CoV-GLUEGenomeCountriesLineagesMutationsInsertionsDeletionsUpdated:

CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF8 : CodonNum = 66 & Codon = ---

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF866G66deldelGGT---76137613128089-28091

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF866G66delGGT---76137613All0.001456
ORF866G66delGGT---22812281B.1.1.70.002042
ORF866G66delGGT---587587AY.40.000914
ORF866G66delGGT---316316AY.440.001923
ORF866G66delGGT---259259B.1.617.20.000975
ORF866G66delGGT---245245B.1.10.004445
ORF866G66delGGT---232232AY.60.009542
ORF866G66delGGT---208208AY.98.10.010074
ORF866G66delGGT---180180AY.430.000797
ORF866G66delGGT---177177B.1.36.360.106562
ORF866G66delGGT---176176AY.1030.001093
ORF866G66delGGT---148148B.1.20.001303
ORF866G66delGGT---138138B.1.1.4130.951724
ORF866G66delGGT---133133AY.250.0008
ORF866G66delGGT---101101AY.260.002859
ORF866G66delGGT---9797Q.60.642384
ORF866G66delGGT---8989AY.30.000885
ORF866G66delGGT---8484B.10.000769
ORF866G66delGGT---7777P.10.001213
ORF866G66delGGT---7474B.1.1600.002308
ORF866G66delGGT---7171B.1.5260.001669
ORF866G66delGGT---6868AY.1190.002401
ORF866G66delGGT---6464B.1.1770.000843
ORF866G66delGGT---5959B.1.1.2940.074684
ORF866G66delGGT---5555AY.690.010267
ORF866G66delGGT---5151B.1.3510.001516
ORF866G66delGGT---5050P.30.079745
ORF866G66delGGT---4949AY.230.003418
ORF866G66delGGT---4444AY.290.000694
ORF866G66delGGT---4444C.360.040073
ORF866G66delGGT---4343AY.3.10.003666
ORF866G66delGGT---4242B.1.2430.002923
ORF866G66delGGT---3939B.1.617.10.00503
ORF866G66delGGT---3636B.1.1.5190.00143
ORF866G66delGGT---3535B.1.4290.000824
ORF866G66delGGT---3434B.1.1.2220.006936
ORF866G66delGGT---3131AY.1020.000822
ORF866G66delGGT---2929AY.1180.001817
ORF866G66delGGT---2727B.1.3110.007414
ORF866G66delGGT---2727Q.80.004453
ORF866G66delGGT---2525B.1.1.2140.001386
ORF866G66delGGT---2424AY.1070.011184
ORF866G66delGGT---2424AY.1200.000892
ORF866G66delGGT---2424B.1.1.3180.007242
ORF866G66delGGT---2121AY.610.0022
ORF866G66delGGT---2020AY.300.007915
ORF866G66delGGT---2020AY.750.00112
ORF866G66delGGT---2020B0.002556
ORF866G66delGGT---1919AY.390.00047
ORF866G66delGGT---1919AY.470.000591
ORF866G66delGGT---1717B.1.438.10.001823
ORF866G66delGGT---1717B.1.4700.023876
ORF866G66delGGT---1717B.1.6210.001505
ORF866G66delGGT---1616B.1.5950.004175
ORF866G66delGGT---1515AD.20.003284
ORF866G66delGGT---1515AY.1000.00069
ORF866G66delGGT---1515AY.4.20.000325
ORF866G66delGGT---1515B.1.177.150.009464
ORF866G66delGGT---1515C.370.001741
ORF866G66delGGT---1414AY.840.006124
ORF866G66delGGT---1313B.1.258.170.001352
ORF866G66delGGT---1212AY.360.001779
ORF866G66delGGT---1212B.1.351.50.007194
ORF866G66delGGT---1212B.1.360.001751
ORF866G66delGGT---1111AY.1170.00093
