CoV-GLUEGenomeCountriesLineagesMutationsInsertionsDeletionsUpdated:

CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = noncoding : CodonNum = 29769

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
noncoding29769C29769TnoncodingCT1574715747129769-29769
noncoding29769C29769-noncodingC-1322113221129769-29769
noncoding29769C29769AnoncodingCA780780129769-29769
noncoding29769C29769GnoncodingCG3030129769-29769

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
noncoding29769C29769TCT1574715747All0.003012
noncoding29769C29769-C-1322113221All0.002529
noncoding29769C29769-C-37173717B.1.5250.420618
noncoding29769C29769TCT26702670B.1.1.3180.805673
noncoding29769C29769-C-22262226B.1.1.70.001993
noncoding29769C29769TCT18641864B.1.1.70.001669
noncoding29769C29769-C-17621762B.1.1.3110.631089
noncoding29769C29769-C-13311331AY.40.002072
noncoding29769C29769TCT11831183AZ.20.971264
noncoding29769C29769TCT11331133AZ.10.982654
noncoding29769C29769-C-827827AY.380.412881
noncoding29769C29769ACA780780All0.000149
noncoding29769C29769TCT659659AY.1030.004092
noncoding29769C29769ACA659659B.1.1.70.00059
noncoding29769C29769TCT589589AY.40.000917
noncoding29769C29769TCT583583AZ.30.886018
noncoding29769C29769TCT470470B.1.1.4640.692194
noncoding29769C29769TCT455455B.1.617.20.001713
noncoding29769C29769TCT381381AY.250.002292
noncoding29769C29769TCT298298B.10.00273
noncoding29769C29769-C-268268AY.50.005534
noncoding29769C29769TCT263263AZ.50.922807
noncoding29769C29769TCT261261B.1.1770.003437
noncoding29769C29769-C-255255B.1.20.002245
noncoding29769C29769TCT250250AZ.40.838926
noncoding29769C29769TCT225225AY.430.000997
noncoding29769C29769TCT210210B.1.1.390.107034
noncoding29769C29769TCT195195B.1.1600.006082
noncoding29769C29769TCT194194B.1.20.001708
noncoding29769C29769TCT176176AY.1020.004666
noncoding29769C29769-C-175175B.1.617.20.000659
noncoding29769C29769TCT171171B.1.10.003102
noncoding29769C29769TCT159159AY.440.000968
noncoding29769C29769TCT157157AY.500.1255
noncoding29769C29769-C-142142AY.1030.000882
noncoding29769C29769-C-138138B.1.1770.001817
noncoding29769C29769TCT138138P.10.002174
noncoding29769C29769-C-137137B.10.001255
noncoding29769C29769-C-125125B.1.466.10.899281
noncoding29769C29769TCT118118AZ.2.10.95935
noncoding29769C29769TCT111111AY.420.004466
noncoding29769C29769TCT103103AY.260.002916
noncoding29769C29769TCT102102AY.390.002521
noncoding29769C29769-C-101101B.1.3510.003002
noncoding29769C29769TCT9797B.1.1.2070.114657
noncoding29769C29769-C-9696AY.430.000425
noncoding29769C29769-C-9595B.1.2210.006748
noncoding29769C29769TCT9292B.1.177.810.017418
noncoding29769C29769-C-8989AY.470.002768
noncoding29769C29769-C-8787AY.250.000523
noncoding29769C29769-C-8181B.1.1600.002526
noncoding29769C29769TCT8080B.1.5820.039254
noncoding29769C29769TCT7676B.1.1.4200.076459
noncoding29769C29769TCT6868AY.470.002115
noncoding29769C29769-C-6767B.1.10.001215
noncoding29769C29769-C-6565AY.30.000647
noncoding29769C29769TCT6363AY.290.000994
noncoding29769C29769-C-5959AY.1110.010806
noncoding29769C29769TCT5858AY.50.001198
noncoding29769C29769TCT5555B.1.5960.004793
noncoding29769C29769TCT5252AY.30.000517
noncoding29769C29769TCT4949AY.4.20.001063
noncoding29769C29769-C-4747B.1.2430.00327
noncoding29769C29769TCT4545AY.1000.00207
noncoding29769C29769-C-4545AY.440.000274
noncoding29769C29769TCT4545B.1.2580.002995
noncoding29769C29769-C-4444B.1.3690.01255
noncoding29769C29769-C-4242C.370.004875
noncoding29769C29769-C-4141P.10.000646
noncoding29769C29769TCT4040AY.200.001555
noncoding29769C29769TCT4040B.1.258.170.004159
noncoding29769C29769TCT3737AY.1210.005007
noncoding29769C29769TCT3737AZ.60.310924
noncoding29769C29769-C-3636AY.290.000568
noncoding29769C29769-C-3636B.1.1.3510.100559
noncoding29769C29769TCT3636B.1.2430.002505
noncoding29769C29769TCT3636N.10.610169
