CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF8 : CodonNum = 96

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF896G96deldelGGT---467467128179-28181
ORF896G96CnonsynGgtTgt4104090.99756128179-28181
ORF896G96CnonsynGgTTgC41010.0024390228179-28181
ORF896G96VnonsyngGtgTt3473460.99711828179-28181
ORF896G96VnonsyngGTgTC34710.0028818428179-28181
ORF896G96RnonsynGgtCgt180180128179-28181
ORF896G96GsynggTggC1181110.94067828179-28181
ORF896G96GsynggTggG11850.042372928179-28181
ORF896G96GsynggTggA11820.016949228179-28181
ORF896G96SnonsynGgtAgt6666128179-28181
ORF896G96DnonsyngGtgAt5151128179-28181
ORF896G96AnonsyngGtgCt1919128179-28181
ORF896G96FnonsynGGtTTt320.66666728179-28181
ORF896G96del1delggTgg-310.33333328179-28181
ORF896G96del1delGgt-gt310.33333328179-28181
ORF896G96del1delgGTgA-310.33333328179-28181
ORF896G96FnonsynGGTTTC310.33333328179-28181
ORF896G96LnonsynGGtCTt11128179-28181
ORF896G96NnonsynGGtAAt11128179-28181
ORF896G96KnonsynGGTAAA11128179-28181
ORF896G96EnonsyngGTgAA11128179-28181

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF896G96delGGT---467467All0.000089
ORF896G96CGgtTgt409410All0.000078
ORF896G96CGgTTgC1410All0
ORF896G96VgGtgTt346347All0.000066
ORF896G96VgGTgTC1347All0
ORF896G96RGgtCgt180180All0.000034
ORF896G96VgGtgTt160160B.1.617.20.000602
ORF896G96GggTggC111118All0.000021
ORF896G96GggTggG5118All0.000001
ORF896G96GggTggA2118All0
ORF896G96RGgtCgt109109B.1.1.2301
ORF896G96delGGT---7878B.1.1.70.00007
ORF896G96CGgtTgt6767AY.420.002695
ORF896G96SGgtAgt6666All0.000013
ORF896G96delGGT---5757AY.40.000089
ORF896G96CGgtTgt5656B.1.1.10.018295
ORF896G96DgGtgAt5151All0.00001
ORF896G96delGGT---3737AY.290.000584
ORF896G96CGgtTgt3737AY.40.000058
ORF896G96VgGtgTt3737B.1.1.2770.028073
ORF896G96GggTggC3535B.1.1.580.188172
ORF896G96delGGT---3333B.1.1.2220.006732
ORF896G96delGGT---3232B.1.1600.000998
ORF896G96delGGT---3232B.1.2430.002227
ORF896G96delGGT---2727B.1.10.00049
ORF896G96VgGtgTt2323D.20.001726
ORF896G96CGgtTgt2121AY.1030.00013
ORF896G96VgGtgTt2121B.1.1600.000655
ORF896G96AgGtgCt1919All0.000004
ORF896G96VgGtgTt1919B.10.000174
ORF896G96RGgtCgt1919B.10.000174
ORF896G96delGGT---1818B0.002301
ORF896G96CGgtTgt1717B.1.1.70.000015
ORF896G96CGgtTgt1717B.1.4290.0004
ORF896G96GggTggC1717C.370.001973
ORF896G96SGgtAgt1616AY.290.000252
ORF896G96delGGT---1515AY.250.00009
ORF896G96VgGtgTt1414AY.430.000062
ORF896G96CGgtTgt1414B.1.617.20.000053
