CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = S : Mut = L242del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
S242L242deldelCTT---3920539205122286-22288

Details of the mutation L242del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
S242L242delCTT---3920539205All0.007498
S242L242delCTT---3021630216B.1.3510.898216
S242L242delCTT---31363136B.1.351.20.948865
S242L242delCTT---13901390B.1.351.50.833333
S242L242delCTT---10351035B.1.351.30.907099
S242L242delCTT---10121012B.1.6200.957427
S242L242delCTT---649649AY.40.00101
S242L242delCTT---371371B.1.1.70.000332
S242L242delCTT---307307B.10.002812
S242L242delCTT---126126B.1.415.10.954545
S242L242delCTT---5555B.1.617.20.000207
S242L242delCTT---4848B.1.10.000871
S242L242delCTT---4141AY.250.000247
S242L242delCTT---4040AY.1030.000248
S242L242delCTT---4040AY.430.000177
S242L242delCTT---3636AY.440.000219
S242L242delCTT---3131B.1.20.000273
S242L242delCTT---2626AY.30.000259
S242L242delCTT---2626B.1.1600.000811
S242L242delCTT---2525B.1.1770.000329
S242L242delCTT---2424B.1.5260.000564
S242L242delCTT---2323P.10.000362
S242L242delCTT---2121B.1.4290.000494
S242L242delCTT---2020AY.1190.000706
S242L242delCTT---1919P.30.030303
S242L242delCTT---1717B.1.6360.114094
S242L242delCTT---1616C.370.001857
S242L242delCTT---1313B.1.2210.000923
S242L242delCTT---1212B.1.177.70.001978
S242L242delCTT---1111AY.260.000311
S242L242delCTT---1010B.1.177.860.001835
S242L242delCTT---1010P.1.150.002323
S242L242delCTT---99AY.1020.000239
S242L242delCTT---99AY.230.000628
S242L242delCTT---99AY.4.20.000195
S242L242delCTT---99B0.00115
S242L242delCTT---99B.1.5250.001018
S242L242delCTT---99B.1.5540.039648
S242L242delCTT---88B.1.177.730.00453
S242L242delCTT---88B.1.5950.002088
S242L242delCTT---77AY.390.000173
S242L242delCTT---77AY.50.000145
S242L242delCTT---77AY.560.011236
S242L242delCTT---77AY.750.000392
S242L242delCTT---77AY.98.10.000339
S242L242delCTT---77B.1.1.4320.008861
S242L242delCTT---77Q.10.000884
S242L242delCTT---66AY.330.000401
S242L242delCTT---55AY.46.60.000361
S242L242delCTT---55AY.75.10.000902
S242L242delCTT---44AY.1200.000149
S242L242delCTT---44AY.140.000352
S242L242delCTT---44AY.200.000155
S242L242delCTT---44B.1.1.3890.024242
S242L242delCTT---44B.1.2580.000266
S242L242delCTT---44B.1.6090.001918
S242L242delCTT---44B.1.6210.000354
S242L242delCTT---44P.50.054795
S242L242delCTT---33AY.10.001187
S242L242delCTT---33AY.1000.000138
S242L242delCTT---33AY.1060.001005
S242L242delCTT---33AY.116.10.000934
S242L242delCTT---33AY.290.000047
S242L242delCTT---33AY.360.000445
S242L242delCTT---33AY.4.50.000322
S242L242delCTT---33AY.420.000121
S242L242delCTT---33AY.450.000365
S242L242delCTT---33AY.470.000093
S242L242delCTT---33B.1.1.5190.000119
S242L242delCTT---33B.1.1700.012931
S242L242delCTT---33B.1.2400.000647
S242L242delCTT---33B.1.3360.007317
S242L242delCTT---33B.1.4160.003807
S242L242delCTT---33B.1.4270.000151
S242L242delCTT---33B.1.5960.000261
S242L242delCTT---33B.1.617.10.000387
S242L242delCTT---220.111111
S242L242delCTT---22AY.1050.001286
S242L242delCTT---22AY.1140.000462
S242L242delCTT---22AY.1180.000125
S242L242delCTT---22AY.130.000322
S242L242delCTT---22AY.3.10.000171
S242L242delCTT---22AY.460.000208
S242L242delCTT---22AY.5.30.000675
S242L242delCTT---22AY.630.000774
S242L242delCTT---22AY.700.000417
S242L242delCTT---22AY.950.001522
S242L242delCTT---22AY.980.000158
S242L242delCTT---22AY.99.20.000184
S242L242delCTT---22B.1.1.2220.000408
S242L242delCTT---22B.1.1.280.000622
S242L242delCTT---22B.1.1.2940.002532
S242L242delCTT---22B.1.1.3180.000604
S242L242delCTT---22B.1.1.3750.02381
S242L242delCTT---22B.1.1.5070.017391
S242L242delCTT---22B.1.1.5280.009615
S242L242delCTT---22B.1.177.160.001329
S242L242delCTT---22B.1.177.20.009091
S242L242delCTT---22B.1.177.310.022989
S242L242delCTT---22B.1.177.540.001213
S242L242delCTT---22B.1.177.810.000379
S242L242delCTT---22B.1.2430.000139
S242L242delCTT---22B.1.258.110.000793
