CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = S : CodonNum = 808

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
S808D808DsyngaTgaC23872387123984-23986
S808D808NnonsynGatAat257257123984-23986
S808D808EnonsyngaTgaG1691590.94082823984-23986
S808D808EnonsyngaTgaA169100.059171623984-23986
S808D808GnonsyngAtgGt125125123984-23986
S808D808deldelGAT---8383123984-23986
S808D808HnonsynGatCat8383123984-23986
S808D808del1delgAtg-t81790.97530923984-23986
S808D808del1delgaTga-8120.024691423984-23986
S808D808YnonsynGatTat5858123984-23986
S808D808AnonsyngAtgCt3131123984-23986
S808D808VnonsyngAtgTt15140.93333323984-23986
S808D808VnonsyngATgTA1510.066666723984-23986
S808D808del2delGAT--C210.523984-23986
S808D808del2delgATg--210.523984-23986
S808D808RnonsynGATAGG11123984-23986
S808D808QnonsynGaTCaA11123984-23986

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
S808D808DgaTgaC23872387All0.000457
S808D808DgaTgaC11841184B.1.1.70.00106
S808D808NGatAat257257All0.000049
S808D808DgaTgaC247247AY.40.000384
S808D808DgaTgaC171171B.1.36.280.982759
S808D808EgaTgaG159169All0.00003
S808D808EgaTgaA10169All0.000002
S808D808DgaTgaC126126AY.440.000767
S808D808GgAtgGt125125All0.000024
S808D808DgaTgaC101101AY.1030.000627
S808D808EgaTgaG9393AY.350.021673
S808D808HGatCat8383All0.000016
S808D808delGAT---8383All0.000016
S808D808del1gAtg-t7981All0.000015
S808D808del1gaTga-281All0
S808D808NGatAat7575B.1.1.70.000067
S808D808del1gAtg-t6666B.1.1.70.000059
S808D808YGatTat5858All0.000011
S808D808DgaTgaC4444B.1.20.000387
S808D808DgaTgaC4444P.1.120.021297
S808D808DgaTgaC3737B.1.617.20.000139
S808D808AgAtgCt3131All0.000006
S808D808DgaTgaC2727P.10.000425
S808D808DgaTgaC2525B.10.000229
S808D808GgAtgGt2525B.1.1600.00078
S808D808GgAtgGt2525B.1.3960.017643
S808D808EgaTgaG2121B.1.1.2650.066246
S808D808NGatAat2020AY.1030.000124
S808D808NGatAat2020AY.250.00012
S808D808DgaTgaC2020AY.430.000089
S808D808DgaTgaC1919A.270.031457
S808D808DgaTgaC1919B.1.1.2910.014105
S808D808GgAtgGt1919B.1.1770.00025
S808D808DgaTgaC1616AY.250.000096
S808D808DgaTgaC1616B.1.10.00029
S808D808delGAT---1616B.1.1.70.000014
S808D808VgAtgTt1415All0.000003
S808D808VgATgTA115All0
S808D808DgaTgaC1515AY.750.00084
S808D808DgaTgaC1515B.1.1.5190.000596
S808D808DgaTgaC1414AY.30.000139
S808D808DgaTgaC1414AY.470.000435
S808D808DgaTgaC1313AY.50.000268
S808D808GgAtgGt1313B.1.2580.000865
S808D808NGatAat1313B.1.617.20.000049
S808D808NGatAat1212AY.40.000019
S808D808AgAtgCt1111AY.46.50.002183
S808D808DgaTgaC1010AY.3.10.000853
S808D808DgaTgaC1010B.1.177.870.007278
S808D808YGatTat99AY.430.00004
S808D808EgaTgaG89B.10.000073
S808D808EgaTgaA19B.10.000009
S808D808GgAtgGt99B.1.1.2140.000499
S808D808NGatAat99B.1.20.000079
S808D808delGAT---99B.1.6210.000797
S808D808YGatTat88B.1.1.70.000007
S808D808HGatCat88B.1.1.70.000007
S808D808DgaTgaC88B.1.2430.000557
S808D808NGatAat88B.1.5260.000188
S808D808HGatCat88B.1.617.20.00003
S808D808DgaTgaC88B.1.6210.000708
S808D808DgaTgaC77AY.1180.000439
S808D808HGatCat77AY.330.000467
S808D808YGatTat77AY.40.000011
