CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF8 : Mut = S54del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF854S54deldelTCA---921921128053-28055

Details of the mutation S54del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF854S54delTCA---921921All0.000176
ORF854S54delTCA---195195B.1.1.70.000175
ORF854S54delTCA---9797AY.40.000151
ORF854S54delTCA---6060AY.1030.000373
ORF854S54delTCA---5959B.1.1.2940.074684
ORF854S54delTCA---4545B.1.3510.001338
ORF854S54delTCA---3838AY.290.000599
ORF854S54delTCA---3434B.1.10.000617
ORF854S54delTCA---3434B.1.2430.002366
ORF854S54delTCA---3333B.1.1.2220.006732
ORF854S54delTCA---3232B.1.1600.000998
ORF854S54delTCA---1919AY.440.000116
ORF854S54delTCA---1818B0.002301
ORF854S54delTCA---1616AY.30.000159
ORF854S54delTCA---1414P.10.000221
ORF854S54delTCA---1111AY.270.000712
ORF854S54delTCA---1111B.1.1.3180.003319
ORF854S54delTCA---99AY.1180.000564
ORF854S54delTCA---88B.1.1.2840.000859
ORF854S54delTCA---88B.1.20.00007
ORF854S54delTCA---77AY.4.20.000152
ORF854S54delTCA---77B.1.1.2650.022082
ORF854S54delTCA---77B.1.36.160.009972
ORF854S54delTCA---77B.1.617.20.000026
ORF854S54delTCA---77B.1.6280.002467
ORF854S54delTCA---77P.1.140.000335
ORF854S54delTCA---66AY.1190.000212
ORF854S54delTCA---66B.1.243.20.086957
ORF854S54delTCA---55AY.29.10.001103
ORF854S54delTCA---55B.10.000046
ORF854S54delTCA---55B.1.1.5190.000199
ORF854S54delTCA---55B.1.2400.001078
ORF854S54delTCA---44AY.60.000165
ORF854S54delTCA---44AY.7.20.002237
ORF854S54delTCA---44B.1.1.2140.000222
ORF854S54delTCA---44B.1.1770.000053
ORF854S54delTCA---44B.1.4290.000094
ORF854S54delTCA---44P.1.10.001271
ORF854S54delTCA---33AY.250.000018
ORF854S54delTCA---33AY.260.000085
ORF854S54delTCA---33B.1.220.003953
ORF854S54delTCA---33B.1.5090.002597
ORF854S54delTCA---33B.1.5260.000071
ORF854S54delTCA---33P.1.150.000697
ORF854S54delTCA---22AY.39.10.000079
ORF854S54delTCA---22AY.480.00093
ORF854S54delTCA---22AY.840.000875
ORF854S54delTCA---22B.1.2100.004264
ORF854S54delTCA---22B.1.258.170.000208
ORF854S54delTCA---22B.1.360.000292
ORF854S54delTCA---22B.1.4270.000101
ORF854S54delTCA---22B.1.6370.000146
ORF854S54delTCA---22B.400.000729
ORF854S54delTCA---11AE.40.043478
ORF854S54delTCA---11AY.1080.001103
ORF854S54delTCA---11AY.230.00007
ORF854S54delTCA---11AY.390.000025
ORF854S54delTCA---11AY.4.40.000409
ORF854S54delTCA---11AY.430.000004
ORF854S54delTCA---11AY.540.000095
ORF854S54delTCA---11AY.690.000187
ORF854S54delTCA---11AY.740.000116
ORF854S54delTCA---11AY.90.000068
ORF854S54delTCA---11AY.9.20.000037
ORF854S54delTCA---11AY.98.10.000048
ORF854S54delTCA---11AZ.20.000821
ORF854S54delTCA---11B.1.1.1740.003378
ORF854S54delTCA---11B.1.1.2160.00089
ORF854S54delTCA---11B.1.1.250.000569
ORF854S54delTCA---11B.1.1.2690.001353
ORF854S54delTCA---11B.1.1.2970.002237
ORF854S54delTCA---11B.1.1.3220.008772
ORF854S54delTCA---11B.1.1.3540.004386
ORF854S54delTCA---11B.1.1.370.000193
ORF854S54delTCA---11B.1.1.630.000386
ORF854S54delTCA---11B.1.1260.001276
ORF854S54delTCA---11B.1.177.120.000152
ORF854S54delTCA---11B.1.177.630.002703
ORF854S54delTCA---11B.1.177.70.000165
ORF854S54delTCA---11B.1.177.830.001481
ORF854S54delTCA---11B.1.1950.005025
ORF854S54delTCA---11B.1.2580.000067
ORF854S54delTCA---11B.1.258.120.007874
ORF854S54delTCA---11B.1.258.90.005
ORF854S54delTCA---11B.1.351.20.000303
ORF854S54delTCA---11B.1.4450.011765
ORF854S54delTCA---11B.1.4680.005714
ORF854S54delTCA---11B.1.5400.009709
ORF854S54delTCA---11B.1.5490.007194
ORF854S54delTCA---11B.1.5640.000426
ORF854S54delTCA---11B.1.6210.000089
ORF854S54delTCA---11B.340.013699
ORF854S54delTCA---11C.260.007353
ORF854S54delTCA---11C.370.000116
ORF854S54delTCA---11M.30.076923
ORF854S54delTCA---11N.60.007092
ORF854S54delTCA---11P.1.120.000484
ORF854S54delTCA---11P.1.170.000162
ORF854S54delTCA---11R.10.00009