CoV-GLUEGenomeCountriesLineagesMutationsInsertionsDeletionsUpdated:

CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = noncoding : CodonNum = 29773

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
noncoding29773G29773-noncodingG-1173011730129773-29773
noncoding29773G29773TnoncodingGT41214121129773-29773
noncoding29773G29773AnoncodingGA346346129773-29773
noncoding29773G29773CnoncodingGC290290129773-29773

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
noncoding29773G29773-G-1173011730All0.002244
noncoding29773G29773TGT41214121All0.000788
noncoding29773G29773-G-37173717B.1.5250.420618
noncoding29773G29773-G-21512151B.1.1.70.001926
noncoding29773G29773-G-17621762B.1.1.3110.631089
noncoding29773G29773-G-11421142AY.40.001777
noncoding29773G29773TGT10231023B.1.1.70.000916
noncoding29773G29773AGA346346All0.000066
noncoding29773G29773CGC290290All0.000055
noncoding29773G29773TGT278278AY.40.000433
noncoding29773G29773-G-268268AY.50.005534
noncoding29773G29773CGC254254B.1.1.70.000227
noncoding29773G29773-G-238238B.1.20.002096
noncoding29773G29773TGT233233B.1.617.20.000877
noncoding29773G29773TGT206206AY.1170.01741
noncoding29773G29773AGA184184B.1.1.70.000165
noncoding29773G29773-G-181181B.1.3510.00538
noncoding29773G29773-G-164164B.1.617.20.000618
noncoding29773G29773TGT156156AY.46.60.011264
noncoding29773G29773-G-142142AY.1030.000882
noncoding29773G29773TGT125125AY.260.003539
noncoding29773G29773-G-125125B.1.466.10.899281
noncoding29773G29773TGT122122AY.430.000541
noncoding29773G29773-G-115115B.1.1770.001514
noncoding29773G29773TGT108108B.1.440.9
noncoding29773G29773TGT104104B.1.2580.006921
noncoding29773G29773-G-9494D.20.007054
noncoding29773G29773TGT8787B.10.000797
noncoding29773G29773-G-8686AY.430.000381
noncoding29773G29773-G-8686AY.470.002675
noncoding29773G29773TGT8585B.1.1.2220.01734
noncoding29773G29773-G-8484B.10.000769
noncoding29773G29773-G-8383AY.250.000499
noncoding29773G29773TGT7676AY.440.000463
noncoding29773G29773-G-6666B.1.1600.002058
noncoding29773G29773-G-6565AY.30.000647
noncoding29773G29773TGT6464AY.1030.000397
noncoding29773G29773-G-6464B.1.10.001161
noncoding29773G29773TGT5959AY.250.000355
noncoding29773G29773TGT5858B.1.1.2840.006229
noncoding29773G29773TGT5858B.1.4290.001365
noncoding29773G29773TGT5252AY.290.00082
noncoding29773G29773TGT4848AY.300.018995
noncoding29773G29773TGT4747B.1.20.000414
noncoding29773G29773-G-4444AY.440.000268
noncoding29773G29773-G-4343B.1.2430.002992
noncoding29773G29773TGT4242AY.330.002805
noncoding29773G29773TGT4141AY.1000.001886
noncoding29773G29773TGT4141P.10.000646
noncoding29773G29773TGT3838B.1.177.750.039542
noncoding29773G29773-G-3737AY.290.000584
noncoding29773G29773-G-3737C.370.004294
noncoding29773G29773-G-3737P.10.000583
noncoding29773G29773-G-3636B.1.1.3510.100559
noncoding29773G29773TGT3535B.1.10.000635
noncoding29773G29773TGT3030B.1.1770.000395
noncoding29773G29773TGT2929C.370.003366
