CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF8 : CodonNum = 66

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF866G66deldelGGT---76137613128089-28091
ORF866G66VnonsyngGtgTt405340070.9886528089-28091
ORF866G66VnonsyngGTgTC4053450.011102928089-28091
ORF866G66VnonsyngGTgTG405310.00024673128089-28091
ORF866G66CnonsynGgtTgt18601860128089-28091
ORF866G66del2delgGTg--6996960.99570828089-28091
ORF866G66del2delGGt--t69920.0028612328089-28091
ORF866G66del2delGGT--N69910.0014306228089-28091
ORF866G66SnonsynGgtAgt652652128089-28091
ORF866G66DnonsyngGtgAt5295250.99243928089-28091
ORF866G66DnonsyngGTgAC52940.0075614428089-28091
ORF866G66AnonsyngGtgCt475475128089-28091
ORF866G66GsynggTggC2882370.82291728089-28091
ORF866G66GsynggTggA288440.15277828089-28091
ORF866G66GsynggTggG28870.024305628089-28091
ORF866G66RnonsynGgtCgt37360.97297328089-28091
ORF866G66RnonsynGgTCgG3710.02702728089-28091
ORF866G66del1delggTgg-19140.73684228089-28091
ORF866G66del1delGgt-gt1930.15789528089-28091
ORF866G66del1delGgT-gN1910.052631628089-28091
ORF866G66del1delGGt-Nt1910.052631628089-28091
ORF866G66FnonsynGGtTTt66128089-28091
ORF866G66EnonsyngGTgAG530.628089-28091
ORF866G66EnonsyngGTgAA520.428089-28091
ORF866G66TnonsynGGtACt44128089-28091
ORF866G66LnonsynGGtCTt210.528089-28091
ORF866G66LnonsynGGTCTG210.528089-28091
ORF866G66WnonsynGgTTgG11128089-28091
ORF866G66InonsynGGtATt11128089-28091
ORF866G66NnonsynGGtAAt11128089-28091

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF866G66delGGT---76137613All0.001456
ORF866G66VgGtgTt40074053All0.000766
ORF866G66VgGTgTC454053All0.000009
ORF866G66VgGTgTG14053All0
ORF866G66VgGtgTt29062906AY.690.542468
ORF866G66delGGT---22812281B.1.1.70.002042
ORF866G66CGgtTgt18601860All0.000356
ORF866G66del2gGTg--696699All0.000133
ORF866G66del2GGt--t2699All0
ORF866G66del2GGT--N1699All0
ORF866G66SGgtAgt652652All0.000125
ORF866G66delGGT---587587AY.40.000914
ORF866G66DgGtgAt525529All0.0001
ORF866G66DgGTgAC4529All0.000001
ORF866G66AgGtgCt475475All0.000091
ORF866G66del2gGTg--474474B.1.1.70.000424
ORF866G66CGgtTgt408408B.1.1.70.000365
ORF866G66delGGT---316316AY.440.001923
ORF866G66GggTggC237288All0.000045
ORF866G66GggTggA44288All0.000008
ORF866G66GggTggG7288All0.000001
ORF866G66VgGtgTt243287B.1.1.70.000218
ORF866G66VgGTgTC44287B.1.1.70.000039
ORF866G66delGGT---259259B.1.617.20.000975
ORF866G66delGGT---245245B.1.10.004445
ORF866G66CGgtTgt233233AY.60.009583
ORF866G66delGGT---232232AY.60.009542
ORF866G66delGGT---208208AY.98.10.010074
ORF866G66delGGT---180180AY.430.000797
ORF866G66VgGtgTt179179AY.1030.001111
ORF866G66del2gGTg--178178B.1.621.10.090035
ORF866G66CGgtTgt177177AY.430.000784
ORF866G66delGGT---177177B.1.36.360.106562
ORF866G66delGGT---176176AY.1030.001093
ORF866G66CGgtTgt171171AY.40.000266
ORF866G66delGGT---148148B.1.20.001303
ORF866G66delGGT---138138B.1.1.4130.951724
ORF866G66delGGT---133133AY.250.0008
ORF866G66GggTggC112112AY.250.000674
ORF866G66AgGtgCt112112B.1.617.20.000422
ORF866G66delGGT---101101AY.260.002859
ORF866G66CGgtTgt9797B.1.1600.003025
ORF866G66delGGT---9797Q.60.642384
ORF866G66VgGtgTt9494AY.40.000146
ORF866G66SGgtAgt9494B.1.1.70.000084
ORF866G66delGGT---8989AY.30.000885
ORF866G66AgGtgCt8989B.1.5260.002092
ORF866G66delGGT---8484B.10.000769
ORF866G66delGGT---7777P.10.001213