noncoding29769C29769TCT3535B.1.4270.001767
noncoding29769C29769-C-3333AY.390.000815
noncoding29769C29769TCT3333B.1.466.20.012911
noncoding29769C29769TCT3232B.1.5260.000752
noncoding29769C29769TCT3131AY.4.50.003332
noncoding29769C29769TCT3131B.1.3510.000922
noncoding29769C29769GCG3030All0.000006
noncoding29769C29769TCT3030B.1.4290.000706
noncoding29769C29769TCT2929B.1.1.5190.001152
noncoding29769C29769TCT2828B.1.1.3170.011527
noncoding29769C29769TCT2626AY.540.002479
noncoding29769C29769ACA2525B.1.617.20.000094
noncoding29769C29769TCT2424B.1.1.330.010101
noncoding29769C29769-C-2323AY.1020.00061
noncoding29769C29769TCT2323AY.39.10.000911
noncoding29769C29769TCT2323B.1.3200.028643
noncoding29769C29769TCT2222AY.330.001469
noncoding29769C29769-C-2222B.1.1.3680.067901
noncoding29769C29769-C-2222B.1.2580.001464
noncoding29769C29769-C-2222B.1.4290.000518
noncoding29769C29769TCT2121AY.230.001465
noncoding29769C29769-C-2121B.1.1.2220.004284
noncoding29769C29769-C-2121B.1.3050.045161
noncoding29769C29769TCT2020AY.1200.000744
noncoding29769C29769TCT2020AY.610.002096
noncoding29769C29769TCT2020AY.7.10.002254
noncoding29769C29769TCT2020AY.750.00112
noncoding29769C29769TCT2020B.1.160.290.084388
noncoding29769C29769-C-1919AY.420.000764
noncoding29769C29769TCT1919AY.90.001284
noncoding29769C29769-C-1919AY.920.005458
noncoding29769C29769TCT1818AY.1050.011576
noncoding29769C29769TCT1717AY.1110.003114
noncoding29769C29769-C-1717AY.5.40.004704
noncoding29769C29769TCT1717AY.60.000699
noncoding29769C29769TCT1717AY.980.001343
noncoding29769C29769-C-1717B.1.1.280.005291
noncoding29769C29769-C-1717B.1.177.560.011348
noncoding29769C29769-C-1616AY.260.000453
noncoding29769C29769-C-1616AY.60.000658
noncoding29769C29769TCT1616B.1.1.1010.16
noncoding29769C29769TCT1616B.1.1.5170.108844
noncoding29769C29769TCT1616B.1.177.440.008303
noncoding29769C29769TCT1515AY.75.10.002705
noncoding29769C29769TCT1515B.1.1.3480.011943
noncoding29769C29769TCT1515B.1.2210.001065
noncoding29769C29769TCT1414AY.34.10.007139
noncoding29769C29769TCT1414AY.450.001704
noncoding29769C29769-C-1414AY.610.001467
noncoding29769C29769-C-1414B.1.4040.018229
noncoding29769C29769-C-1414B.1.5260.000329
noncoding29769C29769-C-1313AY.75.10.002344
noncoding29769C29769-C-1313AY.98.10.00063
noncoding29769C29769-C-1313B.1.1.4200.013078
noncoding29769C29769TCT1313B.1.258.140.012745
noncoding29769C29769TCT1313B.1.36.170.006423
noncoding29769C29769TCT1313B.1.5250.001471
noncoding29769C29769-C-1313P.1.160.004863
noncoding29769C29769-C-1212AY.1180.000752
noncoding29769C29769-C-1212AY.1190.000424
noncoding29769C29769TCT1212B.1.1.2940.01519
noncoding29769C29769-C-1212B.1.177.750.012487
noncoding29769C29769-C-1212B.1.177.860.002201
noncoding29769C29769TCT1212B.1.6190.010453
noncoding29769C29769TCT1212P.20.00224
noncoding29769C29769-C-1111AY.1000.000506
noncoding29769C29769TCT1111AY.1170.00093
noncoding29769C29769TCT1111AY.1190.000388
noncoding29769C29769-C-1111AY.4.20.000239
noncoding29769C29769-C-1111AY.750.000616
noncoding29769C29769TCT1111B.1.1.3980.035484
noncoding29769C29769TCT1111B.1.1.700.003752
noncoding29769C29769TCT1111B.1.3490.007863
noncoding29769C29769-C-1111B.1.360.001605
noncoding29769C29769TCT1111C.370.001277
noncoding29769C29769TCT1010AY.1180.000626
noncoding29769C29769TCT1010AY.460.001041
noncoding29769C29769-C-1010AY.740.001156
noncoding29769C29769-C-1010AY.90.000676
noncoding29769C29769TCT1010B.1.177.790.023419
noncoding29769C29769TCT1010B.1.360.001459
noncoding29769C29769-C-1010B.1.5960.000871
noncoding29769C29769TCT1010B.1.617.10.00129
noncoding29769C29769TCT1010B.1.6210.000885
noncoding29769C29769TCT1010P.1.170.001618
noncoding29769C29769TCT99AY.140.000792
noncoding29769C29769TCT99AY.46.40.001481
noncoding29769C29769TCT99AY.490.028754
noncoding29769C29769TCT99B.1.1.2160.008014
noncoding29769C29769-C-99B.1.1.3180.002716