noncoding29773G29773TGT2626AD.20.005693
noncoding29773G29773TGT2626AY.90.001757
noncoding29773G29773TGT2323AY.1020.00061
noncoding29773G29773TGT2323AY.1080.025358
noncoding29773G29773AGA2323AY.40.000036
noncoding29773G29773-G-2222AY.1020.000583
noncoding29773G29773-G-2222B.1.1.3680.067901
noncoding29773G29773-G-2222B.1.2580.001464
noncoding29773G29773TGT2020AY.460.002082
noncoding29773G29773TGT2020B.1.1.3440.215054
noncoding29773G29773TGT2020B.1.1.5190.000794
noncoding29773G29773TGT1919AY.1130.002705
noncoding29773G29773-G-1919AY.920.005458
noncoding29773G29773TGT1919B.1.1.1530.020811
noncoding29773G29773TGT1818AY.30.000179
noncoding29773G29773TGT1717AY.200.000661
noncoding29773G29773TGT1717AY.50.000351
noncoding29773G29773-G-1717AY.5.40.004704
noncoding29773G29773-G-1717B.1.177.560.011348
noncoding29773G29773-G-1616AY.420.000644
noncoding29773G29773TGT1616AY.60.000658
noncoding29773G29773TGT1616B.1.6210.001416
noncoding29773G29773TGT1515AY.340.001454
noncoding29773G29773-G-1515AY.60.000617
noncoding29773G29773-G-1515AY.850.006408
noncoding29773G29773-G-1515B.1.2210.001065
noncoding29773G29773TGT1515B.1.3510.000446
noncoding29773G29773TGT1515R.10.00135
noncoding29773G29773-G-1414AY.260.000396
noncoding29773G29773TGT1414AY.39.10.000555
noncoding29773G29773TGT1414AY.4.20.000304
noncoding29773G29773TGT1414B.1.1.2140.000776
noncoding29773G29773TGT1414B.1.36.310.024518
noncoding29773G29773-G-1313AY.1190.000459
noncoding29773G29773TGT1313AY.470.000404
noncoding29773G29773-G-1313AY.610.001362
noncoding29773G29773-G-1313B.1.1.2220.002652
noncoding29773G29773TGT1313B.1.1.280.004046
noncoding29773G29773-G-1313B.1.1.4200.013078
noncoding29773G29773AGA1313B.1.617.20.000049
noncoding29773G29773-G-1313P.1.160.004863
noncoding29773G29773-G-1212AY.390.000297
noncoding29773G29773TGT1212AY.9.20.000441
noncoding29773G29773TGT1212B.1.5260.000282
noncoding29773G29773TGT1212B.1.5580.054795
noncoding29773G29773-G-1111AY.1000.000506
noncoding29773G29773-G-1111AY.1180.000689
noncoding29773G29773-G-1111AY.4.20.000239
noncoding29773G29773AGA1111AY.610.001153
noncoding29773G29773TGT1111B.1.1600.000343
noncoding29773G29773-G-1111B.1.177.860.002018
noncoding29773G29773TGT1111B.1.360.001605
noncoding29773G29773-G-1111B.1.4290.000259
noncoding29773G29773TGT1010AD.2.10.454545
noncoding29773G29773TGT1010AY.1210.001353
noncoding29773G29773-G-1010AY.75.10.001803
noncoding29773G29773-G-1010AY.98.10.000484
noncoding29773G29773-G-1010B.1.1.280.003112
noncoding29773G29773TGT1010B.1.1.4480.020325
noncoding29773G29773TGT1010B.1.2210.00071
noncoding29773G29773AGA1010B.1.2210.00071
noncoding29773G29773TGT1010B.1.4040.013021
noncoding29773G29773-G-1010B.1.5960.000871
noncoding29773G29773TGT99AY.1190.000318
noncoding29773G29773AGA99AY.430.00004
noncoding29773G29773TGT99AY.590.004767
noncoding29773G29773-G-99AY.90.000608
noncoding29773G29773-G-99B.1.160.140.019068
noncoding29773G29773-G-99B.1.5260.000212
noncoding29773G29773-G-99P.1.170.001456
