CoV-GLUE | Mutations | Mutation
Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):
ORF | CodonNum | Mut | ORF1abMut | MutType | RefCodon | MutCodon | AACount | CodonCount | CodonProp | Genome Position |
S | 14 | Q14H | nonsyn | caG | caT | 3989 | 3349 | 0.839559 | 21602-21604 | |
S | 14 | Q14H | nonsyn | caG | caC | 3989 | 640 | 0.160441 | 21602-21604 | |
S | 14 | Q14R | nonsyn | cAg | cGg | 496 | 494 | 0.995968 | 21602-21604 | |
S | 14 | Q14R | nonsyn | cAG | cGC | 496 | 1 | 0.00201613 | 21602-21604 | |
S | 14 | Q14R | nonsyn | cAG | cGT | 496 | 1 | 0.00201613 | 21602-21604 | |
S | 14 | Q14del | del | CAG | --- | 318 | 318 | 1 | 21602-21604 | |
S | 14 | Q14Q | syn | caG | caA | 112 | 112 | 1 | 21602-21604 | |
S | 14 | Q14K | nonsyn | Cag | Aag | 98 | 96 | 0.979592 | 21602-21604 | |
S | 14 | Q14K | nonsyn | CaG | AaA | 98 | 2 | 0.0204082 | 21602-21604 | |
S | 14 | Q14L | nonsyn | cAg | cTg | 57 | 55 | 0.964912 | 21602-21604 | |
S | 14 | Q14L | nonsyn | cAG | cTA | 57 | 2 | 0.0350877 | 21602-21604 | |
S | 14 | Q14X | nonsyn | Cag | Tag | 33 | 33 | 1 | 21602-21604 | |
S | 14 | Q14E | nonsyn | Cag | Gag | 16 | 16 | 1 | 21602-21604 | |
S | 14 | Q14del1 | del | caG | ca- | 2 | 2 | 1 | 21602-21604 | |
S | 14 | Q14M | nonsyn | CAg | ATg | 2 | 2 | 1 | 21602-21604 | |
S | 14 | Q14P | nonsyn | cAg | cCg | 2 | 2 | 1 | 21602-21604 | |
S | 14 | Q14I | nonsyn | CAG | ATA | 2 | 2 | 1 | 21602-21604 | |
S | 14 | Q14D | nonsyn | CaG | GaT | 2 | 1 | 0.5 | 21602-21604 | |
S | 14 | Q14G | nonsyn | CAg | GGg | 2 | 1 | 0.5 | 21602-21604 | |
S | 14 | Q14G | nonsyn | CAG | GGC | 2 | 1 | 0.5 | 21602-21604 | |
S | 14 | Q14D | nonsyn | CaG | GaC | 2 | 1 | 0.5 | 21602-21604 | |
S | 14 | Q14Y | nonsyn | CaG | TaT | 1 | 1 | 1 | 21602-21604 | |
S | 14 | Q14W | nonsyn | CAg | TGg | 1 | 1 | 1 | 21602-21604 | |
S | 14 | Q14N | nonsyn | CaG | AaT | 1 | 1 | 1 | 21602-21604 |
Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):
ORF | CodonNum | Mut | RefCodon | MutCodon | CodonCount | AACount | Lineage | LineageCodonProp |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 3349 | 3989 | All | 0.000641 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 640 | 3989 | All | 0.000122 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 720 | 764 | B.1.1.7 | 0.000645 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 44 | 764 | B.1.1.7 | 0.000039 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 660 | 672 | AY.4 | 0.001027 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 12 | 672 | AY.4 | 0.000019 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 494 | 496 | All | 0.000094 |
S | 14 | Q14R | cAG | cGT | 1 | 496 | All | 0 |
S | 14 | Q14R | cAG | cGC | 1 | 496 | All | 0 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 445 | 458 | AY.25 | 0.002677 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 13 | 458 | AY.25 | 0.000078 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 318 | 318 | All | 0.000061 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 200 | 292 | B.1.617.2 | 0.000753 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 92 | 292 | B.1.617.2 | 0.000346 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 161 | 176 | AY.102 | 0.004269 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 15 | 176 | AY.102 | 0.000398 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 147 | 164 | AY.43 | 0.000651 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 17 | 164 | AY.43 | 0.000075 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 121 | 129 | AY.103 | 0.000751 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 8 | 129 | AY.103 | 0.00005 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 120 | 120 | AY.3 | 0.001194 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 75 | 119 | AY.44 | 0.000457 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 44 | 119 | AY.44 | 0.000268 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 113 | 113 | AY.44 | 0.000688 |
S | 14 | Q14Q | caG | caA | 112 | 112 | All | 0.000021 |
S | 14 | Q14K | Cag | Aag | 96 | 98 | All | 0.000018 |
S | 14 | Q14K | CaG | AaA | 2 | 98 | All | 0 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 84 | 84 | B.1.1.7 | 0.000075 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 80 | 80 | B.1.369 | 0.022818 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 66 | 68 | AY.46.4 | 0.010857 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 2 | 68 | AY.46.4 | 0.000329 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 65 | 65 | B.1.177.68 | 0.984848 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 63 | 64 | B.1.2 | 0.000555 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 1 | 64 | B.1.2 | 0.000009 |
S | 14 | Q14L | cAg | cTg | 55 | 57 | All | 0.000011 |
S | 14 | Q14L | cAG | cTA | 2 | 57 | All | 0 |
