CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = S : CodonNum = 950

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
S950D950NnonsynGatAat268192826817000.99991524410-24412
S950D950NnonsynGaTAaC26819282280.000085013524410-24412
S950D950HnonsynGatCat13824138010.99833624410-24412
S950D950HnonsynGaTCaC13824230.0016637724410-24412
S950D950DsyngaTgaC286286124410-24412
S950D950YnonsynGatTat267267124410-24412
S950D950del1delGat-at1471430.97278924410-24412
S950D950del1delgaTga-14740.027210924410-24412
S950D950deldelGAT---7878124410-24412
S950D950SnonsynGAtAGt68670.98529424410-24412
S950D950SnonsynGATAGC6810.014705924410-24412
S950D950GnonsyngAtgGt48460.95833324410-24412
S950D950GnonsyngATgGC4810.020833324410-24412
S950D950GnonsyngATgGA4810.020833324410-24412
S950D950AnonsyngAtgCt2929124410-24412
S950D950EnonsyngaTgaG16100.62524410-24412
S950D950EnonsyngaTgaA1660.37524410-24412
S950D950InonsynGAtATt1313124410-24412
S950D950KnonsynGaTAaA11100.90909124410-24412
S950D950KnonsynGaTAaG1110.090909124410-24412
S950D950TnonsynGAtACt55124410-24412
S950D950VnonsyngAtgTt33124410-24412
S950D950del2delgATg--210.524410-24412
S950D950del2delGAt--t210.524410-24412
S950D950RnonsynGATAGA11124410-24412

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
S950D950NGatAat26817002681928All0.512907
S950D950NGaTAaC2282681928All0.000044
S950D950NGatAat637641637692AY.40.992439
S950D950NGaTAaC51637692AY.40.000079
S950D950NGatAat258153258171B.1.617.20.972053
S950D950NGaTAaC18258171B.1.617.20.000068
S950D950NGatAat208699208704AY.430.924633
S950D950NGaTAaC5208704AY.430.000022
S950D950NGatAat162355162389AY.250.976536
S950D950NGaTAaC34162389AY.250.000205
S950D950NGatAat160024160040AY.440.974028
S950D950NGaTAaC16160040AY.440.000097
S950D950NGatAat157415157417AY.1030.977399
S950D950NGaTAaC2157417AY.1030.000012
S950D950NGatAat9830498304AY.30.97777
S950D950NGatAat6328563285AY.290.998233
S950D950NGatAat4752347529AY.50.981312
S950D950NGaTAaC647529AY.50.000124
S950D950NGatAat4584545846AY.4.20.994318
S950D950NGaTAaC145846AY.4.20.000022
S950D950NGatAat3897939002AY.390.963229
S950D950NGaTAaC2339002AY.390.000568
S950D950NGatAat3489634897AY.1020.925231
S950D950NGaTAaC134897AY.1020.000027
S950D950NGatAat3402134022AY.260.96314
S950D950NGaTAaC134022AY.260.000028
S950D950NGatAat3115431154AY.470.96905
S950D950NGatAat2696926976AY.1190.952228
S950D950NGaTAaC726976AY.1190.000247
S950D950NGatAat2658626587AY.1200.988437
S950D950NGaTAaC126587AY.1200.000037
S950D950NGatAat2591425914AY.9.20.951811
S950D950NGatAat2498024980AY.39.10.989542
S950D950NGatAat2407924080AY.60.990335
S950D950NGaTAaC124080AY.60.000041
S950D950NGatAat2381123812AY.200.925418
S950D950NGaTAaC123812AY.200.000039
S950D950NGatAat2331723319AY.420.938046
S950D950NGaTAaC223319AY.420.00008
S950D950NGatAat2052920533AY.1000.94447
S950D950NGaTAaC420533AY.1000.000184
S950D950NGatAat1957719577AY.98.10.948131
S950D950NGatAat1736017361AY.750.972549
S950D950NGaTAaC117361AY.750.000056
S950D950NGatAat1543815438AY.1180.967172