noncoding29773G29773-G-88AY.1170.000676
noncoding29773G29773TGT88AY.390.000198
noncoding29773G29773-G-88AY.670.003714
noncoding29773G29773-G-88AY.740.000925
noncoding29773G29773-G-88B.1.1.3170.003294
noncoding29773G29773TGT88B.1.1.4320.010127
noncoding29773G29773-G-88B.1.36.290.004139
noncoding29773G29773TGT88B.1.3690.002282
noncoding29773G29773-G-88C.37.10.020942
noncoding29773G29773TGT88P.1.170.001294
noncoding29773G29773AGA77AY.340.000679
noncoding29773G29773-G-77AY.340.000679
noncoding29773G29773-G-77AY.450.000852
noncoding29773G29773-G-77AY.460.000729
noncoding29773G29773-G-77AY.46.40.001152
noncoding29773G29773TGT77AY.610.000733
noncoding29773G29773TGT77AY.890.034314
noncoding29773G29773TGT77B.1.1.2160.006233
noncoding29773G29773-G-77B.1.1.5190.000278
noncoding29773G29773-G-77B.1.36.220.008454
noncoding29773G29773TGT77B.1.36.290.003621
noncoding29773G29773-G-77B.1.6210.00062
noncoding29773G29773-G-66AY.230.000418
noncoding29773G29773TGT66AY.450.00073
noncoding29773G29773-G-66AY.750.000336
noncoding29773G29773-G-66B.1.1.2140.000333
noncoding29773G29773-G-66B.1.36.310.010508
noncoding29773G29773TGT66P.20.00112
noncoding29773G29773TGT55AY.1060.001674
noncoding29773G29773AGA55AY.1180.000313
noncoding29773G29773-G-55AY.1200.000186
noncoding29773G29773-G-55AY.140.00044
noncoding29773G29773-G-55AY.200.000194
noncoding29773G29773TGT55AY.230.000349
noncoding29773G29773TGT55AY.420.000201
noncoding29773G29773TGT55AY.46.40.000823
noncoding29773G29773-G-55AY.540.000477
noncoding29773G29773TGT55AY.560.008026
noncoding29773G29773AGA55AY.690.000933
noncoding29773G29773TGT55AY.7.20.002796
noncoding29773G29773TGT55AY.920.001436
noncoding29773G29773-G-55AY.980.000395
noncoding29773G29773-G-55B0.000639
noncoding29773G29773TGT55B.1.1.4610.060241
noncoding29773G29773-G-55B.1.258.170.00052
noncoding29773G29773CGC55B.1.5250.000566
noncoding29773G29773AGA55B.1.5250.000566
noncoding29773G29773-G-55B.1.6190.004355
noncoding29773G29773-G-55C.10.011962
noncoding29773G29773AGA55C.360.004554
noncoding29773G29773-G-55P.1.120.00242
noncoding29773G29773TGT55P.1.140.000239
noncoding29773G29773-G-55Q.10.000632
noncoding29773G29773TGT44A.2.50.001996
noncoding29773G29773AGA44AY.1030.000025
noncoding29773G29773TGT44AY.1180.000251
noncoding29773G29773TGT44AY.120.001264
noncoding29773G29773TGT44AY.160.001519
noncoding29773G29773TGT44AY.4.50.00043
noncoding29773G29773AGA44AY.440.000024
noncoding29773G29773AGA44AY.730.002661
noncoding29773G29773-G-44AY.9.20.000147
noncoding29773G29773-G-44AY.950.003044
noncoding29773G29773-G-44B.1.1.2880.007663
noncoding29773G29773-G-44B.1.1.330.001684
noncoding29773G29773-G-44B.1.1.4640.005891
noncoding29773G29773-G-44B.1.1.5280.019231
noncoding29773G29773-G-44B.1.1040.01476
noncoding29773G29773-G-44B.1.160.330.017699
noncoding29773G29773-G-44B.1.2400.000862
noncoding29773G29773TGT44B.1.2400.000862
noncoding29773G29773TGT44B.1.438.10.000429
