CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = S : Mut = S884del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
S884S884deldelTCT---132132124212-24214

Details of the mutation S884del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
S884S884delTCT---132132All0.000025
S884S884delTCT---4747B.1.1.70.000042
S884S884delTCT---77B.1.617.20.000026
S884S884delTCT---66AY.40.000009
S884S884delTCT---66B.1.1770.000079
S884S884delTCT---440.222222
S884S884delTCT---44AY.430.000018
S884S884delTCT---44B.1.20.000035
S884S884delTCT---33AY.4.50.000322
S884S884delTCT---33B.10.000027
S884S884delTCT---22AY.1200.000074
S884S884delTCT---22B.1.5260.000047
S884S884delTCT---11A0.000387
S884S884delTCT---11AH.30.003802
S884S884delTCT---11AY.1110.000183
S884S884delTCT---11AY.190.00114
S884S884delTCT---11AY.250.000006
S884S884delTCT---11AY.360.000148
S884S884delTCT---11AY.440.000006
S884S884delTCT---11AY.46.20.000635
S884S884delTCT---11AY.50.000021
S884S884delTCT---11AY.670.000464
S884S884delTCT---11AY.720.001361
S884S884delTCT---11AY.750.000056
S884S884delTCT---11AY.810.001992
S884S884delTCT---11AY.90.000068
S884S884delTCT---11AY.990.001049
S884S884delTCT---11AY.99.10.001553
S884S884delTCT---11B.1.10.000018
S884S884delTCT---11B.1.1.2360.006897
S884S884delTCT---11B.1.1.3110.000358
S884S884delTCT---11B.1.1.3120.001912
S884S884delTCT---11B.1.177.100.000878
S884S884delTCT---11B.1.177.170.000821
S884S884delTCT---11B.1.177.210.000076
S884S884delTCT---11B.1.177.480.003125
S884S884delTCT---11B.1.177.540.000606
S884S884delTCT---11B.1.177.560.000668
S884S884delTCT---11B.1.177.600.000218
S884S884delTCT---11B.1.177.630.002703
S884S884delTCT---11B.1.177.870.000728
S884S884delTCT---11B.1.1790.003759
S884S884delTCT---11B.1.2210.000071
S884S884delTCT---11B.1.2580.000067
S884S884delTCT---11B.1.2790.000514
S884S884delTCT---11B.1.360.000146
S884S884delTCT---11B.1.36.170.000494
S884S884delTCT---11B.1.36.180.00042
S884S884delTCT---11B.1.5770.000687
S884S884delTCT---11B.1.6300.005236
S884S884delTCT---11P.1.100.000269
S884S884delTCT---11P.1.130.000898
S884S884delTCT---11Q.10.000126
S884S884delTCT---11Q.80.000165
S884S884delTCT---11U.30.003861
S884S884delTCT---11W.40.001351