B.1.177.440.001557
noncoding29835C29835TCT33B.1.2180.015464
noncoding29835C29835TCT33B.1.221.30.0025
noncoding29835C29835TCT33B.1.2400.000647
noncoding29835C29835TCT33B.1.5960.000261
noncoding29835C29835TCT33Q.10.000379
noncoding29835C29835TCT22AD.20.000438
noncoding29835C29835TCT22AY.1080.002205
noncoding29835C29835TCT22AY.1130.000285
noncoding29835C29835TCT22AY.1170.000169
noncoding29835C29835TCT22AY.130.000322
noncoding29835C29835TCT22AY.160.000759
noncoding29835C29835TCT22AY.190.002281
noncoding29835C29835TCT22AY.46.60.000144
noncoding29835C29835TCT22AY.480.00093
noncoding29835C29835TCT22AY.520.001629
noncoding29835C29835TCT22AY.680.000547
noncoding29835C29835TCT22AY.7.10.000225
noncoding29835C29835TCT22AY.700.000417
noncoding29835C29835TCT22AY.740.000231
noncoding29835C29835TCT22AY.840.000875
noncoding29835C29835TCT22AY.9.20.000073
noncoding29835C29835TCT22B.1.1.2140.000111
noncoding29835C29835TCT22B.1.1.3540.008772
noncoding29835C29835TCT22B.1.1.500.001358
noncoding29835C29835TCT22B.1.1110.00235
noncoding29835C29835TCT22B.1.2100.004264
noncoding29835C29835TCT22B.1.2210.000142
noncoding29835C29835TCT22B.1.2370.00995
noncoding29835C29835TCT22B.1.258.170.000208
noncoding29835C29835TCT22B.1.3290.001215
noncoding29835C29835TCT22B.1.4000.000858
noncoding29835C29835TCT22B.1.4970.00063
noncoding29835C29835TCT22B.1.5170.000854
noncoding29835C29835TCT22B.1.5250.000226
noncoding29835C29835TCT22B.1.5260.000047
noncoding29835C29835TCT22B.1.5580.009132
noncoding29835C29835TCT22B.1.6090.000959
noncoding29835C29835TCT22B.1.6210.000177
noncoding29835C29835TCT22P.1.40.001953
noncoding29835C29835TCT22P.40.007605
noncoding29835C29835TCT22P.70.008734
noncoding29835C29835TCT110.055556
noncoding29835C29835TCT11A.10.000282
noncoding29835C29835TCT11A.20.000662
noncoding29835C29835TCT11A.2.5.20.001572
noncoding29835C29835TCT11A.23.10.000704
noncoding29835C29835TCT11AY.1050.000643
noncoding29835C29835TCT11AY.1070.000466
noncoding29835C29835TCT11AY.110.001339
noncoding29835C29835TCT11AY.116.10.000311
noncoding29835C29835TCT11AY.1210.000135
noncoding29835C29835TCT11AY.20.000356
noncoding29835C29835TCT11AY.240.000431
noncoding29835C29835TCT11AY.280.00189
noncoding29835C29835TCT11AY.3.10.000085
noncoding29835C29835TCT11AY.34.10.00051
noncoding29835C29835TCT11AY.360.000148
noncoding29835C29835TCT11AY.380.000499
noncoding29835C29835TCT11AY.4.30.000842
noncoding29835C29835TCT11AY.4.50.000107
noncoding29835C29835TCT11AY.410.000294
noncoding29835C29835TCT11AY.570.000656
noncoding29835C29835TCT11AY.670.000464
noncoding29835C29835TCT11AY.70.000196
noncoding29835C29835TCT11AY.900.000684
noncoding29835C29835TCT11AY.950.000761
noncoding29835C29835TCT11AY.990.001049
noncoding29835C29835TCT11AY.99.20.000092
noncoding29835C29835TCT11B0.000128
noncoding29835C29835TCT11B.1.1.100.001115
noncoding29835C29835TCT11B.1.1.1840.058824
noncoding29835C29835TCT11B.1.1.1920.002309
noncoding29835C29835TCT11B.1.1.2070.001182
noncoding29835C29835TCT11B.1.1.2160.00089
noncoding29835C29835TCT11B.1.1.2200.001859
noncoding29835C29835TCT11B.1.1.2300.009174
noncoding29835C29835TCT11B.1.1.2360.006897
noncoding29835C29835TCT11B.1.1.2680.014925
noncoding29835C29835TCT11B.1.1.2770.000759
noncoding29835C29835TCT11B.1.1.3110.000358
noncoding29835C29835TCT11B.1.1.330.000421
noncoding29835C29835TCT11B.1.1.3690.000446
noncoding29835C29835TCT11B.1.1.370.000193
noncoding29835C29835TCT11B.1.1.3720.000689
noncoding29835C29835TCT11B.1.1.390.00051
noncoding29835C29835TCT11B.1.1.3970.002252
noncoding29835C29835TCT11B.1.1.4870.005587
noncoding29835C29835TCT11B.1.1.510.001718
noncoding29835C29835TCT11B.1.1.5180.006329
noncoding29835C29835TCT11B.1.110.30.000718
noncoding29835C29835TCT11B.1.160.300.002976
noncoding29835C29835TCT11B.1.177.280.007407
noncoding29835C29835TCT11B.1.177.330.001645
noncoding29835C29835TCT11B.1.177.460.000918
noncoding29835C29835TCT11B.1.177.500.004695
noncoding29835C29835TCT11B.1.214.20.0006
noncoding29835C29835TCT11B.1.2420.018868
noncoding29835C29835TCT11B.1.2650.001271
noncoding29835C29835TCT11B.1.36.10.00114
noncoding29835C29835TCT11B.1.36.100.004785
noncoding29835C29835TCT11B.1.36.170.000494
noncoding29835C29835TCT11B.1.36.380.001642
noncoding29835C29835TCT11B.1.36.80.001
noncoding29835C29835TCT11B.1.3810.007812
noncoding29835C29835TCT11B.1.3910.001127
noncoding29835C29835TCT11B.1.3960.000706
noncoding29835C29835TCT11B.1.4410.009615
noncoding29835C29835TCT11B.1.4480.002625
noncoding29835C29835TCT11B.1.466.20.000391
noncoding29835C29835TCT11B.1.5460.003704
noncoding29835C29835TCT11B.1.5610.000397
noncoding29835C29835TCT11B.1.5740.002151
noncoding29835C29835TCT11B.1.5750.000303
noncoding29835C29835TCT11B.1.575.10.002439
noncoding29835C29835TCT11B.1.5770.000687
noncoding29835C29835TCT11B.1.6030.010638
noncoding29835C29835TCT11B.1.6190.000871
noncoding29835C29835TCT11B.1.6280.000352
noncoding29835C29835TCT11B.1.760.011364
noncoding29835C29835TCT11B.1.80.001972
noncoding29835C29835TCT11B.1.88.10.004808
noncoding29835C29835TCT11B.1.90.006173
noncoding29835C29835TCT11B.400.000364
noncoding29835C29835TCT11C.110.010638
noncoding29835C29835TCT11C.360.000911
noncoding29835C29835TCT11N.50.001767
noncoding29835C29835TCT11P.1.150.000232
noncoding29835C29835TCT11P.1.20.001156
noncoding29835C29835TCT11P.30.001595
noncoding29835C29835TCT11Q.30.000145
noncoding29835C29835TCT11Q.60.006623