CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = S : CodonNum = 957

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
S957Q957RnonsyncAacGa13044130430.99992324431-24433
S957Q957RnonsyncAAcGT1304410.000076663624431-24433
S957Q957LnonsyncAacTa115711520.99567824431-24433
S957Q957LnonsyncAAcTT115740.0034572224431-24433
S957Q957LnonsyncAAcTC115710.00086430424431-24433
S957Q957QsyncaAcaG164164124431-24433
S957Q957HnonsyncaAcaC80450.562524431-24433
S957Q957HnonsyncaAcaT80350.437524431-24433
S957Q957deldelCAA---6969124431-24433
S957Q957EnonsynCaaGaa2323124431-24433
S957Q957KnonsynCaaAaa12110.91666724431-24433
S957Q957KnonsynCaAAaG1210.083333324431-24433
S957Q957XnonsynCaaTaa88124431-24433
S957Q957del2delCAa--a44124431-24433
S957Q957del1delCaa-aa210.524431-24433
S957Q957del1delcaAca-210.524431-24433
S957Q957PnonsyncAacCa11124431-24433

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
S957Q957RcAacGa1304313044All0.002495
S957Q957RcAAcGT113044All0
S957Q957RcAacGa1283912840B.1.5260.301775
S957Q957RcAAcGT112840B.1.5260.000024
S957Q957LcAacTa11521157All0.00022
S957Q957LcAAcTT41157All0.000001
S957Q957LcAAcTC11157All0
S957Q957LcAacTa546546B.1.1.70.000489
S957Q957LcAacTa478481B.1.1.3120.913958
S957Q957LcAAcTT3481B.1.1.3120.005736
S957Q957QcaAcaG164164All0.000031
S957Q957HcaAcaC4580All0.000009
S957Q957HcaAcaT3580All0.000007
S957Q957delCAA---6969All0.000013
S957Q957QcaAcaG6565B.1.1.70.000058
S957Q957RcAacGa5151B.10.000467
S957Q957RcAacGa3939B.1.1.3120.07457
S957Q957delCAA---3333B.1.1.70.00003
S957Q957QcaAcaG2626B.1.177.210.001988
S957Q957ECaaGaa2323All0.000004
S957Q957LcAacTa2121B.1.1.3110.007521
S957Q957RcAacGa1515AY.250.00009
S957Q957ECaaGaa1515B.1.1.70.000013
S957Q957HcaAcaC1515B.1.3510.000446
S957Q957KCaaAaa1112All0.000002
S957Q957KCaAAaG112All0
S957Q957LcAacTa1212B.1.4270.000606
S957Q957QcaAcaG1212P.10.000189
S957Q957LcAacTa1111B.1.3660.053659
S957Q957LcAacTa1010AY.4.50.001075
S957Q957RcAacGa1010B.1.1.70.000009
S957Q957HcaAcaT910B.1.5960.000784
S957Q957HcaAcaC110B.1.5960.000087
S957Q957RcAacGa1010B.1.6230.005365
S957Q957XCaaTaa88All0.000002
S957Q957LcAacTa88AY.430.000035
S957Q957HcaAcaC68B.10.000055
S957Q957HcaAcaT28B.10.000018
S957Q957QcaAcaG88B.1.177.810.001515
S957Q957LcAacTa88B.1.20.00007
S957Q957RcAacGa88B.1.617.20.00003
S957Q957QcaAcaG77AY.440.000043
S957Q957RcAacGa77AY.440.000043
S957Q957HcaAcaT57B.1.1770.000066
S957Q957HcaAcaC27B.1.1770.000026
S957Q957QcaAcaG77B.1.617.20.000026
S957Q957RcAacGa66B.1.10.000109
S957Q957HcaAcaC66B.1.1.5190.000238
S957Q957RcAacGa66B.1.20.000053
S957Q957QcaAcaG66B.1.5260.000141
S957Q957HcaAcaT55A.300.714286
S957Q957LcAacTa45B.10.000037
S957Q957LcAAcTT15B.10.000009
S957Q957delCAA---55B.1.1770.000066
