CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF8 : CodonNum = 84

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF884L84SnonsyntTatCa16874168730.99994128143-28145
ORF884L84SnonsyntTAtCG1687410.000059262828143-28145
ORF884L84deldelTTA---777777128143-28145
ORF884L84LsynttAttG4863690.75925928143-28145
ORF884L84LsynTtaCta4861150.23662628143-28145
ORF884L84LsynTtACtT48610.0020576128143-28145
ORF884L84LsynTtACtG48610.0020576128143-28145
ORF884L84del1delTta-ta79440.55696228143-28145
ORF884L84del1delttAtt-79340.4303828143-28145
ORF884L84del1deltTAtC-7910.012658228143-28145
ORF884L84VnonsynTtaGta3333128143-28145
ORF884L84FnonsynttAttC24170.70833328143-28145
ORF884L84FnonsynttAttT2470.29166728143-28145
ORF884L84InonsynTtaAta1515128143-28145
ORF884L84XnonsyntTatAa14120.85714328143-28145
ORF884L84XnonsyntTatGa1420.14285728143-28145
ORF884L84del2delTTa--a760.85714328143-28145
ORF884L84del2deltTAt--710.14285728143-28145
ORF884L84YnonsyntTAtAC11128143-28145
ORF884L84TnonsynTTAACG11128143-28145
ORF884L84QnonsynTTaCAa11128143-28145
ORF884L84CnonsyntTAtGT11128143-28145

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF884L84StTatCa1687316874All0.003227
ORF884L84StTAtCG116874All0
ORF884L84StTatCa35233523A.10.992954
ORF884L84StTatCa23302330A0.901703
ORF884L84StTatCa19641964A.2.50.98004
ORF884L84StTatCa14951495A.20.989411
ORF884L84StTatCa14131413A.23.10.99507
ORF884L84delTTA---777777All0.000149
ORF884L84StTatCa626626A.2.5.20.984277
ORF884L84StTatCa600600A.270.993377
ORF884L84StTatCa590590A.2.20.996622
ORF884L84StTatCa517517A.50.994231
ORF884L84LttAttG369486All0.000071
ORF884L84LTtaCta115486All0.000022
ORF884L84LTtACtG1486All0
ORF884L84LTtACtT1486All0
ORF884L84StTatCa473473A.30.991614
ORF884L84StTatCa376376A.280.994709
ORF884L84StTatCa358358A.210.99169
ORF884L84StTatCa296296A.2.40.996633
ORF884L84StTatCa225225B0.028758
ORF884L84StTatCa207207A.2.30.981043
ORF884L84StTatCa207207A.2.5.10.995192
ORF884L84StTatCa195195A.61
ORF884L84LttAttG182190AY.40.000283
ORF884L84LTtaCta8190AY.40.000012
ORF884L84StTatCa187187A.290.994681
ORF884L84delTTA---174174B.1.1.70.000156
ORF884L84StTatCa115115B.10.001053
ORF884L84StTatCa106106A.191
ORF884L84StTatCa9595A.2.5.30.979381
ORF884L84StTatCa9292A.230.968421
ORF884L84StTatCa8383AY.40.000129
ORF884L84del1Tta-ta4479All0.000008
ORF884L84del1ttAtt-3479All0.000007
ORF884L84del1tTAtC-179All0
ORF884L84StTatCa7878A.41
ORF884L84LttAttG6971AY.1030.000428
ORF884L84LTtaCta271AY.1030.000012
ORF884L84StTatCa6363A.151
ORF884L84StTatCa6262A.161
ORF884L84delTTA---6262AY.40.000096
ORF884L84delTTA---5959B.1.1.2940.074684
ORF884L84StTatCa5555A.251
ORF884L84StTatCa5051B.1.1.70.000045
ORF884L84StTAtCG151B.1.1.70.000001
ORF884L84StTatCa5050B.1.1.3180.015088
ORF884L84StTatCa4545B.1.177.810.00852
ORF884L84delTTA---4545B.1.3510.001338
ORF884L84del1Tta-ta3141B.1.1.70.000028
ORF884L84del1ttAtt-1041B.1.1.70.000009
ORF884L84LttAttG3838AY.740.004395
ORF884L84delTTA---3737AY.290.000584
ORF884L84LttAttG2735AY.250.000162
ORF884L84LTtaCta835AY.250.000048
ORF884L84delTTA---3434B.1.2430.002366
ORF884L84VTtaGta3333All0.000006
ORF884L84delTTA---3333B.1.1.2220.006732
ORF884L84delTTA---3131B.1.10.000562
ORF884L84LTtaCta2728AY.440.000164
ORF884L84LttAttG128AY.440.000006
ORF884L84VTtaGta2727B.1.1.70.000024
ORF884L84StTatCa2626AY.1200.000967