S950D950NGatAat1531315313AY.270.991069
S950D950NGatAat1463214634AY.90.98905
S950D950NGaTAaC214634AY.90.000135
S950D950NGatAat1404214042AY.330.937696
S950D950HGatCat1380113824All0.00264
S950D950HGaTCaC2313824All0.000004
S950D950NGatAat1354013540AY.230.94441
S950D950HGatCat1303513058B.1.6370.952503
S950D950HGaTCaC2313058B.1.6370.001681
S950D950NGatAat1244912449AY.980.983411
S950D950NGatAat1242412446AY.46.60.897104
S950D950NGaTAaC2212446AY.46.60.001589
S950D950NGatAat1140811408AY.9.10.955124
S950D950NGatAat1122611226AY.3.10.957115
S950D950NGatAat1116711167AY.140.982838
S950D950NGatAat1108111081AY.1170.936528
S950D950NGatAat1070910711B.1.6210.947951
S950D950NGaTAaC210711B.1.6210.000177
S950D950NGatAat1015610156AY.540.968345
S950D950NGatAat98729872AY.340.957238
S950D950NGatAat92779277AY.99.20.854944
S950D950NGatAat91979198AY.4.50.988606
S950D950NGaTAaC19198AY.4.50.000107
S950D950NGatAat87548754AY.1100.986477
S950D950NGatAat86608660AY.7.10.975995
S950D950NGatAat86478647AY.460.899979
S950D950NGatAat85708570AY.740.991095
S950D950NGatAat82568257AY.610.865046
S950D950NGaTAaC18257AY.610.000105
S950D950NGatAat77787778AY.450.946459
S950D950NGatAat68196819AY.1130.970953
S950D950NGatAat66806680AY.4.2.10.995232
S950D950NGatAat63176317AY.1210.854804
S950D950NGatAat62896289AY.360.932118
S950D950NGatAat60776077AY.130.978268
S950D950NGatAat59865986AY.46.40.984701
S950D950NGatAat53775378AY.1110.984799
S950D950NGaTAaC15378AY.1110.000183
S950D950NGatAat50585058AY.70.991376
S950D950NGatAat50355036AY.46.50.999008
S950D950NGaTAaC15036AY.46.50.000198
S950D950NGatAat48974897AY.75.10.882979
S950D950NGatAat46074607AY.700.960592
S950D950NGatAat45434543AY.690.848049
S950D950NGatAat45124515AY.29.10.994928
S950D950NGaTAaC34515AY.29.10.000662
S950D950NGatAat41604161AY.1140.961405
S950D950NGaTAaC14161AY.1140.000231
S950D950NGatAat40214021AY.350.937078
S950D950NGatAat35773577AY.930.976789
S950D950NGatAat34033403AY.680.931563
S950D950NGatAat33243324AY.530.955722
S950D950NGatAat32903290AY.920.945131
S950D950NGatAat32683268AY.1160.937195
S950D950NGatAat31633163AY.116.10.985051
S950D950NGatAat31163116AY.410.915932
S950D950NGatAat31113111AY.5.40.860819
S950D950NGatAat30753075AY.120.10.987159
S950D950NGatAat30593059AY.370.966814
S950D950NGatAat29662966AY.120.937421
S950D950NGatAat27992799AY.5.30.944332
S950D950NGatAat27622762AY.20.983618
S950D950NGatAat26652665AY.1060.892498
S950D950NGatAat25572557AY.630.989168
S950D950NGatAat24902490AY.300.985358
S950D950NGatAat23962396AY.23.11
S950D950NGatAat23572357AY.10.932727
S950D950NGatAat23002300AY.160.873197
S950D950NGatAat22812281AY.4.40.933306
S950D950NGatAat22722272AY.850.970525
S950D950NGatAat22132213AY.620.96427
S950D950NGatAat22122212AY.240.953448
S950D950NGatAat22022202AY.940.974768
S950D950NGatAat21052105AY.670.977252
S950D950NGatAat20862086AY.480.970233
S950D950NGatAat20772077AY.1070.967847
S950D950NGatAat20402040AY.840.892388
S950D950NGatAat19141914AY.120.2.10.953662
S950D950NGatAat19141914B.1.621.10.968134
S950D950NGatAat18861887AY.16.10.886278