S | 14 | Q14Q | caG | caA | 57 | 57 | B.1.1.7 | 0.000051 |
S | 14 | Q14K | Cag | Aag | 54 | 54 | P.5 | 0.739726 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 37 | 53 | AY.3 | 0.000368 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 16 | 53 | AY.3 | 0.000159 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 53 | 53 | AY.85 | 0.02264 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 49 | 50 | AY.4 | 0.000076 |
S | 14 | Q14R | cAG | cGT | 1 | 50 | AY.4 | 0.000002 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 49 | 49 | AY.75 | 0.002745 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 46 | 46 | P.1 | 0.000725 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 37 | 37 | B.1.177 | 0.000487 |
S | 14 | Q14X | Cag | Tag | 33 | 33 | All | 0.000006 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 33 | 33 | B.1.525 | 0.003734 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 31 | 32 | B.1.1 | 0.000562 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 1 | 32 | B.1.1 | 0.000018 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 27 | 31 | AY.47 | 0.00084 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 4 | 31 | AY.47 | 0.000124 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 28 | 28 | B.1.346 | 0.036697 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 22 | 22 | AY.4 | 0.000034 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 21 | 21 | AY.25 | 0.000126 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 11 | 20 | AY.46 | 0.001145 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 9 | 20 | AY.46 | 0.000937 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 19 | 19 | AY.98.1 | 0.00092 |
S | 14 | Q14L | cAg | cTg | 19 | 19 | B.1.1.7 | 0.000017 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 18 | 19 | B.1.351 | 0.000535 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 1 | 19 | B.1.351 | 0.00003 |
S | 14 | Q14Q | caG | caA | 18 | 18 | AY.4 | 0.000028 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 18 | 18 | B.1.258 | 0.001198 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 15 | 17 | AY.39 | 0.000371 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 2 | 17 | AY.39 | 0.000049 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 17 | 17 | AY.84 | 0.007437 |
S | 14 | Q14E | Cag | Gag | 16 | 16 | All | 0.000003 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 14 | 16 | B.1 | 0.000128 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 2 | 16 | B.1 | 0.000018 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 16 | 16 | B.1.1.7 | 0.000014 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 10 | 15 | AY.42 | 0.000402 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 5 | 15 | AY.42 | 0.000201 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 15 | 15 | B.1.1.214 | 0.000832 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 14 | 15 | B.1.621 | 0.001239 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 1 | 15 | B.1.621 | 0.000089 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 14 | 14 | AY.26 | 0.000396 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 14 | 14 | B.1.596 | 0.00122 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 13 | 13 | AY.119 | 0.000459 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 8 | 12 | AY.120 | 0.000297 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 4 | 12 | AY.120 | 0.000149 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 12 | 12 | B.1.526 | 0.000282 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 12 | 12 | B.1.617.2 | 0.000045 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 11 | 11 | AY.20 | 0.000428 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 10 | 11 | AY.29 | 0.000158 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 1 | 11 | AY.29 | 0.000016 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 9 | 11 | AY.5 | 0.000186 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 2 | 11 | AY.5 | 0.000041 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 11 | 11 | B.1.2 | 0.000097 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 11 | 11 | B.1.369 | 0.003137 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 9 | 10 | AY.120.1 | 0.002889 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 1 | 10 | AY.120.1 | 0.000321 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 10 | 10 | AY.44 | 0.000061 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 10 | 10 | AY.46.6 | 0.000722 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 10 | 10 | B.1.1.284 | 0.001074 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 10 | 10 | B.1.628 | 0.003524 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 10 | 10 | B.1.637 | 0.000731 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 9 | 9 | B.1.160 | 0.000281 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 9 | 9 | B.1.177.15 | 0.005678 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 9 | 9 | B.1.2 | 0.000079 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 9 | 9 | B.1.638 | 0.473684 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 8 | 8 | A.2.5.2 | 0.012579 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 7 | 8 | AY.100 | 0.000322 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 1 | 8 | AY.100 | 0.000046 |