ORF866G66delGGT---7474B.1.1600.002308
ORF866G66VgGtgTt7474B.1.617.20.000279
ORF866G66delGGT---7171B.1.5260.001669
ORF866G66DgGtgAt7070AY.1180.004385
ORF866G66delGGT---6868AY.1190.002401
ORF866G66delGGT---6464B.1.1770.000843
ORF866G66CGgtTgt6363B.1.617.20.000237
ORF866G66AgGtgCt6262B.1.4290.001459
ORF866G66CGgtTgt6161AY.1030.000379
ORF866G66SGgtAgt6060B.1.617.20.000226
ORF866G66delGGT---5959B.1.1.2940.074684
ORF866G66DgGtgAt5757AY.4.2.10.008492
ORF866G66CGgtTgt5656B.1.1.2140.003106
ORF866G66SGgtAgt5656B.1.4290.001318
ORF866G66delGGT---5555AY.690.010267
ORF866G66AgGtgCt5555B.1.1.3120.105163
ORF866G66CGgtTgt5555D.20.004127
ORF866G66DgGtgAt5252B.1.1.70.000047
ORF866G66delGGT---5151B.1.3510.001516
ORF866G66delGGT---5050P.30.079745
ORF866G66delGGT---4949AY.230.003418
ORF866G66SGgtAgt4949AY.30.000487
ORF866G66SGgtAgt4747AY.40.000073
ORF866G66delGGT---4444AY.290.000694
ORF866G66VgGtgTt4444B.1.1770.000579
ORF866G66delGGT---4444C.360.040073
ORF866G66delGGT---4343AY.3.10.003666
ORF866G66SGgtAgt4242AY.60.001727
ORF866G66delGGT---4242B.1.2430.002923
ORF866G66CGgtTgt4040B.1.1.5190.001588
ORF866G66CGgtTgt4040B.1.1770.000527
ORF866G66DgGtgAt4040B.1.617.20.000151
ORF866G66AgGtgCt4040L.30.141844
ORF866G66delGGT---3939B.1.617.10.00503
ORF866G66RGgtCgt3637All0.000007
ORF866G66RGgTCgG137All0
ORF866G66delGGT---3636B.1.1.5190.00143
ORF866G66delGGT---3535B.1.4290.000824
ORF866G66delGGT---3434B.1.1.2220.006936
ORF866G66DgGtgAt3333AY.40.000051
ORF866G66DgGtgAt3232AY.1020.000848
ORF866G66VgGtgTt3232AY.260.000906
ORF866G66GggTggA1932B.1.1.70.000017
ORF866G66GggTggC1332B.1.1.70.000012
ORF866G66CGgtTgt3232B.1.20.000282
ORF866G66delGGT---3131AY.1020.000822
ORF866G66VgGtgTt3030B.1.3750.02459
ORF866G66DgGtgAt3030C.370.003482
ORF866G66delGGT---2929AY.1180.001817
ORF866G66DgGtgAt2929AY.230.002023
ORF866G66SGgtAgt2929B.1.1600.000904
ORF866G66SGgtAgt2828N.50.04947
ORF866G66GggTggC2727B.1.20.000238
ORF866G66delGGT---2727B.1.3110.007414
ORF866G66delGGT---2727Q.80.004453
ORF866G66SGgtAgt2626AY.440.000158
ORF866G66delGGT---2525B.1.1.2140.001386
ORF866G66delGGT---2424AY.1070.011184
ORF866G66delGGT---2424AY.1200.000892
ORF866G66AgGtgCt2424AY.430.000106
ORF866G66delGGT---2424B.1.1.3180.007242
ORF866G66DgGtgAt2424P.10.000378
ORF866G66GggTggC2323AY.1030.000143
ORF866G66VgGtgTt2323AY.430.000102
ORF866G66CGgtTgt2323AY.440.00014
ORF866G66DgGtgAt2323AY.440.00014
ORF866G66CGgtTgt2121AY.250.000126
ORF866G66delGGT---2121AY.610.0022
ORF866G66VgGtgTt2121P.10.000331
ORF866G66delGGT---2020AY.300.007915
ORF866G66delGGT---2020AY.750.00112
ORF866G66delGGT---2020B0.002556
ORF866G66GggTggA1920B.1.3510.000565
ORF866G66GggTggC120B.1.3510.00003
ORF866G66del1ggTgg-1419All0.000003
ORF866G66del1Ggt-gt319All0.000001
ORF866G66del1GgT-gN119All0
ORF866G66del1GGt-Nt119All0
ORF866G66delGGT---1919AY.390.00047
ORF866G66delGGT---1919AY.470.000591
ORF866G66VgGtgTt1919B.1.1600.000593
ORF866G66del2gGTg--1919B.1.6210.001682
ORF866G66CGgtTgt1818AY.30.000179
ORF866G66CGgtTgt1818AY.750.001008
ORF866G66CGgtTgt1818AY.930.004915
ORF866G66DgGtgAt1717AY.1030.000106
ORF866G66CGgtTgt1717AY.1110.003114
ORF866G66VgGtgTt1717AY.250.000102
ORF866G66VgGtgTt1717AY.50.000351
ORF866G66AgGtgCt1717AY.98.10.000823
ORF866G66delGGT---1717B.1.438.10.001823
ORF866G66delGGT---1717B.1.4700.023876
ORF866G66delGGT---1717B.1.6210.001505
