CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = S : Mut = Y144del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
S144Y144deldelTAT---11320571132057121992-21994

Details of the mutation Y144del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
S144Y144delTAT---11320571132057All0.216519
S144Y144delTAT---10623621062362B.1.1.70.951051
S144Y144delTAT---1229412294B.1.6370.898356
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S144Y144delTAT---65176517Q.30.945178
S144Y144delTAT---59515951Q.80.981365
S144Y144delTAT---30173017B.1.1.3180.91038
S144Y144delTAT---21302130B.1.10.03864
S144Y144delTAT---21032103Q.40.956344
S144Y144delTAT---19971997B.10.018292
S144Y144delTAT---15851585Q.20.972393
S144Y144delTAT---11601160AZ.20.952381
S144Y144delTAT---10451045B.1.6200.988647
S144Y144delTAT---887887Q.70.985556
S144Y144delTAT---825825AZ.10.715525
S144Y144delTAT---600600AZ.30.911854
S144Y144delTAT---516516AY.40.000803
S144Y144delTAT---497497B.1.5260.011682
S144Y144delTAT---471471B.1.20.004147
S144Y144delTAT---460460P.10.007247
S144Y144delTAT---400400AY.440.002435
S144Y144delTAT---397397B.1.617.20.001495
S144Y144delTAT---366366AY.430.001622
S144Y144delTAT---365365B.1.3510.01085
S144Y144delTAT---333333B.1.6250.783529
S144Y144delTAT---298298AY.1020.007901
S144Y144delTAT---279279AZ.40.936242
S144Y144delTAT---259259AZ.50.908772
S144Y144delTAT---256256B.1.4290.006023
S144Y144delTAT---250250B.1.5760.226655
S144Y144delTAT---232232B.1.1770.003055
S144Y144delTAT---222222AY.30.002208
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S144Y144delTAT---212212B.1.1.5190.008419
S144Y144delTAT---208208C.1.20.885106
S144Y144delTAT---197197AY.50.004068
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S144Y144delTAT---183183B.1.177.800.349904
S144Y144delTAT---175175B.1.6300.91623
S144Y144delTAT---175175P.30.279107
S144Y144delTAT---165165AY.540.015732
S144Y144delTAT---158158B.1.6210.013986
S144Y144delTAT---157157AT.10.805128
S144Y144delTAT---148148B.1.160.240.654867
S144Y144delTAT---148148Q.60.980132
S144Y144delTAT---146146AY.140.01285
S144Y144delTAT---136136B.1.1.5250.743169
S144Y144delTAT---130130B.1.617.10.016766
S144Y144delTAT---123123AY.160.046697
S144Y144delTAT---120120AZ.2.10.97561
S144Y144delTAT---119119AZ.61
S144Y144delTAT---109109B.1.4270.005504
S144Y144delTAT---107107AY.390.002644
S144Y144delTAT---100100C.380.806452
S144Y144delTAT---9595B.1.177.70.015661
S144Y144delTAT---9191B.1.1600.002838
S144Y144delTAT---9090AY.260.002548
S144Y144delTAT---8888B.1.5960.007668
S144Y144delTAT---8484AY.360.01245
S144Y144delTAT---7272B.1.2580.004791
S144Y144delTAT---7171B.1.258.170.007382
S144Y144delTAT---6868A.2.5.20.106918
S144Y144delTAT---6767B.1.2210.004759
S144Y144delTAT---6767P.1.140.003203
S144Y144delTAT---6666B0.008436
S144Y144delTAT---6565C.370.007544
S144Y144delTAT---5959Q.51
S144Y144delTAT---5555B.1.177.600.012014
S144Y144delTAT---5252AY.46.40.008554
S144Y144delTAT---4646AY.1090.034024
S144Y144delTAT---4545B.1.2430.003131
S144Y144delTAT---4444B.1.6350.77193
S144Y144delTAT---4444XA0.977778
S144Y144delTAT---4343P.1.70.013729
S144Y144delTAT---4242B.1.1.1980.061674
S144Y144delTAT---4141AY.420.001649
S144Y144delTAT---4141B.1.6161
S144Y144delTAT---4040AY.750.002241
S144Y144delTAT---4040B.1.1.3690.017849
S144Y144delTAT---4040P.1.10.012706
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S144Y144delTAT---3939P.1.60.075875
S144Y144delTAT---3535AY.1000.00161
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S144Y144delTAT---3333AY.460.003435
