CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = S : Mut = D80A

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
S80D80AnonsyngAtgCt40300402980.9999521800-21802
S80D80AnonsyngATgCC4030020.000049627821800-21802

Details of the mutation D80A within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
S80D80AgAtgCt4029840300All0.007707
S80D80AgATgCC240300All0
S80D80AgAtgCt3303033031B.1.3510.981867
S80D80AgATgCC133031B.1.3510.00003
S80D80AgAtgCt32993299B.1.351.20.998185
S80D80AgAtgCt16651665B.1.351.50.998201
S80D80AgAtgCt11391139B.1.351.30.998247
S80D80AgAtgCt484484B.10.004433
S80D80AgAtgCt5252B.1.5240.073136
S80D80AgAtgCt4747AY.450.005719
S80D80AgAtgCt4444B.1.617.20.000166
S80D80AgAtgCt3232AY.430.000142
S80D80AgAtgCt3131B.1.10.000562
S80D80AgAtgCt3030B.1.1.3060.013152
S80D80AgAtgCt2626B.1.351.11
S80D80AgAtgCt2424B.1.5540.105727
S80D80AgAtgCt1919AY.610.001991
S80D80AgAtgCt1616B.1.6360.107383
S80D80AgAtgCt1212AY.440.000073
S80D80AgAtgCt1212B.1.1.4320.01519
S80D80AgAtgCt1111B.1.177.730.006229
S80D80AgAtgCt1010AY.590.005297
S80D80AgAtgCt1010B.1.1.1890.015129
S80D80AgAtgCt1010B.1.1.70.000009
S80D80AgAtgCt99AY.190.010262
S80D80AgAtgCt99AY.380.004493
S80D80AgAtgCt99B.1.1.5070.078261
S80D80AgAtgCt88AY.75.10.001442
S80D80AgAtgCt77AY.260.000198
S80D80AgAtgCt77AY.390.000173
S80D80AgAtgCt77AY.40.000011
S80D80AgAtgCt77AY.710.003325
S80D80AgAtgCt77AY.860.005809
S80D80AgAtgCt66AY.420.000241
S80D80AgAtgCt66AY.560.009631
S80D80AgAtgCt66AY.9.20.00022
S80D80AgAtgCt66B.1.5950.001566
S80D80AgAtgCt66B.1.6090.002876
S80D80AgAtgCt55AY.1030.000031
S80D80AgAtgCt55AY.360.000741
S80D80AgAtgCt55AY.460.00052
S80D80AgAtgCt55P.50.068493
S80D80AgAtgCt44A0.001548
S80D80AgAtgCt44AY.10.001583
S80D80AgAtgCt44AY.230.000279
S80D80AgAtgCt44AY.650.002132
S80D80AgAtgCt44AY.660.004278
S80D80AgAtgCt34AY.910.002191
S80D80AgATgCC14AY.910.00073
S80D80AgAtgCt44AY.960.008299
S80D80AgAtgCt44B.1.1.3750.047619
S80D80AgAtgCt44B.1.1.4090.011331
S80D80AgAtgCt44B.1.3670.00317
S80D80AgAtgCt44B.1.4290.000094
S80D80AgAtgCt33AY.1160.00086
S80D80AgAtgCt33AY.120.20.003856
S80D80AgAtgCt33AY.140.000264
S80D80AgAtgCt33AY.30.00003
S80D80AgAtgCt33AY.320.001597
S80D80AgAtgCt33AY.400.002893
S80D80AgAtgCt33AY.50.000062
S80D80AgAtgCt33AY.750.000168
S80D80AgAtgCt33B.1.1.3890.018182
S80D80AgAtgCt33B.1.1.530.041096
S80D80AgAtgCt33B.1.1600.000094
S80D80AgAtgCt33B.1.177.860.00055
S80D80AgAtgCt33P.10.000047
S80D80AgAtgCt22AY.1020.000053
S80D80AgAtgCt22AY.1170.000169
S80D80AgAtgCt22AY.1200.000074
S80D80AgAtgCt22AY.240.000862
S80D80AgAtgCt22AY.290.000032
S80D80AgAtgCt22AY.330.000134
S80D80AgAtgCt22AY.520.001629
S80D80AgAtgCt22AY.530.000575
S80D80AgAtgCt22AY.680.000547
S80D80AgAtgCt22AY.700.000417
S80D80AgAtgCt22AY.920.000575
S80D80AgAtgCt22AY.98.10.000097
S80D80AgAtgCt22B0.000256
S80D80AgAtgCt22B.1.1.5260.007092
S80D80AgAtgCt22B.1.1770.000026
S80D80AgAtgCt22B.1.177.70.00033
S80D80AgAtgCt22B.1.2140.007326
S80D80AgAtgCt22B.1.360.000292
S80D80AgAtgCt22B.1.5250.000226
S80D80AgAtgCt22B.1.617.10.000258
S80D80AgAtgCt22R.10.00018
S80D80AgAtgCt11A.23.10.000704
S80D80AgAtgCt11AY.100.00053
S80D80AgAtgCt11AY.1050.000643
S80D80AgAtgCt11AY.1070.000466
S80D80AgAtgCt11AY.1150.005208
S80D80AgAtgCt11AY.1190.000035
S80D80AgAtgCt11AY.120.000316
S80D80AgAtgCt11AY.1210.000135
S80D80AgAtgCt11AY.16.10.00047
S80D80AgAtgCt11AY.220.002092
S80D80AgAtgCt11AY.300.000396
S80D80AgAtgCt11AY.340.000097
S80D80AgAtgCt11AY.470.000031
S80D80AgAtgCt11AY.480.000465
S80D80AgAtgCt11AY.5.30.000337
S80D80AgAtgCt11AY.550.000917
S80D80AgAtgCt11AY.670.000464
S80D80AgAtgCt11AY.7.10.000113
S80D80AgAtgCt11AY.770.001127
S80D80AgAtgCt11AY.790.001211
S80D80AgAtgCt11AY.850.000427
S80D80AgAtgCt11AY.940.000443
S80D80AgAtgCt11B.1.1.10.000327
S80D80AgAtgCt11B.1.1.2030.016949
S80D80AgAtgCt11B.1.1.2200.001859
S80D80AgAtgCt11B.1.1.250.000569
S80D80AgAtgCt11B.1.1.2690.001353
S80D80AgAtgCt11B.1.1.3720.000689
S80D80AgAtgCt11B.1.1.5210.005348
S80D80AgAtgCt11B.1.1.5230.001563
S80D80AgAtgCt11B.1.110.30.000718
S80D80AgAtgCt11B.1.1390.000733
S80D80AgAtgCt11B.1.1700.00431
S80D80AgAtgCt11B.1.177.420.000894
S80D80AgAtgCt11B.1.177.740.015152
S80D80AgAtgCt11B.1.2400.000216
S80D80AgAtgCt11B.1.2410.000812
S80D80AgAtgCt11B.1.3110.000275
S80D80AgAtgCt11B.1.3990.001934
S80D80AgAtgCt11B.1.4270.00005
S80D80AgAtgCt11B.1.466.20.000391
S80D80AgAtgCt11B.1.5960.000087
S80D80AgAtgCt11B.1.5990.00365
S80D80AgAtgCt11B.1.6000.005848
S80D80AgAtgCt11B.1.6200.000946
S80D80AgAtgCt11B.350.007812
S80D80AgAtgCt11C.10.002392
S80D80AgAtgCt11C.160.00106
S80D80AgAtgCt11C.20.016129
S80D80AgAtgCt11P.20.000187
S80D80AgAtgCt11P.30.001595