CoV-GLUE | Mutations | Mutation
Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):
ORF | CodonNum | Mut | ORF1abMut | MutType | RefCodon | MutCodon | AACount | CodonCount | CodonProp | Genome Position |
ORF8 | 66 | G66del | del | GGT | --- | 7613 | 7613 | 1 | 28089-28091 | |
ORF8 | 66 | G66V | nonsyn | gGt | gTt | 4053 | 4007 | 0.98865 | 28089-28091 | |
ORF8 | 66 | G66V | nonsyn | gGT | gTC | 4053 | 45 | 0.0111029 | 28089-28091 | |
ORF8 | 66 | G66V | nonsyn | gGT | gTG | 4053 | 1 | 0.000246731 | 28089-28091 | |
ORF8 | 66 | G66C | nonsyn | Ggt | Tgt | 1860 | 1860 | 1 | 28089-28091 | |
ORF8 | 66 | G66del2 | del | gGT | g-- | 699 | 696 | 0.995708 | 28089-28091 | |
ORF8 | 66 | G66del2 | del | GGt | --t | 699 | 2 | 0.00286123 | 28089-28091 | |
ORF8 | 66 | G66del2 | del | GGT | --N | 699 | 1 | 0.00143062 | 28089-28091 | |
ORF8 | 66 | G66S | nonsyn | Ggt | Agt | 652 | 652 | 1 | 28089-28091 | |
ORF8 | 66 | G66D | nonsyn | gGt | gAt | 529 | 525 | 0.992439 | 28089-28091 | |
ORF8 | 66 | G66D | nonsyn | gGT | gAC | 529 | 4 | 0.00756144 | 28089-28091 | |
ORF8 | 66 | G66A | nonsyn | gGt | gCt | 475 | 475 | 1 | 28089-28091 | |
ORF8 | 66 | G66G | syn | ggT | ggC | 288 | 237 | 0.822917 | 28089-28091 | |
ORF8 | 66 | G66G | syn | ggT | ggA | 288 | 44 | 0.152778 | 28089-28091 | |
ORF8 | 66 | G66G | syn | ggT | ggG | 288 | 7 | 0.0243056 | 28089-28091 | |
ORF8 | 66 | G66R | nonsyn | Ggt | Cgt | 37 | 36 | 0.972973 | 28089-28091 | |
ORF8 | 66 | G66R | nonsyn | GgT | CgG | 37 | 1 | 0.027027 | 28089-28091 | |
ORF8 | 66 | G66del1 | del | ggT | gg- | 19 | 14 | 0.736842 | 28089-28091 | |
ORF8 | 66 | G66del1 | del | Ggt | -gt | 19 | 3 | 0.157895 | 28089-28091 | |
ORF8 | 66 | G66del1 | del | GgT | -gN | 19 | 1 | 0.0526316 | 28089-28091 | |
ORF8 | 66 | G66del1 | del | GGt | -Nt | 19 | 1 | 0.0526316 | 28089-28091 | |
ORF8 | 66 | G66F | nonsyn | GGt | TTt | 6 | 6 | 1 | 28089-28091 | |
ORF8 | 66 | G66E | nonsyn | gGT | gAG | 5 | 3 | 0.6 | 28089-28091 | |
ORF8 | 66 | G66E | nonsyn | gGT | gAA | 5 | 2 | 0.4 | 28089-28091 | |
ORF8 | 66 | G66T | nonsyn | GGt | ACt | 4 | 4 | 1 | 28089-28091 | |
ORF8 | 66 | G66L | nonsyn | GGt | CTt | 2 | 1 | 0.5 | 28089-28091 | |
ORF8 | 66 | G66L | nonsyn | GGT | CTG | 2 | 1 | 0.5 | 28089-28091 | |
ORF8 | 66 | G66W | nonsyn | GgT | TgG | 1 | 1 | 1 | 28089-28091 | |
ORF8 | 66 | G66I | nonsyn | GGt | ATt | 1 | 1 | 1 | 28089-28091 | |
ORF8 | 66 | G66N | nonsyn | GGt | AAt | 1 | 1 | 1 | 28089-28091 |
Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):
ORF | CodonNum | Mut | RefCodon | MutCodon | CodonCount | AACount | Lineage | LineageCodonProp |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 7613 | 7613 | All | 0.001456 |
ORF8 | 66 | G66V | gGt | gTt | 4007 | 4053 | All | 0.000766 |
ORF8 | 66 | G66V | gGT | gTC | 45 | 4053 | All | 0.000009 |
ORF8 | 66 | G66V | gGT | gTG | 1 | 4053 | All | 0 |
ORF8 | 66 | G66V | gGt | gTt | 2906 | 2906 | AY.69 | 0.542468 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 2281 | 2281 | B.1.1.7 | 0.002042 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 1860 | 1860 | All | 0.000356 |
ORF8 | 66 | G66del2 | gGT | g-- | 696 | 699 | All | 0.000133 |
ORF8 | 66 | G66del2 | GGt | --t | 2 | 699 | All | 0 |
ORF8 | 66 | G66del2 | GGT | --N | 1 | 699 | All | 0 |
ORF8 | 66 | G66S | Ggt | Agt | 652 | 652 | All | 0.000125 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 587 | 587 | AY.4 | 0.000914 |
ORF8 | 66 | G66D | gGt | gAt | 525 | 529 | All | 0.0001 |
ORF8 | 66 | G66D | gGT | gAC | 4 | 529 | All | 0.000001 |
ORF8 | 66 | G66A | gGt | gCt | 475 | 475 | All | 0.000091 |
ORF8 | 66 | G66del2 | gGT | g-- | 474 | 474 | B.1.1.7 | 0.000424 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 408 | 408 | B.1.1.7 | 0.000365 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 316 | 316 | AY.44 | 0.001923 |
ORF8 | 66 | G66G | ggT | ggC | 237 | 288 | All | 0.000045 |
ORF8 | 66 | G66G | ggT | ggA | 44 | 288 | All | 0.000008 |