S242L242delCTT---22B.1.258.30.00335
S242L242delCTT---22B.1.351.10.076923
S242L242delCTT---22B.1.360.000292
S242L242delCTT---22B.1.5760.001813
S242L242delCTT---22B.1.6230.001073
S242L242delCTT---22B.1.6370.000146
S242L242delCTT---22C.160.002121
S242L242delCTT---22C.36.30.001134
S242L242delCTT---22P.1.120.000968
S242L242delCTT---22Q.20.001227
S242L242delCTT---22Q.40.00091
S242L242delCTT---22Q.80.00033
S242L242delCTT---11A0.000387
S242L242delCTT---11A.190.009434
S242L242delCTT---11A.20.000662
S242L242delCTT---11A.2.50.000499
S242L242delCTT---11A.230.010526
S242L242delCTT---11A.270.001656
S242L242delCTT---11A.290.005319
S242L242delCTT---11AD.20.000219
S242L242delCTT---11AU.30.00211
S242L242delCTT---11AY.1010.00049
S242L242delCTT---11AY.1110.000183
S242L242delCTT---11AY.1130.000142
S242L242delCTT---11AY.1170.000085
S242L242delCTT---11AY.1210.000135
S242L242delCTT---11AY.20.000356
S242L242delCTT---11AY.300.000396
S242L242delCTT---11AY.370.000316
S242L242delCTT---11AY.39.10.00004
S242L242delCTT---11AY.4.2.10.000149
S242L242delCTT---11AY.400.000964
S242L242delCTT---11AY.46.10.001027
S242L242delCTT---11AY.5.40.000277
S242L242delCTT---11AY.500.000799
S242L242delCTT---11AY.510.000909
S242L242delCTT---11AY.540.000095
S242L242delCTT---11AY.580.000907
S242L242delCTT---11AY.590.00053
S242L242delCTT---11AY.60.000041
S242L242delCTT---11AY.610.000105
S242L242delCTT---11AY.650.000533
S242L242delCTT---11AY.7.20.000559
S242L242delCTT---11AY.730.000665
S242L242delCTT---11AY.740.000116
S242L242delCTT---11AY.780.001541
S242L242delCTT---11AY.890.004902
S242L242delCTT---11AY.90.000068
S242L242delCTT---11AY.910.00073
S242L242delCTT---11B.1.1.1480.008772
S242L242delCTT---11B.1.1.1590.004673
S242L242delCTT---11B.1.1.1920.002309
S242L242delCTT---11B.1.1.2140.000055
S242L242delCTT---11B.1.1.2170.003636
S242L242delCTT---11B.1.1.2840.000107
S242L242delCTT---11B.1.1.2980.000862
S242L242delCTT---11B.1.1.3230.014085
S242L242delCTT---11B.1.1.3520.03125
S242L242delCTT---11B.1.1.3560.008547
S242L242delCTT---11B.1.1.3690.000446
S242L242delCTT---11B.1.1.3720.000689
S242L242delCTT---11B.1.1.390.00051
S242L242delCTT---11B.1.1.4090.002833
S242L242delCTT---11B.1.1.4480.002033
S242L242delCTT---11B.1.1.4640.001473
S242L242delCTT---11B.1.1.4860.001577
S242L242delCTT---11B.1.110.30.000718
S242L242delCTT---11B.1.1110.001175
S242L242delCTT---11B.1.1390.000733
S242L242delCTT---11B.1.160.70.002079
S242L242delCTT---11B.1.177.180.00116
S242L242delCTT---11B.1.177.280.007407
S242L242delCTT---11B.1.177.40.000211
S242L242delCTT---11B.1.177.440.000519
S242L242delCTT---11B.1.177.510.004566
S242L242delCTT---11B.1.177.600.000218
S242L242delCTT---11B.1.177.620.001192
S242L242delCTT---11B.1.177.690.001484
S242L242delCTT---11B.1.177.770.000726
S242L242delCTT---11B.1.177.820.000477
S242L242delCTT---11B.1.177.850.005435
S242L242delCTT---11B.1.177.870.000728
S242L242delCTT---11B.1.220.001318
S242L242delCTT---11B.1.2370.004975
S242L242delCTT---11B.1.258.140.00098
S242L242delCTT---11B.1.258.170.000104
S242L242delCTT---11B.1.36.200.016949
S242L242delCTT---11B.1.36.370.002778
S242L242delCTT---11B.1.3670.000792
S242L242delCTT---11B.1.3690.000285
S242L242delCTT---11B.1.3750.00082
S242L242delCTT---11B.1.3990.001934
S242L242delCTT---11B.1.4000.000429
S242L242delCTT---11B.1.4090.000781
S242L242delCTT---11B.1.416.10.001563
S242L242delCTT---11B.1.4170.028571
S242L242delCTT---11B.1.438.10.000107
S242L242delCTT---11B.1.4410.009615
S242L242delCTT---11B.1.4970.000315
S242L242delCTT---11B.1.5170.000427
S242L242delCTT---11B.1.5610.000397
S242L242delCTT---11B.1.5820.000491
S242L242delCTT---11B.1.5990.00365
S242L242delCTT---11B.1.80.001972
S242L242delCTT---11B.60.00091
S242L242delCTT---11C.1.10.076923
S242L242delCTT---11C.1.20.004255
S242L242delCTT---11C.360.000911
S242L242delCTT---11P.1.10.000318
S242L242delCTT---11P.1.140.000048
S242L242delCTT---11P.1.60.001946
S242L242delCTT---11Q.30.000145