CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = noncoding : CodonNum = 29771

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
noncoding29771A29771-noncodingA-1308913089129771-29771
noncoding29771A29771GnoncodingAG69026902129771-29771
noncoding29771A29771CnoncodingAC366366129771-29771
noncoding29771A29771TnoncodingAT253253129771-29771
noncoding29771A29771VnoncodingAV11129771-29771

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
noncoding29771A29771-A-1308913089All0.002503
noncoding29771A29771GAG69026902All0.00132
noncoding29771A29771GAG44314431AD.20.970221
noncoding29771A29771-A-37173717B.1.5250.420618
noncoding29771A29771-A-23302330B.1.1.70.002086
noncoding29771A29771-A-17621762B.1.1.3110.631089
noncoding29771A29771-A-13291329AY.40.002068
noncoding29771A29771GAG12761276B.1.617.20.004805
noncoding29771A29771-A-794794AY.380.396405
noncoding29771A29771CAC366366All0.00007
noncoding29771A29771GAG321321B.1.1.70.000287
noncoding29771A29771CAC296296B.1.1.70.000265
noncoding29771A29771-A-268268AY.50.005534
noncoding29771A29771TAT253253All0.000048
noncoding29771A29771-A-249249B.1.20.002193
noncoding29771A29771GAG240240AD.10.987654
noncoding29771A29771-A-189189B.1.3510.005618
noncoding29771A29771-A-176176B.1.617.20.000663
noncoding29771A29771TAT169169B.1.1.70.000151
noncoding29771A29771-A-142142AY.1030.000882
noncoding29771A29771-A-133133B.10.001218
noncoding29771A29771-A-131131B.1.1770.001725
noncoding29771A29771-A-125125B.1.466.10.899281
noncoding29771A29771GAG103103B.1.1.3150.872881
noncoding29771A29771-A-9595AY.430.000421
noncoding29771A29771-A-8787AY.470.002706
noncoding29771A29771-A-8585AY.250.000511
noncoding29771A29771-A-7979B.1.1600.002464
noncoding29771A29771-A-6666AY.30.000656
noncoding29771A29771-A-6666B.1.10.001197
noncoding29771A29771-A-5757AY.1110.01044
noncoding29771A29771GAG5757AY.16.10.026786
noncoding29771A29771GAG5454AY.590.028602
noncoding29771A29771GAG4646AY.430.000204
noncoding29771A29771-A-4545AY.440.000274
noncoding29771A29771-A-4343B.1.2430.002992
noncoding29771A29771-A-4141P.10.000646
noncoding29771A29771-A-3838C.370.00441
noncoding29771A29771-A-3737AY.290.000584
noncoding29771A29771-A-3636B.1.1.3510.100559
noncoding29771A29771GAG3535AY.50.000723
noncoding29771A29771GAG3131B0.003962
noncoding29771A29771GAG2828B.10.000256
noncoding29771A29771GAG2525AY.250.00015
noncoding29771A29771GAG2525AY.440.000152
noncoding29771A29771-A-2323AY.1020.00061
noncoding29771A29771-A-2222B.1.1.3680.067901
noncoding29771A29771-A-2222B.1.2580.001464
noncoding29771A29771GAG1919AY.230.001325
noncoding29771A29771-A-1919AY.420.000764
noncoding29771A29771-A-1919AY.920.005458
noncoding29771A29771-A-1717AY.5.40.004704
noncoding29771A29771-A-1717B.1.177.560.011348
noncoding29771A29771-A-1616AY.260.000453
noncoding29771A29771-A-1616AY.60.000658
noncoding29771A29771-A-1616B.1.2210.001137
noncoding29771A29771-A-1414AY.390.000346
noncoding29771A29771-A-1414AY.610.001467
noncoding29771A29771-A-1414B.1.4040.018229