ORF866G66delGGT---1111B.1.1.3480.008758
ORF866G66delGGT---1111Q.10.00139
ORF866G66delGGT---1010AY.1050.006431
ORF866G66delGGT---1010AY.50.000206
ORF866G66delGGT---1010AY.590.005297
ORF866G66delGGT---1010B.1.1.3120.01912
ORF866G66delGGT---1010B.1.6280.003524
ORF866G66delGGT---99AY.116.10.002803
ORF866G66delGGT---99AY.200.00035
ORF866G66delGGT---99B.1.1.830.02439
ORF866G66delGGT---99P.1.140.00043
ORF866G66delGGT---88AY.1130.001139
ORF866G66delGGT---88AY.1210.001083
ORF866G66delGGT---88AY.400.007715
ORF866G66delGGT---88AY.480.003721
ORF866G66delGGT---88AY.650.004264
ORF866G66delGGT---88AY.670.003714
ORF866G66delGGT---88B.1.1.2840.000859
ORF866G66delGGT---88B.1.1.3560.068376
ORF866G66delGGT---88B.1.177.600.001747
ORF866G66delGGT---88B.1.2400.001725
ORF866G66delGGT---88B.1.3360.019512
ORF866G66delGGT---88B.1.5250.000905
ORF866G66delGGT---88Q.30.00116
ORF866G66delGGT---88R.10.00072
ORF866G66delGGT---77AY.420.000282
ORF866G66delGGT---77AY.5.40.001937
ORF866G66delGGT---77B.1.1.2650.022082
ORF866G66delGGT---77B.1.1.280.002179
ORF866G66delGGT---77B.1.258.90.035
ORF866G66delGGT---77B.1.36.160.009972
ORF866G66delGGT---66AY.330.000401
ORF866G66delGGT---66AY.350.001398
ORF866G66delGGT---66B.1.1.100.006689
ORF866G66delGGT---66B.1.1.2250.043165
ORF866G66delGGT---66B.1.1.3720.004132
ORF866G66delGGT---66B.1.1.500.004073
ORF866G66delGGT---66B.1.243.20.086957
ORF866G66delGGT---66P.1.170.000971
ORF866G66delGGT---55AY.29.10.001103
ORF866G66delGGT---55AY.46.60.000361
ORF866G66delGGT---55AY.860.004149
ORF866G66delGGT---55B.1.1.1580.060976
ORF866G66delGGT---55B.1.1.2160.004452
ORF866G66delGGT---55B.1.177.70.000824
ORF866G66delGGT---55B.1.214.20.002998
ORF866G66delGGT---55B.1.4800.012438
ORF866G66delGGT---55P.1.10.001588
ORF866G66delGGT---44AY.100.00212
ORF866G66delGGT---44AY.1100.000451
ORF866G66delGGT---44AY.130.000644
ORF866G66delGGT---44AY.160.001519
ORF866G66delGGT---44AY.450.000487
ORF866G66delGGT---44AY.460.000416
ORF866G66delGGT---44AY.7.20.002237
ORF866G66delGGT---44AY.740.000463
ORF866G66delGGT---44AY.75.10.000721
ORF866G66delGGT---44AY.980.000316
ORF866G66delGGT---44AY.99.20.000369
ORF866G66delGGT---44B.1.1.2200.007435
ORF866G66delGGT---44B.1.177.420.003578
ORF866G66delGGT---44B.1.177.450.001525
ORF866G66delGGT---44B.1.36.10.004561
ORF866G66delGGT---44B.1.3960.002823
ORF866G66delGGT---44B.1.4270.000202
ORF866G66delGGT---44B.1.466.20.001565
ORF866G66delGGT---44N.50.007067
ORF866G66delGGT---33AY.1010.001471
ORF866G66delGGT---33AY.380.001498
ORF866G66delGGT---33AY.4.50.000322
ORF866G66delGGT---33AY.940.001328
ORF866G66delGGT---33B.1.1.3170.001235
ORF866G66delGGT---33B.1.1.3370.010791
ORF866G66delGGT---33B.1.1.3440.032258
ORF866G66delGGT---33B.1.1.4340.001046
ORF866G66delGGT---33B.1.1.5260.010638