ORF884L84LTtaCta1626B.1.1.70.000014
ORF884L84LttAttG1026B.1.1.70.000009
ORF884L84delTTA---2525AY.1030.000155
ORF884L84FttAttC1724All0.000003
ORF884L84FttAttT724All0.000001
ORF884L84StTatCa2222A.91
ORF884L84delTTA---2222P.10.000347
ORF884L84delTTA---2121B.1.20.000185
ORF884L84StTatCa2020A.181
ORF884L84delTTA---1818B0.002301
ORF884L84StTatCa1717A.111
ORF884L84StTatCa1717A.70.944444
ORF884L84StTatCa1717B.1.10.000308
ORF884L84StTatCa1515A.221
ORF884L84ITtaAta1515All0.000003
ORF884L84del1ttAtt-1515AY.3.10.001279
ORF884L84StTatCa1414A.241
ORF884L84XtTatAa1214All0.000002
ORF884L84XtTatGa214All0
ORF884L84StTatCa1414AY.440.000085
ORF884L84delTTA---1414B.1.617.20.000053
ORF884L84StTatCa1313A.261
ORF884L84StTatCa1313B.1.177.540.007884
ORF884L84LTtaCta1313B.1.3110.003569
ORF884L84StTatCa1111A.171
ORF884L84del1Tta-ta1111B.1.1.3180.003319
ORF884L84delTTA---1111B.1.1600.000343
ORF884L84StTatCa1111B.1.617.20.000041
ORF884L84LttAttG810AY.1180.000501
ORF884L84LTtaCta210AY.1180.000125
ORF884L84delTTA---1010AY.430.000044
ORF884L84LTtaCta1010B.1.617.10.00129
ORF884L84StTatCa1010B.1.617.10.00129
ORF884L84delTTA---99AY.250.000054
ORF884L84delTTA---99B.1.1.2840.000967
ORF884L84ITtaAta99C.160.009544
ORF884L84StTatCa88AY.30.00008
ORF884L84StTatCa77A.301
ORF884L84del2TTa--a67All0.000001
ORF884L84del2tTAt--17All0
ORF884L84StTatCa77AY.1030.000043
ORF884L84LttAttG57AY.430.000022
ORF884L84LTtaCta27AY.430.000009
ORF884L84delTTA---77B.1.1.2650.022082
ORF884L84StTatCa77B.1.20.000062
ORF884L84delTTA---77B.1.36.160.009972
ORF884L84StTatCa66A.121
ORF884L84StTatCa66AY.1020.000159
ORF884L84delTTA---66AY.1190.000212
ORF884L84StTatCa66AY.46.20.003812
ORF884L84LTtaCta66B.1.2430.000418
ORF884L84StTatCa66B.1.3510.000178
ORF884L84StTatCa66B.1.6210.000531
ORF884L84delTTA---66P.1.140.000287
ORF884L84delTTA---55AY.1180.000313
ORF884L84delTTA---55AY.29.10.001103
ORF884L84delTTA---55AY.30.00005
ORF884L84StTatCa55AY.340.000485
ORF884L84LttAttG35B.1.10.000054
ORF884L84LTtaCta25B.1.10.000036
ORF884L84delTTA---55B.1.1.3180.001509
ORF884L84StTatCa55B.1.1.4320.006329
ORF884L84delTTA---55B.1.1.5190.000199
ORF884L84FttAttC55B.1.617.20.000019
ORF884L84delTTA---55P.1.10.001588
ORF884L84delTTA---44AY.1020.000106
ORF884L84delTTA---44AY.260.000113
ORF884L84LttAttG34AY.30.00003
ORF884L84LTtACtT14AY.30.00001
ORF884L84delTTA---44AY.440.000024
ORF884L84FttAttC44AY.750.000224
ORF884L84delTTA---44AY.990.004197
ORF884L84delTTA---44B.1.1.2140.000222
ORF884L84StTatCa44B.1.1770.000053
ORF884L84delTTA---44B.1.1770.000053
ORF884L84StTatCa44B.1.2390.004884
ORF884L84XtTatAa44B.1.3200.004981
ORF884L84StTatCa44B.1.4290.000094
ORF884L84StTatCa44B.1.5260.000094
ORF884L84StTatCa44P.10.000063
ORF884L84del2TTa--a33AY.1030.000019
ORF884L84StTatCa33AY.1130.000427
ORF884L84StTatCa33AY.250.000018
ORF884L84FttAttT33AY.30.00003
ORF884L84LttAttG33AY.390.000074
ORF884L84del1ttAtt-33AY.40.000005
ORF884L84delTTA---33AY.400.002893
ORF884L84StTatCa33AY.430.000013
ORF884L84StTatCa33B.1.1.2650.009464
ORF884L84StTatCa33B.1.1.5190.000119
ORF884L84delTTA---33B.1.220.003953
ORF884L84delTTA---33B.1.4290.000071
ORF884L84delTTA---33B.1.5090.002597
ORF884L84StTatCa33B.1.5760.00272
ORF884L84LTtaCta33B.1.617.20.000011
ORF884L84delTTA---33B.1.6210.000266
ORF884L84LttAttG33C.350.002322
ORF884L84StTatCa22AD.20.000438
ORF884L84StTatCa22AY.1170.000169
