CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF8 : Mut = L60F

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF860L60FnonsynttGttT69255692350.99971128071-28073
ORF860L60FnonsynttGttC69255200.00028878828071-28073

Details of the mutation L60F within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF860L60FttGttT6923569255All0.013242
ORF860L60FttGttC2069255All0.000004
ORF860L60FttGttT6541565420AY.440.398165
ORF860L60FttGttC565420AY.440.00003
ORF860L60FttGttT26102612B.1.617.20.009828
ORF860L60FttGttC22612B.1.617.20.000008
ORF860L60FttGttT338344B.1.1.70.000303
ORF860L60FttGttC6344B.1.1.70.000005
ORF860L60FttGttT9191AY.40.000142
ORF860L60FttGttT8484AB.10.688525
ORF860L60FttGttT8282AY.1030.000509
ORF860L60FttGttT5050AY.1170.004226
ORF860L60FttGttT3436AY.430.000151
ORF860L60FttGttC236AY.430.000009
ORF860L60FttGttT3030AY.390.000741
ORF860L60FttGttT3030P.10.000473
ORF860L60FttGttT2929B.1.258.230.690476
ORF860L60FttGttT2727AY.250.000162
ORF860L60FttGttT2424B.1.5170.010248
ORF860L60FttGttT2020AY.450.002434
ORF860L60FttGttT1616AY.460.001665
ORF860L60FttGttT1515AY.1180.00094
ORF860L60FttGttT1314B.10.000119
ORF860L60FttGttC114B.10.000009
ORF860L60FttGttT1414B.1.4290.000329
ORF860L60FttGttT1313B.1.2340.001715
ORF860L60FttGttT1212AY.1100.001352
ORF860L60FttGttT1212AY.1190.000424
ORF860L60FttGttT1111AY.1020.000292
ORF860L60FttGttT1111AY.750.000616
ORF860L60FttGttT99AY.230.000628
ORF860L60FttGttT99AY.30.00009
ORF860L60FttGttT99B.1.5960.000784
ORF860L60FttGttT88B.1.20.00007
ORF860L60FttGttT88B.1.3510.000238
ORF860L60FttGttT77AY.260.000198
ORF860L60FttGttT77P.1.70.002235
ORF860L60FttGttT66AY.200.000233
ORF860L60FttGttT66AY.3.10.000512
ORF860L60FttGttT66AY.50.000124
ORF860L60FttGttT55AY.1000.00023
ORF860L60FttGttT45AY.1130.00057
ORF860L60FttGttC15AY.1130.000142
ORF860L60FttGttT55AY.130.000805
ORF860L60FttGttT55AY.470.000156
ORF860L60FttGttT55AY.920.001436
ORF860L60FttGttT55B0.000639
ORF860L60FttGttT55Q.80.000825
ORF860L60FttGttT44AY.140.000352
ORF860L60FttGttT44AY.540.000381
ORF860L60FttGttT44AY.930.001092
ORF860L60FttGttT44B.1.1600.000125
ORF860L60FttGttT44B.1.6210.000354
ORF860L60FttGttT33A.2.50.001497
ORF860L60FttGttT33AY.1140.000693
ORF860L60FttGttT33AY.290.000047
ORF860L60FttGttT33AY.330.0002
ORF860L60FttGttC33AY.590.001589
ORF860L60FttGttT33AY.720.004082
ORF860L60FttGttT33AY.9.20.00011
ORF860L60FttGttT33AY.980.000237
ORF860L60FttGttT33B.1.1.1920.006928
ORF860L60FttGttT33B.1.1770.00004
ORF860L60FttGttT33B.1.2430.000209
ORF860L60FttGttT33B.1.2580.0002
ORF860L60FttGttT33B.1.5250.000339
ORF860L60FttGttT33B.1.5260.000071
ORF860L60FttGttT33P.1.140.000143
ORF860L60FttGttT220.111111
ORF860L60FttGttT22AY.1090.001479
ORF860L60FttGttT22AY.320.001065
ORF860L60FttGttT22AY.5.40.000553
ORF860L60FttGttT22AY.620.000871
ORF860L60FttGttT22AY.670.000929
ORF860L60FttGttT22AY.7.10.000225
ORF860L60FttGttT22AY.840.000875
ORF860L60FttGttT22AY.98.10.000097
ORF860L60FttGttT22B.1.10.000036
ORF860L60FttGttT22B.1.177.210.000153
ORF860L60FttGttT22B.1.3490.00143
ORF860L60FttGttT22B.1.4270.000101
ORF860L60FttGttT22B.1.4850.029851
ORF860L60FttGttT22B.1.5650.001621
ORF860L60FttGttT22B.1.6260.011429
ORF860L60FttGttT22C.370.000232
ORF860L60FttGttT22P.1.150.000465
ORF860L60FttGttT11AD.20.000219
ORF860L60FttGttT11AY.1010.00049
ORF860L60FttGttT11AY.1050.000643
ORF860L60FttGttT11AY.1060.000335
ORF860L60FttGttT11AY.1160.000287
ORF860L60FttGttT11AY.116.10.000311
ORF860L60FttGttT11AY.1200.000037
ORF860L60FttGttT11AY.16.10.00047
ORF860L60FttGttT11AY.340.000097
ORF860L60FttGttT11AY.34.10.00051
ORF860L60FttGttT11AY.39.10.00004
ORF860L60FttGttT11AY.4.20.000022
ORF860L60FttGttT11AY.4.50.000107
ORF860L60FttGttT11AY.46.20.000635
ORF860L60FttGttT11AY.46.40.000165
ORF860L60FttGttT11AY.5.30.000337
ORF860L60FttGttT11AY.520.000814
ORF860L60FttGttT11AY.570.000656
ORF860L60FttGttT11AY.680.000274
ORF860L60FttGttT11AY.730.000665
ORF860L60FttGttT11AY.790.001211
ORF860L60FttGttT11AY.90.000068
ORF860L60FttGttT11AY.9.10.000084
ORF860L60FttGttT11AY.960.002075
ORF860L60FttGttT11AY.99.20.000092
ORF860L60FttGttT11B.1.1.1570.000913
ORF860L60FttGttT11B.1.1.2070.001182
ORF860L60FttGttT11B.1.1.280.000311
ORF860L60FttGttT11B.1.1.3060.000438
ORF860L60FttGttT11B.1.1.3180.000302
ORF860L60FttGttT11B.1.1.5190.00004
ORF860L60FttGttT11B.1.1.5260.003546
ORF860L60FttGttT11B.1.177.120.000152
ORF860L60FttGttT11B.1.214.20.0006
ORF860L60FttGttT11B.1.3110.000275
ORF860L60FttGttT11B.1.351.50.0006
ORF860L60FttGttT11B.1.3550.011111
ORF860L60FttGttT11B.1.5640.000426
ORF860L60FttGttT11B.1.5800.004065
ORF860L60FttGttT11B.1.621.10.000506
ORF860L60FttGttT11B.1.6370.000073
ORF860L60FttGttT11B.1.9.50.005682
ORF860L60FttGttT11B.1.930.000934
ORF860L60FttGttT11C.10.002392
ORF860L60FttGttT11C.160.00106
ORF860L60FttGttT11P.1.10.000318
ORF860L60FttGttT11Q.30.000145