CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF8 : Mut = L84L

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF884L84LsynttAttG4863690.75925928143-28145
ORF884L84LsynTtaCta4861150.23662628143-28145
ORF884L84LsynTtACtG48610.0020576128143-28145
ORF884L84LsynTtACtT48610.0020576128143-28145

Details of the mutation L84L within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF884L84LttAttG369486All0.000071
ORF884L84LTtaCta115486All0.000022
ORF884L84LTtACtT1486All0
ORF884L84LTtACtG1486All0
ORF884L84LttAttG182190AY.40.000283
ORF884L84LTtaCta8190AY.40.000012
ORF884L84LttAttG6971AY.1030.000428
ORF884L84LTtaCta271AY.1030.000012
ORF884L84LttAttG3838AY.740.004395
ORF884L84LttAttG2735AY.250.000162
ORF884L84LTtaCta835AY.250.000048
ORF884L84LTtaCta2728AY.440.000164
ORF884L84LttAttG128AY.440.000006
ORF884L84LTtaCta1626B.1.1.70.000014
ORF884L84LttAttG1026B.1.1.70.000009
ORF884L84LTtaCta1313B.1.3110.003569
ORF884L84LttAttG810AY.1180.000501
ORF884L84LTtaCta210AY.1180.000125
ORF884L84LTtaCta1010B.1.617.10.00129
ORF884L84LttAttG57AY.430.000022
ORF884L84LTtaCta27AY.430.000009
ORF884L84LTtaCta66B.1.2430.000418
ORF884L84LttAttG35B.1.10.000054
ORF884L84LTtaCta25B.1.10.000036
ORF884L84LttAttG34AY.30.00003
ORF884L84LTtACtT14AY.30.00001
ORF884L84LttAttG33AY.390.000074
ORF884L84LTtaCta33B.1.617.20.000011
ORF884L84LttAttG33C.350.002322
ORF884L84LttAttG22AY.1190.000071
ORF884L84LttAttG22AY.200.000078
ORF884L84LttAttG12AY.330.000067
ORF884L84LTtaCta12AY.330.000067
ORF884L84LttAttG12B.1.20.000009
ORF884L84LTtaCta12B.1.20.000009
ORF884L84LTtaCta22B.1.2580.000133
ORF884L84LTtaCta11AY.1160.000287
ORF884L84LTtaCta11AY.140.000088
ORF884L84LttAttG11AY.230.00007
ORF884L84LTtaCta11AY.290.000016
ORF884L84LttAttG11AY.29.10.000221
ORF884L84LttAttG11AY.4.20.000022
ORF884L84LTtaCta11AY.420.00004
ORF884L84LttAttG11AY.50.000021
ORF884L84LttAttG11AY.60.000041
ORF884L84LTtaCta11AY.690.000187
ORF884L84LttAttG11AY.820.001357
ORF884L84LTtaCta11AY.900.000684
ORF884L84LTtaCta11B0.000128
ORF884L84LttAttG11B.1.1.1130.006993
ORF884L84LttAttG11B.1.1.1300.015385
ORF884L84LTtaCta11B.1.1.2530.002506
ORF884L84LTtaCta11B.1.1.3180.000302
ORF884L84LTtACtG11B.1.177.630.002703
ORF884L84LttAttG11B.1.4560.003268
ORF884L84LttAttG11B.1.4700.001404
ORF884L84LTtaCta11B.1.5250.000113
ORF884L84LttAttG11B.400.000364
ORF884L84LTtaCta11P.1.140.000048
ORF884L84LTtaCta11P.1.20.001156