ORF8 | 66 | G66G | ggT | ggG | 7 | 288 | All | 0.000001 |
ORF8 | 66 | G66V | gGt | gTt | 243 | 287 | B.1.1.7 | 0.000218 |
ORF8 | 66 | G66V | gGT | gTC | 44 | 287 | B.1.1.7 | 0.000039 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 259 | 259 | B.1.617.2 | 0.000975 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 245 | 245 | B.1.1 | 0.004445 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 233 | 233 | AY.6 | 0.009583 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 232 | 232 | AY.6 | 0.009542 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 208 | 208 | AY.98.1 | 0.010074 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 180 | 180 | AY.43 | 0.000797 |
ORF8 | 66 | G66V | gGt | gTt | 179 | 179 | AY.103 | 0.001111 |
ORF8 | 66 | G66del2 | gGT | g-- | 178 | 178 | B.1.621.1 | 0.090035 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 177 | 177 | AY.43 | 0.000784 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 177 | 177 | B.1.36.36 | 0.106562 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 176 | 176 | AY.103 | 0.001093 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 171 | 171 | AY.4 | 0.000266 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 148 | 148 | B.1.2 | 0.001303 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 138 | 138 | B.1.1.413 | 0.951724 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 133 | 133 | AY.25 | 0.0008 |
ORF8 | 66 | G66G | ggT | ggC | 112 | 112 | AY.25 | 0.000674 |
ORF8 | 66 | G66A | gGt | gCt | 112 | 112 | B.1.617.2 | 0.000422 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 101 | 101 | AY.26 | 0.002859 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 97 | 97 | B.1.160 | 0.003025 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 97 | 97 | Q.6 | 0.642384 |
ORF8 | 66 | G66V | gGt | gTt | 94 | 94 | AY.4 | 0.000146 |
ORF8 | 66 | G66S | Ggt | Agt | 94 | 94 | B.1.1.7 | 0.000084 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 89 | 89 | AY.3 | 0.000885 |
ORF8 | 66 | G66A | gGt | gCt | 89 | 89 | B.1.526 | 0.002092 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 84 | 84 | B.1 | 0.000769 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 77 | 77 | P.1 | 0.001213 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 74 | 74 | B.1.160 | 0.002308 |
ORF8 | 66 | G66V | gGt | gTt | 74 | 74 | B.1.617.2 | 0.000279 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 71 | 71 | B.1.526 | 0.001669 |
ORF8 | 66 | G66D | gGt | gAt | 70 | 70 | AY.118 | 0.004385 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 68 | 68 | AY.119 | 0.002401 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 64 | 64 | B.1.177 | 0.000843 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 63 | 63 | B.1.617.2 | 0.000237 |
ORF8 | 66 | G66A | gGt | gCt | 62 | 62 | B.1.429 | 0.001459 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 61 | 61 | AY.103 | 0.000379 |
ORF8 | 66 | G66S | Ggt | Agt | 60 | 60 | B.1.617.2 | 0.000226 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 59 | 59 | B.1.1.294 | 0.074684 |
ORF8 | 66 | G66D | gGt | gAt | 57 | 57 | AY.4.2.1 | 0.008492 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 56 | 56 | B.1.1.214 | 0.003106 |
ORF8 | 66 | G66S | Ggt | Agt | 56 | 56 | B.1.429 | 0.001318 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 55 | 55 | AY.69 | 0.010267 |
ORF8 | 66 | G66A | gGt | gCt | 55 | 55 | B.1.1.312 | 0.105163 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 55 | 55 | D.2 | 0.004127 |
ORF8 | 66 | G66D | gGt | gAt | 52 | 52 | B.1.1.7 | 0.000047 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 51 | 51 | B.1.351 | 0.001516 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 50 | 50 | P.3 | 0.079745 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 49 | 49 | AY.23 | 0.003418 |
ORF8 | 66 | G66S | Ggt | Agt | 49 | 49 | AY.3 | 0.000487 |
ORF8 | 66 | G66S | Ggt | Agt | 47 | 47 | AY.4 | 0.000073 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 44 | 44 | AY.29 | 0.000694 |