ORF866G66delGGT---33B.1.1.700.001023
ORF866G66delGGT---33B.1.177.210.000229
ORF866G66delGGT---33B.1.220.003953
ORF866G66delGGT---33B.1.2210.000213
ORF866G66delGGT---33B.1.2410.002435
ORF866G66delGGT---33B.1.2580.0002
ORF866G66delGGT---33B.1.351.20.000908
ORF866G66delGGT---33B.1.36.170.001482
ORF866G66delGGT---33B.1.36.180.001261
ORF866G66delGGT---33B.1.36.310.005254
ORF866G66delGGT---33B.1.5090.002597
ORF866G66delGGT---33B.1.5770.002062
ORF866G66delGGT---33B.1.5960.000261
ORF866G66delGGT---33B.1.6010.090909
ORF866G66delGGT---33B.1.6090.001438
ORF866G66delGGT---33C.160.003181
ORF866G66delGGT---33P.1.120.001452
ORF866G66delGGT---33P.1.150.000697
ORF866G66delGGT---33P.1.70.000958
ORF866G66delGGT---22AY.1080.002205
ORF866G66delGGT---22AY.1090.001479
ORF866G66delGGT---22AY.120.000632
ORF866G66delGGT---22AY.240.000862
ORF866G66delGGT---22AY.340.000194
ORF866G66delGGT---22AY.39.10.000079
ORF866G66delGGT---22AY.520.001629
ORF866G66delGGT---22AY.580.001815
ORF866G66delGGT---22AY.70.000392
ORF866G66delGGT---22AY.90.000135
ORF866G66delGGT---22AY.9.10.000167
ORF866G66delGGT---22AY.910.001461
ORF866G66delGGT---22AY.930.000546
ORF866G66delGGT---22B.1.1.10.000653
ORF866G66delGGT---22B.1.1.1570.001826
ORF866G66delGGT---22B.1.1.1590.009346
ORF866G66delGGT---22B.1.1.1740.006757
ORF866G66delGGT---22B.1.1.4870.011173
ORF866G66delGGT---22B.1.1.630.000772
ORF866G66delGGT---22B.1.177.570.000562
ORF866G66delGGT---22B.1.2100.004264
ORF866G66delGGT---22B.1.243.10.044444
ORF866G66delGGT---22B.1.2600.006689
ORF866G66delGGT---22B.1.36.190.018519
ORF866G66delGGT---22B.1.3690.00057
ORF866G66delGGT---22B.1.3750.001639
ORF866G66delGGT---22B.1.3810.015625
ORF866G66delGGT---22B.1.4130.008511
ORF866G66delGGT---22B.1.4620.014493
ORF866G66delGGT---22B.1.4690.00722
ORF866G66delGGT---22B.1.6370.000146
ORF866G66delGGT---22C.37.10.005236
ORF866G66delGGT---11A.10.000282
ORF866G66delGGT---11A.20.000662
ORF866G66delGGT---11A.2.20.001689
ORF866G66delGGT---11A.2.40.003367
ORF866G66delGGT---11A.2.50.000499
ORF866G66delGGT---11A.2.5.20.001572
ORF866G66delGGT---11AE.40.043478
ORF866G66delGGT---11AY.10.000396
ORF866G66delGGT---11AY.120.10.000321
ORF866G66delGGT---11AY.140.000088
ORF866G66delGGT---11AY.190.00114
ORF866G66delGGT---11AY.20.000356
ORF866G66delGGT---11AY.34.10.00051
ORF866G66delGGT---11AY.370.000316
ORF866G66delGGT---11AY.4.30.000842
ORF866G66delGGT---11AY.4.40.000409
ORF866G66delGGT---11AY.46.40.000165
ORF866G66delGGT---11AY.46.50.000198
ORF866G66delGGT---11AY.5.20.002463
ORF866G66delGGT---11AY.540.000095
ORF866G66delGGT---11AY.680.000274
ORF866G66delGGT---11AY.700.000209
ORF866G66delGGT---11AY.710.000475
ORF866G66delGGT---11AY.80.000606
ORF866G66delGGT---11AY.890.004902
ORF866G66delGGT---11AY.9.20.000037
ORF866G66delGGT---11AY.9.2.10.001976