noncoding29771A29771-A-1313AY.1190.000459
noncoding29771A29771-A-1313AY.75.10.002344
noncoding29771A29771-A-1313B.1.1.2220.002652
noncoding29771A29771-A-1313B.1.1.4200.013078
noncoding29771A29771-A-1313P.1.160.004863
noncoding29771A29771-A-1212AY.1180.000752
noncoding29771A29771GAG1212AY.40.000019
noncoding29771A29771-A-1212B.1.1.280.003735
noncoding29771A29771-A-1212B.1.4290.000282
noncoding29771A29771CAC1212B.1.617.20.000045
noncoding29771A29771-A-1111AY.1000.000506
noncoding29771A29771-A-1111AY.4.20.000239
noncoding29771A29771-A-1111AY.750.000616
noncoding29771A29771-A-1111AY.98.10.000533
noncoding29771A29771-A-1111B.1.177.860.002018
noncoding29771A29771-A-1111B.1.360.001605
noncoding29771A29771-A-1111B.1.5260.000259
noncoding29771A29771GAG1010AD.2.10.454545
noncoding29771A29771GAG1010AY.1000.00046
noncoding29771A29771GAG1010AY.4.2.10.00149
noncoding29771A29771-A-1010AY.740.001156
noncoding29771A29771-A-1010AY.90.000676
noncoding29771A29771-A-1010B.1.5960.000871
noncoding29771A29771TAT99AY.600.008443
noncoding29771A29771-A-99B.1.160.140.019068
noncoding29771A29771GAG99B.1.20.000079
noncoding29771A29771-A-88AY.1170.000676
noncoding29771A29771-A-88AY.450.000973
noncoding29771A29771-A-88AY.670.003714
noncoding29771A29771-A-88AY.850.003417
noncoding29771A29771GAG88B.1.10.000145
noncoding29771A29771-A-88B.1.1.3030.022099
noncoding29771A29771-A-88B.1.1.3170.003294
noncoding29771A29771-A-88B.1.36.290.004139
noncoding29771A29771-A-88C.37.10.020942
noncoding29771A29771-A-88P.1.170.001294
noncoding29771A29771GAG77AY.1030.000043
noncoding29771A29771GAG77AY.1080.007718
noncoding29771A29771GAG77AY.1190.000247
noncoding29771A29771-A-77AY.340.000679
noncoding29771A29771-A-77AY.46.40.001152
noncoding29771A29771GAG77AY.840.003062
noncoding29771A29771-A-77B.1.1.5190.000278
noncoding29771A29771TAT77B.1.20.000062
noncoding29771A29771-A-77B.1.2340.000924
noncoding29771A29771-A-77B.1.2400.001509
noncoding29771A29771-A-77B.1.36.220.008454
noncoding29771A29771-A-77B.1.6210.00062
noncoding29771A29771-A-66AY.230.000418
noncoding29771A29771-A-66AY.460.000624
noncoding29771A29771GAG66AY.480.002791
noncoding29771A29771-A-66AY.980.000474
noncoding29771A29771CAC66B.1.10.000109
noncoding29771A29771-A-66B.1.1.2140.000333
noncoding29771A29771GAG66B.1.1770.000079
noncoding29771A29771-A-66B.1.36.310.010508
noncoding29771A29771GAG66B.1.5250.000679
noncoding29771A29771CAC66B.1.5250.000679
noncoding29771A29771TAT66C.300.010363
noncoding29771A29771-A-66Q.10.000758
noncoding29771A29771-A-55AY.1140.001156
noncoding29771A29771-A-55AY.1200.000186
noncoding29771A29771-A-55AY.140.00044
noncoding29771A29771GAG55AY.200.000194
noncoding29771A29771-A-55AY.200.000194
noncoding29771A29771TAT55AY.40.000008
noncoding29771A29771-A-55AY.540.000477
noncoding29771A29771-A-55AY.9.20.000184
noncoding29771A29771GAG55AY.9.20.000184
noncoding29771A29771-A-55B0.000639
noncoding29771A29771-A-55B.1.258.170.00052
noncoding29771A29771GAG55B.1.3510.000149
noncoding29771A29771-A-55B.1.5750.001517