ORF8 | 66 | G66V | gGt | gTt | 44 | 44 | B.1.177 | 0.000579 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 44 | 44 | C.36 | 0.040073 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 43 | 43 | AY.3.1 | 0.003666 |
ORF8 | 66 | G66S | Ggt | Agt | 42 | 42 | AY.6 | 0.001727 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 42 | 42 | B.1.243 | 0.002923 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 40 | 40 | B.1.1.519 | 0.001588 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 40 | 40 | B.1.177 | 0.000527 |
ORF8 | 66 | G66D | gGt | gAt | 40 | 40 | B.1.617.2 | 0.000151 |
ORF8 | 66 | G66A | gGt | gCt | 40 | 40 | L.3 | 0.141844 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 39 | 39 | B.1.617.1 | 0.00503 |
ORF8 | 66 | G66R | Ggt | Cgt | 36 | 37 | All | 0.000007 |
ORF8 | 66 | G66R | GgT | CgG | 1 | 37 | All | 0 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 36 | 36 | B.1.1.519 | 0.00143 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 35 | 35 | B.1.429 | 0.000824 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 34 | 34 | B.1.1.222 | 0.006936 |
ORF8 | 66 | G66D | gGt | gAt | 33 | 33 | AY.4 | 0.000051 |
ORF8 | 66 | G66D | gGt | gAt | 32 | 32 | AY.102 | 0.000848 |
ORF8 | 66 | G66V | gGt | gTt | 32 | 32 | AY.26 | 0.000906 |
ORF8 | 66 | G66G | ggT | ggA | 19 | 32 | B.1.1.7 | 0.000017 |
ORF8 | 66 | G66G | ggT | ggC | 13 | 32 | B.1.1.7 | 0.000012 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 32 | 32 | B.1.2 | 0.000282 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 31 | 31 | AY.102 | 0.000822 |
ORF8 | 66 | G66V | gGt | gTt | 30 | 30 | B.1.375 | 0.02459 |
ORF8 | 66 | G66D | gGt | gAt | 30 | 30 | C.37 | 0.003482 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 29 | 29 | AY.118 | 0.001817 |
ORF8 | 66 | G66D | gGt | gAt | 29 | 29 | AY.23 | 0.002023 |
ORF8 | 66 | G66S | Ggt | Agt | 29 | 29 | B.1.160 | 0.000904 |
ORF8 | 66 | G66S | Ggt | Agt | 28 | 28 | N.5 | 0.04947 |
ORF8 | 66 | G66G | ggT | ggC | 27 | 27 | B.1.2 | 0.000238 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 27 | 27 | B.1.311 | 0.007414 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 27 | 27 | Q.8 | 0.004453 |
ORF8 | 66 | G66S | Ggt | Agt | 26 | 26 | AY.44 | 0.000158 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 25 | 25 | B.1.1.214 | 0.001386 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 24 | 24 | AY.107 | 0.011184 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 24 | 24 | AY.120 | 0.000892 |
ORF8 | 66 | G66A | gGt | gCt | 24 | 24 | AY.43 | 0.000106 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 24 | 24 | B.1.1.318 | 0.007242 |
ORF8 | 66 | G66D | gGt | gAt | 24 | 24 | P.1 | 0.000378 |
ORF8 | 66 | G66G | ggT | ggC | 23 | 23 | AY.103 | 0.000143 |
ORF8 | 66 | G66V | gGt | gTt | 23 | 23 | AY.43 | 0.000102 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 23 | 23 | AY.44 | 0.00014 |
ORF8 | 66 | G66D | gGt | gAt | 23 | 23 | AY.44 | 0.00014 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 21 | 21 | AY.25 | 0.000126 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 21 | 21 | AY.61 | 0.0022 |
ORF8 | 66 | G66V | gGt | gTt | 21 | 21 | P.1 | 0.000331 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 20 | 20 | AY.30 | 0.007915 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 20 | 20 | AY.75 | 0.00112 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 20 | 20 | B | 0.002556 |
ORF8 | 66 | G66G | ggT | ggA | 19 | 20 | B.1.351 | 0.000565 |
ORF8 | 66 | G66G | ggT | ggC | 1 | 20 | B.1.351 | 0.00003 |
ORF8 | 66 | G66del1 | ggT | gg- | 14 | 19 | All | 0.000003 |
ORF8 | 66 | G66del1 | Ggt | -gt | 3 | 19 | All | 0.000001 |
ORF8 | 66 | G66del1 | GgT | -gN | 1 | 19 | All | 0 |
ORF8 | 66 | G66del1 | GGt | -Nt | 1 | 19 | All | 0 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 19 | 19 | AY.39 | 0.00047 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 19 | 19 | AY.47 | 0.000591 |
ORF8 | 66 | G66V | gGt | gTt | 19 | 19 | B.1.160 | 0.000593 |
