CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = S : CodonNum = 140 & Codon = ---

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
S140F140deldelTTT---14571457121980-21982

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
S140F140delTTT---14571457All0.000279
S140F140delTTT---330330B.1.1.70.000295
S140F140delTTT---160160AT.10.820513
S140F140delTTT---110110P.10.001733
S140F140delTTT---100100C.380.806452
S140F140delTTT---6666AY.40.000103
S140F140delTTT---5151B.1.4290.0012
S140F140delTTT---3939AY.430.000173
S140F140delTTT---3333B.1.1770.000435
S140F140delTTT---3131B.10.000284
S140F140delTTT---2929P.1.31
S140F140delTTT---2828B.1.5260.000658
S140F140delTTT---2626B.1.20.000229
S140F140delTTT---2525B.1.3510.000743
S140F140delTTT---2121B.1.5760.019039
S140F140delTTT---1616AY.4.20.000347
S140F140delTTT---1515B.1.10.000272
S140F140delTTT---1414AY.440.000085
S140F140delTTT---1313B.1.1600.000405
S140F140delTTT---1313P.1.140.000621
S140F140delTTT---1212A.2.50.005988
S140F140delTTT---1212AY.1020.000318
S140F140delTTT---1212AY.250.000072
S140F140delTTT---1010B.1.617.20.000038
S140F140delTTT---88B.1.36.80.008
S140F140delTTT---77AY.420.000282
S140F140delTTT---77AY.90.000473
S140F140delTTT---77P.1.150.001626
S140F140delTTT---66AY.4.2.10.000894
S140F140delTTT---66B.1.4270.000303
S140F140delTTT---55AY.290.000079
S140F140delTTT---55B.1.2340.00066
S140F140delTTT---55B.1.2430.000348
S140F140delTTT---55B.1.5960.000436
S140F140delTTT---55B.1.6210.000443
S140F140delTTT---44AY.1030.000025
S140F140delTTT---44AY.30.00004
S140F140delTTT---44AZ.30.006079
S140F140delTTT---44B.1.1.370.000771
S140F140delTTT---44B.1.177.40.000844
S140F140delTTT---44B.1.2580.000266
S140F140delTTT---33AY.1190.000106
S140F140delTTT---33AY.1200.000112
S140F140delTTT---33B.1.1.2220.000612
S140F140delTTT---33B.1.1.5190.000119
S140F140delTTT---33B.1.2210.000213
S140F140delTTT---33B.1.3190.009146
S140F140delTTT---33B.1.360.000438
S140F140delTTT---33B.1.5610.001191
S140F140delTTT---33C.160.003181
S140F140delTTT---33P.1.100.000808
S140F140delTTT---33P.1.170.000485
S140F140delTTT---220.111111
S140F140delTTT---22AY.1080.002205
S140F140delTTT---22AY.34.10.00102
S140F140delTTT---22AY.390.000049
S140F140delTTT---22AY.4.50.000215
S140F140delTTT---22AY.460.000208
S140F140delTTT---22AY.470.000062
S140F140delTTT---22AY.650.001066
S140F140delTTT---22AY.740.000231
S140F140delTTT---22AY.750.000112
S140F140delTTT---22AY.990.002099
S140F140delTTT---22AZ.50.007018
S140F140delTTT---22B.1.1.1700.002494
S140F140delTTT---22B.1.1.2140.000111
S140F140delTTT---22B.1.1.250.001137
S140F140delTTT---22B.1.1.3110.000716
S140F140delTTT---22B.1.1.3180.000604
S140F140delTTT---22B.1.1110.00235
S140F140delTTT---22B.1.177.120.000303
S140F140delTTT---22B.1.177.570.000562
S140F140delTTT---22B.1.177.860.000367
S140F140delTTT---22B.1.177.870.001456
S140F140delTTT---22B.1.2220.003384
S140F140delTTT---22B.1.2410.001623
S140F140delTTT---22B.1.36.380.003284
S140F140delTTT---22B.1.5950.000522
S140F140delTTT---22B.1.6200.001892
S140F140delTTT---22B.1.6350.035088
S140F140delTTT---22B.400.000729
S140F140delTTT---22C.360.001821
S140F140delTTT---22C.36.3.10.005435
S140F140delTTT---22C.370.000232
S140F140delTTT---22P.1.10.000635
S140F140delTTT---22P.1.120.000968
S140F140delTTT---22P.1.70.000639
S140F140delTTT---22P.30.00319