noncoding29771A29771TAT55B.1.617.20.000019
noncoding29771A29771-A-55B.1.6190.004355
noncoding29771A29771-A-55P.1.120.00242
noncoding29771A29771-A-44AY.120.001264
noncoding29771A29771CAC44AY.40.000006
noncoding29771A29771GAG44AY.470.000124
noncoding29771A29771GAG44AY.550.00367
noncoding29771A29771GAG44AY.680.001095
noncoding29771A29771-A-44AY.690.000747
noncoding29771A29771-A-44AY.950.003044
noncoding29771A29771-A-44B.1.1.10.001307
noncoding29771A29771-A-44B.1.1.1700.004988
noncoding29771A29771GAG44B.1.1.1890.006051
noncoding29771A29771-A-44B.1.1.2880.007663
noncoding29771A29771-A-44B.1.1.330.001684
noncoding29771A29771-A-44B.1.1.4640.005891
noncoding29771A29771TAT44B.1.1.4850.066667
noncoding29771A29771-A-44B.1.1.5280.019231
noncoding29771A29771-A-44B.1.1040.01476
noncoding29771A29771-A-44B.1.160.330.017699
noncoding29771A29771TAT44B.1.177.860.000734
noncoding29771A29771CAC44B.1.20.000035
noncoding29771A29771GAG44B.1.4160.005076
noncoding29771A29771-A-44B.1.4270.000202
noncoding29771A29771-A-44B.1.6090.001918
noncoding29771A29771-A-44C.10.009569
noncoding29771A29771CAC44C.360.003643
noncoding29771A29771-A-44D.20.0003
noncoding29771A29771-A-44P.1.140.000191
noncoding29771A29771-A-33AY.1090.002219
noncoding29771A29771GAG33AY.1100.000338
noncoding29771A29771GAG33AY.1210.000406
noncoding29771A29771TAT33AY.290.000047
noncoding29771A29771-A-33AY.3.10.000256
noncoding29771A29771-A-33AY.300.001187
noncoding29771A29771GAG33AY.380.001498
noncoding29771A29771GAG33AY.390.000074
noncoding29771A29771-A-33AY.590.001589
noncoding29771A29771GAG33AY.610.000314
noncoding29771A29771-A-33AY.650.001599
noncoding29771A29771-A-33AY.700.000626
noncoding29771A29771-A-33AY.840.001312
noncoding29771A29771-A-33AY.99.20.000276
noncoding29771A29771TAT33B.1.10.000054
noncoding29771A29771-A-33B.1.1.2360.02069
noncoding29771A29771TAT33B.1.1.2850.019608
noncoding29771A29771-A-33B.1.1.4280.028302
noncoding29771A29771-A-33B.1.1.4320.003797
noncoding29771A29771-A-33B.1.1.460.0131
noncoding29771A29771GAG33B.1.1600.000094
noncoding29771A29771-A-33B.1.2100.006397
noncoding29771A29771-A-33B.1.214.20.001799
noncoding29771A29771-A-33B.1.2980.006342
noncoding29771A29771-A-33B.1.36.160.004274
noncoding29771A29771-A-33B.1.416.10.004687
noncoding29771A29771CAC33B.1.5650.002431
noncoding29771A29771-A-33B.1.5820.001472
noncoding29771A29771-A-33B.1.5950.000783
noncoding29771A29771GAG33B.1.6210.000266
noncoding29771A29771-A-33B.1.6370.000219
noncoding29771A29771-A-33B.1.9.40.018405
noncoding29771A29771-A-33C.360.002732
noncoding29771A29771-A-33P.1.150.000697
noncoding29771A29771CAC33P.1.160.001122
noncoding29771A29771-A-22A0.000774
noncoding29771A29771-A-22A.2.50.000998
noncoding29771A29771CAC22A.2.50.000998
noncoding29771A29771GAG22AP.10.003003
noncoding29771A29771GAG22AY.1020.000053
noncoding29771A29771TAT22AY.1020.000053
noncoding29771A29771GAG22AY.1070.000932
noncoding29771A29771-A-22AY.1100.000225
noncoding29771A29771TAT22AY.240.000862
noncoding29771A29771TAT22AY.250.000012