ORF8 | 66 | G66del2 | gGT | g-- | 19 | 19 | B.1.621 | 0.001682 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 18 | 18 | AY.3 | 0.000179 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 18 | 18 | AY.75 | 0.001008 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 18 | 18 | AY.93 | 0.004915 |
ORF8 | 66 | G66D | gGt | gAt | 17 | 17 | AY.103 | 0.000106 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 17 | 17 | AY.111 | 0.003114 |
ORF8 | 66 | G66V | gGt | gTt | 17 | 17 | AY.25 | 0.000102 |
ORF8 | 66 | G66V | gGt | gTt | 17 | 17 | AY.5 | 0.000351 |
ORF8 | 66 | G66A | gGt | gCt | 17 | 17 | AY.98.1 | 0.000823 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 17 | 17 | B.1.438.1 | 0.001823 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 17 | 17 | B.1.470 | 0.023876 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 17 | 17 | B.1.621 | 0.001505 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 16 | 16 | B.1 | 0.000147 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 16 | 16 | B.1.429 | 0.000376 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 16 | 16 | B.1.526 | 0.000376 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 16 | 16 | B.1.595 | 0.004175 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 15 | 15 | AD.2 | 0.003284 |
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ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.101 | 0.00049 |
ORF8 | 66 | G66G | ggT | ggC | 1 | 1 | AY.102 | 0.000027 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.104 | 0.001984 |
ORF8 | 66 | G66S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.105 | 0.000643 |
ORF8 | 66 | G66V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.105 | 0.000643 |
ORF8 | 66 | G66R | Ggt | Cgt | 1 | 1 | AY.109 | 0.00074 |
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ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.113 | 0.000142 |
ORF8 | 66 | G66D | gGt | gAt | 1 | 1 | AY.114 | 0.000231 |
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ORF8 | 66 | G66G | ggT | ggC | 1 | 1 | AY.119 | 0.000035 |
ORF8 | 66 | G66V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.119 | 0.000035 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.120 | 0.000037 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.120.1 | 0.000321 |
ORF8 | 66 | G66V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.120.1 | 0.000321 |
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ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.19 | 0.00114 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.2 | 0.000356 |
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ORF8 | 66 | G66del1 | Ggt | -gt | 1 | 1 | AY.23 | 0.00007 |
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ORF8 | 66 | G66S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.23 | 0.00007 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.26 | 0.000028 |
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ORF8 | 66 | G66V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.29.1 | 0.000221 |
ORF8 | 66 | G66I | GGt | ATt | 1 | 1 | AY.3 | 0.00001 |
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ORF8 | 66 | G66G | ggT | ggC | 1 | 1 | AY.35 | 0.000233 |
ORF8 | 66 | G66V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.36 | 0.000148 |
ORF8 | 66 | G66del2 | gGT | g-- | 1 | 1 | AY.37 | 0.000316 |
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ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.37 | 0.000316 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.38 | 0.000499 |
ORF8 | 66 | G66G | ggT | ggC | 1 | 1 | AY.39 | 0.000025 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.39.1 | 0.00004 |
ORF8 | 66 | G66del2 | gGT | g-- | 1 | 1 | AY.4 | 0.000002 |
ORF8 | 66 | G66F | GGt | TTt | 1 | 1 | AY.4 | 0.000002 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.4.2 | 0.000022 |
ORF8 | 66 | G66V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.4.2 | 0.000022 |
