CoV-GLUE | Mutations | Mutation
Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):
ORF | CodonNum | Mut | ORF1abMut | MutType | RefCodon | MutCodon | AACount | CodonCount | CodonProp | Genome Position |
S | 838 | G838G | syn | ggT | ggC | 15139 | 15036 | 0.993196 | 24074-24076 | |
S | 838 | G838G | syn | ggT | ggA | 15139 | 96 | 0.00634124 | 24074-24076 | |
S | 838 | G838G | syn | ggT | ggG | 15139 | 7 | 0.000462382 | 24074-24076 | |
S | 838 | G838S | nonsyn | Ggt | Agt | 622 | 621 | 0.998392 | 24074-24076 | |
S | 838 | G838S | nonsyn | GGt | TCt | 622 | 1 | 0.00160772 | 24074-24076 | |
S | 838 | G838D | nonsyn | gGt | gAt | 118 | 117 | 0.991525 | 24074-24076 | |
S | 838 | G838D | nonsyn | gGT | gAC | 118 | 1 | 0.00847458 | 24074-24076 | |
S | 838 | G838V | nonsyn | gGt | gTt | 53 | 53 | 1 | 24074-24076 | |
S | 838 | G838del | del | GGT | --- | 51 | 51 | 1 | 24074-24076 | |
S | 838 | G838C | nonsyn | Ggt | Tgt | 30 | 29 | 0.966667 | 24074-24076 | |
S | 838 | G838C | nonsyn | GgT | TgC | 30 | 1 | 0.0333333 | 24074-24076 | |
S | 838 | G838R | nonsyn | Ggt | Cgt | 19 | 14 | 0.736842 | 24074-24076 | |
S | 838 | G838R | nonsyn | GgT | CgG | 19 | 4 | 0.210526 | 24074-24076 | |
S | 838 | G838R | nonsyn | GgT | AgA | 19 | 1 | 0.0526316 | 24074-24076 | |
S | 838 | G838del1 | del | Ggt | -gt | 2 | 1 | 0.5 | 24074-24076 | |
S | 838 | G838del1 | del | GgT | -gC | 2 | 1 | 0.5 | 24074-24076 | |
S | 838 | G838K | nonsyn | GGT | AAA | 1 | 1 | 1 | 24074-24076 | |
S | 838 | G838A | nonsyn | gGt | gCt | 1 | 1 | 1 | 24074-24076 | |
S | 838 | G838N | nonsyn | GGt | AAt | 1 | 1 | 1 | 24074-24076 | |
S | 838 | G838E | nonsyn | gGT | gAA | 1 | 1 | 1 | 24074-24076 |
Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):
ORF | CodonNum | Mut | RefCodon | MutCodon | CodonCount | AACount | Lineage | LineageCodonProp |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 15036 | 15139 | All | 0.002876 |
S | 838 | G838G | ggT | ggA | 96 | 15139 | All | 0.000018 |
S | 838 | G838G | ggT | ggG | 7 | 15139 | All | 0.000001 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 14102 | 14102 | B.1.243 | 0.981282 |
S | 838 | G838S | Ggt | Agt | 621 | 622 | All | 0.000119 |
S | 838 | G838S | GGt | TCt | 1 | 622 | All | 0 |
S | 838 | G838S | Ggt | Agt | 510 | 510 | AY.25 | 0.003068 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 328 | 331 | B.1 | 0.003004 |
S | 838 | G838G | ggT | ggA | 3 | 331 | B.1 | 0.000027 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 149 | 149 | B.1.602 | 0.973856 |
S | 838 | G838D | gGt | gAt | 117 | 118 | All | 0.000022 |
S | 838 | G838D | gGT | gAC | 1 | 118 | All | 0 |
S | 838 | G838G | ggT | ggA | 89 | 89 | B.1.1.275 | 1 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 69 | 69 | B.1.243.2 | 1 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 68 | 68 | AY.33 | 0.004541 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 54 | 54 | AY.121 | 0.007307 |
S | 838 | G838V | gGt | gTt | 53 | 53 | All | 0.00001 |
S | 838 | G838del | GGT | --- | 51 | 51 | All | 0.00001 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 45 | 45 | B.1.243.1 | 1 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 39 | 39 | B.1.2 | 0.000343 |
S | 838 | G838C | Ggt | Tgt | 29 | 30 | All | 0.000006 |
S | 838 | G838C | GgT | TgC | 1 | 30 | All | 0 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 24 | 24 | B.1.169 | 0.358209 |
S | 838 | G838D | gGt | gAt | 20 | 20 | AY.73 | 0.013307 |
S | 838 | G838R | Ggt | Cgt | 14 | 19 | All | 0.000003 |
S | 838 | G838R | GgT | CgG | 4 | 19 | All | 0.000001 |
S | 838 | G838R | GgT | AgA | 1 | 19 | All | 0 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 19 | 19 | B.1.596 | 0.001656 |
S | 838 | G838D | gGt | gAt | 16 | 16 | AY.4 | 0.000025 |
S | 838 | G838S | Ggt | Agt | 15 | 16 | B.1.617.2 | 0.000056 |