ORF884L84LttAttG22AY.1190.000071
ORF884L84StTatCa22AY.130.000322
ORF884L84LttAttG22AY.200.000078
ORF884L84LttAttG12AY.330.000067
ORF884L84LTtaCta12AY.330.000067
ORF884L84StTatCa22AY.4.20.000043
ORF884L84delTTA---22AY.480.00093
ORF884L84StTatCa22AY.60.000082
ORF884L84delTTA---22AY.600.001876
ORF884L84ITtaAta22AY.70.000392
ORF884L84delTTA---22AY.700.000417
ORF884L84delTTA---22AY.920.000575
ORF884L84VTtaGta22B.10.000018
ORF884L84delTTA---22B.10.000018
ORF884L84StTatCa22B.1.1.10.000653
ORF884L84StTatCa22B.1.1.630.000772
ORF884L84XtTatAa22B.1.1.70.000002
ORF884L84StTatCa22B.1.1390.001466
ORF884L84FttAttT22B.1.1600.000062
ORF884L84del2TTa--a22B.1.1770.000026
ORF884L84LTtaCta12B.1.20.000009
ORF884L84LttAttG12B.1.20.000009
ORF884L84StTatCa22B.1.2340.000264
ORF884L84StTatCa22B.1.2470.029851
ORF884L84LTtaCta22B.1.2580.000133
ORF884L84delTTA---22B.1.360.000292
ORF884L84StTatCa22B.1.36.80.002
ORF884L84delTTA---22B.1.4270.000101
ORF884L84XtTatAa22B.1.617.20.000008
ORF884L84delTTA---22B.400.000729
ORF884L84delTTA---22P.1.150.000465
ORF884L84del1ttAtt-22P.30.00319
ORF884L84CtTAtGT11A.10.000282
ORF884L84delTTA---11AE.40.043478
ORF884L84YtTAtAC11All0
ORF884L84QTTaCAa11All0
ORF884L84CtTAtGT11All0
ORF884L84TTTAACG11All0
ORF884L84StTatCa11AT.10.005128
ORF884L84del1ttAtt-11AY.1030.000006
ORF884L84FttAttC11AY.1030.000006
ORF884L84delTTA---11AY.1080.001103
ORF884L84LTtaCta11AY.1160.000287
ORF884L84delTTA---11AY.116.10.000311
ORF884L84ITtaAta11AY.1200.000037
ORF884L84delTTA---11AY.130.000161
ORF884L84LTtaCta11AY.140.000088
ORF884L84delTTA---11AY.190.00114
ORF884L84StTatCa11AY.200.000039
ORF884L84XtTatAa11AY.200.000039
ORF884L84LttAttG11AY.230.00007
ORF884L84delTTA---11AY.230.00007
ORF884L84StTatCa11AY.270.000065
ORF884L84StTatCa11AY.280.00189
ORF884L84LTtaCta11AY.290.000016
ORF884L84LttAttG11AY.29.10.000221
ORF884L84del1ttAtt-11AY.30.00001
ORF884L84XtTatAa11AY.3.10.000085
ORF884L84delTTA---11AY.340.000097
ORF884L84delTTA---11AY.390.000025
ORF884L84delTTA---11AY.4.20.000022
ORF884L84LttAttG11AY.4.20.000022
ORF884L84VTtaGta11AY.4.20.000022
ORF884L84LTtaCta11AY.420.00004
ORF884L84StTatCa11AY.420.00004
ORF884L84del2TTa--a11AY.430.000004
ORF884L84FttAttT11AY.450.000122
ORF884L84StTatCa11AY.460.000104
ORF884L84delTTA---11AY.470.000031
ORF884L84StTatCa11AY.480.000465
ORF884L84LttAttG11AY.50.000021
ORF884L84StTatCa11AY.5.30.000337
ORF884L84StTatCa11AY.540.000095
ORF884L84delTTA---11AY.580.000907
ORF884L84LttAttG11AY.60.000041
ORF884L84StTatCa11AY.620.000436
ORF884L84StTatCa11AY.650.000533
ORF884L84LTtaCta11AY.690.000187
ORF884L84delTTA---11AY.690.000187
ORF884L84StTatCa11AY.700.000209
ORF884L84delTTA---11AY.740.000116
ORF884L84delTTA---11AY.760.004831
ORF884L84LttAttG11AY.820.001357
ORF884L84LTtaCta11AY.900.000684
ORF884L84StTatCa11AY.900.000684
ORF884L84StTatCa11AY.99.20.000092
ORF884L84LTtaCta11B0.000128
ORF884L84FttAttC11B0.000128
ORF884L84FttAttC11B.10.000009
ORF884L84del1tTAtC-11B.10.000009
ORF884L84TTTAACG11B.1.10.000018
ORF884L84LttAttG11B.1.1.1130.006993
ORF884L84LttAttG11B.1.1.1300.015385
ORF884L84StTatCa11B.1.1.1610.003534
ORF884L84delTTA---11B.1.1.1740.003378
ORF884L84delTTA---11B.1.1.2160.00089
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ORF884L84StTatCa11B.1.1.2220.000204
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