CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = S : Mut = H146Q

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
S146H146QnonsyncaCcaA115411010.95407321998-22000
S146H146QnonsyncaCcaG1154530.045927221998-22000

Details of the mutation H146Q within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
S146H146QcaCcaA11011154All0.000211
S146H146QcaCcaG531154All0.00001
S146H146QcaCcaA433444B.1.1.70.000388
S146H146QcaCcaG11444B.1.1.70.00001
S146H146QcaCcaA6065AY.40.000093
S146H146QcaCcaG565AY.40.000008
S146H146QcaCcaA4747B.1.360.006857
S146H146QcaCcaA3435B.1.617.20.000128
S146H146QcaCcaG135B.1.617.20.000004
S146H146QcaCcaA3434B.1.1.3180.01026
S146H146QcaCcaA3033B.1.177.810.00568
S146H146QcaCcaG333B.1.177.810.000568
S146H146QcaCcaA3030AY.1030.000186
S146H146QcaCcaA2828AY.30.000278
S146H146QcaCcaA2126Q.10.002653
S146H146QcaCcaG526Q.10.000632
S146H146QcaCcaA2424B.1.20.000211
S146H146QcaCcaA2323AY.230.001604
S146H146QcaCcaA2121B.1.6210.001859
S146H146QcaCcaA1720B.10.000156
S146H146QcaCcaG320B.10.000027
S146H146QcaCcaA1819AY.250.000108
S146H146QcaCcaG119AY.250.000006
S146H146QcaCcaA1919B.1.177.630.051351
S146H146QcaCcaA1616AY.140.001408
S146H146QcaCcaA1414AY.440.000085
S146H146QcaCcaA713B.1.10.000127
S146H146QcaCcaG613B.1.10.000109
S146H146QcaCcaA1112P.10.000173
S146H146QcaCcaG112P.10.000016
S146H146QcaCcaA1010AY.4.20.000217
S146H146QcaCcaA1010AY.4.50.001075
S146H146QcaCcaA1010B.1.5260.000235
S146H146QcaCcaG68AY.9.20.00022
S146H146QcaCcaA28AY.9.20.000073
S146H146QcaCcaA88P.1.160.002993
S146H146QcaCcaA77B.1.1770.000092
S146H146QcaCcaA77B.1.3510.000208
S146H146QcaCcaA55AY.430.000022
S146H146QcaCcaA55AY.98.10.000242
S146H146QcaCcaA45B.1.1600.000125
S146H146QcaCcaG15B.1.1600.000031
S146H146QcaCcaA55C.370.00058
S146H146QcaCcaA44AY.1000.000184
S146H146QcaCcaA44AY.1020.000106
S146H146QcaCcaA44AY.116.10.001246
S146H146QcaCcaA44AY.50.000083
S146H146QcaCcaG44B.1.1.4160.00362
S146H146QcaCcaA44B.1.4280.004082
S146H146QcaCcaA33AY.1110.000549
S146H146QcaCcaG23AY.370.000632
S146H146QcaCcaA13AY.370.000316
S146H146QcaCcaA33AY.540.000286
S146H146QcaCcaA33B.1.1.1600.071429
S146H146QcaCcaA33B.1.2430.000209
S146H146QcaCcaA33B.1.2580.0002
S146H146QcaCcaA22AY.20.000712
S146H146QcaCcaA22AY.260.000057
S146H146QcaCcaA22AY.390.000049
S146H146QcaCcaG12AY.420.00004
S146H146QcaCcaA12AY.420.00004
S146H146QcaCcaA22AY.450.000243
S146H146QcaCcaA22AY.580.001815
S146H146QcaCcaA22AY.60.000082
S146H146QcaCcaA22AY.680.000547
S146H146QcaCcaA22B.1.1490.006849
S146H146QcaCcaA22B.1.177.820.000955