noncoding29771A29771-A-22AY.330.000134
noncoding29771A29771GAG22AY.350.000466
noncoding29771A29771-A-22AY.350.000466
noncoding29771A29771-A-22AY.400.001929
noncoding29771A29771-A-22AY.46.30.001867
noncoding29771A29771-A-22AY.46.60.000144
noncoding29771A29771-A-22AY.5.30.000675
noncoding29771A29771GAG22AY.540.000191
noncoding29771A29771-A-22AY.560.00321
noncoding29771A29771-A-22AY.620.000871
noncoding29771A29771GAG22AY.75.10.000361
noncoding29771A29771-A-22AZ.20.001642
noncoding29771A29771TAT22B.10.000018
noncoding29771A29771-A-22B.1.1.250.001137
noncoding29771A29771-A-22B.1.1.2790.002242
noncoding29771A29771-A-22B.1.1.2940.002532
noncoding29771A29771-A-22B.1.1.3060.000877
noncoding29771A29771GAG22B.1.1.3110.000716
noncoding29771A29771-A-22B.1.1.3480.001592
noncoding29771A29771-A-22B.1.1.3540.008772
noncoding29771A29771-A-22B.1.1.370.000386
noncoding29771A29771-A-22B.1.1.390.001019
noncoding29771A29771-A-22B.1.1.5230.003125
noncoding29771A29771CAC22B.1.1600.000062
noncoding29771A29771-A-22B.1.177.120.000303
noncoding29771A29771-A-22B.1.177.440.001038
noncoding29771A29771CAC22B.1.177.620.002384
noncoding29771A29771-A-22B.1.177.750.002081
noncoding29771A29771-A-22B.1.2060.001631
noncoding29771A29771CAC22B.1.2140.007326
noncoding29771A29771CAC22B.1.2210.000142
noncoding29771A29771-A-22B.1.2410.001623
noncoding29771A29771TAT22B.1.2580.000133
noncoding29771A29771-A-22B.1.258.30.00335
noncoding29771A29771CAC22B.1.3510.000059
noncoding29771A29771TAT22B.1.3510.000059
noncoding29771A29771-A-22B.1.36.80.002
noncoding29771A29771-A-22B.1.4000.000858
noncoding29771A29771-A-22B.1.4410.019231
noncoding29771A29771-A-22B.1.4600.035714
noncoding29771A29771-A-22B.1.564.10.003155
noncoding29771A29771-A-22B.310.007463
noncoding29771A29771-A-22B.390.004662
noncoding29771A29771-A-22B.400.000729
noncoding29771A29771-A-22B.60.00182
noncoding29771A29771-A-22C.30.015267
noncoding29771A29771-A-22C.380.016129
noncoding29771A29771TAT22P.10.000032
noncoding29771A29771-A-22P.1.10.000635
noncoding29771A29771-A-22P.1.70.000639
noncoding29771A29771-A-22R.10.00018
noncoding29771A29771VAV11A0.000387
noncoding29771A29771CAC11A.10.000282
noncoding29771A29771GAG11A.2.20.001689
noncoding29771A29771TAT11A.23.10.000704
noncoding29771A29771GAG11AA.50.016129
noncoding29771A29771-A-11AD.20.000219
noncoding29771A29771TAT11AD.20.000219
noncoding29771A29771-A-11AK.20.045455
noncoding29771A29771VAV11All0
noncoding29771A29771-A-11AY.100.00053
noncoding29771A29771GAG11AY.1010.00049
noncoding29771A29771TAT11AY.1030.000006
noncoding29771A29771-A-11AY.1060.000335
noncoding29771A29771TAT11AY.1190.000035
noncoding29771A29771-A-11AY.120.10.000321
noncoding29771A29771-A-11AY.130.000161
noncoding29771A29771GAG11AY.140.000088
noncoding29771A29771-A-11AY.160.00038
noncoding29771A29771GAG11AY.190.00114
noncoding29771A29771TAT11AY.200.000039
noncoding29771A29771TAT11AY.230.00007
noncoding29771A29771CAC11AY.230.00007
noncoding29771A29771-A-11AY.240.000431
noncoding29771A29771CAC11AY.250.000006