S | 14 | Q14L | cAg | cTg | 8 | 8 | AY.4 | 0.000012 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 8 | 8 | B.1 | 0.000073 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 8 | 8 | B.1.617.2 | 0.00003 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 8 | 8 | Q.2 | 0.004908 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 5 | 7 | AY.117 | 0.000423 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 2 | 7 | AY.117 | 0.000169 |
S | 14 | Q14K | Cag | Aag | 7 | 7 | B.1 | 0.000064 |
S | 14 | Q14K | Cag | Aag | 7 | 7 | B.1.1 | 0.000127 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 7 | 7 | B.1.1 | 0.000127 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 7 | 7 | B.1.1.28 | 0.002179 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 5 | 6 | AY.106 | 0.001674 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 1 | 6 | AY.106 | 0.000335 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 6 | 6 | AY.108 | 0.006615 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 6 | 6 | AY.25 | 0.000036 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 6 | 6 | AY.33 | 0.000401 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 6 | 6 | AY.4.2 | 0.00013 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 6 | 6 | B.1.1.420 | 0.006036 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 6 | 6 | B.1.177 | 0.000079 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 5 | 6 | B.1.429 | 0.000118 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 1 | 6 | B.1.429 | 0.000024 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 6 | 6 | B.1.526 | 0.000141 |
S | 14 | Q14Q | caG | caA | 6 | 6 | B.1.617.2 | 0.000023 |
S | 14 | Q14Q | caG | caA | 5 | 5 | A.19 | 0.04717 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 5 | 5 | AY.120 | 0.000186 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 5 | 5 | AY.26 | 0.000142 |
S | 14 | Q14L | cAg | cTg | 5 | 5 | AY.44 | 0.00003 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 3 | 5 | AY.6 | 0.000123 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 2 | 5 | AY.6 | 0.000082 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 5 | 5 | AY.9 | 0.000338 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 5 | 5 | AY.9.1 | 0.000419 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 4 | 5 | AY.92 | 0.001149 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 5 | AY.92 | 0.000287 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 5 | 5 | B.1.1 | 0.000091 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 5 | 5 | B.1.1.431 | 0.080645 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 5 | 5 | B.1.1.432 | 0.006329 |
S | 14 | Q14K | Cag | Aag | 5 | 5 | B.1.1.7 | 0.000004 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 5 | 5 | B.1.237 | 0.024876 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 5 | 5 | B.1.36 | 0.00073 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 4 | 5 | B.1.561 | 0.001588 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 1 | 5 | B.1.561 | 0.000397 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 5 | 5 | B.1.617.1 | 0.000645 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 5 | 5 | P.5 | 0.068493 |
S | 14 | Q14L | cAG | cTA | 2 | 4 | 0.111111 | |
S | 14 | Q14K | Cag | Aag | 2 | 4 | 0.111111 | |
S | 14 | Q14K | CaG | AaA | 2 | 4 | 0.111111 | |
S | 14 | Q14L | cAg | cTg | 2 | 4 | 0.111111 | |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 4 | 4 | AY.102 | 0.000106 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 4 | 4 | AY.113 | 0.00057 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 3 | 4 | AY.16.1 | 0.00141 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 1 | 4 | AY.16.1 | 0.00047 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 4 | 4 | AY.29 | 0.000063 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 4 | 4 | AY.5.3 | 0.00135 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 3 | 4 | AY.70 | 0.000626 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 1 | 4 | AY.70 | 0.000209 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 4 | 4 | B.1 | 0.000037 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 4 | 4 | B.1.1.284 | 0.00043 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 4 | 4 | B.1.1.33 | 0.001684 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 4 | 4 | B.1.1.37 | 0.000771 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 4 | 4 | B.1.177 | 0.000053 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 4 | 4 | B.1.221 | 0.000284 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 4 | 4 | B.1.36.29 | 0.002069 |
