CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF8 : Mut = D119del1

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF8119D119del1delGaT-aN8734700.53837328248-28250
ORF8119D119del1delGat-at8732030.23253228248-28250
ORF8119D119del1delGAT-NN873850.097365428248-28250
ORF8119D119del1delgaTga-873370.042382628248-28250
ORF8119D119del1delGaTNa-873320.036655228248-28250
ORF8119D119del1delGaTAa-873230.026345928248-28250
ORF8119D119del1delGAt-Nt87390.010309328248-28250
ORF8119D119del1delgAtg-t87370.0080183328248-28250
ORF8119D119del1delGAt-Ct87330.0034364328248-28250
ORF8119D119del1delgATg-N87320.0022909528248-28250
ORF8119D119del1delGAt-Tt87310.0011454828248-28250
ORF8119D119del1delGAt-Gt87310.0011454828248-28250

Details of the mutation D119del1 within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF8119D119del1GaT-aN470873All0.00009
ORF8119D119del1Gat-at203873All0.000039
ORF8119D119del1GAT-NN85873All0.000016
ORF8119D119del1gaTga-37873All0.000007
ORF8119D119del1GaTNa-32873All0.000006
ORF8119D119del1GaTAa-23873All0.000004
ORF8119D119del1GAt-Nt9873All0.000002
ORF8119D119del1gAtg-t7873All0.000001
ORF8119D119del1GAt-Ct3873All0.000001
ORF8119D119del1gATg-N2873All0
ORF8119D119del1GAt-Tt1873All0
ORF8119D119del1GAt-Gt1873All0
ORF8119D119del1GaT-aN72104AY.430.000319
ORF8119D119del1Gat-at20104AY.430.000089
ORF8119D119del1GAT-NN10104AY.430.000044
ORF8119D119del1gAtg-t1104AY.430.000004
ORF8119D119del1GAt-Nt1104AY.430.000004
ORF8119D119del1GaT-aN6184AY.40.000095
ORF8119D119del1GAT-NN1284AY.40.000019
ORF8119D119del1GAt-Nt584AY.40.000008
ORF8119D119del1Gat-at584AY.40.000008
ORF8119D119del1GaTNa-184AY.40.000002
ORF8119D119del1GaT-aN2461AY.1030.000149
ORF8119D119del1Gat-at2461AY.1030.000149
ORF8119D119del1GAT-NN661AY.1030.000037
ORF8119D119del1GAt-Ct361AY.1030.000019
ORF8119D119del1GaTNa-361AY.1030.000019
ORF8119D119del1GAt-Nt161AY.1030.000006
ORF8119D119del1GaT-aN4061B.1.617.20.000151
ORF8119D119del1Gat-at1461B.1.617.20.000053
ORF8119D119del1GAT-NN461B.1.617.20.000015
ORF8119D119del1GAt-Gt161B.1.617.20.000004
ORF8119D119del1GAt-Tt161B.1.617.20.000004
ORF8119D119del1GaTNa-161B.1.617.20.000004
ORF8119D119del1GaT-aN4651AY.5.40.012728
ORF8119D119del1GAT-NN551AY.5.40.001384
ORF8119D119del1GaT-aN1949AY.440.000116
ORF8119D119del1Gat-at1649AY.440.000097
ORF8119D119del1GAT-NN649AY.440.000037
ORF8119D119del1GaTNa-649AY.440.000037
ORF8119D119del1gaTga-249AY.440.000012
ORF8119D119del1GaT-aN2341AY.1020.00061
ORF8119D119del1Gat-at1641AY.1020.000424
ORF8119D119del1GAT-NN241AY.1020.000053
ORF8119D119del1Gat-at2132AY.250.000126
ORF8119D119del1GaTNa-632AY.250.000036
ORF8119D119del1GaT-aN332AY.250.000018
ORF8119D119del1GAT-NN232AY.250.000012
