CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = S : CodonNum = 14 & Codon = caT

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
S14Q14HnonsyncaGcaT398933490.83955921602-21604

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
S14Q14HcaGcaT33493989All0.000641
S14Q14HcaGcaT720764B.1.1.70.000645
S14Q14HcaGcaT660672AY.40.001027
S14Q14HcaGcaT445458AY.250.002677
S14Q14HcaGcaT200292B.1.617.20.000753
S14Q14HcaGcaT15176AY.1020.000398
S14Q14HcaGcaT147164AY.430.000651
S14Q14HcaGcaT121129AY.1030.000751
S14Q14HcaGcaT44119AY.440.000268
S14Q14HcaGcaT8080B.1.3690.022818
S14Q14HcaGcaT268AY.46.40.000329
S14Q14HcaGcaT6364B.1.20.000555
S14Q14HcaGcaT3753AY.30.000368
S14Q14HcaGcaT4949AY.750.002745
S14Q14HcaGcaT4646P.10.000725
S14Q14HcaGcaT3737B.1.1770.000487
S14Q14HcaGcaT3333B.1.5250.003734
S14Q14HcaGcaT3132B.1.10.000562
S14Q14HcaGcaT2731AY.470.00084
S14Q14HcaGcaT2828B.1.3460.036697
S14Q14HcaGcaT920AY.460.000937
S14Q14HcaGcaT1919AY.98.10.00092
S14Q14HcaGcaT1819B.1.3510.000535
S14Q14HcaGcaT1818B.1.2580.001198
S14Q14HcaGcaT1517AY.390.000371
S14Q14HcaGcaT1416B.10.000128
S14Q14HcaGcaT1015AY.420.000402
S14Q14HcaGcaT1415B.1.6210.001239
S14Q14HcaGcaT1414AY.260.000396
S14Q14HcaGcaT1414B.1.5960.00122
S14Q14HcaGcaT1313AY.1190.000459
S14Q14HcaGcaT412AY.1200.000149
S14Q14HcaGcaT1212B.1.5260.000282
S14Q14HcaGcaT1111AY.200.000428
S14Q14HcaGcaT1011AY.290.000158
S14Q14HcaGcaT911AY.50.000186
S14Q14HcaGcaT910AY.120.10.002889
S14Q14HcaGcaT1010AY.46.60.000722
S14Q14HcaGcaT1010B.1.6280.003524
S14Q14HcaGcaT1010B.1.6370.000731
S14Q14HcaGcaT99B.1.1600.000281
S14Q14HcaGcaT78AY.1000.000322
S14Q14HcaGcaT88Q.20.004908
S14Q14HcaGcaT27AY.1170.000169
S14Q14HcaGcaT77B.1.1.280.002179
S14Q14HcaGcaT56AY.1060.001674
S14Q14HcaGcaT66AY.1080.006615
S14Q14HcaGcaT66AY.4.20.00013
S14Q14HcaGcaT66B.1.1.4200.006036
S14Q14HcaGcaT56B.1.4290.000118
S14Q14HcaGcaT35AY.60.000123
S14Q14HcaGcaT55AY.90.000338
S14Q14HcaGcaT55AY.9.10.000419
S14Q14HcaGcaT15AY.920.000287
S14Q14HcaGcaT55B.1.1.4310.080645
S14Q14HcaGcaT55B.1.1.4320.006329
S14Q14HcaGcaT55B.1.2370.024876
S14Q14HcaGcaT55B.1.360.00073
S14Q14HcaGcaT45B.1.5610.001588
S14Q14HcaGcaT55B.1.617.10.000645
S14Q14HcaGcaT44AY.1130.00057
S14Q14HcaGcaT34AY.16.10.00141
S14Q14HcaGcaT44AY.5.30.00135
S14Q14HcaGcaT34AY.700.000626
S14Q14HcaGcaT44B.1.1.2840.00043
S14Q14HcaGcaT44B.1.1.330.001684
S14Q14HcaGcaT44B.1.2210.000284
S14Q14HcaGcaT44B.1.36.290.002069
S14Q14HcaGcaT34B.1.4270.000151
S14Q14HcaGcaT44Q.80.00066
S14Q14HcaGcaT33A.10.000846
S14Q14HcaGcaT33AY.1010.001471
S14Q14HcaGcaT33AY.230.000209
S14Q14HcaGcaT33AY.330.0002
S14Q14HcaGcaT23AY.450.000243
S14Q14HcaGcaT33AY.46.10.00308
S14Q14HcaGcaT33AY.560.004815
S14Q14HcaGcaT33AY.610.000314
S14Q14HcaGcaT33AY.740.000347
S14Q14HcaGcaT33AY.9.20.00011
S14Q14HcaGcaT33AY.99.20.000276
S14Q14HcaGcaT33B0.000383
S14Q14HcaGcaT33B.1.1.1010.03
S14Q14HcaGcaT33B.1.1.3180.000905
S14Q14HcaGcaT33B.1.1.5190.000119
S14Q14HcaGcaT13B.1.4000.000429
S14Q14HcaGcaT33B.1.5430.03
S14Q14HcaGcaT33C.370.000348