S146H146QcaCcaA22B.1.2400.000431
S146H146QcaCcaA22B.1.2650.002541
S146H146QcaCcaA22B.1.3440.016393
S146H146QcaCcaA22B.1.36.290.001035
S146H146QcaCcaA22B.1.4270.000101
S146H146QcaCcaA22B.1.4290.000047
S146H146QcaCcaA22B.1.466.20.000782
S146H146QcaCcaA22B.1.5250.000226
S146H146QcaCcaA22B.1.6370.000146
S146H146QcaCcaA22D.20.00015
S146H146QcaCcaA22L.30.007092
S146H146QcaCcaA22R.10.00018
S146H146QcaCcaA110.055556
S146H146QcaCcaA11A.10.000282
S146H146QcaCcaA11A.2.40.003367
S146H146QcaCcaA11A.210.00277
S146H146QcaCcaA11AY.1050.000643
S146H146QcaCcaA11AY.1190.000035
S146H146QcaCcaA11AY.1200.000037
S146H146QcaCcaA11AY.200.000039
S146H146QcaCcaG11AY.290.000016
S146H146QcaCcaA11AY.3.10.000085
S146H146QcaCcaA11AY.330.000067
S146H146QcaCcaA11AY.340.000097
S146H146QcaCcaA11AY.39.10.00004
S146H146QcaCcaA11AY.460.000104
S146H146QcaCcaA11AY.46.30.000934
S146H146QcaCcaA11AY.46.40.000165
S146H146QcaCcaA11AY.470.000031
S146H146QcaCcaA11AY.690.000187
S146H146QcaCcaA11AY.710.000475
S146H146QcaCcaA11AY.750.000056
S146H146QcaCcaA11AY.980.000079
S146H146QcaCcaA11B.1.1.10.000327
S146H146QcaCcaA11B.1.1.1570.000913
S146H146QcaCcaA11B.1.1.1760.000439
S146H146QcaCcaA11B.1.1.2400.004695
S146H146QcaCcaA11B.1.1.2840.000107
S146H146QcaCcaA11B.1.1.3060.000438
S146H146QcaCcaA11B.1.1.3150.008475
S146H146QcaCcaA11B.1.1.3480.000796
S146H146QcaCcaA11B.1.1.3590.027778
S146H146QcaCcaA11B.1.1.4320.001266
S146H146QcaCcaA11B.1.1.460.004367
S146H146QcaCcaG11B.1.1.500.000679
S146H146QcaCcaA11B.1.1.5190.00004
S146H146QcaCcaA11B.1.177.40.000211
S146H146QcaCcaA11B.1.177.60.000977
S146H146QcaCcaA11B.1.177.750.001041
S146H146QcaCcaA11B.1.177.860.000183
S146H146QcaCcaA11B.1.177.870.000728
S146H146QcaCcaA11B.1.1890.004292
S146H146QcaCcaA11B.1.2390.001221
S146H146QcaCcaA11B.1.258.60.019608
S146H146QcaCcaA11B.1.351.20.000303
S146H146QcaCcaA11B.1.36.240.006173
S146H146QcaCcaA11B.1.4000.000429
S146H146QcaCcaA11B.1.4430.004673
S146H146QcaCcaA11B.1.5280.047619
S146H146QcaCcaA11B.1.5490.007194
S146H146QcaCcaA11B.1.5640.000426
S146H146QcaCcaA11B.1.5760.000907
S146H146QcaCcaA11B.1.5960.000087
S146H146QcaCcaA11B.1.617.10.000129
S146H146QcaCcaA11B.1.6250.002353
S146H146QcaCcaG11B.280.003279
S146H146QcaCcaA11B.400.000364
S146H146QcaCcaA11B.550.00295
S146H146QcaCcaA11C.30.10.006711
S146H146QcaCcaA11D.50.004975
S146H146QcaCcaA11N.80.03125
S146H146QcaCcaA11P.1.120.000484
S146H146QcaCcaA11P.1.140.000048
S146H146QcaCcaA11P.1.150.000232
S146H146QcaCcaA11P.1.170.000162
S146H146QcaCcaA11P.1.40.000977
S146H146QcaCcaA11P.20.000187