S808D808EgaTgaG57B.1.1.70.000004
S808D808EgaTgaA27B.1.1.70.000002
S808D808DgaTgaC77B.1.177.860.001284
S808D808HGatCat77B.1.2430.000487
S808D808DgaTgaC77B.1.5260.000165
S808D808NGatAat77B.1.5960.00061
S808D808NGatAat66AY.430.000027
S808D808NGatAat66AY.440.000037
S808D808NGatAat66B.10.000055
S808D808EgaTgaG66B.1.2580.000399
S808D808DgaTgaC66B.1.360.000875
S808D808DgaTgaC55AY.1000.00023
S808D808NGatAat55AY.1190.000177
S808D808NGatAat55AY.270.000324
S808D808AgAtgCt55AY.40.000008
S808D808HGatCat55AY.40.000008
S808D808DgaTgaC55AY.420.000201
S808D808DgaTgaC55B.1.1600.000156
S808D808DgaTgaC55B.1.1770.000066
S808D808HGatCat55B.1.20.000044
S808D808DgaTgaC55B.1.3490.003574
S808D808NGatAat55B.1.360.00073
S808D808DgaTgaC55B.1.36.290.002587
S808D808HGatCat55B.1.4970.001574
S808D808GgAtgGt55B.1.5260.000118
S808D808DgaTgaC55B.60.00455
S808D808delGAT---55P.10.000079
S808D808delGAT---55P.1.150.001162
S808D808NGatAat55R.10.00045
S808D808GgAtgGt44AY.40.000006
S808D808delGAT---44AY.430.000018
S808D808YGatTat44B.10.000037
S808D808delGAT---44B.10.000037
S808D808HGatCat44B.1.10.000073
S808D808EgaTgaG33A.2.50.001497
S808D808DgaTgaC33AY.1020.00008
S808D808HGatCat33AY.1030.000019
S808D808NGatAat33AY.1170.000254
S808D808DgaTgaC33AY.130.000483
S808D808NGatAat33AY.200.000117
S808D808delGAT---33AY.250.000018
S808D808DgaTgaC33AY.270.000194
S808D808DgaTgaC33AY.290.000047
S808D808DgaTgaC33AY.390.000074
S808D808VgAtgTt33AY.40.000005
S808D808AgAtgCt33AY.4.50.000322
S808D808DgaTgaC33AY.660.003209
S808D808DgaTgaC33AY.98.10.000145
S808D808GgAtgGt33B.10.000027
S808D808HGatCat33B.10.000027
S808D808DgaTgaC33B.1.1.390.001529
S808D808HGatCat33B.1.1770.00004
S808D808del1gAtg-t33B.1.177.820.001432
S808D808DgaTgaC33B.1.258.140.002941
S808D808DgaTgaC33B.1.3110.000824
S808D808DgaTgaC33B.1.3510.000089
S808D808del1gAtg-t33B.1.3510.000089
S808D808DgaTgaC33B.1.4160.003807
S808D808DgaTgaC33B.1.4270.000151
S808D808delGAT---33B.1.617.20.000011
S808D808NGatAat33C.370.000348
S808D808del2GAT--C12All0
S808D808del2gATg--12All0
S808D808NGatAat22AY.1020.000053
S808D808YGatTat22AY.1030.000012
S808D808DgaTgaC22AY.1050.001286
S808D808DgaTgaC22AY.1160.000574
S808D808delGAT---22AY.1200.000074
S808D808DgaTgaC22AY.230.000139
S808D808AgAtgCt22AY.250.000012
S808D808NGatAat22AY.260.000057
S808D808YGatTat22AY.260.000057
S808D808AgAtgCt22AY.270.000129
S808D808DgaTgaC22AY.300.000791
S808D808NGatAat22AY.300.000791
S808D808DgaTgaC22AY.330.000134
S808D808EgaTgaG22AY.40.000003
S808D808DgaTgaC22AY.4.20.000043
S808D808DgaTgaC22AY.4.50.000215
S808D808HGatCat22AY.430.000009
S808D808GgAtgGt22AY.430.000009
S808D808EgaTgaG22AY.440.000012
S808D808YGatTat22AY.50.000041
S808D808NGatAat22AY.50.000041
S808D808DgaTgaC22AY.5.30.000675
S808D808del1gAtg-t22AY.520.001629
S808D808delGAT---22AY.750.000112
S808D808NGatAat22AY.98.10.000097
S808D808GgAtgGt22AY.99.10.003106
S808D808NGatAat22B.1.10.000036
S808D808DgaTgaC22B.1.1.100.00223
S808D808NGatAat22B.1.1.1160.125
S808D808EgaTgaG22B.1.1.280.000622
S808D808HGatCat22B.1.1.390.001019
S808D808HGatCat22B.1.1.4090.005666