noncoding29773G29773TGT44B.1.5610.001588
noncoding29773G29773-G-44B.1.5750.001214
noncoding29773G29773-G-44B.1.6090.001918
noncoding29773G29773TGT44B.1.617.10.000516
noncoding29773G29773TGT44P.1.70.001277
noncoding29773G29773TGT33A.23.10.002113
noncoding29773G29773-G-33AY.1090.002219
noncoding29773G29773TGT33AY.1140.000693
noncoding29773G29773-G-33AY.1140.000693
noncoding29773G29773-G-33AY.120.000948
noncoding29773G29773TGT33AY.1200.000112
noncoding29773G29773AGA33AY.230.000209
noncoding29773G29773-G-33AY.3.10.000256
noncoding29773G29773-G-33AY.300.001187
noncoding29773G29773TGT33AY.350.000699
noncoding29773G29773TGT33AY.4.40.001227
noncoding29773G29773TGT33AY.5.30.001012
noncoding29773G29773TGT33AY.530.000863
noncoding29773G29773-G-33AY.590.001589
noncoding29773G29773TGT33AY.690.00056
noncoding29773G29773-G-33AY.700.000626
noncoding29773G29773TGT33AY.750.000168
noncoding29773G29773-G-33AY.840.001312
noncoding29773G29773TGT33AY.9.10.000251
noncoding29773G29773TGT33AY.910.002191
noncoding29773G29773-G-33AY.99.20.000276
noncoding29773G29773AGA33B.1.10.000054
noncoding29773G29773-G-33B.1.1.10.00098
noncoding29773G29773-G-33B.1.1.1700.003741
noncoding29773G29773-G-33B.1.1.2360.02069
noncoding29773G29773TGT33B.1.1.250.001706
noncoding29773G29773TGT33B.1.1.3060.001315
noncoding29773G29773-G-33B.1.1.4280.028302
noncoding29773G29773-G-33B.1.1.460.0131
noncoding29773G29773AGA33B.1.1.5190.000119
noncoding29773G29773TGT33B.1.177.440.001557
noncoding29773G29773TGT33B.1.177.860.00055
noncoding29773G29773-G-33B.1.214.20.001799
noncoding29773G29773-G-33B.1.2340.000396
noncoding29773G29773-G-33B.1.2980.006342
noncoding29773G29773TGT33B.1.36.10.003421
noncoding29773G29773TGT33B.1.4000.001287
noncoding29773G29773AGA33B.1.5510.003871
noncoding29773G29773-G-33B.1.5820.001472
noncoding29773G29773-G-33B.1.5950.000783
noncoding29773G29773TGT33B.1.5960.000261
noncoding29773G29773-G-33B.1.6370.000219
noncoding29773G29773-G-33B.1.9.40.018405
noncoding29773G29773-G-33C.360.002732
noncoding29773G29773CGC33C.360.002732
noncoding29773G29773TGT33C.36.30.001702
noncoding29773G29773-G-33P.1.140.000143
noncoding29773G29773-G-33P.1.150.000697
noncoding29773G29773CGC33P.1.160.001122
noncoding29773G29773TGT22A0.000774
noncoding29773G29773-G-22A0.000774
noncoding29773G29773-G-22A.2.50.000998
noncoding29773G29773-G-22AY.1100.000225
noncoding29773G29773TGT22AY.116.10.000623
noncoding29773G29773TGT22AY.120.10.000642
noncoding29773G29773TGT22AY.140.000176
noncoding29773G29773TGT22AY.20.000712
noncoding29773G29773TGT22AY.3.10.000171
noncoding29773G29773-G-22AY.330.000134
noncoding29773G29773-G-22AY.350.000466
noncoding29773G29773TGT22AY.370.000632
noncoding29773G29773-G-22AY.400.001929
noncoding29773G29773-G-22AY.46.30.001867
noncoding29773G29773-G-22AY.46.60.000144
noncoding29773G29773-G-22AY.5.30.000675
noncoding29773G29773AGA22AY.540.000191
noncoding29773G29773TGT22AY.620.000871
noncoding29773G29773-G-22AY.620.000871