noncoding29769C29769GCG99B.1.1.70.000008
noncoding29769C29769-C-99B.1.160.140.019068
noncoding29769C29769TCT99B.1.3110.002471
noncoding29769C29769-C-99C.350.006966
noncoding29769C29769TCT99Q.10.001137
noncoding29769C29769TCT88AY.10.003166
noncoding29769C29769TCT88AY.116.10.002491
noncoding29769C29769-C-88AY.1170.000676
noncoding29769C29769TCT88AY.3.10.000682
noncoding29769C29769TCT88AY.360.001186
noncoding29769C29769-C-88AY.450.000973
noncoding29769C29769TCT88AY.46.60.000578
noncoding29769C29769TCT88AY.480.003721
noncoding29769C29769-C-88AY.670.003714
noncoding29769C29769TCT88AY.740.000925
noncoding29769C29769-C-88AY.850.003417
noncoding29769C29769TCT88AY.9.10.00067
noncoding29769C29769-C-88B.1.1.2140.000444
noncoding29769C29769-C-88B.1.1.3030.022099
noncoding29769C29769-C-88B.1.1.3170.003294
noncoding29769C29769-C-88B.1.1.5190.000318
noncoding29769C29769TCT88B.1.177.600.001747
noncoding29769C29769TCT88B.1.2340.001056
noncoding29769C29769-C-88B.1.2400.001725
noncoding29769C29769-C-88B.1.258.200.126984
noncoding29769C29769-C-88B.1.36.290.004139
noncoding29769C29769-C-88B.1.6210.000708
noncoding29769C29769TCT88B.1.621.10.004047
noncoding29769C29769TCT88D.20.0006
noncoding29769C29769-C-88P.1.170.001294
noncoding29769C29769TCT77AY.340.000679
noncoding29769C29769-C-77AY.340.000679
noncoding29769C29769-C-77AY.46.40.001152
noncoding29769C29769TCT77AY.550.006422
noncoding29769C29769TCT77B.1.1.280.002179
noncoding29769C29769TCT77B.1.177.70.001154
noncoding29769C29769-C-77B.1.2340.000924
noncoding29769C29769TCT77B.1.2400.001509
noncoding29769C29769ACA77B.1.3510.000208
noncoding29769C29769-C-77B.1.36.220.008454
noncoding29769C29769TCT77B.1.4700.009831
noncoding29769C29769TCT77C.360.006375
noncoding29769C29769TCT77R.10.00063
noncoding29769C29769-C-66AY.230.000418
noncoding29769C29769-C-66AY.460.000624
noncoding29769C29769TCT66AY.710.00285
noncoding29769C29769TCT66AY.9.20.00022
noncoding29769C29769-C-66AY.980.000474
noncoding29769C29769TCT66AY.99.20.000553
noncoding29769C29769TCT66B.1.1.2220.001224
noncoding29769C29769TCT66B.1.1.2510.047619
noncoding29769C29769TCT66B.1.177.320.008097
noncoding29769C29769-C-66B.1.36.310.010508
noncoding29769C29769TCT66B.1.5950.001566
noncoding29769C29769TCT66B.1.6090.002876
noncoding29769C29769-C-66Q.10.000758
noncoding29769C29769TCT55AT.10.025641
noncoding29769C29769TCT55AY.100.00265
noncoding29769C29769-C-55AY.1140.001156
noncoding29769C29769-C-55AY.1200.000186
noncoding29769C29769-C-55AY.140.00044
noncoding29769C29769-C-55AY.200.000194
noncoding29769C29769TCT55AY.280.009452
noncoding29769C29769ACA55AY.40.000008
noncoding29769C29769TCT55AY.46.50.000992
noncoding29769C29769-C-55AY.540.000477
noncoding29769C29769-C-55AY.9.20.000184
noncoding29769C29769TCT55AY.98.10.000242
noncoding29769C29769-C-55B0.000639
noncoding29769C29769TCT55B.1.1.250.002843
noncoding29769C29769-C-55B.1.1.2840.000537
noncoding29769C29769TCT55B.1.1.3060.002192
noncoding29769C29769TCT55B.1.1110.005875
noncoding29769C29769TCT55B.1.177.770.003631
noncoding29769C29769ACA55B.1.177.860.000917
noncoding29769C29769ACA55B.1.2580.000333
noncoding29769C29769-C-55B.1.258.170.00052
noncoding29769C29769TCT55B.1.36.80.005
noncoding29769C29769TCT55B.1.3960.003529
noncoding29769C29769-C-55B.1.5750.001517
noncoding29769C29769-C-55B.1.6190.004355
noncoding29769C29769TCT55B.400.001821
noncoding29769C29769-C-55P.1.120.00242
noncoding29769C29769TCT55P.1.140.000239
noncoding29769C29769TCT44A0.001548
noncoding29769C29769TCT44AM.30.133333
noncoding29769C29769-C-44AY.120.001264
noncoding29769C29769TCT44AY.23.10.001669
noncoding29769C29769TCT44AY.370.001264
noncoding29769C29769GCG44AY.40.000006
noncoding29769C29769TCT44AY.4.2.10.000596
noncoding29769C29769TCT44AY.530.00115
noncoding29769C29769TCT44AY.690.000747
noncoding29769C29769-C-44AY.690.000747
