CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = S : Mut = D80del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
S80D80deldelGAT---502502121800-21802

Details of the mutation D80del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
S80D80delGAT---502502All0.000096
S80D80delGAT---9292B.1.617.20.000346
S80D80delGAT---8484AY.430.000372
S80D80delGAT---4646B.1.1.70.000041
S80D80delGAT---2828AY.440.00017
S80D80delGAT---2727AY.90.001825
S80D80delGAT---2222AY.250.000132
S80D80delGAT---2020AY.40.000031
S80D80delGAT---1616AY.1020.000424
S80D80delGAT---1212AY.34.10.006119
S80D80delGAT---77AY.30.00007
S80D80delGAT---66AY.1030.000037
S80D80delGAT---66AY.330.000401
S80D80delGAT---66B.1.1770.000079
S80D80delGAT---55AY.390.000124
S80D80delGAT---55AY.4.50.000537
S80D80delGAT---55AY.460.00052
S80D80delGAT---55AY.610.000524
S80D80delGAT---55AY.9.20.000184
S80D80delGAT---55B.1.10.000091
S80D80delGAT---440.222222
S80D80delGAT---44AY.1210.000541
S80D80delGAT---44AY.260.000113
S80D80delGAT---44AY.470.000124
S80D80delGAT---44AY.50.000083
S80D80delGAT---44B.10.000037
S80D80delGAT---33AY.1180.000188
S80D80delGAT---33AY.200.000117
S80D80delGAT---33AY.750.000168
S80D80delGAT---33AY.850.001282
S80D80delGAT---33B.1.4290.000071
S80D80delGAT---22AY.1080.002205
S80D80delGAT---22AY.420.00008
S80D80delGAT---22AY.540.000191
S80D80delGAT---22AY.590.001059
S80D80delGAT---22AY.680.000547
S80D80delGAT---22AY.7.20.001119
S80D80delGAT---22AY.75.10.000361
S80D80delGAT---22AY.98.10.000097
S80D80delGAT---22B.1.20.000018
S80D80delGAT---22B.1.5250.000226
S80D80delGAT---22R.10.00018
S80D80delGAT---11AY.1010.00049
S80D80delGAT---11AY.1050.000643
S80D80delGAT---11AY.1110.000183
S80D80delGAT---11AY.120.000316
S80D80delGAT---11AY.1200.000037
S80D80delGAT---11AY.3.10.000085
S80D80delGAT---11AY.300.000396
S80D80delGAT---11AY.4.40.000409
S80D80delGAT---11AY.450.000122
S80D80delGAT---11AY.520.000814
S80D80delGAT---11AY.600.000938
S80D80delGAT---11AY.640.000595
S80D80delGAT---11AY.670.000464
S80D80delGAT---11AY.700.000209
S80D80delGAT---11AY.720.001361
S80D80delGAT---11AY.940.000443
S80D80delGAT---11AY.990.001049
S80D80delGAT---11AZ.20.000821
S80D80delGAT---11B.1.1.3060.000438
S80D80delGAT---11B.1.1.3110.000358
S80D80delGAT---11B.1.1.3150.008475
S80D80delGAT---11B.1.1.3180.000302
S80D80delGAT---11B.1.1.4340.000349
S80D80delGAT---11B.1.1.5230.001563
S80D80delGAT---11B.1.1600.000031
S80D80delGAT---11B.1.177.170.000821
S80D80delGAT---11B.1.177.180.00116
S80D80delGAT---11B.1.177.210.000076
S80D80delGAT---11B.1.177.510.004566
S80D80delGAT---11B.1.177.560.000668
S80D80delGAT---11B.1.1790.003759
S80D80delGAT---11B.1.258.160.001637
S80D80delGAT---11B.1.6200.000946
S80D80delGAT---11B.1.6210.000089
S80D80delGAT---11B.610.005747
S80D80delGAT---11C.350.000774
S80D80delGAT---11C.36.30.000567
S80D80delGAT---11P.1.10.000318
S80D80delGAT---11Q.10.000126