ORF896G96VgGtgTt1313B.1.10.000236
ORF896G96CGgtTgt1313B.1.6370.00095
ORF896G96CGgtTgt1212AY.430.000053
ORF896G96SGgtAgt1111AY.430.000049
ORF896G96RGgtCgt1111B.1.10.0002
ORF896G96DgGtgAt1010AY.340.00097
ORF896G96GggTggC1010AY.440.000061
ORF896G96CGgtTgt1010B.10.000092
ORF896G96CGgtTgt1010B.1.10.000181
ORF896G96delGGT---1010P.10.000158
ORF896G96RGgtCgt99AY.40.000014
ORF896G96delGGT---99AY.430.00004
ORF896G96CGgtTgt99B.1.1.330.003788
ORF896G96CGgtTgt88AY.440.000049
ORF896G96CGgtTgt88AY.50.000165
ORF896G96CGgtTgt88B.1.1.3180.002414
ORF896G96delGGT---77B.1.1.2840.000752
ORF896G96DgGtgAt77B.1.1.70.000006
ORF896G96VgGtgTt77B.1.1.70.000006
ORF896G96CGgtTgt77B.1.2580.000466
ORF896G96delGGT---77B.1.36.160.009972
ORF896G96GggTggC77B.1.4270.000353
ORF896G96delGGT---66B.1.1.2650.018927
ORF896G96CGgtTgt66B.1.2430.000418
ORF896G96GggTggC66B.1.360.000875
ORF896G96delGGT---66B.1.617.20.000023
ORF896G96CGgtTgt66B.1.6280.002114
ORF896G96VgGtgTt66C.370.000696
ORF896G96delGGT---66P.1.140.000287
ORF896G96delGGT---55AY.29.10.001103
ORF896G96RGgtCgt55AY.440.00003
ORF896G96AgGtgCt55AY.75.10.000902
ORF896G96SGgtAgt55B.1.10.000091
ORF896G96GggTggC55B.1.1.70.000004
ORF896G96delGGT---55B.1.177.210.000382
ORF896G96RGgtCgt55B.1.20.000044
ORF896G96CGgtTgt44AY.1020.000106
ORF896G96CGgtTgt44AY.200.000155
ORF896G96SGgtAgt44AY.40.000006
ORF896G96AgGtgCt44AY.420.000161
ORF896G96RGgtCgt44AY.470.000124
ORF896G96GggTggC44B.10.000037
ORF896G96delGGT---44B.1.1.5190.000159
ORF896G96CGgtTgt44B.1.1600.000125
ORF896G96CGgtTgt44B.1.177.770.002905
ORF896G96delGGT---44B.1.3200.004981
ORF896G96GggTggC44B.1.617.20.000015
ORF896G96CGgtTgt44C.350.003096
ORF896G96VgGtgTt44P.1.150.000929
ORF896G96FGGtTTt23All0
ORF896G96del1Ggt-gt13All0
ORF896G96FGGTTTC13All0
ORF896G96del1ggTgg-13All0
ORF896G96del1gGTgA-13All0
ORF896G96SGgtAgt33AY.1030.000019
ORF896G96CGgtTgt33AY.30.00003
ORF896G96DgGtgAt33AY.30.00003
ORF896G96delGGT---33AY.30.00003
ORF896G96GggTggC33AY.40.000005
ORF896G96VgGtgTt33AY.40.000005
ORF896G96GggTggC33AY.70.000588
ORF896G96delGGT---33B.10.000027
ORF896G96VgGtgTt33B.1.1.250.001706
ORF896G96SGgtAgt33B.1.1.70.000003
ORF896G96CGgtTgt33B.1.1770.00004
ORF896G96delGGT---33B.1.20.000026
ORF896G96delGGT---33B.1.220.003953
ORF896G96DgGtgAt33B.1.2340.000396
ORF896G96VgGtgTt33B.1.4290.000071
ORF896G96delGGT---33B.1.4290.000071
ORF896G96delGGT---33B.1.5090.002597
ORF896G96AgGtgCt33B.1.617.20.000011
ORF896G96SGgtAgt33B.230.008772