noncoding29769C29769-C-44AY.950.003044
noncoding29769C29769-C-44B.1.1.10.001307
noncoding29769C29769-C-44B.1.1.1700.004988
noncoding29769C29769TCT44B.1.1.2140.000222
noncoding29769C29769-C-44B.1.1.2880.007663
noncoding29769C29769-C-44B.1.1.330.001684
noncoding29769C29769TCT44B.1.1.3370.014388
noncoding29769C29769TCT44B.1.1.4340.001394
noncoding29769C29769-C-44B.1.1.4640.005891
noncoding29769C29769TCT44B.1.1.500.002716
noncoding29769C29769-C-44B.1.1.5280.019231
noncoding29769C29769-C-44B.1.1040.01476
noncoding29769C29769-C-44B.1.1080.023256
noncoding29769C29769-C-44B.1.160.330.017699
noncoding29769C29769TCT44B.1.177.120.000607
noncoding29769C29769ACA44B.1.2210.000284
noncoding29769C29769TCT44B.1.2350.010076
noncoding29769C29769TCT44B.1.36.290.002069
noncoding29769C29769-C-44B.1.4270.000202
noncoding29769C29769TCT44B.1.5410.017699
noncoding29769C29769-C-44B.1.6090.001918
noncoding29769C29769TCT44B.1.6280.001409
noncoding29769C29769-C-44C.10.009569
noncoding29769C29769TCT44C.180.010363
noncoding29769C29769TCT44C.36.30.002269
noncoding29769C29769ACA44C.37.10.010471
noncoding29769C29769-C-44C.37.10.010471
noncoding29769C29769-C-44D.20.0003
noncoding29769C29769GCG44P.10.000063
noncoding29769C29769-C-44P.1.140.000191
noncoding29769C29769TCT44P.1.70.001277
noncoding29769C29769TCT44P.30.00638
noncoding29769C29769TCT33A.270.004967
noncoding29769C29769TCT33AY.1080.003308
noncoding29769C29769-C-33AY.1090.002219
noncoding29769C29769TCT33AY.1100.000338
noncoding29769C29769TCT33AY.130.000483
noncoding29769C29769TCT33AY.240.001293
noncoding29769C29769-C-33AY.3.10.000256
noncoding29769C29769-C-33AY.300.001187
noncoding29769C29769TCT33AY.4.30.002525
noncoding29769C29769TCT33AY.5.30.001012
noncoding29769C29769TCT33AY.5.40.00083
noncoding29769C29769TCT33AY.590.001589
noncoding29769C29769-C-33AY.590.001589
noncoding29769C29769-C-33AY.650.001599
noncoding29769C29769-C-33AY.700.000626
noncoding29769C29769TCT33AY.730.001996
noncoding29769C29769-C-33AY.840.001312
noncoding29769C29769TCT33AY.920.000862
noncoding29769C29769-C-33AY.99.20.000276
noncoding29769C29769TCT33B0.000383
noncoding29769C29769ACA33B.1.10.000054
noncoding29769C29769TCT33B.1.1.1410.006036
noncoding29769C29769TCT33B.1.1.1710.011029
noncoding29769C29769-C-33B.1.1.2360.02069
noncoding29769C29769TCT33B.1.1.2840.000322
noncoding29769C29769TCT33B.1.1.2910.002227
noncoding29769C29769TCT33B.1.1.2970.006711
noncoding29769C29769TCT33B.1.1.3260.005282
noncoding29769C29769TCT33B.1.1.3970.006757
noncoding29769C29769-C-33B.1.1.4280.028302
noncoding29769C29769-C-33B.1.1.4320.003797
noncoding29769C29769TCT33B.1.1.4480.006098
noncoding29769C29769-C-33B.1.1.460.0131
noncoding29769C29769TCT33B.1.1.4610.036145
noncoding29769C29769TCT33B.1.1470.002268
noncoding29769C29769ACA33B.1.1770.00004
noncoding29769C29769TCT33B.1.177.40.000633
noncoding29769C29769TCT33B.1.177.50.003727
noncoding29769C29769TCT33B.1.177.540.001819
noncoding29769C29769-C-33B.1.177.720.010169
noncoding29769C29769GCG33B.1.20.000026
noncoding29769C29769-C-33B.1.2100.006397
noncoding29769C29769-C-33B.1.214.20.001799
noncoding29769C29769TCT33B.1.2320.001612
noncoding29769C29769-C-33B.1.2980.006342
noncoding29769C29769TCT33B.1.351.20.000908
noncoding29769C29769-C-33B.1.36.160.004274
noncoding29769C29769-C-33B.1.416.10.004687
noncoding29769C29769-C-33B.1.440.025
noncoding29769C29769TCT33B.1.4620.021739
noncoding29769C29769TCT33B.1.4740.005703
noncoding29769C29769TCT33B.1.5760.00272
noncoding29769C29769-C-33B.1.5820.001472
noncoding29769C29769-C-33B.1.5950.000783
noncoding29769C29769ACA33B.1.6190.002613
noncoding29769C29769-C-33B.1.6370.000219
noncoding29769C29769TCT33B.1.6370.000219
noncoding29769C29769-C-33B.1.9.40.018405
noncoding29769C29769-C-33B.1.910.006224
noncoding29769C29769-C-33C.360.002732
noncoding29769C29769ACA33C.360.002732
noncoding29769C29769ACA33P.1.10.000953
