CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF8 : Mut = F120L

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF8120F120LnonsynTtCCtT45316315540.6963128251-28253
ORF8120F120LnonsynttCttA45316129470.28570528251-28253
ORF8120F120LnonsynTtCCtG453163930.0086724328251-28253
ORF8120F120LnonsynTtcCtc453162970.0065539828251-28253
ORF8120F120LnonsynttCttG453161040.00229528251-28253
ORF8120F120LnonsynTtCCtA45316210.00046341228251-28253

Details of the mutation F120L within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF8120F120LTtCCtT3155445316All0.006035
ORF8120F120LttCttA1294745316All0.002476
ORF8120F120LTtCCtG39345316All0.000075
ORF8120F120LTtcCtc29745316All0.000057
ORF8120F120LttCttG10445316All0.00002
ORF8120F120LTtCCtA2145316All0.000004
ORF8120F120LTtCCtT2791828157B.1.1.70.024993
ORF8120F120LTtCCtG14528157B.1.1.70.00013
ORF8120F120LTtcCtc7328157B.1.1.70.000065
ORF8120F120LttCttG1228157B.1.1.70.000011
ORF8120F120LttCttA528157B.1.1.70.000004
ORF8120F120LTtCCtA428157B.1.1.70.000004
ORF8120F120LttCttA18141861B.1.617.20.00683
ORF8120F120LTtCCtT381861B.1.617.20.000143
ORF8120F120LTtCCtG61861B.1.617.20.000023
ORF8120F120LTtcCtc21861B.1.617.20.000008
ORF8120F120LTtCCtA11861B.1.617.20.000004
ORF8120F120LttCttA16111616AY.1030.010003
ORF8120F120LTtCCtG41616AY.1030.000025
ORF8120F120LTtCCtT11616AY.1030.000006
ORF8120F120LTtCCtT15251560B.1.6370.111436
ORF8120F120LTtCCtG351560B.1.6370.002558
ORF8120F120LttCttA11641182AY.440.007085
ORF8120F120LTtCCtG111182AY.440.000067
ORF8120F120LTtCCtT51182AY.440.00003
ORF8120F120LTtCCtA21182AY.440.000012
ORF8120F120LttCttA743745AY.1020.0197
ORF8120F120LTtCCtT2745AY.1020.000053
ORF8120F120LttCttA723745AY.430.003203
ORF8120F120LTtCCtT12745AY.430.000053
ORF8120F120LTtcCtc6745AY.430.000027
ORF8120F120LTtCCtA3745AY.430.000013
ORF8120F120LttCttG1745AY.430.000004
ORF8120F120LttCttA608617AY.250.003657
ORF8120F120LTtCCtG5617AY.250.00003
ORF8120F120LTtCCtA4617AY.250.000024
ORF8120F120LttCttA592596AY.290.009338
ORF8120F120LttCttG4596AY.290.000063
ORF8120F120LttCttA501502AY.1190.017689
ORF8120F120LTtCCtG1502AY.1190.000035
ORF8120F120LttCttA388394AY.30.003859
ORF8120F120LTtCCtA4394AY.30.00004
ORF8120F120LTtCCtG2394AY.30.00002
ORF8120F120LttCttA327334AY.610.034262
ORF8120F120LTtCCtT7334AY.610.000733
ORF8120F120LttCttA325325AY.330.021703
ORF8120F120LttCttA272272AY.390.006722
ORF8120F120LttCttA245254AY.40.000381
ORF8120F120LTtCCtT9254AY.40.000014
ORF8120F120LTtCCtT171241B.1.20.001506
ORF8120F120LTtcCtc67241B.1.20.00059
ORF8120F120LttCttG2241B.1.20.000018
ORF8120F120LTtCCtG1241B.1.20.000009
ORF8120F120LttCttA221221AY.200.008589
ORF8120F120LttCttA197197AY.770.222097
ORF8120F120LTtCCtT186186D.20.013958
ORF8120F120LTtCCtT179181B.1.5260.004207
ORF8120F120LTtCCtG2181B.1.5260.000047
ORF8120F120LTtCCtT150176B.10.001374
ORF8120F120LTtcCtc10176B.10.000092
ORF8120F120LttCttA8176B.10.000073
ORF8120F120LttCttG5176B.10.000046
ORF8120F120LTtCCtG3176B.10.000027
ORF8120F120LTtCCtG140173P.10.002206
ORF8120F120LTtCCtT21173P.10.000331
ORF8120F120LttCttG6173P.10.000095
ORF8120F120LTtcCtc3173P.10.000047