S | 838 | G838S | GGt | TCt | 1 | 16 | B.1.617.2 | 0.000004 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 11 | 13 | B.1.1.7 | 0.00001 |
S | 838 | G838G | ggT | ggG | 1 | 13 | B.1.1.7 | 0.000001 |
S | 838 | G838G | ggT | ggA | 1 | 13 | B.1.1.7 | 0.000001 |
S | 838 | G838S | Ggt | Agt | 13 | 13 | B.1.177 | 0.000171 |
S | 838 | G838S | Ggt | Agt | 12 | 12 | AY.103 | 0.000075 |
S | 838 | G838D | gGt | gAt | 12 | 12 | B.1 | 0.00011 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 12 | 12 | B.1.1 | 0.000218 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 12 | 12 | B.1.199 | 0.049587 |
S | 838 | G838D | gGt | gAt | 12 | 12 | B.1.526 | 0.000282 |
S | 838 | G838D | gGt | gAt | 11 | 11 | AY.119 | 0.000388 |
S | 838 | G838D | gGt | gAt | 11 | 11 | B.1.1.7 | 0.00001 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 11 | 11 | B.1.234 | 0.001451 |
S | 838 | G838del | GGT | --- | 10 | 10 | B.1.1.7 | 0.000009 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 10 | 10 | B.1.258 | 0.000665 |
S | 838 | G838R | Ggt | Cgt | 9 | 9 | AY.103 | 0.000056 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 9 | 9 | B.1.177 | 0.000119 |
S | 838 | G838V | gGt | gTt | 8 | 8 | AY.4 | 0.000012 |
S | 838 | G838S | Ggt | Agt | 7 | 7 | AY.119 | 0.000247 |
S | 838 | G838D | gGt | gAt | 6 | 6 | A.1 | 0.001691 |
S | 838 | G838C | Ggt | Tgt | 5 | 6 | B.1 | 0.000046 |
S | 838 | G838C | GgT | TgC | 1 | 6 | B.1 | 0.000009 |
S | 838 | G838S | Ggt | Agt | 6 | 6 | B.1.1.7 | 0.000005 |
S | 838 | G838D | gGt | gAt | 6 | 6 | B.1.177 | 0.000079 |
S | 838 | G838V | gGt | gTt | 6 | 6 | P.1.4 | 0.005859 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 4 | 5 | AY.25 | 0.000024 |
S | 838 | G838G | ggT | ggA | 1 | 5 | AY.25 | 0.000006 |
S | 838 | G838S | Ggt | Agt | 5 | 5 | AY.4 | 0.000008 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 4 | 5 | AY.43 | 0.000018 |
S | 838 | G838G | ggT | ggG | 1 | 5 | AY.43 | 0.000004 |
S | 838 | G838S | Ggt | Agt | 5 | 5 | AY.44 | 0.00003 |
S | 838 | G838V | gGt | gTt | 5 | 5 | B.1 | 0.000046 |
S | 838 | G838S | Ggt | Agt | 5 | 5 | B.1.1.391 | 0.042735 |
S | 838 | G838V | gGt | gTt | 5 | 5 | B.1.438.1 | 0.000536 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 4 | 5 | B.1.617.2 | 0.000015 |
S | 838 | G838G | ggT | ggG | 1 | 5 | B.1.617.2 | 0.000004 |
S | 838 | G838C | Ggt | Tgt | 4 | 4 | AY.4 | 0.000006 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 3 | 4 | AY.4 | 0.000005 |
S | 838 | G838G | ggT | ggG | 1 | 4 | AY.4 | 0.000002 |
S | 838 | G838C | Ggt | Tgt | 4 | 4 | AY.43 | 0.000018 |
S | 838 | G838del | GGT | --- | 4 | 4 | AY.43 | 0.000018 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 4 | 4 | AY.5 | 0.000083 |
S | 838 | G838V | gGt | gTt | 3 | 3 | AY.119 | 0.000106 |
S | 838 | G838S | Ggt | Agt | 3 | 3 | AY.20 | 0.000117 |
S | 838 | G838S | Ggt | Agt | 3 | 3 | AY.5 | 0.000062 |
S | 838 | G838R | GgT | CgG | 3 | 3 | B.1 | 0.000027 |
S | 838 | G838S | Ggt | Agt | 3 | 3 | B.1 | 0.000027 |
S | 838 | G838C | Ggt | Tgt | 3 | 3 | B.1.1.7 | 0.000003 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 3 | 3 | B.1.396 | 0.002117 |
S | 838 | G838D | gGt | gAt | 3 | 3 | B.1.617.2 | 0.000011 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 3 | 3 | B.1.621 | 0.000266 |
S | 838 | G838V | gGt | gTt | 3 | 3 | D.2 | 0.000225 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 3 | 3 | P.1 | 0.000047 |
S | 838 | G838S | Ggt | Agt | 3 | 3 | P.1 | 0.000047 |
S | 838 | G838del | GGT | --- | 3 | 3 | P.1.15 | 0.000697 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 2 | 2 | A.2.4 | 0.006734 |
S | 838 | G838del1 | GgT | -gC | 1 | 2 | All | 0 |
S | 838 | G838del1 | Ggt | -gt | 1 | 2 | All | 0 |
S | 838 | G838S | Ggt | Agt | 2 | 2 | AY.100 | 0.000092 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 2 | 2 | AY.103 | 0.000012 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 2 | 2 | AY.26 | 0.000057 |
S | 838 | G838D | gGt | gAt | 2 | 2 | AY.3 | 0.00002 |
