CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = S : Mut = G142del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
S142G142deldelGGT---60146014121986-21988

Details of the mutation G142del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
S142G142delGGT---60146014All0.00115
S142G142delGGT---16161616A.2.50.806387
S142G142delGGT---588588P.30.937799
S142G142delGGT---531531A.2.5.20.834906
S142G142delGGT---338338B.1.4290.007953
S142G142delGGT---274274P.10.004317
S142G142delGGT---232232B.1.1.70.000208
S142G142delGGT---172172A.2.5.10.826923
S142G142delGGT---160160AT.10.820513
S142G142delGGT---102102C.380.822581
S142G142delGGT---100100B.1.3510.002973
S142G142delGGT---9797B.10.000888
S142G142delGGT---9393AY.40.000145
S142G142delGGT---9393B.1.20.000819
S142G142delGGT---9292A.2.5.30.948454
S142G142delGGT---8989B.1.5260.002092
S142G142delGGT---7474B.1.1770.000974
S142G142delGGT---6262B.1.10.001125
S142G142delGGT---4848B.1.6350.842105
S142G142delGGT---4444B.1.1.5240.916667
S142G142delGGT---4343B.1.1600.001341
S142G142delGGT---4242AY.430.000186
S142G142delGGT---3131N.100.911765
S142G142delGGT---2929P.1.31
S142G142delGGT---2727B.1.258.170.002807
S142G142delGGT---2626AY.1030.000161
S142G142delGGT---2424P.1.150.005576
S142G142delGGT---2121AY.250.000126
S142G142delGGT---2121B.1.5760.019039
S142G142delGGT---2020B.1.1.5190.000794
S142G142delGGT---2020B.1.2580.001331
S142G142delGGT---1919B.1.2210.00135
S142G142delGGT---1616AY.4.20.000347
S142G142delGGT---1616B.1.177.210.001224
S142G142delGGT---1616B.1.2430.001113
S142G142delGGT---1616B.1.438.10.001716
S142G142delGGT---1515B.1.2340.001979
S142G142delGGT---1515B.1.6210.001328
S142G142delGGT---1414AY.30.000139
S142G142delGGT---1414AY.440.000085
S142G142delGGT---1414P.1.140.000669
S142G142delGGT---1313B.1.3690.003708
S142G142delGGT---1212AY.1020.000318
S142G142delGGT---1212B.1.1.2970.026846
S142G142delGGT---1212B.1.617.20.000045
S142G142delGGT---1212P.1.60.023346
S142G142delGGT---1111B.1.177.420.009839
S142G142delGGT---1111B.1.258.140.010784
S142G142delGGT---1010B.1.1.2980.008621
S142G142delGGT---1010B.1.4270.000505
S142G142delGGT---99AY.1000.000414
S142G142delGGT---99B.1.6380.473684
S142G142delGGT---99Q.30.001305
S142G142delGGT---88AY.260.000226
S142G142delGGT---88B.1.1.3680.024691
S142G142delGGT---88P.1.170.001294
S142G142delGGT---77AY.420.000282
S142G142delGGT---77B0.000895
S142G142delGGT---77B.1.1.280.002179
S142G142delGGT---77B.1.1.3180.002112
S142G142delGGT---77B.1.360.001021
S142G142delGGT---77B.1.4860.777778
S142G142delGGT---77B.1.5740.015054
S142G142delGGT---77B.1.617.10.000903
S142G142delGGT---66AY.290.000095
S142G142delGGT---66AY.390.000148
S142G142delGGT---66AY.4.2.10.000894
S142G142delGGT---66AY.470.000187
S142G142delGGT---66AY.90.000406
S142G142delGGT---66B.1.1.2140.000333
S142G142delGGT---66B.1.1.370.001157
S142G142delGGT---66B.1.1.4340.002091
S142G142delGGT---66B.1.1280.003812
S142G142delGGT---66B.1.6370.000438
S142G142delGGT---55A.10.001409
S142G142delGGT---55B.1.1.2840.000537
S142G142delGGT---55B.1.177.60.004883
S142G142delGGT---55B.1.3890.00501
S142G142delGGT---55B.1.5960.000436
S142G142delGGT---55B.1.6280.001762
S142G142delGGT---55D.20.000375
S142G142delGGT---55P.1.100.001347
S142G142delGGT---55P.1.120.00242
