CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = S : CodonNum = 689 & Codon = agC

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
S689S689SsynagTagC173173123627-23629

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
S689S689SagTagC173173All0.000033
S689S689SagTagC2727AY.430.00012
S689S689SagTagC2222B.1.1.70.00002
S689S689SagTagC1515B.1.617.20.000056
S689S689SagTagC1313AY.40.00002
S689S689SagTagC1111B.10.000101
S689S689SagTagC77AY.260.000198
S689S689SagTagC55AY.1030.000031
S689S689SagTagC55AY.9.20.000184
S689S689SagTagC55B.1.4290.000118
S689S689SagTagC44AY.1000.000184
S689S689SagTagC44AY.1020.000106
S689S689SagTagC44AY.330.000267
S689S689SagTagC33AY.1170.000254
S689S689SagTagC33AY.1190.000106
S689S689SagTagC33B.1.1770.00004
S689S689SagTagC33B.1.20.000026
S689S689SagTagC33B.1.2210.000213
S689S689SagTagC33B.1.2580.0002
S689S689SagTagC33B.1.5250.000339
S689S689SagTagC22AY.1210.000271
S689S689SagTagC22AY.390.000049
S689S689SagTagC22C.370.000232
S689S689SagTagC22P.1.10.000635
S689S689SagTagC11AY.250.000006
S689S689SagTagC11AY.290.000016
S689S689SagTagC11AY.30.00001
S689S689SagTagC11AY.360.000148
S689S689SagTagC11AY.39.10.00004
S689S689SagTagC11AY.440.000006
S689S689SagTagC11AY.450.000122
S689S689SagTagC11AY.46.40.000165
S689S689SagTagC11AY.50.000021
S689S689SagTagC11AY.610.000105
S689S689SagTagC11AY.75.10.00018
S689S689SagTagC11AY.980.000079
S689S689SagTagC11B.1.1.5190.00004
S689S689SagTagC11B.1.177.210.000076
S689S689SagTagC11B.1.177.430.001477
S689S689SagTagC11B.1.36.80.001
S689S689SagTagC11B.1.5760.000907
S689S689SagTagC11P.10.000016
S689S689SagTagC11P.1.100.000269
S689S689SagTagC11P.1.130.000898
S689S689SagTagC11P.1.140.000048
S689S689SagTagC11Z.10.00289