noncoding29773G29773TGT22AY.7.10.000225
noncoding29773G29773TGT22AY.730.001331
noncoding29773G29773TGT22AY.75.10.000361
noncoding29773G29773TGT22AY.840.000875
noncoding29773G29773AGA22AY.9.10.000167
noncoding29773G29773TGT22AY.980.000158
noncoding29773G29773TGT22AY.99.10.003106
noncoding29773G29773TGT22AY.99.20.000184
noncoding29773G29773-G-22B.1.1.1660.066667
noncoding29773G29773-G-22B.1.1.250.001137
noncoding29773G29773-G-22B.1.1.2790.002242
noncoding29773G29773-G-22B.1.1.2940.002532
noncoding29773G29773-G-22B.1.1.3060.000877
noncoding29773G29773AGA22B.1.1.3480.001592
noncoding29773G29773-G-22B.1.1.3480.001592
noncoding29773G29773-G-22B.1.1.3540.008772
noncoding29773G29773-G-22B.1.1.370.000386
noncoding29773G29773TGT22B.1.1.390.001019
noncoding29773G29773TGT22B.1.1.4200.002012
noncoding29773G29773-G-22B.1.1.4320.002532
noncoding29773G29773-G-22B.1.1.5230.003125
noncoding29773G29773CGC22B.1.1770.000026
noncoding29773G29773-G-22B.1.177.120.000303
noncoding29773G29773-G-22B.1.177.750.002081
noncoding29773G29773-G-22B.1.2060.001631
noncoding29773G29773-G-22B.1.2100.004264
noncoding29773G29773TGT22B.1.2430.000139
noncoding29773G29773CGC22B.1.2580.000133
noncoding29773G29773TGT22B.1.258.150.037736
noncoding29773G29773CGC22B.1.3510.000059
noncoding29773G29773AGA22B.1.360.000292
noncoding29773G29773-G-22B.1.360.000292
noncoding29773G29773-G-22B.1.36.160.002849
noncoding29773G29773-G-22B.1.36.80.002
noncoding29773G29773-G-22B.1.4000.000858
noncoding29773G29773-G-22B.1.416.10.003125
noncoding29773G29773-G-22B.1.4270.000101
noncoding29773G29773TGT22B.1.4270.000101
noncoding29773G29773-G-22B.1.4410.019231
noncoding29773G29773-G-22B.1.4600.035714
noncoding29773G29773TGT22B.1.4970.00063
noncoding29773G29773CGC22B.1.617.20.000008
noncoding29773G29773AGA22B.1.6210.000177
noncoding29773G29773-G-22B.310.007463
noncoding29773G29773-G-22B.390.004662
noncoding29773G29773TGT22B.40.004415
noncoding29773G29773-G-22B.400.000729
noncoding29773G29773-G-22B.60.00182
noncoding29773G29773-G-22C.30.015267
noncoding29773G29773-G-22C.380.016129
noncoding29773G29773TGT22D.20.00015
noncoding29773G29773CGC22P.10.000032
noncoding29773G29773AGA22P.10.000032
noncoding29773G29773-G-22P.1.10.000635
noncoding29773G29773TGT22P.1.120.000968
noncoding29773G29773-G-22P.1.70.000639
noncoding29773G29773AGA22Q.10.000253
noncoding29773G29773-G-22R.10.00018
noncoding29773G29773TGT11A.10.000282
noncoding29773G29773TGT11A.20.000662
noncoding29773G29773AGA11A.2.50.000499
noncoding29773G29773TGT11A.210.00277
noncoding29773G29773CGC11A.23.10.000704
noncoding29773G29773TGT11A.280.002646
noncoding29773G29773-G-11AD.20.000219
noncoding29773G29773TGT11AH.30.003802
noncoding29773G29773TGT11AK.10.012658
noncoding29773G29773-G-11AK.20.045455
noncoding29773G29773AGA11AY.1000.000046
noncoding29773G29773-G-11AY.1060.000335
noncoding29773G29773AGA11AY.1060.000335
noncoding29773G29773TGT11AY.1090.00074
noncoding29773G29773TGT11AY.1100.000113
