CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF8 : Mut = H17H

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF817H17HsyncaCcaT114060114060127942-27944

Details of the mutation H17H within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF817H17HcaCcaT114060114060All0.021815
ORF817H17HcaCcaT4738447384B.1.1770.623933
ORF817H17HcaCcaT1298212982B.1.177.210.992735
ORF817H17HcaCcaT59315931B.1.177.70.977745
ORF817H17HcaCcaT54045404B.1.177.860.991378
ORF817H17HcaCcaT52355235B.1.177.810.991102
ORF817H17HcaCcaT46534653B.1.177.40.98206
ORF817H17HcaCcaT45774577B.1.177.600.999782
ORF817H17HcaCcaT35033503B.1.177.570.984265
ORF817H17HcaCcaT16341634B.1.177.540.990904
ORF817H17HcaCcaT14891489B.1.177.650.990685
ORF817H17HcaCcaT14821482B.1.177.560.989319
ORF817H17HcaCcaT13661366B.1.177.770.992012
ORF817H17HcaCcaT13211321B.1.177.80.99398
ORF817H17HcaCcaT10071007B.1.1.70.000901
ORF817H17HcaCcaT983983B.1.177.60.959961
ORF817H17HcaCcaT820820B.1.177.620.977354
ORF817H17HcaCcaT792792B.1.177.50.983851
ORF817H17HcaCcaT770770B.1.177.240.997409
ORF817H17HcaCcaT736736W.40.994595
ORF817H17HcaCcaT734734B.1.177.580.977364
ORF817H17HcaCcaT708708B.10.006485
ORF817H17HcaCcaT555555B.1.177.520.975395
ORF817H17HcaCcaT522522B.1.177.800.998088
ORF817H17HcaCcaT507507AY.40.000789
ORF817H17HcaCcaT460460AY.440.0028
ORF817H17HcaCcaT427427B.1.177.791
ORF817H17HcaCcaT424424B.1.177.550.988345
ORF817H17HcaCcaT404404B.1.177.530.966507
ORF817H17HcaCcaT399399B.1.177.760.995012
ORF817H17HcaCcaT364364B.1.177.630.983784
ORF817H17HcaCcaT345345Z.10.99711
ORF817H17HcaCcaT317317B.1.177.480.990625
ORF817H17HcaCcaT308308B.1.20.002712
ORF817H17HcaCcaT258258U.30.996139
ORF817H17HcaCcaT243243P.10.003828
ORF817H17HcaCcaT219219B.1.177.511
ORF817H17HcaCcaT217217B.1.177.20.986364
ORF817H17HcaCcaT209209B.1.177.500.981221
ORF817H17HcaCcaT207207W.21
ORF817H17HcaCcaT188188W.30.989474
ORF817H17HcaCcaT186186B.1.617.20.0007
ORF817H17HcaCcaT184184B.1.177.851
ORF817H17HcaCcaT142142AY.250.000854
ORF817H17HcaCcaT142142B.1.177.260.993007
ORF817H17HcaCcaT131131B.1.177.671
ORF817H17HcaCcaT127127B.1.177.30.969466
ORF817H17HcaCcaT115115W.11
ORF817H17HcaCcaT113113U.20.991228
ORF817H17HcaCcaT106106B.1.10.001923
ORF817H17HcaCcaT105105B.1.177.270.990566
ORF817H17HcaCcaT9999AY.4.20.002147
ORF817H17HcaCcaT9494C.370.01091
ORF817H17HcaCcaT8888B.1.5250.009958
ORF817H17HcaCcaT8686AY.1030.000534
ORF817H17HcaCcaT8484AY.30.000835
ORF817H17HcaCcaT7878U.11
ORF817H17HcaCcaT7878Y.11
ORF817H17HcaCcaT7272AY.430.000319
ORF817H17HcaCcaT7171B.1.177.470.922078
ORF817H17HcaCcaT6767AY.260.001897
ORF817H17HcaCcaT6767B.1.177.251
ORF817H17HcaCcaT6666B.1.177.681
ORF817H17HcaCcaT6464B.1.177.740.969697
ORF817H17HcaCcaT6262B.1.177.591
ORF817H17HcaCcaT6060AY.540.005721
ORF817H17HcaCcaT5353B.1.2580.003527
ORF817H17HcaCcaT4444V.11
ORF817H17HcaCcaT4343B.1.1.1410.086519
ORF817H17HcaCcaT4040AY.1020.001061
ORF817H17HcaCcaT3939B.1.1.2140.002163
ORF817H17HcaCcaT3838AY.1000.001748
ORF817H17HcaCcaT3434B.1.4290.0008
ORF817H17HcaCcaT3333AY.1180.002067
ORF817H17HcaCcaT3131V.21