S | 14 | Q14K | Cag | Aag | 4 | 4 | B.1.36.31 | 0.007005 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 3 | 4 | B.1.427 | 0.000151 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 1 | 4 | B.1.427 | 0.00005 |
S | 14 | Q14X | Cag | Tag | 4 | 4 | D.2 | 0.0003 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 4 | 4 | Q.8 | 0.00066 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 3 | 3 | A.1 | 0.000846 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 3 | 3 | AY.101 | 0.001471 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 3 | 3 | AY.23 | 0.000209 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 3 | 3 | AY.33 | 0.0002 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 3 | 3 | AY.39 | 0.000074 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 3 | 3 | AY.43 | 0.000013 |
S | 14 | Q14Q | caG | caA | 3 | 3 | AY.44 | 0.000018 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 2 | 3 | AY.45 | 0.000243 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 1 | 3 | AY.45 | 0.000122 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 3 | 3 | AY.46.1 | 0.00308 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 3 | 3 | AY.56 | 0.004815 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 3 | 3 | AY.61 | 0.000314 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 3 | 3 | AY.74 | 0.000347 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 3 | 3 | AY.9.2 | 0.00011 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 3 | 3 | AY.98 | 0.000237 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 3 | 3 | AY.99.2 | 0.000276 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 3 | 3 | B | 0.000383 |
S | 14 | Q14X | Cag | Tag | 3 | 3 | B.1 | 0.000027 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 3 | 3 | B.1.1.101 | 0.03 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 3 | 3 | B.1.1.318 | 0.000905 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 3 | 3 | B.1.1.519 | 0.000119 |
S | 14 | Q14E | Cag | Gag | 3 | 3 | B.1.1.7 | 0.000003 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 3 | 3 | B.1.160 | 0.000094 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 3 | 3 | B.1.351 | 0.000089 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 2 | 3 | B.1.400 | 0.000858 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 3 | B.1.400 | 0.000429 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 3 | 3 | B.1.543 | 0.03 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 3 | 3 | C.37 | 0.000348 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 3 | 3 | D.2 | 0.000225 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 3 | 3 | P.1 | 0.000047 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 3 | 3 | P.1.14 | 0.000143 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 3 | 3 | W.1 | 0.026087 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 2 | 2 | 0.111111 | |
S | 14 | Q14P | cAg | cCg | 2 | 2 | 0.111111 | |
S | 14 | Q14I | CAG | ATA | 2 | 2 | 0.111111 | |
S | 14 | Q14M | CAg | ATg | 2 | 2 | 0.111111 | |
S | 14 | Q14Q | caG | caA | 2 | 2 | 0.111111 | |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 2 | 2 | A.2.5 | 0.000998 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 2 | 2 | AB.1 | 0.016393 |
S | 14 | Q14I | CAG | ATA | 2 | 2 | All | 0 |
S | 14 | Q14del1 | caG | ca- | 2 | 2 | All | 0 |
S | 14 | Q14P | cAg | cCg | 2 | 2 | All | 0 |
S | 14 | Q14M | CAg | ATg | 2 | 2 | All | 0 |
S | 14 | Q14D | CaG | GaT | 1 | 2 | All | 0 |
S | 14 | Q14D | CaG | GaC | 1 | 2 | All | 0 |
S | 14 | Q14G | CAG | GGC | 1 | 2 | All | 0 |
S | 14 | Q14G | CAg | GGg | 1 | 2 | All | 0 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 2 | 2 | AY.100 | 0.000092 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 2 | 2 | AY.103 | 0.000012 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 2 | 2 | AY.110 | 0.000225 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 2 | 2 | AY.118 | 0.000125 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 2 | 2 | AY.120.1 | 0.000642 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 2 | 2 | AY.13 | 0.000322 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 2 | 2 | AY.14 | 0.000176 |