ORF8 | 66 | G66S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.4.2.1 | 0.000149 |
ORF8 | 66 | G66V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.4.2.1 | 0.000149 |
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ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.4.4 | 0.000409 |
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ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.40 | 0.000964 |
ORF8 | 66 | G66del2 | gGT | g-- | 1 | 1 | AY.43 | 0.000004 |
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ORF8 | 66 | G66R | Ggt | Cgt | 1 | 1 | AY.44 | 0.000006 |
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ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.46.4 | 0.000165 |
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ORF8 | 66 | G66D | gGt | gAt | 1 | 1 | AY.5 | 0.000021 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.5.2 | 0.002463 |
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ORF8 | 66 | G66G | ggT | ggC | 1 | 1 | AY.6 | 0.000041 |
ORF8 | 66 | G66G | ggT | ggA | 1 | 1 | AY.61 | 0.000105 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.61 | 0.000105 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.62 | 0.000436 |
ORF8 | 66 | G66D | gGt | gAt | 1 | 1 | AY.62 | 0.000436 |
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ORF8 | 66 | G66V | gGt | gTt | 1 | 1 | AY.65 | 0.000533 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.68 | 0.000274 |
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ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.7 | 0.000196 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.70 | 0.000209 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.70 | 0.000209 |
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ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.9.1 | 0.000084 |
ORF8 | 66 | G66del2 | gGT | g-- | 1 | 1 | AY.9.1 | 0.000084 |
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ORF8 | 66 | G66S | Ggt | Agt | 1 | 1 | AY.9.2 | 0.000037 |
ORF8 | 66 | G66D | gGt | gAt | 1 | 1 | AY.9.2 | 0.000037 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.9.2.1 | 0.001976 |
ORF8 | 66 | G66D | gGt | gAt | 1 | 1 | AY.91 | 0.00073 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | AY.92 | 0.000287 |
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ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.98 | 0.000079 |
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ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.99 | 0.001049 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | AY.99.2 | 0.000092 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B | 0.000128 |
ORF8 | 66 | G66V | gGt | gTt | 1 | 1 | B | 0.000128 |
ORF8 | 66 | G66del1 | Ggt | -gt | 1 | 1 | B.1 | 0.000009 |
ORF8 | 66 | G66A | gGt | gCt | 1 | 1 | B.1 | 0.000009 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.1.1 | 0.000327 |
ORF8 | 66 | G66A | gGt | gCt | 1 | 1 | B.1.1.10 | 0.001115 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.161 | 0.003534 |
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ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.198 | 0.001468 |
ORF8 | 66 | G66S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.1.214 | 0.000055 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.231 | 0.003096 |
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ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.37 | 0.000193 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.398 | 0.003226 |
ORF8 | 66 | G66V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.1.402 | 0.011111 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.1.412 | 0.007634 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.416 | 0.000905 |
ORF8 | 66 | G66D | gGt | gAt | 1 | 1 | B.1.1.433 | 0.001425 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.437 | 0.010417 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.463 | 0.0625 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.1.463 | 0.0625 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.1.464 | 0.001473 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.507 | 0.008696 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.1.51 | 0.001718 |