ORF8120F120LttCttA2173P.10.000032
ORF8120F120LTtCCtA1173P.10.000016
ORF8120F120LttCttA160160AY.99.20.014745
ORF8120F120LttCttA149150AY.260.004218
ORF8120F120LTtCCtT1150AY.260.000028
ORF8120F120LTtCCtT127145B.1.10.002304
ORF8120F120LTtcCtc13145B.1.10.000236
ORF8120F120LttCttG2145B.1.10.000036
ORF8120F120LttCttA2145B.1.10.000036
ORF8120F120LTtCCtG1145B.1.10.000018
ORF8120F120LttCttA141142AY.470.004386
ORF8120F120LTtCCtG1142AY.470.000031
ORF8120F120LttCttA140140AY.1000.006441
ORF8120F120LttCttA136139AY.420.005471
ORF8120F120LTtCCtT1139AY.420.00004
ORF8120F120LTtCCtA1139AY.420.00004
ORF8120F120LTtcCtc1139AY.420.00004
ORF8120F120LttCttA138139AY.5.40.038185
ORF8120F120LTtCCtT1139AY.5.40.000277
ORF8120F120LTtCCtT136136B.1.177.540.082474
ORF8120F120LttCttA121122AY.460.012594
ORF8120F120LTtcCtc1122AY.460.000104
ORF8120F120LTtCCtT107109B.1.6210.009472
ORF8120F120LttCttG1109B.1.6210.000089
ORF8120F120LttCttA1109B.1.6210.000089
ORF8120F120LttCttA101101AY.750.005658
ORF8120F120LttCttA99100AY.1200.003681
ORF8120F120LTtCCtT1100AY.1200.000037
ORF8120F120LttCttA9092AY.29.10.019846
ORF8120F120LttCttG292AY.29.10.000441
ORF8120F120LttCttA8086AY.9.20.002938
ORF8120F120LttCttG586AY.9.20.000184
ORF8120F120LTtCCtT186AY.9.20.000037
ORF8120F120LttCttA8184AY.1170.006846
ORF8120F120LTtCCtG384AY.1170.000254
ORF8120F120LttCttA8181AY.46.60.005849
ORF8120F120LttCttA6970AY.16.10.032425
ORF8120F120LTtCCtT170AY.16.10.00047
ORF8120F120LttCttA6666AY.50.001363
ORF8120F120LttCttA6263AY.98.10.003003
ORF8120F120LTtcCtc163AY.98.10.000048
ORF8120F120LttCttA5660AY.1180.003508
ORF8120F120LTtCCtT360AY.1180.000188
ORF8120F120LTtCCtG160AY.1180.000063
ORF8120F120LttCttG3558B.1.2430.002435
ORF8120F120LTtCCtT2158B.1.2430.001461
ORF8120F120LTtcCtc258B.1.2430.000139
ORF8120F120LttCttA5757AY.370.018015
ORF8120F120LttCttA5555AY.160.020881
ORF8120F120LTtCCtT5051B.1.5950.013048
ORF8120F120LTtcCtc151B.1.5950.000261
ORF8120F120LTtCCtT4850C.40.48
ORF8120F120LTtCCtG150C.40.01
ORF8120F120LttCttG150C.40.01
ORF8120F120LttCttA4848AY.540.004577
ORF8120F120LTtCCtT4648B.1.1.5190.001827
ORF8120F120LTtCCtG148B.1.1.5190.00004
ORF8120F120LTtcCtc148B.1.1.5190.00004
ORF8120F120LttCttA4646AY.340.00446
ORF8120F120LTtCCtT3346C.370.00383
ORF8120F120LTtcCtc1046C.370.001161
ORF8120F120LTtCCtG246C.370.000232
ORF8120F120LttCttA146C.370.000116
ORF8120F120LttCttA4545AY.990.047219
ORF8120F120LttCttA4242AY.1210.005683
ORF8120F120LttCttA3841AY.680.010402
ORF8120F120LTtCCtT341AY.680.000821
ORF8120F120LttCttA3737AY.75.10.006671
ORF8120F120LttCttA3236AY.1060.010717
ORF8120F120LTtCCtG236AY.1060.00067
ORF8120F120LTtCCtT236AY.1060.00067
ORF8120F120LttCttA3335AY.130.005312
ORF8120F120LTtCCtT235AY.130.000322
ORF8120F120LttCttA3235AY.230.002232
ORF8120F120LTtCCtT235AY.230.000139
ORF8120F120LTtcCtc135AY.230.00007
ORF8120F120LTtCCtT3434B.1.1.3720.023416
ORF8120F120LTtCCtT3434B.1.4320.382022
ORF8120F120LttCttA3333AY.1100.003719
ORF8120F120LttCttA3333AY.530.009488
ORF8120F120LttCttA3232AY.500.02558
ORF8120F120LttCttA3031AY.710.014252
ORF8120F120LTtcCtc131AY.710.000475
ORF8120F120LTtcCtc3031B.1.4680.171429