noncoding29773G29773-G-11AY.1110.000183
noncoding29773G29773TGT11AY.1110.000183
noncoding29773G29773-G-11AY.130.000161
noncoding29773G29773CGC11AY.130.000161
noncoding29773G29773-G-11AY.160.00038
noncoding29773G29773TGT11AY.16.10.00047
noncoding29773G29773-G-11AY.240.000431
noncoding29773G29773AGA11AY.250.000006
noncoding29773G29773-G-11AY.29.10.000221
noncoding29773G29773AGA11AY.300.000396
noncoding29773G29773TGT11AY.34.10.00051
noncoding29773G29773TGT11AY.360.000148
noncoding29773G29773-G-11AY.360.000148
noncoding29773G29773-G-11AY.380.000499
noncoding29773G29773-G-11AY.39.10.00004
noncoding29773G29773AGA11AY.4.20.000022
noncoding29773G29773-G-11AY.4.2.10.000149
noncoding29773G29773TGT11AY.4.2.10.000149
noncoding29773G29773-G-11AY.4.50.000107
noncoding29773G29773TGT11AY.400.000964
noncoding29773G29773CGC11AY.430.000004
noncoding29773G29773CGC11AY.440.000006
noncoding29773G29773TGT11AY.46.50.000198
noncoding29773G29773AGA11AY.46.60.000072
noncoding29773G29773-G-11AY.480.000465
noncoding29773G29773TGT11AY.5.40.000277
noncoding29773G29773-G-11AY.510.000909
noncoding29773G29773TGT11AY.520.000814
noncoding29773G29773AGA11AY.530.000288
noncoding29773G29773TGT11AY.540.000095
noncoding29773G29773-G-11AY.560.001605
noncoding29773G29773TGT11AY.570.000656
noncoding29773G29773AGA11AY.620.000436
noncoding29773G29773AGA11AY.650.000533
noncoding29773G29773-G-11AY.70.000196
noncoding29773G29773TGT11AY.740.000116
noncoding29773G29773AGA11AY.75.10.00018
noncoding29773G29773TGT11AY.770.001127
noncoding29773G29773-G-11AY.800.001129
noncoding29773G29773-G-11AY.810.001992
noncoding29773G29773TGT11AY.850.000427
noncoding29773G29773-G-11AY.870.000833
noncoding29773G29773-G-11AY.9.10.000084
noncoding29773G29773TGT11AY.940.000443
noncoding29773G29773TGT11AY.98.10.000048
noncoding29773G29773TGT11AZ.20.000821
noncoding29773G29773TGT11B0.000128
noncoding29773G29773AGA11B.10.000009
noncoding29773G29773TGT11B.1.1.100.001115
noncoding29773G29773-G-11B.1.1.100.001115
noncoding29773G29773TGT11B.1.1.1410.002012
noncoding29773G29773-G-11B.1.1.1610.003534
noncoding29773G29773-G-11B.1.1.1740.003378
noncoding29773G29773TGT11B.1.1.1890.001513
noncoding29773G29773-G-11B.1.1.1970.037037
noncoding29773G29773TGT11B.1.1.2070.001182
noncoding29773G29773AGA11B.1.1.2160.00089
noncoding29773G29773-G-11B.1.1.2180.007692
noncoding29773G29773-G-11B.1.1.2210.010101
noncoding29773G29773-G-11B.1.1.2290.005747
noncoding29773G29773TGT11B.1.1.2430.004082
noncoding29773G29773TGT11B.1.1.2530.002506
noncoding29773G29773TGT11B.1.1.2570.009709
noncoding29773G29773TGT11B.1.1.2610.008621
noncoding29773G29773TGT11B.1.1.2630.001558
noncoding29773G29773AGA11B.1.1.270.00565
noncoding29773G29773-G-11B.1.1.2740.005051
noncoding29773G29773-G-11B.1.1.2770.000759
noncoding29773G29773TGT11B.1.1.2790.001121
noncoding29773G29773-G-11B.1.1.2860.002899
noncoding29773G29773AGA11B.1.1.2940.001266
noncoding29773G29773AGA11B.1.1.3060.000438