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ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.111 | 0.001175 |
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ORF8 | 66 | G66A | gGt | gCt | 1 | 1 | B.1.177 | 0.000013 |
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ORF8 | 66 | G66D | gGt | gAt | 1 | 1 | B.1.177.17 | 0.000821 |
ORF8 | 66 | G66V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.177.21 | 0.000076 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.177.4 | 0.000211 |
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ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.177.63 | 0.002703 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.177.63 | 0.002703 |
ORF8 | 66 | G66V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.177.81 | 0.000189 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.177.81 | 0.000189 |
ORF8 | 66 | G66A | gGt | gCt | 1 | 1 | B.1.177.81 | 0.000189 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.177.83 | 0.001481 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.177.86 | 0.000183 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.192 | 0.009259 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.192 | 0.009259 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.195 | 0.005025 |
ORF8 | 66 | G66del1 | GGt | -Nt | 1 | 1 | B.1.2 | 0.000009 |
ORF8 | 66 | G66A | gGt | gCt | 1 | 1 | B.1.2 | 0.000009 |
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ORF8 | 66 | G66S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.340 | 0.004292 |
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ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.36.29 | 0.000517 |
ORF8 | 66 | G66D | gGt | gAt | 1 | 1 | B.1.36.29 | 0.000517 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.36.7 | 0.004 |
ORF8 | 66 | G66D | gGT | gAC | 1 | 1 | B.1.361 | 0.001289 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.361 | 0.001289 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.362.2 | 0.004717 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.367 | 0.000792 |
ORF8 | 66 | G66V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.389 | 0.001002 |
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ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.400 | 0.000429 |
ORF8 | 66 | G66V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.407 | 0.035714 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.427 | 0.00005 |
ORF8 | 66 | G66del1 | GgT | -gN | 1 | 1 | B.1.429 | 0.000024 |
ORF8 | 66 | G66G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.429 | 0.000024 |
ORF8 | 66 | G66V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.429 | 0.000024 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.468 | 0.005714 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.497 | 0.000315 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.517 | 0.000427 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.524 | 0.001406 |
ORF8 | 66 | G66G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.525 | 0.000113 |
ORF8 | 66 | G66G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.526 | 0.000024 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.533 | 0.009615 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.534 | 0.0125 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.540 | 0.009709 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.544 | 0.006024 |
ORF8 | 66 | G66S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.546 | 0.003704 |
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ORF8 | 66 | G66V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.549 | 0.007194 |
