CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = S : Mut = S256del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
S256S256deldelTCA---180180122328-22330

Details of the mutation S256del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
S256S256delTCA---180180All0.000034
S256S256delTCA---4545B.1.1.70.00004
S256S256delTCA---3030N.100.882353
S256S256delTCA---88AY.430.000035
S256S256delTCA---77P.10.00011
S256S256delTCA---66B.1.1.330.002525
S256S256delTCA---66B.1.5250.000679
S256S256delTCA---66B.1.6210.000531
S256S256delTCA---66P.1.150.001394
S256S256delTCA---55B.10.000046
S256S256delTCA---55B.1.617.20.000019
S256S256delTCA---44AY.250.000024
S256S256delTCA---44AY.290.000063
S256S256delTCA---44B.1.351.20.00121
S256S256delTCA---22AY.1020.000053
S256S256delTCA---22AY.40.000003
S256S256delTCA---22AY.4.50.000215
S256S256delTCA---22AY.440.000012
S256S256delTCA---22AY.650.001066
S256S256delTCA---22B.1.1770.000026
S256S256delTCA---22B.1.20.000018
S256S256delTCA---22B.1.4290.000047
S256S256delTCA---22B.1.6300.010471
S256S256delTCA---11A0.000387
S256S256delTCA---11A.2.50.000499
S256S256delTCA---11AV.10.005051
S256S256delTCA---11AY.1010.00049
S256S256delTCA---11AY.1170.000085
S256S256delTCA---11AY.1180.000063
S256S256delTCA---11AY.30.00001
S256S256delTCA---11AY.330.000067
S256S256delTCA---11AY.470.000031
S256S256delTCA---11AY.60.000041
S256S256delTCA---11AY.670.000464
S256S256delTCA---11AY.9.20.000037
S256S256delTCA---11AY.950.000761
S256S256delTCA---11B.1.10.000018
S256S256delTCA---11B.1.1.1590.004673
S256S256delTCA---11B.1.177.160.000664
S256S256delTCA---11B.1.177.690.001484
S256S256delTCA---11B.1.2210.000071
S256S256delTCA---11B.1.36.180.00042
S256S256delTCA---11B.1.5610.000397
S256S256delTCA---11B.1.5950.000261
S256S256delTCA---11B.1.6200.000946
S256S256delTCA---11B.550.00295
S256S256delTCA---11C.370.000116
S256S256delTCA---11P.1.10.000318
S256S256delTCA---11Q.40.000455