ORF8119D119del1GaT-aN2829AY.46.60.002022
ORF8119D119del1GAT-NN129AY.46.60.000072
ORF8119D119del1GaT-aN1522AY.230.001046
ORF8119D119del1GAT-NN722AY.230.000488
ORF8119D119del1Gat-at1222AY.30.000119
ORF8119D119del1GaTNa-822AY.30.00008
ORF8119D119del1GaT-aN122AY.30.00001
ORF8119D119del1GAT-NN122AY.30.00001
ORF8119D119del1GaT-aN1521AY.98.10.000726
ORF8119D119del1GAT-NN421AY.98.10.000194
ORF8119D119del1Gat-at221AY.98.10.000097
ORF8119D119del1GaTAa-1920P.10.000299
ORF8119D119del1gaTga-120P.10.000016
ORF8119D119del1GaT-aN1316AY.420.000523
ORF8119D119del1GAT-NN316AY.420.000121
ORF8119D119del1Gat-at811AY.75.10.001442
ORF8119D119del1GaT-aN211AY.75.10.000361
ORF8119D119del1GAT-NN111AY.75.10.00018
ORF8119D119del1GaT-aN710AY.9.20.000257
ORF8119D119del1GAT-NN310AY.9.20.00011
ORF8119D119del1gAtg-t69AY.1200.000223
ORF8119D119del1GaT-aN29AY.1200.000074
ORF8119D119del1Gat-at19AY.1200.000037
ORF8119D119del1Gat-at69AY.470.000187
ORF8119D119del1GaTNa-29AY.470.000062
ORF8119D119del1GaT-aN19AY.470.000031
ORF8119D119del1Gat-at68AY.260.00017
ORF8119D119del1GaT-aN18AY.260.000028
ORF8119D119del1gaTga-18AY.260.000028
ORF8119D119del1GaT-aN78AY.390.000173
ORF8119D119del1GAT-NN18AY.390.000025
ORF8119D119del1GaT-aN68AY.9.10.000502
ORF8119D119del1GAT-NN28AY.9.10.000167
ORF8119D119del1gaTga-78B.1.4290.000165
ORF8119D119del1Gat-at18B.1.4290.000024
ORF8119D119del1Gat-at57AY.1000.00023
ORF8119D119del1GaTNa-17AY.1000.000046
ORF8119D119del1GAT-NN17AY.1000.000046
ORF8119D119del1Gat-at37AY.1190.000106
ORF8119D119del1GaT-aN27AY.1190.000071
ORF8119D119del1GAT-NN17AY.1190.000035
ORF8119D119del1GaTNa-17AY.1190.000035
ORF8119D119del1GaT-aN67AY.50.000124
ORF8119D119del1Gat-at17AY.50.000021
ORF8119D119del1GaT-aN57AY.510.004545
ORF8119D119del1GAT-NN27AY.510.001818
ORF8119D119del1GaT-aN66AY.1180.000376
ORF8119D119del1GaT-aN66AY.1210.000812
ORF8119D119del1GaT-aN46AY.200.000155
ORF8119D119del1Gat-at26AY.200.000078
ORF8119D119del1GaT-aN26B.10.000018
ORF8119D119del1gaTga-26B.10.000018
ORF8119D119del1GAT-NN16B.10.000009
ORF8119D119del1GaTNa-16B.10.000009
ORF8119D119del1gaTga-66B.1.5960.000523
ORF8119D119del1GaT-aN45AY.1060.00134
ORF8119D119del1GAT-NN15AY.1060.000335
ORF8119D119del1Gat-at45AY.1170.000338
ORF8119D119del1gaTga-15AY.1170.000085
ORF8119D119del1Gat-at55AY.20.001781
ORF8119D119del1GaT-aN55AY.4.40.002046
ORF8119D119del1GaT-aN35AY.460.000312
ORF8119D119del1GAT-NN15AY.460.000104
ORF8119D119del1Gat-at15AY.460.000104
ORF8119D119del1Gat-at34AY.140.000264
ORF8119D119del1GaTNa-14AY.140.000088
ORF8119D119del1GaT-aN34AY.340.000291
ORF8119D119del1Gat-at14AY.340.000097
ORF8119D119del1gaTga-34AY.820.004071
ORF8119D119del1gATg-N14AY.820.001357
ORF8119D119del1gaTga-44B.1.1.70.000004
