CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = S : Mut = F157S

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
S157F157SnonsyntTctCc15537152390.9808222031-22033
S157F157SnonsynTTCAGT155372840.018278922031-22033
S157F157SnonsyntTCtCT1553790.00057926222031-22033
S157F157SnonsynTTcAGc1553730.00019308722031-22033
S157F157SnonsyntTCtCA1553720.00012872522031-22033

Details of the mutation F157S within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
S157F157StTctCc1523915537All0.002915
S157F157STTCAGT28415537All0.000054
S157F157StTCtCT915537All0.000002
S157F157STTcAGc315537All0.000001
S157F157StTCtCA215537All0
S157F157StTctCc1349913506B.1.6370.986408
S157F157StTCtCT613506B.1.6370.000438
S157F157StTCtCA113506B.1.6370.000073
S157F157StTctCc652653B.10.005972
S157F157STTCAGT1653B.10.000009
S157F157StTctCc389393B.1.10.007057
S157F157STTCAGT2393B.1.10.000036
S157F157STTcAGc1393B.1.10.000018
S157F157StTCtCT1393B.1.10.000018
S157F157StTctCc130130B.1.6320.872483
S157F157StTctCc117119B.1.1.70.000105
S157F157StTCtCA1119B.1.1.70.000001
S157F157StTCtCT1119B.1.1.70.000001
S157F157STTCAGT7373AY.40.000114
S157F157StTctCc6161B.1.1.1920.140878
S157F157StTctCc5757B.1.20.000502
S157F157STTCAGT5656AY.1130.007974
S157F157StTctCc3131B.1.360.004523
S157F157StTctCc2626B.1.5260.000611
S157F157STTCAGT2124AY.430.000093
S157F157StTctCc224AY.430.000009
S157F157StTCtCT124AY.430.000004
S157F157StTctCc2222B.1.1.4190.162963
S157F157STTCAGT1822B.1.617.20.000068
S157F157StTctCc422B.1.617.20.000015
S157F157StTctCc1919B.1.177.70.003132
S157F157STTCAGT1516AY.250.00009
S157F157StTctCc116AY.250.000006
S157F157StTctCc1515A.2.50.007485
S157F157StTctCc815AY.440.000049
S157F157STTCAGT715AY.440.000043
S157F157StTctCc1515P.10.000236
S157F157STTCAGT1213AY.260.00034
S157F157StTctCc113AY.260.000028
S157F157STTCAGT1313AY.90.000879
S157F157StTctCc1212B0.001534
S157F157STTCAGT1011AY.1100.001127
S157F157STTcAGc111AY.1100.000113
S157F157StTctCc99B.1.1.5070.078261
S157F157STTCAGT57AY.9.20.000184
S157F157StTctCc17AY.9.20.000037
S157F157STTcAGc17AY.9.20.000037
S157F157StTctCc77B.1.1.1890.01059
S157F157StTctCc77B.1.214.20.004197
S157F157StTctCc77B.1.5960.00061
S157F157StTctCc77B.1.6360.04698
S157F157STTCAGT66AY.420.000241
S157F157STTCAGT66AY.610.000629
S157F157StTctCc66B.1.466.20.002347
S157F157StTctCc66B.1.5510.007742
S157F157StTctCc35AY.1030.000019
S157F157STTCAGT25AY.1030.000012
S157F157StTctCc55B.1.1600.000156
S157F157StTctCc55B.1.177.730.002831
S157F157StTctCc55B.1.6210.000443
S157F157StTctCc24AY.30.00002
S157F157STTCAGT24AY.30.00002
S157F157STTCAGT44AY.450.000487
S157F157STTCAGT44AY.750.000224
S157F157StTctCc44B.1.30.010471
S157F157StTctCc44B.1.6230.002146
S157F157STTCAGT33AY.1020.00008
S157F157STTCAGT33AY.1180.000188
S157F157STTCAGT33AY.200.000117