noncoding29773G29773TGT11B.1.1.3160.000925
noncoding29773G29773TGT11B.1.1.3170.000412
noncoding29773G29773CGC11B.1.1.3170.000412
noncoding29773G29773TGT11B.1.1.3180.000302
noncoding29773G29773TGT11B.1.1.3260.001761
noncoding29773G29773-G-11B.1.1.3370.003597
noncoding29773G29773TGT11B.1.1.3680.003086
noncoding29773G29773TGT11B.1.1.3690.000446
noncoding29773G29773-G-11B.1.1.390.00051
noncoding29773G29773-G-11B.1.1.4090.002833
noncoding29773G29773-G-11B.1.1.4130.006897
noncoding29773G29773-G-11B.1.1.500.000679
noncoding29773G29773TGT11B.1.1.5000.02
noncoding29773G29773TGT11B.1.1.5260.003546
noncoding29773G29773-G-11B.1.1.5260.003546
noncoding29773G29773-G-11B.1.1.540.003021
noncoding29773G29773AGA11B.1.1.630.000386
noncoding29773G29773-G-11B.1.1.700.000341
noncoding29773G29773TGT11B.1.1.970.029412
noncoding29773G29773-G-11B.1.1.990.02381
noncoding29773G29773-G-11B.1.1100.004525
noncoding29773G29773-G-11B.1.1110.001175
noncoding29773G29773TGT11B.1.1570.002985
noncoding29773G29773AGA11B.1.1600.000031
noncoding29773G29773AGA11B.1.1770.000013
noncoding29773G29773-G-11B.1.177.110.001698
noncoding29773G29773TGT11B.1.177.170.000821
noncoding29773G29773AGA11B.1.177.210.000076
noncoding29773G29773-G-11B.1.177.320.00135
noncoding29773G29773CGC11B.1.177.330.001645
noncoding29773G29773-G-11B.1.177.330.001645
noncoding29773G29773-G-11B.1.177.420.000894
noncoding29773G29773-G-11B.1.177.440.000519
noncoding29773G29773-G-11B.1.177.540.000606
noncoding29773G29773-G-11B.1.177.570.000281
noncoding29773G29773-G-11B.1.177.60.000977
noncoding29773G29773CGC11B.1.177.620.001192
noncoding29773G29773AGA11B.1.177.620.001192
noncoding29773G29773AGA11B.1.177.630.002703
noncoding29773G29773CGC11B.1.177.650.000665
noncoding29773G29773TGT11B.1.177.730.000566
noncoding29773G29773CGC11B.1.177.730.000566
noncoding29773G29773-G-11B.1.177.810.000189
noncoding29773G29773AGA11B.1.177.860.000183
noncoding29773G29773CGC11B.1.177.860.000183
noncoding29773G29773-G-11B.1.1790.003759
noncoding29773G29773TGT11B.1.1920.009259
noncoding29773G29773-G-11B.1.1920.009259
noncoding29773G29773-G-11B.1.2220.001692
noncoding29773G29773TGT11B.1.2320.000537
noncoding29773G29773TGT11B.1.2340.000132
noncoding29773G29773TGT11B.1.2370.004975
noncoding29773G29773-G-11B.1.2410.000812
noncoding29773G29773AGA11B.1.2580.000067
noncoding29773G29773-G-11B.1.258.30.001675
noncoding29773G29773-G-11B.1.2600.003344
noncoding29773G29773-G-11B.1.2810.021739
noncoding29773G29773TGT11B.1.3110.000275
noncoding29773G29773TGT11B.1.3240.001605
noncoding29773G29773AGA11B.1.3510.00003
noncoding29773G29773-G-11B.1.351.20.000303
noncoding29773G29773-G-11B.1.351.30.000876
noncoding29773G29773-G-11B.1.351.50.0006
noncoding29773G29773CGC11B.1.36.170.000494
noncoding29773G29773TGT11B.1.36.180.00042
noncoding29773G29773-G-11B.1.36.190.009259
noncoding29773G29773TGT11B.1.36.80.001
noncoding29773G29773-G-11B.1.3620.001541
noncoding29773G29773-G-11B.1.3670.000792