noncoding29771A29771-A-11AY.29.10.000221
noncoding29771A29771CAC11AY.30.00001
noncoding29771A29771GAG11AY.330.000067
noncoding29771A29771CAC11AY.340.000097
noncoding29771A29771-A-11AY.360.000148
noncoding29771A29771CAC11AY.360.000148
noncoding29771A29771-A-11AY.39.10.00004
noncoding29771A29771-A-11AY.4.2.10.000149
noncoding29771A29771-A-11AY.4.50.000107
noncoding29771A29771GAG11AY.420.00004
noncoding29771A29771TAT11AY.450.000122
noncoding29771A29771GAG11AY.450.000122
noncoding29771A29771TAT11AY.470.000031
noncoding29771A29771-A-11AY.480.000465
noncoding29771A29771TAT11AY.50.000021
noncoding29771A29771GAG11AY.5.40.000277
noncoding29771A29771GAG11AY.510.000909
noncoding29771A29771-A-11AY.510.000909
noncoding29771A29771GAG11AY.520.000814
noncoding29771A29771-A-11AY.520.000814
noncoding29771A29771TAT11AY.520.000814
noncoding29771A29771GAG11AY.560.001605
noncoding29771A29771CAC11AY.590.00053
noncoding29771A29771CAC11AY.610.000105
noncoding29771A29771-A-11AY.70.000196
noncoding29771A29771GAG11AY.710.000475
noncoding29771A29771GAG11AY.750.000056
noncoding29771A29771-A-11AY.800.001129
noncoding29771A29771-A-11AY.810.001992
noncoding29771A29771-A-11AY.870.000833
noncoding29771A29771GAG11AY.870.000833
noncoding29771A29771-A-11AY.9.10.000084
noncoding29771A29771GAG11AY.950.000761
noncoding29771A29771GAG11AY.980.000079
noncoding29771A29771GAG11AY.99.20.000092
noncoding29771A29771CAC11B.10.000009
noncoding29771A29771TAT11B.1.1.10.000327
noncoding29771A29771-A-11B.1.1.100.001115
noncoding29771A29771-A-11B.1.1.1610.003534
noncoding29771A29771-A-11B.1.1.1660.033333
noncoding29771A29771-A-11B.1.1.1740.003378
noncoding29771A29771-A-11B.1.1.1970.037037
noncoding29771A29771CAC11B.1.1.2140.000055
noncoding29771A29771-A-11B.1.1.2160.00089
noncoding29771A29771-A-11B.1.1.2180.007692
noncoding29771A29771-A-11B.1.1.2210.010101
noncoding29771A29771-A-11B.1.1.2290.005747
noncoding29771A29771GAG11B.1.1.250.000569
noncoding29771A29771GAG11B.1.1.2530.002506
noncoding29771A29771-A-11B.1.1.2740.005051
noncoding29771A29771-A-11B.1.1.2770.000759
noncoding29771A29771GAG11B.1.1.280.000311
noncoding29771A29771-A-11B.1.1.2860.002899
noncoding29771A29771CAC11B.1.1.3000.010753
noncoding29771A29771TAT11B.1.1.3170.000412
noncoding29771A29771-A-11B.1.1.3370.003597
noncoding29771A29771GAG11B.1.1.370.000193
noncoding29771A29771TAT11B.1.1.3720.000689
noncoding29771A29771GAG11B.1.1.4090.002833
noncoding29771A29771-A-11B.1.1.4090.002833
noncoding29771A29771-A-11B.1.1.4130.006897
noncoding29771A29771-A-11B.1.1.500.000679
noncoding29771A29771GAG11B.1.1.5190.00004
noncoding29771A29771-A-11B.1.1.5260.003546
noncoding29771A29771-A-11B.1.1.540.003021
noncoding29771A29771-A-11B.1.1.630.000386
noncoding29771A29771-A-11B.1.1.700.000341
noncoding29771A29771-A-11B.1.1.750.010638
noncoding29771A29771-A-11B.1.1.990.02381
noncoding29771A29771-A-11B.1.1100.004525
noncoding29771A29771-A-11B.1.1110.001175
noncoding29771A29771TAT11B.1.1110.001175
noncoding29771A29771-A-11B.1.160.320.004292
noncoding29771A29771CAC11B.1.1770.000013