S | 838 | G838S | Ggt | Agt | 2 | 2 | AY.39 | 0.000049 |
S | 838 | G838del | GGT | --- | 2 | 2 | AY.4 | 0.000003 |
S | 838 | G838V | gGt | gTt | 2 | 2 | AY.4.2 | 0.000043 |
S | 838 | G838del | GGT | --- | 2 | 2 | AY.4.5 | 0.000215 |
S | 838 | G838V | gGt | gTt | 2 | 2 | AY.43 | 0.000009 |
S | 838 | G838V | gGt | gTt | 2 | 2 | AY.54 | 0.000191 |
S | 838 | G838S | Ggt | Agt | 2 | 2 | AY.99.2 | 0.000184 |
S | 838 | G838S | Ggt | Agt | 2 | 2 | B | 0.000256 |
S | 838 | G838del | GGT | --- | 2 | 2 | B.1 | 0.000018 |
S | 838 | G838del | GGT | --- | 2 | 2 | B.1.1 | 0.000036 |
S | 838 | G838V | gGt | gTt | 2 | 2 | B.1.1 | 0.000036 |
S | 838 | G838del | GGT | --- | 2 | 2 | B.1.1.236 | 0.013793 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 2 | 2 | B.1.1.335 | 0.025974 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 2 | 2 | B.1.1.486 | 0.003155 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 2 | 2 | B.1.160 | 0.000062 |
S | 838 | G838del | GGT | --- | 2 | 2 | B.1.177.63 | 0.005405 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 2 | 2 | B.1.311 | 0.000549 |
S | 838 | G838D | gGt | gAt | 2 | 2 | B.1.470 | 0.002809 |
S | 838 | G838S | Ggt | Agt | 2 | 2 | B.1.526 | 0.000047 |
S | 838 | G838D | gGt | gAt | 2 | 2 | B.1.551 | 0.002581 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 2 | 2 | B.1.577 | 0.001375 |
S | 838 | G838del | GGT | --- | 2 | 2 | B.1.617.2 | 0.000008 |
S | 838 | G838S | Ggt | Agt | 1 | 1 | 0.055556 | |
S | 838 | G838D | gGt | gAt | 1 | 1 | 0.055556 | |
S | 838 | G838G | ggT | ggA | 1 | 1 | 0.055556 | |
S | 838 | G838N | GGt | AAt | 1 | 1 | 0.055556 | |
S | 838 | G838E | gGT | gAA | 1 | 1 | 0.055556 | |
S | 838 | G838R | GgT | AgA | 1 | 1 | 0.055556 | |
S | 838 | G838K | GGT | AAA | 1 | 1 | 0.055556 | |
S | 838 | G838del | GGT | --- | 1 | 1 | A | 0.000387 |
S | 838 | G838D | gGt | gAt | 1 | 1 | AL.1 | 0.012987 |
S | 838 | G838E | gGT | gAA | 1 | 1 | All | 0 |
S | 838 | G838K | GGT | AAA | 1 | 1 | All | 0 |
S | 838 | G838A | gGt | gCt | 1 | 1 | All | 0 |
S | 838 | G838N | GGt | AAt | 1 | 1 | All | 0 |
S | 838 | G838S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.102 | 0.000027 |
S | 838 | G838D | gGt | gAt | 1 | 1 | AY.102 | 0.000027 |
S | 838 | G838D | gGt | gAt | 1 | 1 | AY.103 | 0.000006 |
S | 838 | G838V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.103 | 0.000006 |
S | 838 | G838C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.103 | 0.000006 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 1 | 1 | AY.113 | 0.000142 |
S | 838 | G838del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.119 | 0.000035 |
S | 838 | G838V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.12 | 0.000316 |
S | 838 | G838del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.120 | 0.000037 |
S | 838 | G838V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.120 | 0.000037 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 1 | 1 | AY.120 | 0.000037 |
S | 838 | G838D | gGt | gAt | 1 | 1 | AY.120 | 0.000037 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 1 | 1 | AY.23 | 0.00007 |
S | 838 | G838G | ggT | ggG | 1 | 1 | AY.24 | 0.000431 |
S | 838 | G838D | gGt | gAt | 1 | 1 | AY.25 | 0.000006 |
S | 838 | G838del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.25 | 0.000006 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 1 | 1 | AY.29 | 0.000016 |
S | 838 | G838S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.3 | 0.00001 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 1 | 1 | AY.39 | 0.000025 |
S | 838 | G838C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.39.1 | 0.00004 |
S | 838 | G838R | Ggt | Cgt | 1 | 1 | AY.4 | 0.000002 |
S | 838 | G838C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.42 | 0.00004 |
S | 838 | G838S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.43 | 0.000004 |