ORF866G66delGGT---11AY.920.000287
ORF866G66delGGT---11B.1.1.1610.003534
ORF866G66delGGT---11B.1.1.1710.003676
ORF866G66delGGT---11B.1.1.1760.000439
ORF866G66delGGT---11B.1.1.1980.001468
ORF866G66delGGT---11B.1.1.2310.003096
ORF866G66delGGT---11B.1.1.250.000569
ORF866G66delGGT---11B.1.1.2690.001353
ORF866G66delGGT---11B.1.1.2740.005051
ORF866G66delGGT---11B.1.1.3060.000438
ORF866G66delGGT---11B.1.1.3220.008772
ORF866G66delGGT---11B.1.1.3260.001761
ORF866G66delGGT---11B.1.1.3540.004386
ORF866G66delGGT---11B.1.1.370.000193
ORF866G66delGGT---11B.1.1.3980.003226
ORF866G66delGGT---11B.1.1.4160.000905
ORF866G66delGGT---11B.1.1.4370.010417
ORF866G66delGGT---11B.1.1.4630.0625
ORF866G66delGGT---11B.1.1.5070.008696
ORF866G66delGGT---11B.1.1.510.001718
ORF866G66delGGT---11B.1.1.520.012195
ORF866G66delGGT---11B.1.1.890.006061
ORF866G66delGGT---11B.1.1.990.02381
ORF866G66delGGT---11B.1.110.30.000718
ORF866G66delGGT---11B.1.1150.021739
ORF866G66delGGT---11B.1.1260.001276
ORF866G66delGGT---11B.1.1390.000733
ORF866G66delGGT---11B.1.1460.004237
ORF866G66delGGT---11B.1.177.170.000821
ORF866G66delGGT---11B.1.177.40.000211
ORF866G66delGGT---11B.1.177.530.002392
ORF866G66delGGT---11B.1.177.630.002703
ORF866G66delGGT---11B.1.177.810.000189
ORF866G66delGGT---11B.1.177.830.001481
ORF866G66delGGT---11B.1.177.860.000183
ORF866G66delGGT---11B.1.1920.009259
ORF866G66delGGT---11B.1.1950.005025
ORF866G66delGGT---11B.1.2370.004975
ORF866G66delGGT---11B.1.258.120.007874
ORF866G66delGGT---11B.1.2810.021739
ORF866G66delGGT---11B.1.3370.005587
ORF866G66delGGT---11B.1.3490.000715
ORF866G66delGGT---11B.1.350.008475
ORF866G66delGGT---11B.1.36.250.002208
ORF866G66delGGT---11B.1.36.70.004
ORF866G66delGGT---11B.1.3610.001289
ORF866G66delGGT---11B.1.3670.000792
ORF866G66delGGT---11B.1.3950.007042
ORF866G66delGGT---11B.1.4000.000429
ORF866G66delGGT---11B.1.4970.000315
ORF866G66delGGT---11B.1.5170.000427
ORF866G66delGGT---11B.1.5240.001406
ORF866G66delGGT---11B.1.5330.009615
ORF866G66delGGT---11B.1.5400.009709
ORF866G66delGGT---11B.1.5440.006024
ORF866G66delGGT---11B.1.5490.007194
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CoV-GLUE is still in development. CoV-GLUE was originally developed as part of COG-UK by Josh Singer using the GLUE framework at the MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research (CVR). In 2021 it was redeveloped by Richard Orton to scale to the millions of genome sequences available. We acknowledge support from the MRC (MC_UU_12014/12), WT (220977/Z/20/Z) and UKRI G2P (MR/W005611/1). Please contact Richard Orton with any queries: Richard.Orton@glasgow.ac.uk

CoV-GLUE uses sequence data from GISAID. GISAID data provided via this web application is subject to GISAID's Terms and Conditions.