noncoding29771A29771GAG11B.1.177.100.000878
noncoding29771A29771-A-11B.1.177.110.001698
noncoding29771A29771GAG11B.1.177.190.001431
noncoding29771A29771-A-11B.1.177.320.00135
noncoding29771A29771CAC11B.1.177.330.001645
noncoding29771A29771-A-11B.1.177.40.000211
noncoding29771A29771-A-11B.1.177.420.000894
noncoding29771A29771-A-11B.1.177.540.000606
noncoding29771A29771-A-11B.1.177.570.000281
noncoding29771A29771-A-11B.1.177.60.000977
noncoding29771A29771-A-11B.1.177.650.000665
noncoding29771A29771-A-11B.1.177.810.000189
noncoding29771A29771GAG11B.1.177.860.000183
noncoding29771A29771-A-11B.1.1920.009259
noncoding29771A29771-A-11B.1.2220.001692
noncoding29771A29771GAG11B.1.2400.000216
noncoding29771A29771GAG11B.1.2430.00007
noncoding29771A29771CAC11B.1.2580.000067
noncoding29771A29771-A-11B.1.258.240.010753
noncoding29771A29771-A-11B.1.2600.003344
noncoding29771A29771-A-11B.1.2810.021739
noncoding29771A29771-A-11B.1.3290.000608
noncoding29771A29771-A-11B.1.351.20.000303
noncoding29771A29771-A-11B.1.351.30.000876
noncoding29771A29771-A-11B.1.351.50.0006
noncoding29771A29771TAT11B.1.360.000146
noncoding29771A29771GAG11B.1.360.000146
noncoding29771A29771-A-11B.1.36.190.009259
noncoding29771A29771-A-11B.1.3620.001541
noncoding29771A29771-A-11B.1.3670.000792
noncoding29771A29771GAG11B.1.3890.001002
noncoding29771A29771-A-11B.1.4090.000781
noncoding29771A29771-A-11B.1.4160.001269
noncoding29771A29771-A-11B.1.4200.010417
noncoding29771A29771TAT11B.1.4290.000024
noncoding29771A29771-A-11B.1.4620.007246
noncoding29771A29771-A-11B.1.4700.001404
noncoding29771A29771-A-11B.1.5060.02381
noncoding29771A29771-A-11B.1.5090.000866
noncoding29771A29771TAT11B.1.5260.000024
noncoding29771A29771GAG11B.1.5610.000397
noncoding29771A29771-A-11B.1.5650.00081
noncoding29771A29771-A-11B.1.5760.000907
noncoding29771A29771-A-11B.1.595.10.005848
noncoding29771A29771-A-11B.1.617.10.000129
noncoding29771A29771-A-11B.1.617.30.002985
noncoding29771A29771CAC11B.1.6190.000871
noncoding29771A29771TAT11B.1.6190.000871
noncoding29771A29771-A-11B.1.619.10.000641
noncoding29771A29771-A-11B.1.6300.005236
noncoding29771A29771-A-11B.1.9.50.005682
noncoding29771A29771-A-11B.3.10.001658
noncoding29771A29771-A-11B.550.00295
noncoding29771A29771GAG11C.290.0625
noncoding29771A29771-A-11C.300.001727
noncoding29771A29771-A-11C.350.000774
noncoding29771A29771TAT11C.36.30.000567
noncoding29771A29771-A-11C.36.30.000567
noncoding29771A29771GAG11C.370.000116
noncoding29771A29771-A-11K.30.006173
noncoding29771A29771-A-11L.30.003546
noncoding29771A29771-A-11N.40.004255
noncoding29771A29771-A-11N.50.001767
noncoding29771A29771GAG11P.10.000016
noncoding29771A29771CAC11P.1.10.000318
noncoding29771A29771-A-11P.1.100.000269
noncoding29771A29771TAT11P.20.000187
noncoding29771A29771-A-11P.20.000187
noncoding29771A29771-A-11P.60.003145
noncoding29771A29771TAT11Q.10.000126
noncoding29771A29771-A-11Q.20.000613
noncoding29771A29771GAG11R.10.00009
noncoding29771A29771-A-11W.40.001351