S | 838 | G838R | Ggt | Cgt | 1 | 1 | AY.43 | 0.000004 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 1 | 1 | AY.44 | 0.000006 |
S | 838 | G838C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.45 | 0.000122 |
S | 838 | G838S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.46.1 | 0.001027 |
S | 838 | G838del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.46.2 | 0.000635 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 1 | 1 | AY.46.2 | 0.000635 |
S | 838 | G838D | gGt | gAt | 1 | 1 | AY.46.4 | 0.000165 |
S | 838 | G838V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.53 | 0.000288 |
S | 838 | G838G | ggT | ggG | 1 | 1 | AY.65 | 0.000533 |
S | 838 | G838D | gGt | gAt | 1 | 1 | AY.65 | 0.000533 |
S | 838 | G838D | gGt | gAt | 1 | 1 | AY.68 | 0.000274 |
S | 838 | G838C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.7.1 | 0.000113 |
S | 838 | G838C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.75 | 0.000056 |
S | 838 | G838del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.75 | 0.000056 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 1 | 1 | AY.88 | 0.000884 |
S | 838 | G838del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.9.2 | 0.000037 |
S | 838 | G838S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.90 | 0.000684 |
S | 838 | G838V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.92 | 0.000287 |
S | 838 | G838del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.98.1 | 0.000048 |
S | 838 | G838D | gGt | gAt | 1 | 1 | B | 0.000128 |
S | 838 | G838del1 | Ggt | -gt | 1 | 1 | B.1 | 0.000009 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.1.148 | 0.008772 |
S | 838 | G838V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.1.148 | 0.008772 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.1.161 | 0.003534 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.1.210 | 0.005714 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.1.214 | 0.000055 |
S | 838 | G838S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.1.222 | 0.000204 |
S | 838 | G838R | GgT | CgG | 1 | 1 | B.1.1.265 | 0.003155 |
S | 838 | G838del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.409 | 0.002833 |
S | 838 | G838S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.1.482 | 0.023256 |
S | 838 | G838S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.1.519 | 0.00004 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.1.519 | 0.00004 |
S | 838 | G838V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.1.519 | 0.00004 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.1.526 | 0.003546 |
S | 838 | G838A | gGt | gCt | 1 | 1 | B.1.1.7 | 0.000001 |
S | 838 | G838S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.1.70 | 0.000341 |
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S | 838 | G838S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.146 | 0.004237 |
S | 838 | G838S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.160 | 0.000031 |
S | 838 | G838del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.177 | 0.000013 |
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S | 838 | G838del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.177.17 | 0.000821 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.177.7 | 0.000165 |
S | 838 | G838S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.177.77 | 0.000726 |
S | 838 | G838C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.2 | 0.000009 |
S | 838 | G838del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.2 | 0.000009 |
S | 838 | G838D | gGt | gAt | 1 | 1 | B.1.2 | 0.000009 |
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S | 838 | G838D | gGT | gAC | 1 | 1 | B.1.243 | 0.00007 |
S | 838 | G838del1 | GgT | -gC | 1 | 1 | B.1.243 | 0.00007 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.247 | 0.014925 |
S | 838 | G838S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.258 | 0.000067 |