ORF8119D119del1GaT-aN23AY.1110.000366
ORF8119D119del1Gat-at13AY.1110.000183
ORF8119D119del1Gat-at23AY.1130.000285
ORF8119D119del1GaT-aN13AY.1130.000142
ORF8119D119del1Gat-at33AY.290.000047
ORF8119D119del1GaT-aN33AY.4.20.000065
ORF8119D119del1GaT-aN23AY.410.000588
ORF8119D119del1GAT-NN13AY.410.000294
ORF8119D119del1Gat-at23AY.540.000191
ORF8119D119del1GaT-aN13AY.540.000095
ORF8119D119del1GaT-aN23AY.750.000112
ORF8119D119del1GaTNa-13AY.750.000056
ORF8119D119del1GaT-aN23AY.920.000575
ORF8119D119del1Gat-at13AY.920.000287
ORF8119D119del1GaT-aN33AY.980.000237
ORF8119D119del1gaTga-23B.1.10.000036
ORF8119D119del1Gat-at13B.1.10.000018
ORF8119D119del1GaT-aN22AY.330.000134
ORF8119D119del1Gat-at12AY.380.000499
ORF8119D119del1GaT-aN12AY.380.000499
ORF8119D119del1GAT-NN12AY.39.10.00004
ORF8119D119del1GaT-aN12AY.39.10.00004
ORF8119D119del1GaT-aN12AY.4.30.000842
ORF8119D119del1GAT-NN12AY.4.30.000842
ORF8119D119del1GAt-Nt12AY.46.20.000635
ORF8119D119del1GaT-aN12AY.46.20.000635
ORF8119D119del1GaT-aN22AY.610.00021
ORF8119D119del1GaT-aN22AY.7.10.000225
ORF8119D119del1GaT-aN22AY.840.000875
ORF8119D119del1GaT-aN22AY.90.000135
ORF8119D119del1Gat-at12B.1.1770.000013
ORF8119D119del1gaTga-12B.1.1770.000013
ORF8119D119del1gaTga-22B.1.177.120.000303
ORF8119D119del1gaTga-22B.1.20.000018
ORF8119D119del1Gat-at11AY.1070.000466
ORF8119D119del1Gat-at11AY.1100.000113
ORF8119D119del1Gat-at11AY.116.10.000311
ORF8119D119del1Gat-at11AY.130.000161
ORF8119D119del1GaT-aN11AY.190.00114
ORF8119D119del1Gat-at11AY.240.000431
ORF8119D119del1GaT-aN11AY.360.000148
ORF8119D119del1Gat-at11AY.370.000316
ORF8119D119del1Gat-at11AY.400.000964
ORF8119D119del1GAT-NN11AY.450.000122
ORF8119D119del1Gat-at11AY.5.30.000337
ORF8119D119del1GaT-aN11AY.530.000288
ORF8119D119del1GaT-aN11AY.580.000907
ORF8119D119del1GAt-Nt11AY.60.000041
ORF8119D119del1GAT-NN11AY.600.000938
ORF8119D119del1Gat-at11AY.680.000274
ORF8119D119del1GAT-NN11AY.7.20.000559
ORF8119D119del1GaT-aN11AY.700.000209
ORF8119D119del1GaT-aN11AY.710.000475
ORF8119D119del1Gat-at11AY.830.001724
ORF8119D119del1Gat-at11AY.860.00083
ORF8119D119del1Gat-at11AY.870.000833
ORF8119D119del1GaT-aN11AY.940.000443
ORF8119D119del1GAT-NN11AY.960.002075
ORF8119D119del1GAT-NN11B.1.1.2240.014286
ORF8119D119del1gaTga-11B.1.1.250.000569
ORF8119D119del1gaTga-11B.1.110.30.000718
ORF8119D119del1gaTga-11B.1.177.310.011494
ORF8119D119del1Gat-at11B.1.2580.000067
ORF8119D119del1gATg-N11B.1.3620.001541
ORF8119D119del1GaT-aN11B.1.3750.00082
ORF8119D119del1Gat-at11B.1.466.20.000391
ORF8119D119del1GaTAa-11P.1.10.000318
ORF8119D119del1GaTAa-11P.1.140.000048
ORF8119D119del1GaTAa-11P.1.160.000374
ORF8119D119del1GaTAa-11P.1.70.000319