S157F157StTctCc33B.1.1770.00004
S157F157StTctCc33B.1.4270.000151
S157F157StTctCc33B.1.6090.001438
S157F157StTctCc33B.1.6180.012097
S157F157StTctCc33C.370.000348
S157F157StTctCc33D.20.000225
S157F157StTctCc33N.50.0053
S157F157StTctCc33P.1.10.000953
S157F157StTctCc33P.1.170.000485
S157F157StTctCc22A.2.5.20.003145
S157F157STTCAGT22AY.1200.000074
S157F157STTCAGT22AY.4.20.000043
S157F157STTCAGT22AY.50.000041
S157F157STTCAGT22AY.540.000191
S157F157StTctCc22B.1.1.2140.000111
S157F157StTctCc22B.1.1.2200.003717
S157F157StTctCc22B.1.1.3720.001377
S157F157StTctCc22B.1.1.3970.004505
S157F157StTctCc22B.1.1.4480.004065
S157F157StTctCc22B.1.1.5190.000079
S157F157StTctCc22B.1.2340.000264
S157F157StTctCc22B.1.243.10.044444
S157F157StTctCc22B.1.3360.004878
S157F157StTctCc22B.1.4130.008511
S157F157StTctCc22B.40.004415
S157F157StTctCc11A.50.001923
S157F157STTCAGT11AY.100.00053
S157F157StTctCc11AY.1000.000046
S157F157STTCAGT11AY.1170.000085
S157F157STTCAGT11AY.1190.000035
S157F157StTctCc11AY.120.10.000321
S157F157StTctCc11AY.140.000088
S157F157STTCAGT11AY.190.00114
S157F157StTctCc11AY.20.000356
S157F157STTCAGT11AY.360.000148
S157F157STTCAGT11AY.370.000316
S157F157StTctCc11AY.390.000025
S157F157STTCAGT11AY.46.60.000072
S157F157StTctCc11AY.770.001127
S157F157STTCAGT11AY.80.000606
S157F157StTctCc11AY.950.000761
S157F157STTCAGT11AY.980.000079
S157F157STTCAGT11AY.98.10.000048
S157F157StTctCc11B.1.1.1410.002012
S157F157StTctCc11B.1.1.1440.028571
S157F157StTctCc11B.1.1.1490.016393
S157F157StTctCc11B.1.1.3010.001179
S157F157StTctCc11B.1.1.3060.000438
S157F157StTctCc11B.1.1.3160.000925
S157F157StTctCc11B.1.1.3170.000412
S157F157StTctCc11B.1.1.3180.000302
S157F157StTctCc11B.1.1.370.000193
S157F157StTctCc11B.1.1.5240.020833
S157F157StTctCc11B.1.1.5250.005464
S157F157StTctCc11B.1.1.860.035714
S157F157StTctCc11B.1.1270.002198
S157F157StTctCc11B.1.177.540.000606
S157F157StTctCc11B.1.2140.003663
S157F157StTctCc11B.1.2580.000067
S157F157StTctCc11B.1.2800.007143
S157F157StTctCc11B.1.3240.001605
S157F157StTctCc11B.1.3380.008621
S157F157StTctCc11B.1.3500.002933
S157F157StTctCc11B.1.3560.001727
S157F157StTctCc11B.1.36.290.000517
S157F157StTctCc11B.1.3670.000792
S157F157StTctCc11B.1.3750.00082
S157F157StTctCc11B.1.4110.003704
S157F157StTctCc11B.1.5050.004386
S157F157StTctCc11B.1.5090.000866
S157F157StTctCc11B.1.5170.000427
S157F157StTctCc11B.1.5250.000113
S157F157StTctCc11B.1.5330.009615
S157F157StTctCc11B.1.5610.000397
S157F157StTctCc11B.1.5750.000303
S157F157StTctCc11B.1.5760.000907
S157F157StTctCc11B.1.621.10.000506
S157F157StTctCc11B.1.6270.00202
S157F157StTctCc11B.1.6280.000352
S157F157StTctCc11B.1.6300.005236
S157F157StTctCc11B.270.015385
S157F157StTctCc11B.290.003509
S157F157StTctCc11B.60.00091
S157F157StTctCc11R.10.00009