S957Q957RcAacGa55P.10.000079
S957Q957LcAacTa55P.1.140.000239
S957Q957del2CAa--a44All0.000001
S957Q957RcAacGa44AY.20.001425
S957Q957HcaAcaT44AY.330.000267
S957Q957LcAacTa44AY.40.000006
S957Q957LcAacTa44B0.000511
S957Q957HcaAcaC44C.140.017316
S957Q957QcaAcaG44Q.10.000505
S957Q957RcAacGa33AY.360.000445
S957Q957QcaAcaG33AY.40.000005
S957Q957delCAA---33AY.40.000005
S957Q957QcaAcaG33AY.4.20.000065
S957Q957HcaAcaC33B.1.1.70.000003
S957Q957RcAacGa33B.1.3510.000089
S957Q957LcAacTa33B.1.4280.003061
S957Q957ECaaGaa33P.1.170.000485
S957Q957KCaaAaa120.055556
S957Q957KCaAAaG120.055556
S957Q957del1Caa-aa12All0
S957Q957del1caAca-12All0
S957Q957LcAacTa22AY.1030.000012
S957Q957LcAacTa22AY.290.000032
S957Q957LcAacTa22AY.30.00002
S957Q957RcAacGa22AY.430.000009
S957Q957delCAA---22AY.430.000009
S957Q957QcaAcaG22AY.430.000009
S957Q957LcAacTa22AY.440.000012
S957Q957delCAA---22AY.50.000041
S957Q957QcaAcaG22B0.000256
S957Q957KCaaAaa22B.10.000018
S957Q957delCAA---22B.10.000018
S957Q957delCAA---22B.1.1.3120.003824
S957Q957RcAacGa22B.1.1.5190.000079
S957Q957KCaaAaa22B.1.1.70.000002
S957Q957QcaAcaG22B.1.20.000018
S957Q957LcAacTa22B.1.2430.000139
S957Q957QcaAcaG22B.1.2580.000133
S957Q957RcAacGa22B.1.3110.000549
S957Q957LcAacTa22B.1.360.000292
S957Q957RcAacGa22B.1.4270.000101
S957Q957LcAacTa22B.1.5260.000047
S957Q957RcAacGa22B.1.5440.012048
S957Q957delCAA---22B.1.617.20.000008
S957Q957LcAacTa22B.1.617.20.000008
S957Q957RcAacGa22B.1.6370.000146
S957Q957HcaAcaC22B.1.6380.105263
S957Q957RcAacGa22D.20.00015
S957Q957XCaaTaa22D.20.00015
S957Q957HcaAcaC22P.10.000032
S957Q957RcAacGa22P.1.120.000968
S957Q957LcAacTa22P.1.130.001797
S957Q957RcAacGa22P.1.170.000324
S957Q957QcaAcaG110.055556
S957Q957HcaAcaT11A.2.20.001689
S957Q957QcaAcaG11A.2.50.000499
S957Q957PcAacCa11All0
S957Q957HcaAcaC11AY.1020.000027
S957Q957QcaAcaG11AY.1020.000027
S957Q957QcaAcaG11AY.1110.000183
S957Q957LcAacTa11AY.1140.000231
S957Q957QcaAcaG11AY.1200.000037
S957Q957LcAacTa11AY.140.000088
S957Q957QcaAcaG11AY.16.10.00047
S957Q957ECaaGaa11AY.230.00007
S957Q957HcaAcaT11AY.230.00007
S957Q957LcAacTa11AY.250.000006
S957Q957LcAacTa11AY.270.000065
S957Q957HcaAcaT11AY.290.000016
S957Q957QcaAcaG11AY.320.000532
S957Q957QcaAcaG11AY.330.000067
S957Q957LcAacTa11AY.390.000025
S957Q957HcaAcaC11AY.40.000002
S957Q957HcaAcaT11AY.410.000294
S957Q957XCaaTaa11AY.430.000004
S957Q957del1Caa-aa11AY.430.000004
S957Q957ECaaGaa11AY.440.000006
S957Q957HcaAcaT11AY.440.000006
S957Q957QcaAcaG11AY.450.000122
S957Q957delCAA---11AY.46.20.000635
S957Q957LcAacTa11AY.470.000031
S957Q957KCaaAaa11AY.50.000021
S957Q957del1caAca-11AY.50.000021
S957Q957RcAacGa11AY.5.30.000337
S957Q957HcaAcaC11AY.5.40.000277