noncoding29769C29769TCT33P.1.120.001452
noncoding29769C29769TCT33P.1.150.000697
noncoding29769C29769-C-33P.1.150.000697
noncoding29769C29769ACA33P.1.160.001122
noncoding29769C29769ACA33P.20.00056
noncoding29769C29769-C-33Q.30.000435
noncoding29769C29769-C-22A0.000774
noncoding29769C29769TCT22A.10.000564
noncoding29769C29769TCT22A.20.001324
noncoding29769C29769TCT22A.2.50.000998
noncoding29769C29769-C-22A.2.50.000998
noncoding29769C29769TCT22AD.20.000438
noncoding29769C29769TCT22AY.1010.000981
noncoding29769C29769TCT22AY.1060.00067
noncoding29769C29769-C-22AY.1100.000225
noncoding29769C29769TCT22AY.1160.000574
noncoding29769C29769TCT22AY.320.001065
noncoding29769C29769-C-22AY.330.000134
noncoding29769C29769-C-22AY.350.000466
noncoding29769C29769-C-22AY.400.001929
noncoding29769C29769GCG22AY.430.000009
noncoding29769C29769TCT22AY.46.30.001867
noncoding29769C29769-C-22AY.46.30.001867
noncoding29769C29769-C-22AY.46.60.000144
noncoding29769C29769-C-22AY.5.30.000675
noncoding29769C29769-C-22AY.560.00321
noncoding29769C29769TCT22AY.580.001815
noncoding29769C29769-C-22AY.620.000871
noncoding29769C29769TCT22AY.70.000392
noncoding29769C29769TCT22AY.820.002714
noncoding29769C29769TCT22AY.850.000854
noncoding29769C29769TCT22AY.890.009804
noncoding29769C29769TCT22AY.950.001522
noncoding29769C29769ACA22AY.99.20.000184
noncoding29769C29769-C-22AZ.20.001642
noncoding29769C29769-C-22AZ.40.006711
noncoding29769C29769TCT22B.1.1.10.000653
noncoding29769C29769TCT22B.1.1.1170.019417
noncoding29769C29769TCT22B.1.1.1760.000879
noncoding29769C29769-C-22B.1.1.250.001137
noncoding29769C29769-C-22B.1.1.2790.002242
noncoding29769C29769-C-22B.1.1.2940.002532
noncoding29769C29769-C-22B.1.1.2980.001724
noncoding29769C29769-C-22B.1.1.3060.000877
noncoding29769C29769TCT22B.1.1.3440.021505
noncoding29769C29769-C-22B.1.1.3480.001592
noncoding29769C29769-C-22B.1.1.3540.008772
noncoding29769C29769TCT22B.1.1.370.000386
noncoding29769C29769-C-22B.1.1.370.000386
noncoding29769C29769TCT22B.1.1.3720.001377
noncoding29769C29769-C-22B.1.1.390.001019
noncoding29769C29769TCT22B.1.1.4300.083333
noncoding29769C29769-C-22B.1.1.500.001358
noncoding29769C29769ACA22B.1.1.5190.000079
noncoding29769C29769ACA22B.1.1600.000062
noncoding29769C29769-C-22B.1.177.120.000303
noncoding29769C29769TCT22B.1.177.160.001329
noncoding29769C29769-C-22B.1.177.440.001038
noncoding29769C29769ACA22B.1.177.620.002384
noncoding29769C29769-C-22B.1.177.650.001331
noncoding29769C29769-C-22B.1.2060.001631
noncoding29769C29769-C-22B.1.2410.001623
noncoding29769C29769TCT22B.1.258.160.003273
noncoding29769C29769ACA22B.1.258.170.000208
noncoding29769C29769-C-22B.1.258.30.00335
noncoding29769C29769TCT22B.1.3360.004878
noncoding29769C29769TCT22B.1.36.10.002281
noncoding29769C29769TCT22B.1.36.180.00084
noncoding29769C29769-C-22B.1.36.80.002
noncoding29769C29769TCT22B.1.3670.001585
noncoding29769C29769TCT22B.1.3690.00057
noncoding29769C29769TCT22B.1.3910.002255
noncoding29769C29769TCT22B.1.4000.000858
noncoding29769C29769-C-22B.1.4000.000858
noncoding29769C29769TCT22B.1.4040.002604
noncoding29769C29769TCT22B.1.4090.001563
noncoding29769C29769-C-22B.1.4090.001563
noncoding29769C29769TCT22B.1.4220.001625
noncoding29769C29769TCT22B.1.4260.002018
noncoding29769C29769-C-22B.1.4280.002041
noncoding29769C29769TCT22B.1.4360.002058
noncoding29769C29769-C-22B.1.4410.019231
noncoding29769C29769TCT22B.1.4530.006472
noncoding29769C29769TCT22B.1.4590.008163
noncoding29769C29769-C-22B.1.4600.035714
noncoding29769C29769TCT22B.1.4830.222222
noncoding29769C29769TCT22B.1.5170.000854
noncoding29769C29769ACA22B.1.5250.000226
noncoding29769C29769TCT22B.1.5270.007407
noncoding29769C29769-C-22B.1.564.10.003155
noncoding29769C29769-C-22B.1.5650.001621
noncoding29769C29769-C-22B.1.5760.001813
noncoding29769C29769TCT22B.1.5770.001375