ORF896G96VgGtgTt33B.6.60.002667
ORF896G96CGgtTgt33C.370.000348
ORF896G96VgGtgTt33P.10.000047
ORF896G96SGgtAgt33P.10.000047
ORF896G96delGGT---33P.1.10.000953
ORF896G96delGGT---220.111111
ORF896G96DgGtgAt22AY.1030.000012
ORF896G96CGgtTgt22AY.1150.010417
ORF896G96DgGtgAt22AY.1200.000074
ORF896G96CGgtTgt22AY.1200.000074
ORF896G96VgGtgTt22AY.1210.000271
ORF896G96GggTggC22AY.16.10.00094
ORF896G96CGgtTgt22AY.250.000012
ORF896G96delGGT---22AY.260.000057
ORF896G96CGgtTgt22AY.350.000466
ORF896G96GggTggG22AY.430.000009
ORF896G96SGgtAgt22AY.440.000012
ORF896G96VgGtgTt22AY.440.000012
ORF896G96delGGT---22AY.480.00093
ORF896G96VgGtgTt22AY.50.000041
ORF896G96DgGtgAt22AY.50.000041
ORF896G96GggTggC22AY.50.000041
ORF896G96delGGT---22B.1.1.2140.000111
ORF896G96GggTggG22B.1.1.280.000622
ORF896G96VgGtgTt22B.1.1.280.000622
ORF896G96VgGTgTC12B.1.1.3960.045455
ORF896G96CGgTTgC12B.1.1.3960.045455
ORF896G96VgGtgTt12B.1.1.3960.045455
ORF896G96FGGTTTC12B.1.1.3960.045455
ORF896G96CGgtTgt12B.1.1.3960.045455
ORF896G96FGGtTTt12B.1.1.3960.045455
ORF896G96CGgtTgt22B.1.1.5190.000079
ORF896G96AgGtgCt22B.1.1.70.000002
ORF896G96del1ggTgg-12B.1.1.70.000001
ORF896G96del1gGTgA-12B.1.1.70.000001
ORF896G96delGGT---22B.1.1770.000026
ORF896G96VgGtgTt22B.1.1770.000026
ORF896G96delGGT---22B.1.360.000292
ORF896G96CGgtTgt22B.1.360.000292
ORF896G96DgGtgAt22B.1.438.10.000215
ORF896G96CGgtTgt22B.1.438.10.000215
ORF896G96RGgtCgt22B.1.466.20.000782
ORF896G96SGgtAgt22B.1.5250.000226
ORF896G96RGgtCgt22B.1.5960.000174
ORF896G96DgGtgAt22B.1.617.20.000008
ORF896G96CGgtTgt22B.1.6210.000177
ORF896G96delGGT---22B.1.6370.000146
ORF896G96DgGtgAt22C.130.051282
ORF896G96CGgtTgt22P.10.000032
ORF896G96GggTggC12P.10.000016
ORF896G96GggTggA12P.10.000016
ORF896G96DgGtgAt11A.2.40.003367
ORF896G96delGGT---11AE.40.043478
ORF896G96KGGTAAA11All0
ORF896G96EgGTgAA11All0
ORF896G96NGGtAAt11All0
ORF896G96LGGtCTt11All0
ORF896G96RGgtCgt11AY.1000.000046
ORF896G96VgGtgTt11AY.1020.000027
ORF896G96SGgtAgt11AY.1020.000027
ORF896G96DgGtgAt11AY.1020.000027
ORF896G96NGGtAAt11AY.1030.000006
ORF896G96delGGT---11AY.1080.001103
ORF896G96DgGtgAt11AY.1080.001103
ORF896G96RGgtCgt11AY.1130.000142
ORF896G96delGGT---11AY.116.10.000311
ORF896G96delGGT---11AY.1180.000063
ORF896G96VgGtgTt11AY.1190.000035
ORF896G96CGgtTgt11AY.1190.000035
ORF896G96delGGT---11AY.1200.000037
ORF896G96VgGtgTt11AY.1200.000037
ORF896G96delGGT---11AY.190.00114
ORF896G96RGgtCgt11AY.200.000039