noncoding29773G29773TGT11B.1.3670.000792
noncoding29773G29773CGC11B.1.4160.001269
noncoding29773G29773-G-11B.1.4160.001269
noncoding29773G29773TGT11B.1.429.10.012048
noncoding29773G29773TGT11B.1.4530.003236
noncoding29773G29773TGT11B.1.4590.004082
noncoding29773G29773-G-11B.1.4620.007246
noncoding29773G29773-G-11B.1.4700.001404
noncoding29773G29773TGT11B.1.4700.001404
noncoding29773G29773-G-11B.1.5060.02381
noncoding29773G29773-G-11B.1.5090.000866
noncoding29773G29773TGT11B.1.5250.000113
noncoding29773G29773TGT11B.1.5300.007143
noncoding29773G29773TGT11B.1.5640.000426
noncoding29773G29773-G-11B.1.564.10.001577
noncoding29773G29773TGT11B.1.5680.001111
noncoding29773G29773-G-11B.1.5760.000907
noncoding29773G29773TGT11B.1.5900.004545
noncoding29773G29773TGT11B.1.5910.010638
noncoding29773G29773AGA11B.1.5960.000087
noncoding29773G29773TGT11B.1.6090.000479
noncoding29773G29773-G-11B.1.617.10.000129
noncoding29773G29773-G-11B.1.617.30.002985
noncoding29773G29773AGA11B.1.6190.000871
noncoding29773G29773TGT11B.1.6190.000871
noncoding29773G29773TGT11B.1.619.10.000641
noncoding29773G29773-G-11B.1.619.10.000641
noncoding29773G29773CGC11B.1.6210.000089
noncoding29773G29773-G-11B.1.6300.005236
noncoding29773G29773TGT11B.1.6310.003367
noncoding29773G29773TGT11B.1.88.10.004808
noncoding29773G29773-G-11B.1.9.50.005682
noncoding29773G29773TGT11B.1.9.50.005682
noncoding29773G29773-G-11B.550.00295
noncoding29773G29773TGT11C.140.004329
noncoding29773G29773TGT11C.350.000774
noncoding29773G29773TGT11C.360.000911
noncoding29773G29773-G-11C.36.30.000567
noncoding29773G29773CGC11C.36.30.000567
noncoding29773G29773AGA11C.370.000116
noncoding29773G29773AGA11D.20.000075
noncoding29773G29773-G-11K.30.006173
noncoding29773G29773-G-11L.30.003546
noncoding29773G29773-G-11N.40.004255
noncoding29773G29773-G-11N.50.001767
noncoding29773G29773AGA11N.60.007092
noncoding29773G29773AGA11P.1.10.000318
noncoding29773G29773CGC11P.1.10.000318
noncoding29773G29773-G-11P.1.100.000269
noncoding29773G29773TGT11P.1.160.000374
noncoding29773G29773-G-11P.20.000187
noncoding29773G29773-G-11P.60.003145
noncoding29773G29773TGT11P.70.004367
noncoding29773G29773-G-11Q.20.000613
noncoding29773G29773TGT11Q.20.000613
noncoding29773G29773TGT11Q.30.000145
noncoding29773G29773TGT11W.30.005263
noncoding29773G29773-G-11W.40.001351

CoV-GLUE is still in development. CoV-GLUE was originally developed as part of COG-UK by Josh Singer using the GLUE framework at the MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research (CVR). In 2021 it was redeveloped by Richard Orton to scale to the millions of genome sequences available. We acknowledge support from the MRC (MC_UU_12014/12), WT (220977/Z/20/Z) and UKRI G2P (MR/W005611/1). Please contact Richard Orton with any queries: Richard.Orton@glasgow.ac.uk

CoV-GLUE uses sequence data from GISAID. GISAID data provided via this web application is subject to GISAID's Terms and Conditions.