S | 838 | G838del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.258 | 0.000067 |
S | 838 | G838D | gGt | gAt | 1 | 1 | B.1.258.17 | 0.000104 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.284 | 0.013158 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.336 | 0.002439 |
S | 838 | G838C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.351 | 0.00003 |
S | 838 | G838D | gGt | gAt | 1 | 1 | B.1.362 | 0.001541 |
S | 838 | G838G | ggT | ggG | 1 | 1 | B.1.367 | 0.000792 |
S | 838 | G838del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.369 | 0.000285 |
S | 838 | G838V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.375 | 0.00082 |
S | 838 | G838S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.415.1 | 0.007576 |
S | 838 | G838C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.427 | 0.00005 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.427 | 0.00005 |
S | 838 | G838R | Ggt | Cgt | 1 | 1 | B.1.427 | 0.00005 |
S | 838 | G838C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.456 | 0.003268 |
S | 838 | G838S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.517 | 0.000427 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.526 | 0.000024 |
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S | 838 | G838G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.565 | 0.00081 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.567 | 0.003333 |
S | 838 | G838R | Ggt | Cgt | 1 | 1 | B.1.576 | 0.000907 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.580 | 0.004065 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.581 | 0.009434 |
S | 838 | G838S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.582 | 0.000491 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.595 | 0.000261 |
S | 838 | G838C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.596 | 0.000087 |
S | 838 | G838R | Ggt | Cgt | 1 | 1 | B.1.615 | 0.04 |
S | 838 | G838V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.617.2 | 0.000004 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.619 | 0.000871 |
S | 838 | G838del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.621 | 0.000089 |
S | 838 | G838V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.630 | 0.005236 |
S | 838 | G838del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.638 | 0.052632 |
S | 838 | G838del | GGT | --- | 1 | 1 | C.37 | 0.000116 |
S | 838 | G838S | Ggt | Agt | 1 | 1 | C.37 | 0.000116 |
S | 838 | G838S | Ggt | Agt | 1 | 1 | D.2 | 0.000075 |
S | 838 | G838C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | D.2 | 0.000075 |
S | 838 | G838del | GGT | --- | 1 | 1 | P.1 | 0.000016 |
S | 838 | G838D | gGt | gAt | 1 | 1 | P.1 | 0.000016 |
S | 838 | G838S | Ggt | Agt | 1 | 1 | P.1.10 | 0.000269 |
S | 838 | G838del | GGT | --- | 1 | 1 | P.1.13 | 0.000898 |
S | 838 | G838C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | P.1.16 | 0.000374 |
S | 838 | G838del | GGT | --- | 1 | 1 | Q.2 | 0.000613 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 1 | 1 | Q.8 | 0.000165 |
S | 838 | G838S | Ggt | Agt | 1 | 1 | Q.8 | 0.000165 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 1 | 1 | R.1 | 0.00009 |
S | 838 | G838V | gGt | gTt | 1 | 1 | R.1 | 0.00009 |
S | 838 | G838G | ggT | ggC | 1 | 1 | W.3 | 0.005263 |
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CoV-GLUE is still in development. CoV-GLUE was originally developed as part of COG-UK by Josh Singer using the GLUE framework at the MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research (CVR). In 2021 it was redeveloped by Richard Orton to scale to the millions of genome sequences available. We acknowledge support from the MRC (MC_UU_12014/12), WT (220977/Z/20/Z) and UKRI G2P (MR/W005611/1). Please contact Richard Orton with any queries: Richard.Orton@glasgow.ac.uk
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