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S144Y144delTAT---2727AY.530.007763
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S144Y144delTAT---2525P.1.120.012101
S144Y144delTAT---2424AY.470.000747
S144Y144delTAT---2424AY.610.002515
S144Y144delTAT---2424B.1.1.2050.089219
S144Y144delTAT---2424B.1.360.003502
S144Y144delTAT---2323AY.75.10.004147
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S144Y144delTAT---2323B.1.2410.018669
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S144Y144delTAT---2222B.1.1.5070.191304
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S144Y144delTAT---1010B.1.6230.005365
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S144Y144delTAT---99AY.1200.000335
S144Y144delTAT---99AY.16.10.004229
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S144Y144delTAT---99B.1.177.40.0019
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S144Y144delTAT---99B.1.6330.375
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S144Y144delTAT---88AY.710.0038
S144Y144delTAT---88AY.950.006088
S144Y144delTAT---88B.1.1.2160.007124
S144Y144delTAT---88B.1.1.4200.008048
S144Y144delTAT---88B.1.1.500.005431
S144Y144delTAT---88B.1.5610.003176
S144Y144delTAT---88B.1.5740.017204
S144Y144delTAT---88B.1.5820.003925
S144Y144delTAT---77A.10.001973
S144Y144delTAT---77A.301
S144Y144delTAT---77AY.1130.000997
S144Y144delTAT---77AY.340.000679
S144Y144delTAT---77AY.380.003495
S144Y144delTAT---77AY.590.003708
S144Y144delTAT---77AY.740.00081
S144Y144delTAT---77AY.990.007345
S144Y144delTAT---77B.1.1.1410.014085
S144Y144delTAT---77B.1.1.3060.003069
S144Y144delTAT---77B.1.1.3680.021605
S144Y144delTAT---77B.1.1.4160.006335
S144Y144delTAT---77B.1.1280.004447
S144Y144delTAT---77B.1.160.260.016949
S144Y144delTAT---77B.1.177.440.003633
S144Y144delTAT---77B.1.177.620.008343
S144Y144delTAT---77B.1.2390.008547
S144Y144delTAT---77B.1.4110.025926
S144Y144delTAT---77B.1.4860.777778
S144Y144delTAT---77B.1.5170.002989
S144Y144delTAT---77B.1.621.10.003541
S144Y144delTAT---77L.30.024823
S144Y144delTAT---66AB.10.04918
S144Y144delTAT---66AE.80.002934
S144Y144delTAT---66AY.1110.001099
S144Y144delTAT---66AY.4.2.10.000894
S144Y144delTAT---66AY.70.001176
S144Y144delTAT---66B.1.1.100.006689
S144Y144delTAT---66B.1.1.1890.009077
S144Y144delTAT---66B.1.1.4340.002091
S144Y144delTAT---66B.1.1.700.002046
S144Y144delTAT---66B.1.2140.021978
S144Y144delTAT---66B.1.351.30.005259
S144Y144delTAT---66B.1.6360.040268
S144Y144delTAT---55AD.20.001095
S144Y144delTAT---55AY.1010.002452
S144Y144delTAT---55AY.210.009488
S144Y144delTAT---55AY.370.00158
S144Y144delTAT---55AY.39.10.000198
S144Y144delTAT---55AY.400.004822
S144Y144delTAT---55AY.5.30.001687
S144Y144delTAT---55AY.510.004545
S144Y144delTAT---55AY.560.008026
S144Y144delTAT---55AY.670.002321
S144Y144delTAT---55B.1.1.3110.001791
S144Y144delTAT---55B.1.1.3720.003444
S144Y144delTAT---55B.1.1.4640.007364
S144Y144delTAT---55B.1.1.5230.007812
S144Y144delTAT---55B.1.2370.024876
S144Y144delTAT---55B.1.36.380.00821
S144Y144delTAT---55B.1.36.80.005
S144Y144delTAT---55B.1.3800.033113
S144Y144delTAT---55B.1.5090.004329
S144Y144delTAT---55B.1.5650.004052
S144Y144delTAT---55B.400.001821
S144Y144delTAT---55C.160.005302
S144Y144delTAT---44AY.1070.001864
S144Y144delTAT---44AY.570.002625
S144Y144delTAT---44AY.840.00175
S144Y144delTAT---44AY.90.00027
S144Y144delTAT---44AY.910.002922
S144Y144delTAT---44AY.980.000316
S144Y144delTAT---44B.1.1.1590.018692
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