noncoding29769C29769-C-22B.310.007463
noncoding29769C29769-C-22B.390.004662
noncoding29769C29769-C-22B.400.000729
noncoding29769C29769-C-22B.60.00182
noncoding29769C29769-C-22C.30.015267
noncoding29769C29769-C-22C.380.016129
noncoding29769C29769TCT22N.50.003534
noncoding29769C29769-C-22N.50.003534
noncoding29769C29769TCT22P.1.100.000539
noncoding29769C29769TCT22P.1.10.10.01626
noncoding29769C29769ACA22P.1.170.000324
noncoding29769C29769-C-22P.1.70.000639
noncoding29769C29769ACA22Q.10.000253
noncoding29769C29769TCT22Q.30.00029
noncoding29769C29769TCT22Q.40.00091
noncoding29769C29769TCT22Q.80.00033
noncoding29769C29769-C-22R.10.00018
noncoding29769C29769ACA11A.10.000282
noncoding29769C29769TCT11A.210.00277
noncoding29769C29769TCT11A.23.10.000704
noncoding29769C29769TCT11A.50.001923
noncoding29769C29769-C-11AD.20.000219
noncoding29769C29769TCT11AH.30.003802
noncoding29769C29769-C-11AK.20.045455
noncoding29769C29769TCT11AM.40.003571
noncoding29769C29769-C-11AY.100.00053
noncoding29769C29769ACA11AY.1000.000046
noncoding29769C29769ACA11AY.1010.00049
noncoding29769C29769ACA11AY.1020.000027
noncoding29769C29769ACA11AY.1030.000006
noncoding29769C29769-C-11AY.1060.000335
noncoding29769C29769TCT11AY.1090.00074
noncoding29769C29769TCT11AY.110.001339
noncoding29769C29769TCT11AY.1130.000142
noncoding29769C29769-C-11AY.120.10.000321
noncoding29769C29769-C-11AY.130.000161
noncoding29769C29769-C-11AY.160.00038
noncoding29769C29769TCT11AY.16.10.00047
noncoding29769C29769TCT11AY.190.00114
noncoding29769C29769TCT11AY.210.001898
noncoding29769C29769ACA11AY.230.00007
noncoding29769C29769ACA11AY.23.10.000417
noncoding29769C29769-C-11AY.240.000431
noncoding29769C29769GCG11AY.250.000006
noncoding29769C29769-C-11AY.270.000065
noncoding29769C29769TCT11AY.29.10.000221
noncoding29769C29769-C-11AY.29.10.000221
noncoding29769C29769GCG11AY.330.000067
noncoding29769C29769-C-11AY.360.000148
noncoding29769C29769ACA11AY.380.000499
noncoding29769C29769-C-11AY.39.10.00004
noncoding29769C29769TCT11AY.4.10.000737
noncoding29769C29769ACA11AY.4.20.000022
noncoding29769C29769-C-11AY.4.2.10.000149
noncoding29769C29769TCT11AY.4.40.000409
noncoding29769C29769TCT11AY.400.000964
noncoding29769C29769ACA11AY.430.000004
noncoding29769C29769ACA11AY.440.000006
noncoding29769C29769TCT11AY.46.10.001027
noncoding29769C29769ACA11AY.46.40.000165
noncoding29769C29769-C-11AY.480.000465
noncoding29769C29769-C-11AY.510.000909
noncoding29769C29769TCT11AY.510.000909
noncoding29769C29769-C-11AY.520.000814
noncoding29769C29769ACA11AY.610.000105
noncoding29769C29769ACA11AY.620.000436
noncoding29769C29769TCT11AY.680.000274
noncoding29769C29769ACA11AY.690.000187
noncoding29769C29769-C-11AY.70.000196
noncoding29769C29769TCT11AY.7.20.000559
noncoding29769C29769TCT11AY.700.000209
noncoding29769C29769TCT11AY.720.001361
noncoding29769C29769ACA11AY.75.10.00018
noncoding29769C29769TCT11AY.770.001127
noncoding29769C29769-C-11AY.800.001129
noncoding29769C29769-C-11AY.810.001992
noncoding29769C29769-C-11AY.870.000833
noncoding29769C29769-C-11AY.9.10.000084
noncoding29769C29769TCT11AY.9.2.10.001976
noncoding29769C29769TCT11AY.990.001049
noncoding29769C29769ACA11B.10.000009
noncoding29769C29769-C-11B.1.1.100.001115
noncoding29769C29769TCT11B.1.1.1420.017544
noncoding29769C29769-C-11B.1.1.1610.003534
noncoding29769C29769TCT11B.1.1.1630.007634
noncoding29769C29769-C-11B.1.1.1660.033333
noncoding29769C29769TCT11B.1.1.1700.001247
noncoding29769C29769-C-11B.1.1.1740.003378
noncoding29769C29769TCT11B.1.1.1890.001513
noncoding29769C29769ACA11B.1.1.1920.002309
noncoding29769C29769TCT11B.1.1.1940.00495
noncoding29769C29769-C-11B.1.1.1960.005714
noncoding29769C29769-C-11B.1.1.1970.037037
noncoding29769C29769GCG11B.1.1.2140.000055
noncoding29769C29769-C-11B.1.1.2160.00089
noncoding29769C29769TCT11B.1.1.2180.007692