S14Q14HcaGcaT33D.20.000225
S14Q14HcaGcaT33P.1.140.000143
S14Q14HcaGcaT22A.2.50.000998
S14Q14HcaGcaT22AY.1100.000225
S14Q14HcaGcaT22AY.1180.000125
S14Q14HcaGcaT22AY.140.000176
S14Q14HcaGcaT22AY.3.10.000171
S14Q14HcaGcaT22AY.380.000999
S14Q14HcaGcaT22AY.39.10.000079
S14Q14HcaGcaT22AY.410.000588
S14Q14HcaGcaT22AY.530.000575
S14Q14HcaGcaT22AY.540.000191
S14Q14HcaGcaT22AY.70.000392
S14Q14HcaGcaT22AY.730.001331
S14Q14HcaGcaT22B.1.1.1890.003026
S14Q14HcaGcaT22B.1.1.2140.000111
S14Q14HcaGcaT22B.1.1.3150.016949
S14Q14HcaGcaT22B.1.1.4130.013793
S14Q14HcaGcaT22B.1.1120.010363
S14Q14HcaGcaT22B.1.177.210.000153
S14Q14HcaGcaT22B.1.177.40.000422
S14Q14HcaGcaT22B.1.2340.000264
S14Q14HcaGcaT22B.1.2430.000139
S14Q14HcaGcaT22B.1.3490.00143
S14Q14HcaGcaT22B.1.3670.001585
S14Q14HcaGcaT22B.1.3750.001639
S14Q14HcaGcaT12B.1.4040.001302
S14Q14HcaGcaT22B.1.466.20.000782
S14Q14HcaGcaT22B.1.6200.001892
S14Q14HcaGcaT22P.20.000373
S14Q14HcaGcaT22P.30.00319
S14Q14HcaGcaT22Q.10.000253
S14Q14HcaGcaT11A0.000387
S14Q14HcaGcaT11AY.1110.000183
S14Q14HcaGcaT11AY.1140.000231
S14Q14HcaGcaT11AY.116.10.000311
S14Q14HcaGcaT11AY.120.000316
S14Q14HcaGcaT11AY.1210.000135
S14Q14HcaGcaT11AY.190.00114
S14Q14HcaGcaT11AY.20.000356
S14Q14HcaGcaT11AY.4.2.10.000149
S14Q14HcaGcaT11AY.4.30.000842
S14Q14HcaGcaT11AY.4.40.000409
S14Q14HcaGcaT11AY.4.50.000107
S14Q14HcaGcaT11AY.46.50.000198
S14Q14HcaGcaT11AY.5.40.000277
S14Q14HcaGcaT11AY.670.000464
S14Q14HcaGcaT11AY.7.10.000113
S14Q14HcaGcaT11AY.75.10.00018
S14Q14HcaGcaT11AY.780.001541
S14Q14HcaGcaT11AY.890.004902
S14Q14HcaGcaT11AY.980.000079
S14Q14HcaGcaT11B.1.1.1210.002427
S14Q14HcaGcaT11B.1.1.170.016667
S14Q14HcaGcaT11B.1.1.2370.005405
S14Q14HcaGcaT11B.1.1.250.000569
S14Q14HcaGcaT11B.1.1.2610.008621
S14Q14HcaGcaT11B.1.1.2890.002083
S14Q14HcaGcaT11B.1.1.3010.001179
S14Q14HcaGcaT11B.1.1.3060.000438
S14Q14HcaGcaT11B.1.1.3110.000358
S14Q14HcaGcaT11B.1.1.3440.010753
S14Q14HcaGcaT11B.1.1.3620.005618
S14Q14HcaGcaT11B.1.1.370.000193
S14Q14HcaGcaT11B.1.1.4330.001425
S14Q14HcaGcaT11B.1.1.500.000679
S14Q14HcaGcaT11B.1.1.700.000341
S14Q14HcaGcaT11B.1.1470.000756
S14Q14HcaGcaT11B.1.160.260.002421
S14Q14HcaGcaT11B.1.177.600.000218
S14Q14HcaGcaT11B.1.1870.033333
S14Q14HcaGcaT11B.1.2060.000816
S14Q14HcaGcaT11B.1.214.10.02
S14Q14HcaGcaT11B.1.2410.000812
S14Q14HcaGcaT11B.1.258.170.000104
S14Q14HcaGcaT11B.1.2740.011905
S14Q14HcaGcaT11B.1.3110.000275
S14Q14HcaGcaT11B.1.3240.001605
S14Q14HcaGcaT11B.1.36.220.001208
S14Q14HcaGcaT11B.1.4090.000781
S14Q14HcaGcaT11B.1.4110.003704
S14Q14HcaGcaT11B.1.4690.00361
S14Q14HcaGcaT11B.1.4970.000315
S14Q14HcaGcaT11B.1.5050.004386
S14Q14HcaGcaT11B.1.5090.000866
S14Q14HcaGcaT11B.1.5640.000426
S14Q14HcaGcaT11B.1.564.10.001577
S14Q14HcaGcaT11B.1.5910.010638
S14Q14HcaGcaT11B.1.6190.000871
S14Q14HcaGcaT11B.1.6270.00202
S14Q14HcaGcaT11B.1.6380.052632
S14Q14HcaGcaT11B.1.80.001972
S14Q14HcaGcaT11N.10.016949
S14Q14HcaGcaT11P.1.100.000269
S14Q14HcaGcaT11P.1.70.000319
S14Q14HcaGcaT11Q.30.000145