CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = noncoding : CodonNum = 27198

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
noncoding27198A27198-noncodingA-298298127198-27198
noncoding27198A27198GnoncodingAG225225127198-27198
noncoding27198A27198TnoncodingAT147147127198-27198
noncoding27198A27198CnoncodingAC44127198-27198
noncoding27198A27198DnoncodingAD22127198-27198
noncoding27198A27198HnoncodingAH11127198-27198

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
noncoding27198A27198-A-298298All0.000057
noncoding27198A27198GAG225225All0.000043
noncoding27198A27198TAT147147All0.000028
noncoding27198A27198-A-146146B.1.177.210.011165
noncoding27198A27198GAG113113AY.250.00068
noncoding27198A27198TAT8787B.1.617.20.000328
noncoding27198A27198-A-2828AY.40.000044
noncoding27198A27198-A-2323B.1.1.70.000021
noncoding27198A27198GAG1414AY.440.000085
noncoding27198A27198GAG1111AY.40.000017
noncoding27198A27198TAT99AY.1030.000056
noncoding27198A27198-A-99B.1.617.20.000034
noncoding27198A27198-A-88B.10.000073
noncoding27198A27198GAG88B.1.1.70.000007
noncoding27198A27198TAT77AY.1020.000186
noncoding27198A27198TAT77AY.250.000042
noncoding27198A27198-A-77AY.290.00011
noncoding27198A27198TAT77AY.40.000011
noncoding27198A27198GAG77B.1.5050.030702
noncoding27198A27198-A-66B.1.20.000053
noncoding27198A27198GAG55A.300.714286
noncoding27198A27198GAG55AY.1030.000031
noncoding27198A27198-A-55AY.250.00003
noncoding27198A27198-A-55AY.39.10.000198
noncoding27198A27198CAC44All0.000001
noncoding27198A27198-A-44AY.30.00004
noncoding27198A27198GAG44AY.920.001149
noncoding27198A27198GAG44B.10.000037
noncoding27198A27198GAG44B.1.1600.000125
noncoding27198A27198GAG44B.1.617.20.000015
noncoding27198A27198GAG44B.3.10.006633
noncoding27198A27198GAG44P.10.000063
noncoding27198A27198-A-33AY.1030.000019
noncoding27198A27198TAT33AY.390.000074
noncoding27198A27198-A-33AY.420.000121
noncoding27198A27198-A-33AY.430.000013
noncoding27198A27198-A-33AY.440.000018
noncoding27198A27198-A-33AY.50.000062
noncoding27198A27198-A-33AY.590.001589
noncoding27198A27198TAT33B.10.000027
noncoding27198A27198GAG33B.1.10.000054
noncoding27198A27198TAT33B.1.1.3160.002775
noncoding27198A27198-A-33B.1.1600.000094
noncoding27198A27198TAT33B.1.177.810.000568
noncoding27198A27198GAG33B.1.2210.000213
noncoding27198A27198GAG33B.1.4970.000944
noncoding27198A27198DAD22All0
noncoding27198A27198-A-22AY.1200.000074
noncoding27198A27198GAG22AY.120.2.10.000997
noncoding27198A27198-A-22AY.16.10.00094
noncoding27198A27198GAG22AY.200.000078
noncoding27198A27198TAT22AY.440.000012
noncoding27198A27198GAG22AY.460.000208
noncoding27198A27198-A-22AY.60.000082
noncoding27198A27198TAT22AY.660.002139
noncoding27198A27198GAG22AY.7.10.000225
noncoding27198A27198-A-22AY.740.000231
noncoding27198A27198DAD22B.10.000018
noncoding27198A27198-A-22B.1.10.000036
noncoding27198A27198GAG22B.1.5260.000047
noncoding27198A27198HAH11All0
noncoding27198A27198-A-11AY.10.000396
noncoding27198A27198-A-11AY.1000.000046
noncoding27198A27198GAG11AY.1090.00074
noncoding27198A27198-A-11AY.1100.000113
noncoding27198A27198TAT11AY.1110.000183
noncoding27198A27198GAG11AY.1160.000287
noncoding27198A27198-A-11AY.1180.000063
noncoding27198A27198-A-11AY.1190.000035
noncoding27198A27198CAC11AY.250.000006
noncoding27198A27198GAG11AY.30.00001
noncoding27198A27198-A-11AY.370.000316
noncoding27198A27198GAG11AY.390.000025
noncoding27198A27198GAG11AY.410.000294
noncoding27198A27198GAG11AY.430.000004
noncoding27198A27198TAT11AY.460.000104
noncoding27198A27198-A-11AY.470.000031
noncoding27198A27198GAG11AY.470.000031
noncoding27198A27198GAG11AY.50.000021
noncoding27198A27198-A-11AY.580.000907
noncoding27198A27198TAT11AY.670.000464
noncoding27198A27198-A-11AY.670.000464
noncoding27198A27198TAT11AY.680.000274
noncoding27198A27198GAG11AY.730.000665
noncoding27198A27198GAG11AY.750.000056
noncoding27198A27198-A-11AY.760.004831
noncoding27198A27198TAT11AY.840.000437
noncoding27198A27198-A-11AY.880.000884
noncoding27198A27198-A-11AZ.10.000867
noncoding27198A27198CAC11B.10.000009
noncoding27198A27198HAH11B.10.000009
noncoding27198A27198TAT11B.1.10.000018
noncoding27198A27198-A-11B.1.1.2630.001558
noncoding27198A27198TAT11B.1.1.3060.000438
noncoding27198A27198TAT11B.1.1.3170.000412
noncoding27198A27198GAG11B.1.1.3170.000412
noncoding27198A27198TAT11B.1.1.3180.000302
noncoding27198A27198-A-11B.1.1.4130.006897
noncoding27198A27198GAG11B.1.1.4170.002703
noncoding27198A27198-A-11B.1.1.5190.00004
noncoding27198A27198-A-11B.1.1150.021739
noncoding27198A27198-A-11B.1.1770.000013
noncoding27198A27198TAT11B.1.1770.000013
noncoding27198A27198GAG11B.1.1770.000013
noncoding27198A27198GAG11B.1.177.210.000076
noncoding27198A27198-A-11B.1.177.440.000519
noncoding27198A27198GAG11B.1.177.810.000189
noncoding27198A27198TAT11B.1.20.000009
noncoding27198A27198-A-11B.1.2580.000067
noncoding27198A27198GAG11B.1.36.310.001751
noncoding27198A27198TAT11B.1.3750.00082
noncoding27198A27198-A-11B.1.3890.001002
noncoding27198A27198GAG11B.1.4260.001009
noncoding27198A27198TAT11B.1.4270.00005
noncoding27198A27198-A-11B.1.4940.034483
noncoding27198A27198-A-11B.1.5250.000113
noncoding27198A27198-A-11B.1.5960.000087
noncoding27198A27198-A-11B.1.6090.000479
noncoding27198A27198CAC11B.1.617.20.000004
noncoding27198A27198-A-11B.1.6210.000089
noncoding27198A27198GAG11B.1.6280.000352
noncoding27198A27198CAC11P.1.10.000318
noncoding27198A27198GAG11P.1.140.000048
noncoding27198A27198TAT11P.1.170.000162
noncoding27198A27198-A-11R.10.00009