CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF8 : Mut = M1T

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF81M1TnonsynaTgaCg104990.95192327894-27896
ORF81M1TnonsynaTGaCA10440.038461527894-27896
ORF81M1TnonsynaTGaCT10410.0096153827894-27896

Details of the mutation M1T within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF81M1TaTgaCg99104All0.000019
ORF81M1TaTGaCA4104All0.000001
ORF81M1TaTGaCT1104All0
ORF81M1TaTgaCg2828B.1.1.70.000025
ORF81M1TaTgaCg99C.160.009544
ORF81M1TaTgaCg88AY.250.000048
ORF81M1TaTgaCg66B.10.000055
ORF81M1TaTgaCg55AY.9.20.000184
ORF81M1TaTgaCg44AY.1030.000025
ORF81M1TaTGaCA24B.1.1.250.001137
ORF81M1TaTgaCg24B.1.1.250.001137
ORF81M1TaTgaCg33AY.40.000005
ORF81M1TaTgaCg33AY.470.000093
ORF81M1TaTgaCg23B.1.10.000036
ORF81M1TaTGaCA13B.1.10.000018
ORF81M1TaTgaCg33P.10.000047
ORF81M1TaTgaCg33P.20.00056
ORF81M1TaTgaCg22AY.30.00002
ORF81M1TaTgaCg22AY.980.000158
ORF81M1TaTgaCg11A.2.40.003367
ORF81M1TaTgaCg11AY.1000.000046
ORF81M1TaTgaCg11AY.1190.000035
ORF81M1TaTgaCg11AY.380.000499
ORF81M1TaTGaCT11AY.390.000025
ORF81M1TaTgaCg11AY.430.000004
ORF81M1TaTgaCg11AY.50.000021
ORF81M1TaTGaCA11AY.840.000437
ORF81M1TaTgaCg11B.1.1.1710.003676
ORF81M1TaTgaCg11B.1.1.280.000311
ORF81M1TaTgaCg11B.1.1600.000031
ORF81M1TaTgaCg11B.1.1770.000013
ORF81M1TaTgaCg11B.1.177.40.000211
ORF81M1TaTgaCg11B.1.20.000009
ORF81M1TaTgaCg11B.1.3400.004292
ORF81M1TaTgaCg11B.1.362.20.004717
ORF81M1TaTgaCg11B.1.4270.00005
ORF81M1TaTgaCg11B.1.6210.000089
ORF81M1TaTgaCg11B.60.00091
ORF81M1TaTgaCg11C.360.000911
ORF81M1TaTgaCg11P.1.20.001156