ORF8120F120LTtCCtT131B.1.4680.005714
ORF8120F120LttCttA3030AY.450.003651
ORF8120F120LTtCCtT2929B.1.1.3730.690476
ORF8120F120LTtCCtT2429B.1.1770.000316
ORF8120F120LTtcCtc229B.1.1770.000026
ORF8120F120LttCttG229B.1.1770.000026
ORF8120F120LttCttA129B.1.1770.000013
ORF8120F120LTtCCtT2629B.1.6090.012464
ORF8120F120LTtcCtc329B.1.6090.001438
ORF8120F120LTtCCtT2828B.1.1.2140.001553
ORF8120F120LttCttA2727AY.1130.003845
ORF8120F120LttCttA2727AY.3.10.002302
ORF8120F120LttCttA2727AY.700.00563
ORF8120F120LTtCCtT2727B.1.1.3710.28125
ORF8120F120LTtCCtT1927B.1.1600.000593
ORF8120F120LTtcCtc727B.1.1600.000218
ORF8120F120LTtCCtG127B.1.1600.000031
ORF8120F120LTtCCtT2427B.1.5960.002091
ORF8120F120LTtcCtc327B.1.5960.000261
ORF8120F120LttCttA2425AY.5.30.008097
ORF8120F120LTtCCtT125AY.5.30.000337
ORF8120F120LTtCCtT2025B.1.3510.000595
ORF8120F120LttCttG225B.1.3510.000059
ORF8120F120LTtcCtc125B.1.3510.00003
ORF8120F120LttCttA125B.1.3510.00003
ORF8120F120LTtCCtG125B.1.3510.00003
ORF8120F120LttCttA2222AY.1080.024256
ORF8120F120LttCttA2222AY.840.009624
ORF8120F120LTtCCtT2222B.1.1.250.012507
ORF8120F120LttCttA2121AY.9.10.001758
ORF8120F120LTtCCtT2021B.1.1.4320.025316
ORF8120F120LTtcCtc121B.1.1.4320.001266
ORF8120F120LttCttA2020B.491
ORF8120F120LttCttA1919AY.1010.009318
ORF8120F120LttCttA1919AY.590.010064
ORF8120F120LttCttA1818AY.1110.003297
ORF8120F120LTtCCtT1818Q.80.002968
ORF8120F120LTtCCtT1217AY.350.002797
ORF8120F120LttCttA517AY.350.001165
ORF8120F120LttCttA1717AY.400.016393
ORF8120F120LttCttA1717AY.560.027287
ORF8120F120LttCttA1717AY.670.007892
ORF8120F120LttCttA1717AY.780.026194
ORF8120F120LTtCCtT1517B.1.1.2840.001611
ORF8120F120LttCttA217B.1.1.2840.000215
ORF8120F120LTtCCtT1617B.1.4270.000808
ORF8120F120LttCttG117B.1.4270.00005
ORF8120F120LttCttA1616AY.140.001408
ORF8120F120LttCttA1616AY.20.005698
ORF8120F120LttCttA1616AY.46.40.002632
ORF8120F120LttCttA1616AY.99.10.024845
ORF8120F120LTtCCtT1616P.20.002986
ORF8120F120LttCttA1515AY.100.007949
ORF8120F120LttCttA1515AY.410.004409
ORF8120F120LTtCCtT1414A.210.038781
ORF8120F120LttCttA1414AY.1070.006524
ORF8120F120LTtCCtT1314B.1.5750.003944
ORF8120F120LTtcCtc114B.1.5750.000303
ORF8120F120LttCttA1313AY.1140.003004
ORF8120F120LttCttA1313AY.920.003735
ORF8120F120LTtCCtT1313D.30.076923
ORF8120F120LttCttA1212AY.150.026667
ORF8120F120LTtCCtT1212B.1.1.3190.210526
ORF8120F120LTtcCtc712B.1.2580.000466
ORF8120F120LTtCCtG212B.1.2580.000133
ORF8120F120LttCttG212B.1.2580.000133
ORF8120F120LTtCCtT112B.1.2580.000067
ORF8120F120LTtCCtT1212B.1.621.10.00607
ORF8120F120LttCttA1111A.270.018212
ORF8120F120LttCttA1111AY.910.008035
ORF8120F120LTtCCtT1111B.1.1.3180.003319
ORF8120F120LTtCCtT1011Q.30.00145
ORF8120F120LTtCCtG111Q.30.000145
ORF8120F120LttCttA1010AY.39.10.000396
ORF8120F120LttCttA910AY.820.012212
ORF8120F120LTtCCtT110AY.820.001357
ORF8120F120LTtCCtT1010B.1.1.280.003112
ORF8120F120LTtCCtT710B.1.2400.001509
ORF8120F120LTtcCtc210B.1.2400.000431
ORF8120F120LTtCCtG110B.1.2400.000216
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ORF8120F120LttCttA99AY.4.40.003682
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