noncoding29769C29769-C-11B.1.1.2180.007692
noncoding29769C29769TCT11B.1.1.2200.001859
noncoding29769C29769-C-11B.1.1.2210.010101
noncoding29769C29769-C-11B.1.1.2290.005747
noncoding29769C29769GCG11B.1.1.2310.003096
noncoding29769C29769TCT11B.1.1.2360.006897
noncoding29769C29769TCT11B.1.1.2370.005405
noncoding29769C29769ACA11B.1.1.250.000569
noncoding29769C29769-C-11B.1.1.2740.005051
noncoding29769C29769-C-11B.1.1.2770.000759
noncoding29769C29769TCT11B.1.1.2770.000759
noncoding29769C29769-C-11B.1.1.2860.002899
noncoding29769C29769TCT11B.1.1.2880.001916
noncoding29769C29769TCT11B.1.1.2980.000862
noncoding29769C29769TCT11B.1.1.3050.003861
noncoding29769C29769TCT11B.1.1.310.066667
noncoding29769C29769TCT11B.1.1.3120.001912
noncoding29769C29769ACA11B.1.1.3170.000412
noncoding29769C29769TCT11B.1.1.3280.016949
noncoding29769C29769-C-11B.1.1.3370.003597
noncoding29769C29769TCT11B.1.1.3540.004386
noncoding29769C29769TCT11B.1.1.3750.011905
noncoding29769C29769TCT11B.1.1.4090.002833
noncoding29769C29769-C-11B.1.1.4090.002833
noncoding29769C29769-C-11B.1.1.4130.006897
noncoding29769C29769TCT11B.1.1.430.014925
noncoding29769C29769TCT11B.1.1.4320.001266
noncoding29769C29769TCT11B.1.1.4420.018519
noncoding29769C29769TCT11B.1.1.460.004367
noncoding29769C29769TCT11B.1.1.4620.008621
noncoding29769C29769TCT11B.1.1.4630.0625
noncoding29769C29769ACA11B.1.1.480.002874
noncoding29769C29769TCT11B.1.1.4860.001577
noncoding29769C29769TCT11B.1.1.5210.005348
noncoding29769C29769TCT11B.1.1.5230.001563
noncoding29769C29769-C-11B.1.1.5230.001563
noncoding29769C29769ACA11B.1.1.5230.001563
noncoding29769C29769TCT11B.1.1.5260.003546
noncoding29769C29769-C-11B.1.1.5260.003546
noncoding29769C29769TCT11B.1.1.540.003021
noncoding29769C29769-C-11B.1.1.540.003021
noncoding29769C29769-C-11B.1.1.630.000386
noncoding29769C29769TCT11B.1.1.710.006061
noncoding29769C29769-C-11B.1.1.750.010638
noncoding29769C29769TCT11B.1.1.870.066667
noncoding29769C29769-C-11B.1.1.990.02381
noncoding29769C29769TCT11B.1.1040.00369
noncoding29769C29769-C-11B.1.1100.004525
noncoding29769C29769TCT11B.1.110.30.000718
noncoding29769C29769-C-11B.1.1110.001175
noncoding29769C29769TCT11B.1.1190.010526
noncoding29769C29769TCT11B.1.1260.001276
noncoding29769C29769TCT11B.1.1310.008772
noncoding29769C29769TCT11B.1.1450.052632
noncoding29769C29769TCT11B.1.160.280.002924
noncoding29769C29769-C-11B.1.160.320.004292
noncoding29769C29769TCT11B.1.177.100.000878
noncoding29769C29769-C-11B.1.177.110.001698
noncoding29769C29769TCT11B.1.177.210.000076
noncoding29769C29769TCT11B.1.177.280.007407
noncoding29769C29769TCT11B.1.177.310.011494
noncoding29769C29769-C-11B.1.177.320.00135
noncoding29769C29769TCT11B.1.177.330.001645
noncoding29769C29769TCT11B.1.177.350.000691
noncoding29769C29769-C-11B.1.177.40.000211
noncoding29769C29769-C-11B.1.177.420.000894
noncoding29769C29769-C-11B.1.177.540.000606
noncoding29769C29769TCT11B.1.177.570.000281
noncoding29769C29769-C-11B.1.177.570.000281
noncoding29769C29769-C-11B.1.177.60.000977
noncoding29769C29769TCT11B.1.177.730.000566
noncoding29769C29769ACA11B.1.177.730.000566
noncoding29769C29769-C-11B.1.177.810.000189
noncoding29769C29769TCT11B.1.177.870.000728
noncoding29769C29769-C-11B.1.1920.009259
noncoding29769C29769TCT11B.1.2060.000816
noncoding29769C29769TCT11B.1.2140.003663
noncoding29769C29769TCT11B.1.214.20.0006
noncoding29769C29769-C-11B.1.2220.001692
noncoding29769C29769TCT11B.1.2370.004975
noncoding29769C29769-C-11B.1.258.240.010753
noncoding29769C29769-C-11B.1.2600.003344
noncoding29769C29769TCT11B.1.2840.013158
noncoding29769C29769TCT11B.1.3130.006579
noncoding29769C29769TCT11B.1.3240.001605
noncoding29769C29769-C-11B.1.3290.000608
noncoding29769C29769TCT11B.1.3400.004292
noncoding29769C29769-C-11B.1.3490.000715
noncoding29769C29769TCT11B.1.3500.002933
noncoding29769C29769-C-11B.1.351.20.000303