ORF866G66CGgtTgt1616B.10.000147
ORF866G66CGgtTgt1616B.1.4290.000376
ORF866G66CGgtTgt1616B.1.5260.000376
ORF866G66delGGT---1616B.1.5950.004175
ORF866G66delGGT---1515AD.20.003284
ORF866G66delGGT---1515AY.1000.00069
ORF866G66VgGtgTt1515AY.1100.00169
ORF866G66delGGT---1515AY.4.20.000325
ORF866G66delGGT---1515B.1.177.150.009464
ORF866G66delGGT---1515C.370.001741
ORF866G66SGgtAgt1414AY.1140.003235
ORF866G66RGgtCgt1414AY.40.000022
ORF866G66VgGtgTt1314AY.440.000079
ORF866G66VgGTgTC114AY.440.000006
ORF866G66delGGT---1414AY.840.006124
ORF866G66VgGtgTt1414B.1.20.000123
ORF866G66VgGtgTt1313A.2.50.006487
ORF866G66CGgtTgt1313AY.1170.001099
ORF866G66VgGtgTt1313AY.75.10.002344
ORF866G66VgGtgTt1313B.1.1.1220.590909
ORF866G66delGGT---1313B.1.258.170.001352
ORF866G66delGGT---1212AY.360.001779
ORF866G66CGgtTgt1212B.1.10.000218
ORF866G66delGGT---1212B.1.351.50.007194
ORF866G66delGGT---1212B.1.360.001751
ORF866G66AgGtgCt1111AY.1020.000292
ORF866G66SGgtAgt1111AY.1030.000068
ORF866G66delGGT---1111AY.1170.00093
ORF866G66SGgtAgt1111AY.250.000066
ORF866G66SGgtAgt1111AY.430.000049
ORF866G66delGGT---1111B.1.1.3480.008758
ORF866G66VgGtgTt1111B.1.258.70.021033
ORF866G66delGGT---1111Q.10.00139
ORF866G66delGGT---1010AY.1050.006431
ORF866G66SGgtAgt1010AY.1180.000626
ORF866G66delGGT---1010AY.50.000206
ORF866G66delGGT---1010AY.590.005297
ORF866G66delGGT---1010B.1.1.3120.01912
ORF866G66DgGtgAt1010B.1.1600.000312
ORF866G66VgGtgTt1010B.1.177.600.002184
ORF866G66GggTggC1010B.1.617.20.000038
ORF866G66delGGT---1010B.1.6280.003524
ORF866G66CGgtTgt1010P.10.000158
ORF866G66CGgtTgt1010Q.10.001263
ORF866G66delGGT---99AY.116.10.002803
ORF866G66delGGT---99AY.200.00035
ORF866G66VgGtgTt99AY.30.00009
ORF866G66AgGtgCt99AY.440.000055
ORF866G66CGgtTgt99AY.470.00028
ORF866G66CGgtTgt99AY.50.000186
ORF866G66delGGT---99B.1.1.830.02439
ORF866G66RGgtCgt99B.1.20.000079
ORF866G66delGGT---99P.1.140.00043
ORF866G66delGGT---88AY.1130.001139
ORF866G66delGGT---88AY.1210.001083
ORF866G66VgGtgTt88AY.23.10.003339
ORF866G66SGgtAgt88AY.290.000126
ORF866G66VgGtgTt88AY.290.000126
ORF866G66delGGT---88AY.400.007715
ORF866G66CGgtTgt88AY.420.000322
ORF866G66VgGtgTt88AY.470.000249
ORF866G66SGgtAgt88AY.470.000249
ORF866G66delGGT---88AY.480.003721
ORF866G66delGGT---88AY.650.004264
ORF866G66delGGT---88AY.670.003714
ORF866G66VgGtgTt88B.10.000073
ORF866G66delGGT---88B.1.1.2840.000859
ORF866G66delGGT---88B.1.1.3560.068376
ORF866G66delGGT---88B.1.177.600.001747
ORF866G66SGgtAgt88B.1.20.00007
ORF866G66delGGT---88B.1.2400.001725
ORF866G66delGGT---88B.1.3360.019512
ORF866G66delGGT---88B.1.5250.000905
ORF866G66AgGtgCt88B.1.617.10.001032
ORF866G66delGGT---88Q.30.00116
ORF866G66del2gGTg--88Q.80.001319
ORF866G66delGGT---88R.10.00072
ORF866G66CGgtTgt77AY.1190.000247
ORF866G66VgGtgTt77AY.200.000272
ORF866G66VgGtgTt77AY.300.00277
ORF866G66VgGtgTt77AY.380.003495
ORF866G66GggTggC77AY.4.20.000152
ORF866G66delGGT---77AY.420.000282
ORF866G66delGGT---77AY.5.40.001937
ORF866G66delGGT---77B.1.1.2650.022082
ORF866G66delGGT---77B.1.1.280.002179
ORF866G66VgGtgTt77B.1.1.5190.000278
ORF866G66SGgtAgt77B.1.1770.000092
ORF866G66delGGT---77B.1.258.90.035
ORF866G66delGGT---77B.1.36.160.009972
ORF866G66GggTggC77C.36.30.003971
ORF866G66SGgtAgt77P.10.00011
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