S142G142delGGT---44AY.350.000932
S142G142delGGT---44AY.75.10.000721
S142G142delGGT---44B.1.1.1590.018692
S142G142delGGT---44B.1.1.2180.030769
S142G142delGGT---44B.1.1.2320.00726
S142G142delGGT---44B.1.1.2940.005063
S142G142delGGT---44B.1.1.3060.001754
S142G142delGGT---44B.1.1.3690.001785
S142G142delGGT---44B.1.1.500.002716
S142G142delGGT---44B.1.1.570.045977
S142G142delGGT---44B.1.177.40.000844
S142G142delGGT---44B.1.177.860.000734
S142G142delGGT---44B.1.2320.002149
S142G142delGGT---44B.1.3190.012195
S142G142delGGT---44B.1.5610.001588
S142G142delGGT---44B.1.621.10.002023
S142G142delGGT---44P.1.10.001271
S142G142delGGT---44P.20.000747
S142G142delGGT---33A0.001161
S142G142delGGT---33A.20.001985
S142G142delGGT---33A.30.006289
S142G142delGGT---33AY.1010.001471
S142G142delGGT---33AY.1190.000106
S142G142delGGT---33AY.1200.000112
S142G142delGGT---33AY.460.000312
S142G142delGGT---33AY.50.000062
S142G142delGGT---33AY.740.000347
S142G142delGGT---33AY.9.20.00011
S142G142delGGT---33AY.920.000862
S142G142delGGT---33B.1.1.250.001706
S142G142delGGT---33B.1.1.2530.007519
S142G142delGGT---33B.1.1.2860.008696
S142G142delGGT---33B.1.1.3110.001074
S142G142delGGT---33B.1.1.330.001263
S142G142delGGT---33B.1.1.390.001529
S142G142delGGT---33B.1.1.630.001157
S142G142delGGT---33B.1.177.120.000455
S142G142delGGT---33B.1.177.160.001993
S142G142delGGT---33B.1.177.300.007538
S142G142delGGT---33B.1.177.810.000568
S142G142delGGT---33B.1.2400.000647
S142G142delGGT---33B.1.2410.002435
S142G142delGGT---33B.1.3200.003736
S142G142delGGT---33B.1.351.20.000908
S142G142delGGT---33B.1.36.80.003
S142G142delGGT---33B.1.3670.002377
S142G142delGGT---33B.1.5650.002431
S142G142delGGT---33B.1.5750.00091
S142G142delGGT---33B.1.5950.000783
S142G142delGGT---33B.400.001093
S142G142delGGT---33P.1.20.003468
S142G142delGGT---22A.290.010638
S142G142delGGT---22AB.10.016393
S142G142delGGT---22AC.10.074074
S142G142delGGT---22AY.10.000791
S142G142delGGT---22AY.1080.002205
S142G142delGGT---22AY.140.000176
S142G142delGGT---22AY.34.10.00102
S142G142delGGT---22AY.360.000296
S142G142delGGT---22AY.4.50.000215
S142G142delGGT---22AY.650.001066
S142G142delGGT---22AY.840.000875
S142G142delGGT---22AY.990.002099
S142G142delGGT---22AZ.50.007018
S142G142delGGT---22B.1.1.100.00223
S142G142delGGT---22B.1.1.1700.002494
S142G142delGGT---22B.1.1.2200.003717
S142G142delGGT---22B.1.1.2410.004141
S142G142delGGT---22B.1.1.2630.003115
S142G142delGGT---22B.1.1.3160.00185
S142G142delGGT---22B.1.1.4640.002946
S142G142delGGT---22B.1.1.5280.009615
S142G142delGGT---22B.1.1.700.000682
S142G142delGGT---22B.1.110.30.001437
S142G142delGGT---22B.1.160.280.005848
S142G142delGGT---22B.1.177.440.001038
S142G142delGGT---22B.1.177.50.002484
S142G142delGGT---22B.1.177.570.000562
S142G142delGGT---22B.1.221.20.008032
S142G142delGGT---22B.1.221.40.008333
S142G142delGGT---22B.1.2220.003384
S142G142delGGT---22B.1.2390.002442
S142G142delGGT---22B.1.258.110.000793
S142G142delGGT---22B.1.3110.000549
S142G142delGGT---22B.1.351.30.001753
S142G142delGGT---22B.1.36.380.003284
S142G142delGGT---22B.1.3800.013245
S142G142delGGT---22B.1.3930.057143
S142G142delGGT---22B.1.3960.001411
S142G142delGGT---22B.1.4040.002604
S142G142delGGT---22B.1.4650.007605