S | 14 | Q14X | Cag | Tag | 2 | 2 | AY.26 | 0.000057 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 2 | 2 | AY.29 | 0.000032 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 2 | 2 | AY.3.1 | 0.000171 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 2 | 2 | AY.32 | 0.001065 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 2 | 2 | AY.34 | 0.000194 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 2 | 2 | AY.38 | 0.000999 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 2 | 2 | AY.39.1 | 0.000079 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 2 | 2 | AY.41 | 0.000588 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 2 | 2 | AY.47 | 0.000062 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 2 | 2 | AY.5 | 0.000041 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 2 | 2 | AY.5 | 0.000041 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 2 | 2 | AY.53 | 0.000575 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 2 | 2 | AY.54 | 0.000191 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 2 | 2 | AY.7 | 0.000392 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 2 | 2 | AY.73 | 0.001331 |
S | 14 | Q14Q | caG | caA | 2 | 2 | AY.92 | 0.000575 |
S | 14 | Q14L | cAg | cTg | 2 | 2 | AY.98.1 | 0.000097 |
S | 14 | Q14Q | caG | caA | 2 | 2 | B.1.1 | 0.000036 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 2 | 2 | B.1.1.189 | 0.003026 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 2 | 2 | B.1.1.214 | 0.000111 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 2 | 2 | B.1.1.25 | 0.001137 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 2 | 2 | B.1.1.284 | 0.000215 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 2 | 2 | B.1.1.289 | 0.004167 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 2 | 2 | B.1.1.315 | 0.016949 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 2 | 2 | B.1.1.413 | 0.013793 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 2 | 2 | B.1.1.519 | 0.000079 |
S | 14 | Q14X | Cag | Tag | 2 | 2 | B.1.1.7 | 0.000002 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 2 | 2 | B.1.112 | 0.010363 |
S | 14 | Q14X | Cag | Tag | 2 | 2 | B.1.177 | 0.000026 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 2 | 2 | B.1.177.21 | 0.000153 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 2 | 2 | B.1.177.4 | 0.000422 |
S | 14 | Q14Q | caG | caA | 2 | 2 | B.1.2 | 0.000018 |
S | 14 | Q14L | cAg | cTg | 2 | 2 | B.1.2 | 0.000018 |
S | 14 | Q14L | cAg | cTg | 2 | 2 | B.1.221 | 0.000142 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 2 | 2 | B.1.234 | 0.000264 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 2 | 2 | B.1.243 | 0.000139 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 2 | 2 | B.1.243 | 0.000139 |
S | 14 | Q14L | cAg | cTg | 2 | 2 | B.1.258 | 0.000133 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 2 | 2 | B.1.258 | 0.000133 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 2 | 2 | B.1.349 | 0.00143 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 2 | 2 | B.1.367 | 0.001585 |
S | 14 | Q14Q | caG | caA | 2 | 2 | B.1.369 | 0.00057 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 2 | 2 | B.1.375 | 0.001639 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 1 | 2 | B.1.404 | 0.001302 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 2 | B.1.404 | 0.001302 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 2 | 2 | B.1.429 | 0.000047 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 2 | 2 | B.1.466.2 | 0.000782 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 2 | 2 | B.1.525 | 0.000226 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 2 | 2 | B.1.526 | 0.000047 |
S | 14 | Q14G | CAG | GGC | 1 | 2 | B.1.561 | 0.000397 |
S | 14 | Q14R | cAG | cGC | 1 | 2 | B.1.561 | 0.000397 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 1 | 2 | B.1.561 | 0.000397 |
S | 14 | Q14G | CAg | GGg | 1 | 2 | B.1.561 | 0.000397 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 2 | 2 | B.1.596 | 0.000174 |
S | 14 | Q14L | cAg | cTg | 2 | 2 | B.1.617.2 | 0.000008 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 2 | 2 | B.1.620 | 0.001892 |
S | 14 | Q14Q | caG | caA | 2 | 2 | P.1 | 0.000032 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 2 | 2 | P.1 | 0.000032 |
S | 14 | Q14Q | caG | caA | 2 | 2 | P.1.14 | 0.000096 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 2 | 2 | P.2 | 0.000373 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 2 | 2 | P.3 | 0.00319 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 2 | 2 | Q.1 | 0.000253 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 1 | 1 | A | 0.000387 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | A | 0.000387 |
S | 14 | Q14X | Cag | Tag | 1 | 1 | A.2 | 0.000662 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 1 | 1 | A.2.4 | 0.003367 |
S | 14 | Q14K | Cag | Aag | 1 | 1 | A.2.4 | 0.003367 |
S | 14 | Q14Q | caG | caA | 1 | 1 | A.27 | 0.001656 |
S | 14 | Q14W | CAg | TGg | 1 | 1 | All | 0 |
S | 14 | Q14N | CaG | AaT | 1 | 1 | All | 0 |
S | 14 | Q14Y | CaG | TaT | 1 | 1 | All | 0 |