S957Q957QcaAcaG11AY.610.000105
S957Q957delCAA---11AY.720.001361
S957Q957QcaAcaG11AY.740.000116
S957Q957delCAA---11AY.810.001992
S957Q957delCAA---11AY.90.000068
S957Q957XCaaTaa11AY.9.20.000037
S957Q957ECaaGaa11AY.9.20.000037
S957Q957LcAacTa11AY.98.10.000048
S957Q957XCaaTaa11B0.000128
S957Q957XCaaTaa11B.10.000009
S957Q957KCaaAaa11B.1.10.000018
S957Q957LcAacTa11B.1.10.000018
S957Q957delCAA---11B.1.10.000018
S957Q957delCAA---11B.1.1.2360.006897
S957Q957LcAacTa11B.1.1.3060.000438
S957Q957RcAacGa11B.1.1.4610.012048
S957Q957XCaaTaa11B.1.1.5190.00004
S957Q957QcaAcaG11B.1.1.5190.00004
S957Q957PcAacCa11B.1.1.70.000001
S957Q957XCaaTaa11B.1.1.70.000001
S957Q957delCAA---11B.1.1.700.000341
S957Q957RcAacGa11B.1.1600.000031
S957Q957delCAA---11B.1.1610.017241
S957Q957QcaAcaG11B.1.1770.000013
S957Q957LcAacTa11B.1.1770.000013
S957Q957del2CAa--a11B.1.1770.000013
S957Q957delCAA---11B.1.177.100.000878
S957Q957delCAA---11B.1.177.150.000631
S957Q957delCAA---11B.1.177.170.000821
S957Q957del2CAa--a11B.1.177.190.001431
S957Q957delCAA---11B.1.177.210.000076
S957Q957delCAA---11B.1.177.40.000211
S957Q957HcaAcaC11B.1.177.570.000281
S957Q957delCAA---11B.1.177.570.000281
S957Q957delCAA---11B.1.177.580.001332
S957Q957delCAA---11B.1.177.630.002703
S957Q957delCAA---11B.1.177.70.000165
S957Q957KCaaAaa11B.1.177.70.000165
S957Q957del2CAa--a11B.1.177.70.000165
S957Q957RcAacGa11B.1.177.730.000566
S957Q957KCaaAaa11B.1.2210.000071
S957Q957QcaAcaG11B.1.2210.000071
S957Q957HcaAcaT11B.1.2210.000071
S957Q957LcAacTa11B.1.2210.000071
S957Q957del2CAa--a11B.1.230.006061
S957Q957LcAacTa11B.1.2580.000067
S957Q957RcAacGa11B.1.258.70.001912
S957Q957RcAacGa11B.1.3360.002439
S957Q957LcAacTa11B.1.3560.001727
S957Q957delCAA---11B.1.36.170.000494
S957Q957RcAacGa11B.1.36.380.001642
S957Q957QcaAcaG11B.1.3610.001289
S957Q957LcAacTa11B.1.3690.000285
S957Q957LcAacTa11B.1.4290.000024
S957Q957RcAacGa11B.1.4970.000315
S957Q957RcAacGa11B.1.5680.001111
S957Q957RcAacGa11B.1.5760.000907
S957Q957LcAacTa11B.1.5770.000687
S957Q957RcAacGa11B.1.5800.004065
S957Q957HcaAcaT11B.1.5820.000491
S957Q957RcAacGa11B.1.5820.000491
S957Q957HcaAcaT11B.1.5950.000261
S957Q957KCaaAaa11B.1.617.10.000129
S957Q957KCaaAaa11B.1.617.20.000004
S957Q957HcaAcaT11B.1.617.20.000004
S957Q957RcAacGa11B.1.6210.000089
S957Q957HcaAcaT11B.1.6280.000352
S957Q957LcAAcTC11B.4.40.018868
S957Q957LcAacTa11B.4.50.011905
S957Q957ECaaGaa11B.60.00091
S957Q957LcAacTa11C.10.002392
S957Q957RcAacGa11C.140.004329
S957Q957LcAacTa11C.260.007353
S957Q957ECaaGaa11C.36.30.000567
S957Q957RcAacGa11C.370.000116
S957Q957RcAacGa11P.1.10.000318
S957Q957RcAacGa11P.1.100.000269
S957Q957RcAacGa11P.1.140.000048
S957Q957LcAacTa11P.1.20.001156
S957Q957RcAacGa11P.60.003145