S140F140delTTT---22Q.80.00033
S140F140delTTT---11A.10.000282
S140F140delTTT---11A.20.000662
S140F140delTTT---11A.23.10.000704
S140F140delTTT---11A.30.002096
S140F140delTTT---11AC.10.037037
S140F140delTTT---11AD.20.000219
S140F140delTTT---11AY.1010.00049
S140F140delTTT---11AY.1060.000335
S140F140delTTT---11AY.1070.000466
S140F140delTTT---11AY.1090.00074
S140F140delTTT---11AY.1180.000063
S140F140delTTT---11AY.120.000316
S140F140delTTT---11AY.120.20.001285
S140F140delTTT---11AY.1210.000135
S140F140delTTT---11AY.270.000065
S140F140delTTT---11AY.29.10.000221
S140F140delTTT---11AY.330.000067
S140F140delTTT---11AY.350.000233
S140F140delTTT---11AY.360.000148
S140F140delTTT---11AY.4.10.000737
S140F140delTTT---11AY.4.40.000409
S140F140delTTT---11AY.450.000122
S140F140delTTT---11AY.50.000021
S140F140delTTT---11AY.600.000938
S140F140delTTT---11AY.620.000436
S140F140delTTT---11AY.7.20.000559
S140F140delTTT---11AY.730.000665
S140F140delTTT---11AY.780.001541
S140F140delTTT---11AY.840.000437
S140F140delTTT---11AY.850.000427
S140F140delTTT---11AY.9.20.000037
S140F140delTTT---11AY.920.000287
S140F140delTTT---11AY.98.10.000048
S140F140delTTT---11AY.99.10.001553
S140F140delTTT---11B0.000128
S140F140delTTT---11B.1.1.10.000327
S140F140delTTT---11B.1.1.1390.022727
S140F140delTTT---11B.1.1.2840.000107
S140F140delTTT---11B.1.1.2940.001266
S140F140delTTT---11B.1.1.3060.000438
S140F140delTTT---11B.1.1.3070.002532
S140F140delTTT---11B.1.1.3680.003086
S140F140delTTT---11B.1.1.390.00051
S140F140delTTT---11B.1.1.3970.002252
S140F140delTTT---11B.1.1.410.006329
S140F140delTTT---11B.1.1.4320.001266
S140F140delTTT---11B.1.1.5280.004808
S140F140delTTT---11B.1.1.580.005376
S140F140delTTT---11B.1.1.700.000341
S140F140delTTT---11B.1.110.30.000718
S140F140delTTT---11B.1.160.230.004831
S140F140delTTT---11B.1.177.110.001698
S140F140delTTT---11B.1.177.210.000076
S140F140delTTT---11B.1.177.420.000894
S140F140delTTT---11B.1.177.450.000381
S140F140delTTT---11B.1.177.50.001242
S140F140delTTT---11B.1.177.540.000606
S140F140delTTT---11B.1.177.690.001484
S140F140delTTT---11B.1.177.760.002494
S140F140delTTT---11B.1.177.810.000189
S140F140delTTT---11B.1.1990.004132
S140F140delTTT---11B.1.2320.000537
S140F140delTTT---11B.1.258.110.000396
S140F140delTTT---11B.1.258.140.00098
S140F140delTTT---11B.1.258.40.003448
S140F140delTTT---11B.1.351.30.000876
S140F140delTTT---11B.1.36.10.00114
S140F140delTTT---11B.1.36.160.001425
S140F140delTTT---11B.1.36.180.00042
S140F140delTTT---11B.1.36.310.001751
S140F140delTTT---11B.1.36.370.002778
S140F140delTTT---11B.1.370.014706
S140F140delTTT---11B.1.3700.008
S140F140delTTT---11B.1.3800.006623
S140F140delTTT---11B.1.3950.007042
S140F140delTTT---11B.1.3960.000706
S140F140delTTT---11B.1.4000.000429
S140F140delTTT---11B.1.4160.001269
S140F140delTTT---11B.1.4260.001009
S140F140delTTT---11B.1.5850.027778
S140F140delTTT---11B.1.5870.001898
S140F140delTTT---11B.1.596.10.009346
S140F140delTTT---11B.1.6120.002653
S140F140delTTT---11B.1.6230.000536
S140F140delTTT---11B.1.930.000934
S140F140delTTT---11B.300.014706
S140F140delTTT---11B.520.010101
S140F140delTTT---11P.1.130.000898
S140F140delTTT---11P.1.160.000374
S140F140delTTT---11P.1.60.001946
S140F140delTTT---11Q.10.000126
S140F140delTTT---11Q.20.000613
S140F140delTTT---11Q.70.001111
S140F140delTTT---11R.10.00009