ORF817H17HcaCcaT2929B.1.1600.000904
ORF817H17HcaCcaT2828AY.420.001126
ORF817H17HcaCcaT2828B.1.5260.000658
ORF817H17HcaCcaT2727B.1.177.491
ORF817H17HcaCcaT2626AY.750.001457
ORF817H17HcaCcaT2424B.1.1.2220.004896
ORF817H17HcaCcaT2424B.1.177.661
ORF817H17HcaCcaT2424P.1.140.001147
ORF817H17HcaCcaT2222AY.60.000905
ORF817H17HcaCcaT2222B.1.177.610.956522
ORF817H17HcaCcaT1818AY.290.000284
ORF817H17HcaCcaT1818AY.50.000372
ORF817H17HcaCcaT1717AY.120.10.005457
ORF817H17HcaCcaT1616B0.002045
ORF817H17HcaCcaT1616B.1.1.3770.022099
ORF817H17HcaCcaT1616B.1.1.5190.000635
ORF817H17HcaCcaT1616B.1.177.90.021305
ORF817H17HcaCcaT1515B.1.3510.000446
ORF817H17HcaCcaT1515B.1.360.002189
ORF817H17HcaCcaT1515B.1.36.180.006303
ORF817H17HcaCcaT1414AY.200.000544
ORF817H17HcaCcaT1313AY.9.20.000477
ORF817H17HcaCcaT1212AY.390.000297
ORF817H17HcaCcaT1212AY.39.10.000475
ORF817H17HcaCcaT1212B.1.177.310.137931
ORF817H17HcaCcaT1212B.1.5960.001046
ORF817H17HcaCcaT1111AY.1190.000388
ORF817H17HcaCcaT1111AY.46.60.000794
ORF817H17HcaCcaT1111B.1.177.350.007602
ORF817H17HcaCcaT1111B.1.177.641
ORF817H17HcaCcaT1111B.1.2430.000765
ORF817H17HcaCcaT1010AY.1130.001424
ORF817H17HcaCcaT1010AY.46.40.001645
ORF817H17HcaCcaT1010AY.610.001048
ORF817H17HcaCcaT1010B.1.3610.012887
ORF817H17HcaCcaT1010Q.80.001649
ORF817H17HcaCcaT99AY.34.10.004589
ORF817H17HcaCcaT99AY.470.00028
ORF817H17HcaCcaT99AY.9.10.000754
ORF817H17HcaCcaT99B.1.1.3440.096774
ORF817H17HcaCcaT99B.1.2210.000639
ORF817H17HcaCcaT99B.1.2800.064286
ORF817H17HcaCcaT88AY.3.10.000682
ORF817H17HcaCcaT88AY.4.50.00086
ORF817H17HcaCcaT88B.1.177.440.004152
ORF817H17HcaCcaT77AY.1170.000592
ORF817H17HcaCcaT77AY.1200.00026
ORF817H17HcaCcaT77AY.700.00146
ORF817H17HcaCcaT77B.1.258.110.002774
ORF817H17HcaCcaT77B.1.36.390.015521
ORF817H17HcaCcaT77B.1.6210.00062
ORF817H17HcaCcaT77P.1.150.001626
ORF817H17HcaCcaT77Q.10.000884
ORF817H17HcaCcaT66AY.370.001896
ORF817H17HcaCcaT66AY.960.012448
ORF817H17HcaCcaT66B.1.1.1700.007481
ORF817H17HcaCcaT66B.1.1.3260.010563
ORF817H17HcaCcaT66B.1.1.370.001157
ORF817H17HcaCcaT66B.1.177.720.020339
ORF817H17HcaCcaT66B.1.2340.000792
ORF817H17HcaCcaT66B.1.258.170.000624
ORF817H17HcaCcaT66B.1.4160.007614
ORF817H17HcaCcaT66B.1.6370.000438
ORF817H17HcaCcaT66B.4.10.113208
ORF817H17HcaCcaT55AY.140.00044
ORF817H17HcaCcaT55AY.320.002662
ORF817H17HcaCcaT55B.1.1.250.002843
ORF817H17HcaCcaT55B.1.1.3110.001791
ORF817H17HcaCcaT55B.1.177.150.003155
ORF817H17HcaCcaT55B.1.177.450.001906
ORF817H17HcaCcaT55B.1.36.170.00247
ORF817H17HcaCcaT55P.20.000933
ORF817H17HcaCcaT44AY.230.000279
ORF817H17HcaCcaT44AY.450.000487
ORF817H17HcaCcaT44AY.46.30.003735
ORF817H17HcaCcaT44B.1.1.1530.004381
ORF817H17HcaCcaT44B.1.1.3060.001754
ORF817H17HcaCcaT44B.1.1.3150.033898
ORF817H17HcaCcaT44B.1.1.390.002039
ORF817H17HcaCcaT44B.1.36.270.003053
ORF817H17HcaCcaT44B.1.3690.001141
ORF817H17HcaCcaT44B.1.4360.004115
ORF817H17HcaCcaT44B.1.5090.003463
ORF817H17HcaCcaT44B.1.5880.00364
ORF817H17HcaCcaT44B.1.617.10.000516
ORF817H17HcaCcaT44P.1.170.000647
ORF817H17HcaCcaT44Q.30.00058