ORF896G96GggTggC11AY.200.000039
ORF896G96GggTggA11AY.250.000006
ORF896G96CGgtTgt11AY.260.000028
ORF896G96del1Ggt-gt11AY.260.000028
ORF896G96GggTggC11AY.290.000016
ORF896G96SGgtAgt11AY.29.10.000221
ORF896G96GggTggC11AY.30.00001
ORF896G96CGgtTgt11AY.3.10.000085
ORF896G96SGgtAgt11AY.320.000532
ORF896G96CGgtTgt11AY.340.000097
ORF896G96CGgtTgt11AY.380.000499
ORF896G96SGgtAgt11AY.390.000025
ORF896G96delGGT---11AY.390.000025
ORF896G96CGgtTgt11AY.390.000025
ORF896G96delGGT---11AY.4.20.000022
ORF896G96CGgtTgt11AY.4.2.10.000149
ORF896G96RGgtCgt11AY.430.000004
ORF896G96DgGtgAt11AY.430.000004
ORF896G96DgGtgAt11AY.440.000006
ORF896G96delGGT---11AY.440.000006
ORF896G96VgGtgTt11AY.46.40.000165
ORF896G96SGgtAgt11AY.470.000031
ORF896G96SGgtAgt11AY.50.000021
ORF896G96CGgtTgt11AY.5.30.000337
ORF896G96GggTggC11AY.550.000917
ORF896G96GggTggC11AY.560.001605
ORF896G96delGGT---11AY.580.000907
ORF896G96AgGtgCt11AY.600.000938
ORF896G96GggTggC11AY.680.000274
ORF896G96CGgtTgt11AY.680.000274
ORF896G96CGgtTgt11AY.690.000187
ORF896G96CGgtTgt11AY.7.10.000113
ORF896G96CGgtTgt11AY.750.000056
ORF896G96CGgtTgt11AY.820.001357
ORF896G96VgGtgTt11AY.850.000427
ORF896G96VgGtgTt11AY.90.000068
ORF896G96CGgtTgt11AY.9.10.000084
ORF896G96RGgtCgt11AY.9.20.000037
ORF896G96DgGtgAt11AY.930.000273
ORF896G96AgGtgCt11AY.98.10.000048
ORF896G96CGgtTgt11AY.98.10.000048
ORF896G96CGgtTgt11AY.99.20.000092
ORF896G96CGgtTgt11AZ.50.003509
ORF896G96DgGtgAt11B0.000128
ORF896G96AgGtgCt11B.1.10.000018
ORF896G96delGGT---11B.1.1.1740.003378
ORF896G96CGgtTgt11B.1.1.1890.001513
ORF896G96delGGT---11B.1.1.2160.00089
ORF896G96KGGTAAA11B.1.1.2650.003155
ORF896G96RGgtCgt11B.1.1.2940.001266
ORF896G96RGgtCgt11B.1.1.3150.008475
ORF896G96VgGtgTt11B.1.1.3260.001761
ORF896G96CGgtTgt11B.1.1.3440.010753
ORF896G96RGgtCgt11B.1.1.3500.04
ORF896G96delGGT---11B.1.1.3540.004386
ORF896G96delGGT---11B.1.1.370.000193
ORF896G96RGgtCgt11B.1.1.3700.012658
ORF896G96VgGtgTt11B.1.1.3720.000689
ORF896G96GggTggC11B.1.1.3960.045455
ORF896G96DgGtgAt11B.1.1.4160.000905
ORF896G96RGgtCgt11B.1.1.4170.002703
ORF896G96GggTggC11B.1.1.4320.001266
ORF896G96CGgtTgt11B.1.1.4340.000349
ORF896G96CGgtTgt11B.1.1.500.000679
ORF896G96SGgtAgt11B.1.1.5190.00004
ORF896G96LGGtCTt11B.1.1.70.000001
ORF896G96EgGTgAA11B.1.1.70.000001
ORF896G96FGGtTTt11B.1.1.70.000001
ORF896G96GggTggG11B.1.1.700.000341
ORF896G96VgGtgTt11B.1.1170.0125
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