S | 14 | Q14E | Cag | Gag | 1 | 1 | AY.1 | 0.000396 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 1 | 1 | AY.101 | 0.00049 |
S | 14 | Q14E | Cag | Gag | 1 | 1 | AY.102 | 0.000027 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 1 | 1 | AY.102 | 0.000027 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 1 | 1 | AY.103 | 0.000006 |
S | 14 | Q14K | Cag | Aag | 1 | 1 | AY.103 | 0.000006 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | AY.111 | 0.000183 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 1 | 1 | AY.113 | 0.000142 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | AY.114 | 0.000231 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 1 | 1 | AY.116.1 | 0.000311 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | AY.116.1 | 0.000311 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 1 | 1 | AY.117 | 0.000085 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 1 | 1 | AY.118 | 0.000063 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | AY.12 | 0.000316 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 1 | 1 | AY.121 | 0.000135 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | AY.121 | 0.000135 |
S | 14 | Q14X | Cag | Tag | 1 | 1 | AY.13 | 0.000161 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 1 | 1 | AY.14 | 0.000088 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | AY.19 | 0.00114 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | AY.2 | 0.000356 |
S | 14 | Q14Q | caG | caA | 1 | 1 | AY.20 | 0.000039 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 1 | 1 | AY.23 | 0.00007 |
S | 14 | Q14L | cAg | cTg | 1 | 1 | AY.23.1 | 0.000417 |
S | 14 | Q14Y | CaG | TaT | 1 | 1 | AY.25 | 0.000006 |
S | 14 | Q14L | cAg | cTg | 1 | 1 | AY.29 | 0.000016 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 1 | 1 | AY.34.1 | 0.00051 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 1 | 1 | AY.36 | 0.000148 |
S | 14 | Q14Q | caG | caA | 1 | 1 | AY.39 | 0.000025 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 1 | 1 | AY.39.1 | 0.00004 |
S | 14 | Q14K | Cag | Aag | 1 | 1 | AY.4 | 0.000002 |
S | 14 | Q14X | Cag | Tag | 1 | 1 | AY.4 | 0.000002 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 1 | 1 | AY.4.2 | 0.000022 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | AY.4.2.1 | 0.000149 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | AY.4.3 | 0.000842 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | AY.4.4 | 0.000409 |
S | 14 | Q14X | Cag | Tag | 1 | 1 | AY.4.5 | 0.000107 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | AY.4.5 | 0.000107 |
S | 14 | Q14K | Cag | Aag | 1 | 1 | AY.42 | 0.00004 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 1 | 1 | AY.42 | 0.00004 |
S | 14 | Q14del1 | caG | ca- | 1 | 1 | AY.42 | 0.00004 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 1 | 1 | AY.42 | 0.00004 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 1 | 1 | AY.43 | 0.000004 |
S | 14 | Q14Q | caG | caA | 1 | 1 | AY.43 | 0.000004 |
S | 14 | Q14K | Cag | Aag | 1 | 1 | AY.44 | 0.000006 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 1 | 1 | AY.45 | 0.000122 |
S | 14 | Q14E | Cag | Gag | 1 | 1 | AY.45 | 0.000122 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | AY.46.5 | 0.000198 |
S | 14 | Q14X | Cag | Tag | 1 | 1 | AY.46.6 | 0.000072 |
S | 14 | Q14K | Cag | Aag | 1 | 1 | AY.5 | 0.000021 |
S | 14 | Q14Q | caG | caA | 1 | 1 | AY.5.3 | 0.000337 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | AY.5.4 | 0.000277 |
S | 14 | Q14X | Cag | Tag | 1 | 1 | AY.56 | 0.001605 |
S | 14 | Q14K | Cag | Aag | 1 | 1 | AY.6 | 0.000041 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 1 | 1 | AY.61 | 0.000105 |
S | 14 | Q14Q | caG | caA | 1 | 1 | AY.61 | 0.000105 |
S | 14 | Q14E | Cag | Gag | 1 | 1 | AY.61 | 0.000105 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | AY.67 | 0.000464 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 1 | 1 | AY.68 | 0.000274 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | AY.7.1 | 0.000113 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 1 | 1 | AY.75 | 0.000056 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 1 | 1 | AY.75 | 0.000056 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | AY.75.1 | 0.00018 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | AY.78 | 0.001541 |
S | 14 | Q14X | Cag | Tag | 1 | 1 | AY.79 | 0.001211 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | AY.89 | 0.004902 |
S | 14 | Q14L | cAg | cTg | 1 | 1 | AY.9 | 0.000068 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 1 | 1 | AY.9 | 0.000068 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 1 | 1 | AY.90 | 0.000684 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 1 | 1 | AY.92 | 0.000287 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 1 | 1 | AY.93 | 0.000273 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | AY.98 | 0.000079 |