ORF817H17HcaCcaT33A.2.50.001497
ORF817H17HcaCcaT33AY.1060.001005
ORF817H17HcaCcaT33AY.1100.000338
ORF817H17HcaCcaT33AY.160.001139
ORF817H17HcaCcaT33AY.340.000291
ORF817H17HcaCcaT33AY.360.000445
ORF817H17HcaCcaT33AY.98.10.000145
ORF817H17HcaCcaT33AY.99.20.000276
ORF817H17HcaCcaT33B.1.1.100.003344
ORF817H17HcaCcaT33B.1.1.330.001263
ORF817H17HcaCcaT33B.1.177.730.001699
ORF817H17HcaCcaT33B.1.177.820.001432
ORF817H17HcaCcaT33B.1.258.70.005736
ORF817H17HcaCcaT33B.1.36.290.001552
ORF817H17HcaCcaT33B.1.3890.003006
ORF817H17HcaCcaT33B.1.4270.000151
ORF817H17HcaCcaT33B.1.5400.029126
ORF817H17HcaCcaT33B.1.5820.001472
ORF817H17HcaCcaT33P.1.70.000958
ORF817H17HcaCcaT22A0.000774
ORF817H17HcaCcaT22AY.1070.000932
ORF817H17HcaCcaT22AY.1210.000271
ORF817H17HcaCcaT22AY.270.000129
ORF817H17HcaCcaT22AY.330.000134
ORF817H17HcaCcaT22AY.460.000208
ORF817H17HcaCcaT22AY.500.001599
ORF817H17HcaCcaT22AY.850.000854
ORF817H17HcaCcaT22AY.90.000135
ORF817H17HcaCcaT22B.1.1.150.027027
ORF817H17HcaCcaT22B.1.1.2310.006192
ORF817H17HcaCcaT22B.1.1.2410.004141
ORF817H17HcaCcaT22B.1.1.3510.005587
ORF817H17HcaCcaT22B.1.1.4340.000697
ORF817H17HcaCcaT22B.1.1.4480.004065
ORF817H17HcaCcaT22B.1.177.100.001756
ORF817H17HcaCcaT22B.1.177.110.003396
ORF817H17HcaCcaT22B.1.177.120.000303
ORF817H17HcaCcaT22B.1.177.170.001642
ORF817H17HcaCcaT22B.1.177.750.002081
ORF817H17HcaCcaT22B.1.2410.001623
ORF817H17HcaCcaT22B.1.258.160.003273
ORF817H17HcaCcaT22B.1.2650.002541
ORF817H17HcaCcaT22B.1.3190.006098
ORF817H17HcaCcaT22B.1.3670.001585
ORF817H17HcaCcaT22B.1.3980.005952
ORF817H17HcaCcaT22B.1.4040.002604
ORF817H17HcaCcaT22B.1.4220.001625
ORF817H17HcaCcaT22B.1.429.10.024096
ORF817H17HcaCcaT22B.1.466.20.000782
ORF817H17HcaCcaT22B.1.4710.005464
ORF817H17HcaCcaT22B.1.4990.002101
ORF817H17HcaCcaT22B.1.5230.004902
ORF817H17HcaCcaT22B.1.5300.014286
ORF817H17HcaCcaT22B.1.5670.006667
ORF817H17HcaCcaT22B.1.5990.007299
ORF817H17HcaCcaT22B.1.9.50.011364
ORF817H17HcaCcaT22C.360.001821
ORF817H17HcaCcaT22N.50.003534
ORF817H17HcaCcaT22P.1.120.000968
ORF817H17HcaCcaT22P.1.160.000748
ORF817H17HcaCcaT110.055556
ORF817H17HcaCcaT11A.10.000282
ORF817H17HcaCcaT11A.50.001923
ORF817H17HcaCcaT11AA.50.016129
ORF817H17HcaCcaT11AD.20.000219
ORF817H17HcaCcaT11AY.10.000396
ORF817H17HcaCcaT11AY.100.00053
ORF817H17HcaCcaT11AY.1160.000287
ORF817H17HcaCcaT11AY.120.000316
ORF817H17HcaCcaT11AY.16.10.00047
ORF817H17HcaCcaT11AY.20.000356
ORF817H17HcaCcaT11AY.300.000396
ORF817H17HcaCcaT11AY.350.000233
ORF817H17HcaCcaT11AY.380.000499
ORF817H17HcaCcaT11AY.4.30.000842
ORF817H17HcaCcaT11AY.4.40.000409
ORF817H17HcaCcaT11AY.410.000294
ORF817H17HcaCcaT11AY.590.00053
ORF817H17HcaCcaT11AY.620.000436
ORF817H17HcaCcaT11AY.670.000464
ORF817H17HcaCcaT11AY.730.000665
ORF817H17HcaCcaT11AY.770.001127
ORF817H17HcaCcaT11AY.790.001211
ORF817H17HcaCcaT11AY.880.000884
ORF817H17HcaCcaT11AZ.20.000821
ORF817H17HcaCcaT11B.1.1.10.000327
ORF817H17HcaCcaT11B.1.1.1280.007092
ORF817H17HcaCcaT11B.1.1.1340.011364
ORF817H17HcaCcaT11B.1.1.1480.008772
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