S142G142delGGT---22B.1.5090.001732
S142G142delGGT---22B.1.5250.000226
S142G142delGGT---22B.1.5550.044444
S142G142delGGT---22B.1.6200.001892
S142G142delGGT---22B.1.6230.001073
S142G142delGGT---22B.1.930.001867
S142G142delGGT---22B.30.001661
S142G142delGGT---22B.520.020202
S142G142delGGT---22C.1.20.008511
S142G142delGGT---22C.160.002121
S142G142delGGT---22C.180.005181
S142G142delGGT---22C.300.003454
S142G142delGGT---22C.36.30.001134
S142G142delGGT---22C.36.3.10.005435
S142G142delGGT---22C.370.000232
S142G142delGGT---22L.30.007092
S142G142delGGT---22P.1.130.001797
S142G142delGGT---22P.1.160.000748
S142G142delGGT---22R.10.00018
S142G142delGGT---11A.23.10.000704
S142G142delGGT---11AD.20.000219
S142G142delGGT---11AE.80.000489
S142G142delGGT---11AK.10.012658
S142G142delGGT---11AY.100.00053
S142G142delGGT---11AY.1060.000335
S142G142delGGT---11AY.1070.000466
S142G142delGGT---11AY.1090.00074
S142G142delGGT---11AY.1130.000142
S142G142delGGT---11AY.1180.000063
S142G142delGGT---11AY.120.20.001285
S142G142delGGT---11AY.1210.000135
S142G142delGGT---11AY.230.00007
S142G142delGGT---11AY.270.000065
S142G142delGGT---11AY.29.10.000221
S142G142delGGT---11AY.330.000067
S142G142delGGT---11AY.4.10.000737
S142G142delGGT---11AY.450.000122
S142G142delGGT---11AY.600.000938
S142G142delGGT---11AY.620.000436
S142G142delGGT---11AY.7.20.000559
S142G142delGGT---11AY.730.000665
S142G142delGGT---11AY.750.000056
S142G142delGGT---11AY.780.001541
S142G142delGGT---11AY.850.000427
S142G142delGGT---11AY.9.10.000084
S142G142delGGT---11AY.970.001701
S142G142delGGT---11AY.980.000079
S142G142delGGT---11AY.98.10.000048
S142G142delGGT---11AY.99.10.001553
S142G142delGGT---11AZ.20.000821
S142G142delGGT---11B.1.1.1180.010204
S142G142delGGT---11B.1.1.1370.0125
S142G142delGGT---11B.1.1.1390.022727
S142G142delGGT---11B.1.1.1530.001095
S142G142delGGT---11B.1.1.1890.001513
S142G142delGGT---11B.1.1.2030.016949
S142G142delGGT---11B.1.1.2160.00089
S142G142delGGT---11B.1.1.2190.005
S142G142delGGT---11B.1.1.2290.005747
S142G142delGGT---11B.1.1.2400.004695
S142G142delGGT---11B.1.1.2580.003257
S142G142delGGT---11B.1.1.2650.003155
S142G142delGGT---11B.1.1.2660.012195
S142G142delGGT---11B.1.1.2670.010101
S142G142delGGT---11B.1.1.2690.001353
S142G142delGGT---11B.1.1.2790.001121
S142G142delGGT---11B.1.1.3440.010753
S142G142delGGT---11B.1.1.3480.000796
S142G142delGGT---11B.1.1.3720.000689
S142G142delGGT---11B.1.1.3970.002252
S142G142delGGT---11B.1.1.4010.066667
S142G142delGGT---11B.1.1.4020.011111
S142G142delGGT---11B.1.1.4090.002833
S142G142delGGT---11B.1.1.410.006329
S142G142delGGT---11B.1.1.4200.001006
S142G142delGGT---11B.1.1.4470.035714
S142G142delGGT---11B.1.1.530.013699
S142G142delGGT---11B.1.1.710.006061
S142G142delGGT---11B.1.1.890.006061
S142G142delGGT---11B.1.1110.001175
S142G142delGGT---11B.1.1130.015625
S142G142delGGT---11B.1.1260.001276
S142G142delGGT---11B.1.130.002375
S142G142delGGT---11B.1.1310.008772
S142G142delGGT---11B.1.1570.002985
S142G142delGGT---11B.1.160.230.004831
S142G142delGGT---11B.1.160.260.002421
S142G142delGGT---11B.1.160.270.015152
S142G142delGGT---11B.1.160.70.002079
S142G142delGGT---11B.1.160.80.001289
S142G142delGGT---11B.1.1670.007812
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