S | 14 | Q14L | cAg | cTg | 1 | 1 | B.1 | 0.000009 |
S | 14 | Q14X | Cag | Tag | 1 | 1 | B.1.1 | 0.000018 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 1 | 1 | B.1.1.1 | 0.000327 |
S | 14 | Q14E | Cag | Gag | 1 | 1 | B.1.1.10 | 0.001115 |
S | 14 | Q14X | Cag | Tag | 1 | 1 | B.1.1.115 | 0.008929 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 1 | 1 | B.1.1.118 | 0.010204 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.1.121 | 0.002427 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.1.17 | 0.016667 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 1 | 1 | B.1.1.198 | 0.001468 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 1 | 1 | B.1.1.220 | 0.001859 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.1.237 | 0.005405 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.1.25 | 0.000569 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.1.261 | 0.008621 |
S | 14 | Q14K | Cag | Aag | 1 | 1 | B.1.1.28 | 0.000311 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 1 | 1 | B.1.1.288 | 0.001916 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.1.289 | 0.002083 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.1.301 | 0.001179 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.1.306 | 0.000438 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.1.311 | 0.000358 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 1 | 1 | B.1.1.315 | 0.008475 |
S | 14 | Q14E | Cag | Gag | 1 | 1 | B.1.1.318 | 0.000302 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 1 | 1 | B.1.1.33 | 0.000421 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.1.344 | 0.010753 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.1.362 | 0.005618 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.1.37 | 0.000193 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 1 | 1 | B.1.1.372 | 0.000689 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 1 | 1 | B.1.1.39 | 0.00051 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 1 | 1 | B.1.1.420 | 0.001006 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 1 | 1 | B.1.1.433 | 0.001425 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.1.433 | 0.001425 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 1 | 1 | B.1.1.46 | 0.004367 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.1.50 | 0.000679 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 1 | 1 | B.1.1.519 | 0.00004 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 1 | 1 | B.1.1.54 | 0.003021 |
S | 14 | Q14del1 | caG | ca- | 1 | 1 | B.1.1.7 | 0.000001 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 1 | 1 | B.1.1.70 | 0.000341 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.1.70 | 0.000341 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.147 | 0.000756 |
S | 14 | Q14N | CaG | AaT | 1 | 1 | B.1.160 | 0.000031 |
S | 14 | Q14X | Cag | Tag | 1 | 1 | B.1.160 | 0.000031 |
S | 14 | Q14E | Cag | Gag | 1 | 1 | B.1.160 | 0.000031 |
S | 14 | Q14X | Cag | Tag | 1 | 1 | B.1.160.16 | 0.000929 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 1 | 1 | B.1.160.16 | 0.000929 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.160.26 | 0.002421 |
S | 14 | Q14X | Cag | Tag | 1 | 1 | B.1.177.15 | 0.000631 |
S | 14 | Q14Q | caG | caA | 1 | 1 | B.1.177.18 | 0.00116 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 1 | 1 | B.1.177.23 | 0.003236 |
S | 14 | Q14K | Cag | Aag | 1 | 1 | B.1.177.52 | 0.001757 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 1 | 1 | B.1.177.6 | 0.000977 |
S | 14 | Q14E | Cag | Gag | 1 | 1 | B.1.177.6 | 0.000977 |
S | 14 | Q14X | Cag | Tag | 1 | 1 | B.1.177.60 | 0.000218 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.177.60 | 0.000218 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 1 | 1 | B.1.177.68 | 0.015152 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 1 | 1 | B.1.177.74 | 0.015152 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 1 | 1 | B.1.177.83 | 0.001481 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.187 | 0.033333 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.206 | 0.000816 |
S | 14 | Q14X | Cag | Tag | 1 | 1 | B.1.210 | 0.002132 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.214.1 | 0.02 |
S | 14 | Q14X | Cag | Tag | 1 | 1 | B.1.221 | 0.000071 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 1 | 1 | B.1.221 | 0.000071 |
S | 14 | Q14E | Cag | Gag | 1 | 1 | B.1.234 | 0.000132 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 1 | 1 | B.1.240 | 0.000216 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.241 | 0.000812 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 1 | 1 | B.1.258.11 | 0.000396 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.258.17 | 0.000104 |
