CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF8 : Mut = I9T

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF89I9TnonsynaTcaCc133713350.99850427918-27920
ORF89I9TnonsynaTCaCT133710.00074794327918-27920
ORF89I9TnonsynaTCaCA133710.00074794327918-27920

Details of the mutation I9T within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF89I9TaTcaCc13351337All0.000255
ORF89I9TaTCaCT11337All0
ORF89I9TaTCaCA11337All0
ORF89I9TaTcaCc220220AY.40.000342
ORF89I9TaTcaCc8989B.1.1.70.00008
ORF89I9TaTcaCc8282AY.440.000499
ORF89I9TaTcaCc7878B.1.1770.001027
ORF89I9TaTcaCc7777B.1.10.001397
ORF89I9TaTcaCc4646B.1.1.580.247312
ORF89I9TaTcaCc4646B.1.617.20.000173
ORF89I9TaTcaCc4444B.1.6390.956522
ORF89I9TaTcaCc3333AY.1030.000205
ORF89I9TaTcaCc3232B.1.6210.002833
ORF89I9TaTcaCc2929AY.250.000174
ORF89I9TaTcaCc2829B.10.000256
ORF89I9TaTCaCA129B.10.000009
ORF89I9TaTcaCc2727B.1.1.2140.001497
ORF89I9TaTcaCc2727B.1.1.5190.001072
ORF89I9TaTcaCc2626B.1.36.90.083601
ORF89I9TaTcaCc2424B.1.5600.111111
ORF89I9TaTcaCc2323AY.390.000568
ORF89I9TaTcaCc2222B.1.1.3060.009645
ORF89I9TaTcaCc2020B.1.20.000176
ORF89I9TaTcaCc2020B.1.2430.001392
ORF89I9TaTcaCc1919P.10.000299
ORF89I9TaTcaCc1616AY.430.000071
ORF89I9TaTcaCc1313AY.50.000268
ORF89I9TaTcaCc1313B.1.1.2840.001396
ORF89I9TaTcaCc1313B.1.1600.000405
ORF89I9TaTcaCc1212AY.290.000189
ORF89I9TaTcaCc1212AY.470.000373
ORF89I9TaTcaCc1111B.1.1.3890.066667
ORF89I9TaTcaCc1010AY.30.000099
ORF89I9TaTcaCc1010B.1.130.023753
ORF89I9TaTcaCc1010B.1.258.181
ORF89I9TaTcaCc88AP.10.012012
ORF89I9TaTcaCc88B.1.4270.000404
ORF89I9TaTcaCc77AY.1000.000322
ORF89I9TaTcaCc77C.370.000812
ORF89I9TaTcaCc66AY.1190.000212
ORF89I9TaTcaCc55A.2.50.002495
ORF89I9TaTcaCc55B.1.1.2220.00102
ORF89I9TaTcaCc55B.1.1.280.001556
ORF89I9TaTcaCc44AY.120.001264
ORF89I9TaTcaCc44AY.200.000155
ORF89I9TaTcaCc44AY.4.50.00043
ORF89I9TaTcaCc44AY.420.000161
ORF89I9TaTcaCc44B.1.5380.032258
ORF89I9TaTcaCc44B.1.9.40.02454
ORF89I9TaTcaCc33AY.540.000286
ORF89I9TaTcaCc33AY.60.000123
ORF89I9TaTcaCc33AY.750.000168
ORF89I9TaTcaCc33AY.75.10.000541
ORF89I9TaTcaCc33B.1.1.2160.002671
ORF89I9TaTcaCc33B.1.1.330.001263
ORF89I9TaTcaCc33B.1.2210.000213
ORF89I9TaTcaCc33B.1.3510.000089
ORF89I9TaTcaCc33B.1.4040.003906
ORF89I9TaTcaCc22A.20.001324
ORF89I9TaTcaCc22AD.20.000438
ORF89I9TaTcaCc22AY.1080.002205
ORF89I9TaTcaCc22AY.130.000322
ORF89I9TaTcaCc22AY.160.000759