ORF8 | 66 | G66R | Ggt | Cgt | 1 | 1 | B.1.560 | 0.00463 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.575 | 0.000303 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.576 | 0.000907 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.577 | 0.000687 |
ORF8 | 66 | G66S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.577 | 0.000687 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.582 | 0.000491 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.588 | 0.00091 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.595 | 0.000261 |
ORF8 | 66 | G66V | gGt | gTt | 1 | 1 | B.1.595 | 0.000261 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.597 | 0.00463 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.598 | 0.016949 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.603 | 0.010638 |
ORF8 | 66 | G66del2 | gGT | g-- | 1 | 1 | B.1.617.2 | 0.000004 |
ORF8 | 66 | G66S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.1.619.1 | 0.000641 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.621.1 | 0.000506 |
ORF8 | 66 | G66G | ggT | ggC | 1 | 1 | B.1.621.1 | 0.000506 |
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ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.628 | 0.000352 |
ORF8 | 66 | G66R | Ggt | Cgt | 1 | 1 | B.1.637 | 0.000073 |
ORF8 | 66 | G66del1 | ggT | gg- | 1 | 1 | B.1.637 | 0.000073 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.1.637 | 0.000073 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | B.1.9.4 | 0.006135 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | B.34 | 0.013699 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | B.4.5 | 0.011905 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | B.40 | 0.000364 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | B.58 | 0.010204 |
ORF8 | 66 | G66S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.6 | 0.00091 |
ORF8 | 66 | G66S | Ggt | Agt | 1 | 1 | B.6.6 | 0.000889 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | C.1 | 0.002392 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | C.26 | 0.007353 |
ORF8 | 66 | G66A | gGt | gCt | 1 | 1 | C.37 | 0.000116 |
ORF8 | 66 | G66R | Ggt | Cgt | 1 | 1 | C.37 | 0.000116 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | D.2 | 0.000075 |
ORF8 | 66 | G66R | Ggt | Cgt | 1 | 1 | D.2 | 0.000075 |
ORF8 | 66 | G66D | gGt | gAt | 1 | 1 | D.2 | 0.000075 |
ORF8 | 66 | G66G | ggT | ggG | 1 | 1 | D.2 | 0.000075 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | M.3 | 0.076923 |
ORF8 | 66 | G66V | gGt | gTt | 1 | 1 | N.6 | 0.007092 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | N.6 | 0.007092 |
ORF8 | 66 | G66G | ggT | ggG | 1 | 1 | P.1 | 0.000016 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | P.1.12 | 0.000484 |
ORF8 | 66 | G66D | gGt | gAt | 1 | 1 | P.1.13 | 0.000898 |
ORF8 | 66 | G66S | Ggt | Agt | 1 | 1 | P.1.4 | 0.000977 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | P.1.8 | 0.004785 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | P.2 | 0.000187 |
ORF8 | 66 | G66S | Ggt | Agt | 1 | 1 | P.3 | 0.001595 |
ORF8 | 66 | G66V | gGt | gTt | 1 | 1 | P.6 | 0.003145 |
ORF8 | 66 | G66V | gGt | gTt | 1 | 1 | P.7 | 0.004367 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | Q.4 | 0.000455 |
ORF8 | 66 | G66del2 | gGT | g-- | 1 | 1 | Q.4 | 0.000455 |
ORF8 | 66 | G66del | GGT | --- | 1 | 1 | Q.7 | 0.001111 |
ORF8 | 66 | G66C | Ggt | Tgt | 1 | 1 | Q.8 | 0.000165 |
ORF8 | 66 | G66V | gGt | gTt | 1 | 1 | R.1 | 0.00009 |
ORF8 | 66 | G66V | gGt | gTt | 1 | 1 | Z.1 | 0.00289 |
CoV-GLUE is still in development. CoV-GLUE was originally developed as part of COG-UK by Josh Singer using the GLUE framework at the MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research (CVR). In 2021 it was redeveloped by Richard Orton to scale to the millions of genome sequences available. We acknowledge support from the MRC (MC_UU_12014/12), WT (220977/Z/20/Z) and UKRI G2P (MR/W005611/1). Please contact Richard Orton with any queries: Richard.Orton@glasgow.ac.uk
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