S950D950NGaTAaC11887AY.16.10.00047
S950D950NGatAat18721872B.10.017147
S950D950NGatAat18361836AY.1010.900441
S950D950NGatAat18321832AY.710.870309
S950D950NGatAat18291829AY.100.969263
S950D950NGatAat17871799AY.590.946504
S950D950NGaTAaC121799AY.590.006356
S950D950NGatAat17221722AY.650.91791
S950D950NGatAat16951695AY.7.20.947987
S950D950NGatAat16451645AY.80.99697
S950D950NGatAat16211621AY.640.964881
S950D950NGatAat15621562AY.320.831736
S950D950NGatAat15541554AY.380.775836
S950D950NGatAat15111512AY.46.20.959975
S950D950NGaTAaC11512AY.46.20.000635
S950D950NGatAat15041504AY.570.986877
S950D950NGatAat14731473AY.1050.947267
S950D950NGatAat14571457AY.730.969395
S950D950NGatAat14541454AY.900.995209
S950D950NGatAat13791379AY.39.1.10.999275
S950D950NGatAat13531353AY.4.10.997788
S950D950NGatAat13141314AY.1090.971893
S950D950NGatAat12661266AY.910.924763
S950D950NGatAat12351235AY.500.98721
S950D950NGatAat11821182AY.520.962541
S950D950NGatAat11781178AY.870.980849
S950D950NGatAat11661166AY.950.887367
S950D950NGatAat11211121AY.860.93029
S950D950NGatAat10711071AY.880.94695
S950D950NGatAat10601060AY.4.30.892256
S950D950NGatAat10201020AY.600.956848
S950D950NGatAat10091009AY.510.917273
S950D950NGatAat997997AY.580.904719
S950D950NGatAat985985AY.400.949855
S950D950NGatAat955955AY.46.10.980493
S950D950NGatAat902902AY.660.964706
S950D950NGatAat895895AY.34.10.4564
S950D950NGatAat879879AY.800.992099
S950D950NGatAat840840AY.990.881427
S950D950NGatAat839839AY.770.945885
S950D950NGatAat816816AY.190.930445
S950D950NGatAat812812AY.790.983051
S950D950NGatAat806806AY.46.30.752568
S950D950NGatAat741741AY.120.20.952442
S950D950NGatAat735735AY.110.983936
S950D950NGatAat722722AY.820.979647
S950D950NGatAat699700AY.1080.770673
S950D950NGaTAaC1700AY.1080.001103
S950D950NGatAat690690AY.720.938776
S950D950NGatAat648648AY.39.20.998459
S950D950NGatAat620620AY.99.10.962733
S950D950NGatAat590590AY.560.94703
S950D950NGatAat589589AY.780.90755
S950D950NGatAat576576AY.830.993103
S950D950NGatAat545545AY.970.926871
S950D950NGatAat532532AY.550.488073
S950D950NGatAat506506AY.9.2.11
S950D950NGatAat491491AY.210.931689
S950D950NGatAat488488AY.810.972112
S950D950NGatAat483483AY.1040.958333
S950D950NGatAat480480AY.280.907372
S950D950NGatAat470470AY.220.983264
S950D950HGatCat461461B.10.004223
S950D950NGatAat441441AY.150.98
S950D950NGatAat397397AY.5.20.977833
S950D950NGatAat396396B.1.6250.931765
S950D950NGatAat299299AY.490.955272
S950D950DgaTgaC286286All0.000055
S950D950NGatAat281281B.1.617.30.838806
S950D950YGatTat267267All0.000051
S950D950NGatAat263263AY.5.10.988722
S950D950NGatAat238238AY.91.10.96748
S950D950NGatAat198198AY.760.956522
S950D950NGatAat196196AY.890.960784
S950D950NGatAat186186B.1.6300.973822
S950D950NGatAat178178B0.022751
S950D950YGatTat170170B.1.1.70.000152
S950D950del1Gat-at143147All0.000027
S950D950del1gaTga-4147All0.000001
S950D950DgaTgaC144144B.1.1.70.000129
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S950D950NGatAat122122AY.171
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