S808D808NGatAat22B.1.1.5190.000079
S808D808del1gAtg-t22B.1.1600.000062
S808D808AgAtgCt22B.1.177.650.001331
S808D808EgaTgaG22B.1.20.000018
S808D808NGatAat22B.1.2100.004264
S808D808NGatAat22B.1.2430.000139
S808D808NGatAat22B.1.2560.034483
S808D808DgaTgaC22B.1.258.170.000208
S808D808HGatCat22B.1.360.000292
S808D808EgaTgaA22B.1.4270.000101
S808D808DgaTgaC22B.1.4290.000047
S808D808EgaTgaG22B.1.5250.000226
S808D808YGatTat22B.1.5960.000174
S808D808DgaTgaC22B.1.5960.000174
S808D808EgaTgaA22B.1.617.20.000008
S808D808del1gaTga-22B.1.6270.00404
S808D808NGatAat22P.10.000032
S808D808DgaTgaC22P.1.10.000635
S808D808DgaTgaC22P.1.140.000096
S808D808DgaTgaC22P.1.20.002312
S808D808DgaTgaC22P.1.70.000639
S808D808DgaTgaC11A0.000387
S808D808delGAT---11A0.000387
S808D808YGatTat11A0.000387
S808D808NGatAat11A.20.000662
S808D808EgaTgaG11A.210.00277
S808D808VgAtgTt11A.270.001656
S808D808DgaTgaC11AL.10.012987
S808D808QGaTCaA11All0
S808D808RGATAGG11All0
S808D808DgaTgaC11AU.20.002421
S808D808delGAT---11AY.100.00053
S808D808NGatAat11AY.1000.000046
S808D808delGAT---11AY.1030.000006
S808D808DgaTgaC11AY.1060.000335
S808D808DgaTgaC11AY.1110.000183
S808D808HGatCat11AY.1110.000183
S808D808GgAtgGt11AY.1170.000085
S808D808VgAtgTt11AY.1190.000035
S808D808HGatCat11AY.1190.000035
S808D808HGatCat11AY.1200.000037
S808D808EgaTgaG11AY.1200.000037
S808D808HGatCat11AY.1210.000135
S808D808VgAtgTt11AY.1210.000135
S808D808DgaTgaC11AY.1210.000135
S808D808DgaTgaC11AY.140.000088
S808D808EgaTgaG11AY.160.00038
S808D808DgaTgaC11AY.16.10.00047
S808D808DgaTgaC11AY.200.000039
S808D808HGatCat11AY.200.000039
S808D808EgaTgaG11AY.230.00007
S808D808HGatCat11AY.23.10.000417
S808D808delGAT---11AY.240.000431
S808D808EgaTgaG11AY.250.000006
S808D808YGatTat11AY.250.000006
S808D808AgAtgCt11AY.260.000028
S808D808delGAT---11AY.290.000016
S808D808GgAtgGt11AY.30.00001
S808D808NGatAat11AY.30.00001
S808D808YGatTat11AY.30.00001
S808D808RGATAGG11AY.330.000067
S808D808GgAtgGt11AY.340.000097
S808D808DgaTgaC11AY.360.000148
S808D808HGatCat11AY.390.000025
S808D808VgAtgTt11AY.390.000025
S808D808delGAT---11AY.40.000002
S808D808EgaTgaG11AY.4.20.000022
S808D808NGatAat11AY.4.20.000022
S808D808HGatCat11AY.4.20.000022
S808D808GgAtgGt11AY.4.20.000022
S808D808YGatTat11AY.420.00004
S808D808NGatAat11AY.420.00004
S808D808QGaTCaA11AY.420.00004
S808D808del2GAT--C11AY.430.000004
S808D808AgAtgCt11AY.430.000004
S808D808GgAtgGt11AY.440.000006
S808D808delGAT---11AY.440.000006
S808D808VgAtgTt11AY.440.000006
S808D808DgaTgaC11AY.460.000104
S808D808DgaTgaC11AY.46.60.000072
S808D808YGatTat11AY.46.60.000072
S808D808HGatCat11AY.470.000031
S808D808EgaTgaA11AY.480.000465
S808D808GgAtgGt11AY.50.000021
S808D808DgaTgaC11AY.520.000814
S808D808YGatTat11AY.520.000814
S808D808DgaTgaC11AY.540.000095
S808D808GgAtgGt11AY.540.000095
S808D808DgaTgaC11AY.60.000041
S808D808HGatCat11AY.600.000938
S808D808EgaTgaG11AY.620.000436
S808D808delGAT---11AY.680.000274
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S808D808HGatCat11AY.7.10.000113
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