S | 14 | Q14L | cAg | cTg | 1 | 1 | B.1.265 | 0.001271 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.274 | 0.011905 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.311 | 0.000275 |
S | 14 | Q14X | Cag | Tag | 1 | 1 | B.1.314 | 0.007519 |
S | 14 | Q14K | Cag | Aag | 1 | 1 | B.1.319 | 0.003049 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.324 | 0.001605 |
S | 14 | Q14K | Cag | Aag | 1 | 1 | B.1.351 | 0.00003 |
S | 14 | Q14L | cAg | cTg | 1 | 1 | B.1.351 | 0.00003 |
S | 14 | Q14K | Cag | Aag | 1 | 1 | B.1.351.2 | 0.000303 |
S | 14 | Q14K | Cag | Aag | 1 | 1 | B.1.36.16 | 0.001425 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.36.22 | 0.001208 |
S | 14 | Q14Q | caG | caA | 1 | 1 | B.1.36.29 | 0.000517 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 1 | 1 | B.1.36.37 | 0.002778 |
S | 14 | Q14L | cAg | cTg | 1 | 1 | B.1.367 | 0.000792 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 1 | 1 | B.1.369 | 0.000285 |
S | 14 | Q14X | Cag | Tag | 1 | 1 | B.1.369 | 0.000285 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.409 | 0.000781 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.411 | 0.003704 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 1 | 1 | B.1.413 | 0.004255 |
S | 14 | Q14E | Cag | Gag | 1 | 1 | B.1.429 | 0.000024 |
S | 14 | Q14Q | caG | caA | 1 | 1 | B.1.459 | 0.004082 |
S | 14 | Q14K | Cag | Aag | 1 | 1 | B.1.459 | 0.004082 |
S | 14 | Q14X | Cag | Tag | 1 | 1 | B.1.466.2 | 0.000391 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.469 | 0.00361 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 1 | 1 | B.1.470 | 0.001404 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 1 | 1 | B.1.486 | 0.111111 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.497 | 0.000315 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.505 | 0.004386 |
S | 14 | Q14X | Cag | Tag | 1 | 1 | B.1.508 | 0.025641 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.509 | 0.000866 |
S | 14 | Q14L | cAg | cTg | 1 | 1 | B.1.524 | 0.001406 |
S | 14 | Q14D | CaG | GaC | 1 | 1 | B.1.561 | 0.000397 |
S | 14 | Q14E | Cag | Gag | 1 | 1 | B.1.561 | 0.000397 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.564 | 0.000426 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.564.1 | 0.001577 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 1 | 1 | B.1.575 | 0.000303 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 1 | 1 | B.1.576 | 0.000907 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 1 | 1 | B.1.587 | 0.001898 |
S | 14 | Q14D | CaG | GaT | 1 | 1 | B.1.591 | 0.010638 |
S | 14 | Q14E | Cag | Gag | 1 | 1 | B.1.591 | 0.010638 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.591 | 0.010638 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 1 | 1 | B.1.595 | 0.000261 |
S | 14 | Q14K | Cag | Aag | 1 | 1 | B.1.596 | 0.000087 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 1 | 1 | B.1.606 | 0.006024 |
S | 14 | Q14X | Cag | Tag | 1 | 1 | B.1.617.2 | 0.000004 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.619 | 0.000871 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 1 | 1 | B.1.620 | 0.000946 |
S | 14 | Q14K | Cag | Aag | 1 | 1 | B.1.623 | 0.000536 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.627 | 0.00202 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 1 | 1 | B.1.637 | 0.000073 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.638 | 0.052632 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | B.1.8 | 0.001972 |
S | 14 | Q14H | caG | caC | 1 | 1 | B.40 | 0.000364 |
S | 14 | Q14E | Cag | Gag | 1 | 1 | B.60 | 0.015873 |
S | 14 | Q14del | CAG | --- | 1 | 1 | C.36.3 | 0.000567 |
S | 14 | Q14R | cAg | cGg | 1 | 1 | D.2 | 0.000075 |
S | 14 | Q14W | CAg | TGg | 1 | 1 | D.2 | 0.000075 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | N.1 | 0.016949 |
S | 14 | Q14L | cAg | cTg | 1 | 1 | N.4 | 0.004255 |
S | 14 | Q14K | Cag | Aag | 1 | 1 | P.1 | 0.000016 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | P.1.10 | 0.000269 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | P.1.7 | 0.000319 |
S | 14 | Q14L | cAg | cTg | 1 | 1 | Q.3 | 0.000145 |
S | 14 | Q14H | caG | caT | 1 | 1 | Q.3 | 0.000145 |
S | 14 | Q14L | cAg | cTg | 1 | 1 | Q.8 | 0.000165 |
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CoV-GLUE is still in development. CoV-GLUE was originally developed as part of COG-UK by Josh Singer using the GLUE framework at the MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research (CVR). In 2021 it was redeveloped by Richard Orton to scale to the millions of genome sequences available. We acknowledge support from the MRC (MC_UU_12014/12), WT (220977/Z/20/Z) and UKRI G2P (MR/W005611/1). Please contact Richard Orton with any queries: Richard.Orton@glasgow.ac.uk
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