noncoding29769C29769TCT11B.1.351.30.000876
noncoding29769C29769-C-11B.1.351.30.000876
noncoding29769C29769TCT11B.1.3550.011111
noncoding29769C29769TCT11B.1.36.160.001425
noncoding29769C29769-C-11B.1.36.180.00042
noncoding29769C29769-C-11B.1.36.190.009259
noncoding29769C29769TCT11B.1.36.270.000763
noncoding29769C29769TCT11B.1.36.350.002604
noncoding29769C29769TCT11B.1.36.380.001642
noncoding29769C29769TCT11B.1.3610.001289
noncoding29769C29769-C-11B.1.3620.001541
noncoding29769C29769-C-11B.1.3630.012987
noncoding29769C29769-C-11B.1.3670.000792
noncoding29769C29769TCT11B.1.3890.001002
noncoding29769C29769GCG11B.1.4000.000429
noncoding29769C29769TCT11B.1.4060.006061
noncoding29769C29769TCT11B.1.415.10.007576
noncoding29769C29769TCT11B.1.4160.001269
noncoding29769C29769-C-11B.1.4160.001269
noncoding29769C29769-C-11B.1.4200.010417
noncoding29769C29769ACA11B.1.4290.000024
noncoding29769C29769TCT11B.1.4390.005917
noncoding29769C29769TCT11B.1.4560.003268
noncoding29769C29769-C-11B.1.4620.007246
noncoding29769C29769-C-11B.1.4700.001404
noncoding29769C29769ACA11B.1.4970.000315
noncoding29769C29769TCT11B.1.4970.000315
noncoding29769C29769TCT11B.1.4990.00105
noncoding29769C29769-C-11B.1.5060.02381
noncoding29769C29769-C-11B.1.5090.000866
noncoding29769C29769TCT11B.1.5110.034483
noncoding29769C29769TCT11B.1.5240.001406
noncoding29769C29769TCT11B.1.5400.009709
noncoding29769C29769TCT11B.1.5600.00463
noncoding29769C29769TCT11B.1.5610.000397
noncoding29769C29769TCT11B.1.5640.000426
noncoding29769C29769TCT11B.1.5650.00081
noncoding29769C29769TCT11B.1.5680.001111
noncoding29769C29769TCT11B.1.5750.000303
noncoding29769C29769ACA11B.1.5890.007576
noncoding29769C29769-C-11B.1.595.10.005848
noncoding29769C29769TCT11B.1.595.10.005848
noncoding29769C29769TCT11B.1.5990.00365
noncoding29769C29769TCT11B.1.6000.005848
noncoding29769C29769-C-11B.1.617.10.000129
noncoding29769C29769GCG11B.1.617.20.000004
noncoding29769C29769-C-11B.1.617.30.002985
noncoding29769C29769TCT11B.1.617.30.002985
noncoding29769C29769-C-11B.1.619.10.000641
noncoding29769C29769TCT11B.1.6200.000946
noncoding29769C29769-C-11B.1.6300.005236
noncoding29769C29769ACA11B.1.6370.000073
noncoding29769C29769-C-11B.1.9.50.005682
noncoding29769C29769TCT11B.30.000831
noncoding29769C29769-C-11B.3.10.001658
noncoding29769C29769TCT11B.390.002331
noncoding29769C29769TCT11B.450.003831
noncoding29769C29769-C-11B.550.00295
noncoding29769C29769TCT11C.1.20.004255
noncoding29769C29769TCT11C.110.010638
noncoding29769C29769-C-11C.300.001727
noncoding29769C29769-C-11C.36.30.000567
noncoding29769C29769ACA11C.36.30.000567
noncoding29769C29769TCT11C.36.3.10.002717
noncoding29769C29769TCT11C.37.10.002618
noncoding29769C29769TCT11C.40.01
noncoding29769C29769GCG11D.20.000075
noncoding29769C29769GCG11K.10.02381
noncoding29769C29769-C-11L.30.003546
noncoding29769C29769-C-11P.1.10.000318
noncoding29769C29769-C-11P.1.100.000269
noncoding29769C29769TCT11P.1.130.000898
noncoding29769C29769ACA11P.1.150.000232
noncoding29769C29769TCT11P.1.20.001156
noncoding29769C29769TCT11P.1.40.000977
noncoding29769C29769-C-11P.20.000187
noncoding29769C29769-C-11P.60.003145
noncoding29769C29769-C-11Q.20.000613
noncoding29769C29769-C-11W.40.001351

CoV-GLUE is still in development. CoV-GLUE was originally developed as part of COG-UK by Josh Singer using the GLUE framework at the MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research (CVR). In 2021 it was redeveloped by Richard Orton to scale to the millions of genome sequences available. We acknowledge support from the MRC (MC_UU_12014/12), WT (220977/Z/20/Z) and UKRI G2P (MR/W005611/1). Please contact Richard Orton with any queries: Richard.Orton@glasgow.ac.uk

CoV-GLUE uses sequence data from GISAID. GISAID data provided via this web application is subject to GISAID's Terms and Conditions.