ORF89I9TaTcaCc22AY.46.40.000329
ORF89I9TaTcaCc22AY.610.00021
ORF89I9TaTcaCc22AY.920.000575
ORF89I9TaTcaCc22B.1.1.2940.002532
ORF89I9TaTcaCc22B.1.1.3850.008929
ORF89I9TaTcaCc22B.1.1.4320.002532
ORF89I9TaTcaCc22B.1.1.4340.000697
ORF89I9TaTcaCc22B.1.1.830.00542
ORF89I9TaTcaCc22B.1.177.70.00033
ORF89I9TaTcaCc22B.1.3750.001639
ORF89I9TaTcaCc22B.1.4290.000047
ORF89I9TaTcaCc22B.1.5770.001375
ORF89I9TaTcaCc22B.30.001661
ORF89I9TaTcaCc22B.3.10.003317
ORF89I9TaTcaCc22C.160.002121
ORF89I9TaTcaCc22P.1.140.000096
ORF89I9TaTcaCc11A0.000387
ORF89I9TaTcaCc11A.50.001923
ORF89I9TaTcaCc11AY.1020.000027
ORF89I9TaTcaCc11AY.1060.000335
ORF89I9TaTcaCc11AY.1090.00074
ORF89I9TaTcaCc11AY.1100.000113
ORF89I9TaTcaCc11AY.1160.000287
ORF89I9TaTcaCc11AY.1170.000085
ORF89I9TaTcaCc11AY.1210.000135
ORF89I9TaTcaCc11AY.16.10.00047
ORF89I9TaTcaCc11AY.260.000028
ORF89I9TaTcaCc11AY.270.000065
ORF89I9TaTcaCc11AY.4.20.000022
ORF89I9TaTcaCc11AY.450.000122
ORF89I9TaTcaCc11AY.510.000909
ORF89I9TaTcaCc11AY.590.00053
ORF89I9TaTCaCT11AY.670.000464
ORF89I9TaTcaCc11AY.840.000437
ORF89I9TaTcaCc11AY.9.10.000084
ORF89I9TaTcaCc11AY.9.20.000037
ORF89I9TaTcaCc11AY.930.000273
ORF89I9TaTcaCc11AY.980.000079
ORF89I9TaTcaCc11B0.000128
ORF89I9TaTcaCc11B.1.1.1480.008772
ORF89I9TaTcaCc11B.1.1.2770.000759
ORF89I9TaTcaCc11B.1.1.3880.045455
ORF89I9TaTcaCc11B.1.1.4480.002033
ORF89I9TaTcaCc11B.1.1040.00369
ORF89I9TaTcaCc11B.1.1640.014925
ORF89I9TaTcaCc11B.1.1700.00431
ORF89I9TaTcaCc11B.1.177.140.006098
ORF89I9TaTcaCc11B.1.177.160.000664
ORF89I9TaTcaCc11B.1.177.170.000821
ORF89I9TaTcaCc11B.1.177.40.000211
ORF89I9TaTcaCc11B.1.2100.002132
ORF89I9TaTcaCc11B.1.2320.000537
ORF89I9TaTcaCc11B.1.2340.000132
ORF89I9TaTcaCc11B.1.2400.000216
ORF89I9TaTcaCc11B.1.2580.000067
ORF89I9TaTcaCc11B.1.30.002618
ORF89I9TaTcaCc11B.1.351.20.000303
ORF89I9TaTcaCc11B.1.360.000146
ORF89I9TaTcaCc11B.1.36.290.000517
ORF89I9TaTcaCc11B.1.36.70.004
ORF89I9TaTcaCc11B.1.3990.001934
ORF89I9TaTcaCc11B.1.4280.00102
ORF89I9TaTcaCc11B.1.5030.002488
ORF89I9TaTcaCc11B.1.5090.000866
ORF89I9TaTcaCc11B.1.5260.000024
ORF89I9TaTcaCc11B.1.5400.009709
ORF89I9TaTcaCc11B.1.5450.014493
ORF89I9TaTcaCc11B.1.5880.00091
ORF89I9TaTcaCc11B.1.5960.000087
ORF89I9TaTcaCc11B.1.617.10.000129
ORF89I9TaTcaCc11B.1.6370.000073
ORF89I9TaTcaCc11B.1.9.50.005682
ORF89I9TaTcaCc11D.20.000075
ORF89I9TaTcaCc11P.1.170.000162
ORF89I9TaTcaCc11Q.80.000165
ORF89I9TaTcaCc11U.30.003861