CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF8 : CodonNum = 62 & Codon = gtT

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF862V62VsyngtGgtT913786090.94221328077-28079

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF862V62VgtGgtT86099137All0.001647
ORF862V62VgtGgtT13561396B.1.1.70.001214
ORF862V62VgtGgtT703719AY.40.001094
ORF862V62VgtGgtT448477B.1.617.20.001687
ORF862V62VgtGgtT355359AY.430.001573
ORF862V62VgtGgtT242252AY.250.001456
ORF862V62VgtGgtT231241B.1.2580.015372
ORF862V62VgtGgtT228233B.1.20.002008
ORF862V62VgtGgtT220220D.20.016509
ORF862V62VgtGgtT186202AY.440.001132
ORF862V62VgtGgtT170195AY.30.001691
ORF862V62VgtGgtT164186P.10.002584
ORF862V62VgtGgtT169169AT.10.866667
ORF862V62VgtGgtT166167B.1.3510.004935
ORF862V62VgtGgtT166166AY.260.004699
ORF862V62VgtGgtT154154AY.1200.005726
ORF862V62VgtGgtT134143B.10.001227
ORF862V62VgtGgtT135139AY.1030.000838
ORF862V62VgtGgtT118118C.360.107468
ORF862V62VgtGgtT111113AY.4.50.011932
ORF862V62VgtGgtT102107B.1.10.00185
ORF862V62VgtGgtT106106B.1.5610.04208
ORF862V62VgtGgtT100101B.1.4270.00505
ORF862V62VgtGgtT9395B.1.1770.001225
ORF862V62VgtGgtT9090B.1.4290.002118
ORF862V62VgtGgtT8787C.36.30.049348
ORF862V62VgtGgtT7981AY.1020.002095
ORF862V62VgtGgtT7778AY.390.001903
ORF862V62VgtGgtT7272AY.320.038339
ORF862V62VgtGgtT6868B.1.1260.086735
ORF862V62VgtGgtT6767AY.98.10.003245
ORF862V62VgtGgtT6464B.1.1.5190.002541
ORF862V62VgtGgtT6363AY.39.10.002496
ORF862V62VgtGgtT5858A.23.10.040845
ORF862V62VgtGgtT5757B.1.5250.00645
ORF862V62VgtGgtT3355AY.50.000681
ORF862V62VgtGgtT5353B.1.3490.037884
ORF862V62VgtGgtT5252B.1.1.250.029562
ORF862V62VgtGgtT4749AY.750.002633
ORF862V62VgtGgtT4848B.1.1.3170.019761
ORF862V62VgtGgtT4445B.1.1110.051704
ORF862V62VgtGgtT4244B.1.1600.00131
ORF862V62VgtGgtT4040B.1.360.005836
ORF862V62VgtGgtT3537AY.46.60.002527
ORF862V62VgtGgtT3636B.1.5260.000846
ORF862V62VgtGgtT2929AY.1210.003924
ORF862V62VgtGgtT2729AY.4.20.000586
ORF862V62VgtGgtT2727AC.11
ORF862V62VgtGgtT2727AY.1190.000953
ORF862V62VgtGgtT2727AY.60.00111
ORF862V62VgtGgtT2527P.1.140.001195
ORF862V62VgtGgtT2626AY.1000.001196
ORF862V62VgtGgtT2425AY.200.000933
ORF862V62VgtGgtT2525B.1.6370.001827
ORF862V62VgtGgtT2424AY.920.006895
ORF862V62VgtGgtT2123B.1.2340.002771
ORF862V62VgtGgtT1922AY.230.001325
ORF862V62VgtGgtT2022B.1.2320.010747
ORF862V62VgtGgtT2222B.1.466.20.008607
ORF862V62VgtGgtT2020B.1.5170.00854
ORF862V62VgtGgtT2020B.1.5600.092593
ORF862V62VgtGgtT1919AY.610.001991
ORF862V62VgtGgtT1919B.1.177.600.00415
ORF862V62VgtGgtT1818AY.1180.001128
ORF862V62VgtGgtT1318AY.9.20.000477
ORF862V62VgtGgtT1717AY.980.001343
ORF862V62VgtGgtT1717B.1.1.280.005291
ORF862V62VgtGgtT1717B.1.2430.001183
ORF862V62VgtGgtT1717B.1.6210.001505
ORF862V62VgtGgtT1617P.20.002986
ORF862V62VgtGgtT1616AY.420.000644
ORF862V62VgtGgtT1616B.1.3690.004564
ORF862V62VgtGgtT1515AY.1060.005023
ORF862V62VgtGgtT1515AY.290.000237
ORF862V62VgtGgtT1415AY.330.000935
ORF862V62VgtGgtT1515B.1.1.2220.00306
ORF862V62VgtGgtT1515B.1.177.750.015609
ORF862V62VgtGgtT1515B.1.3110.004119
ORF862V62VgtGgtT715B.1.36.290.003621
ORF862V62VgtGgtT1414AY.270.000906
ORF862V62VgtGgtT1414AY.460.001457
ORF862V62VgtGgtT1314B.1.1.700.004434
ORF862V62VgtGgtT1414B.1.438.10.001502
ORF862V62VgtGgtT1313AY.75.10.002344
ORF862V62VgtGgtT1313AY.90.000879
ORF862V62VgtGgtT1212AU.30.025316
ORF862V62VgtGgtT712B.1.1.10.002287
ORF862V62VgtGgtT1212B.1.5820.005888
ORF862V62VgtGgtT1111AY.450.001339
ORF862V62VgtGgtT1011AY.540.000953
ORF862V62VgtGgtT1111B.1.1.3060.004822
ORF862V62VgtGgtT1111B.1.1.4050.916667
ORF862V62VgtGgtT1111B.1.36.260.031429
ORF862V62VgtGgtT1111B.1.5960.000959
ORF862V62VgtGgtT1111Q.10.00139
ORF862V62VgtGgtT1010AY.470.000311
ORF862V62VgtGgtT910AY.9.10.000754
ORF862V62VgtGgtT1010B.1.1.2070.01182
ORF862V62VgtGgtT1010B.1.351.20.003026
ORF862V62VgtGgtT1010P.30.015949
ORF862V62VgtGgtT99AY.340.000873
ORF862V62VgtGgtT99AY.850.003845
ORF862V62VgtGgtT99AY.99.20.000829
ORF862V62VgtGgtT99B.1.1.3180.002716
ORF862V62VgtGgtT99B.1.2400.00194
ORF862V62VgtGgtT88AY.1090.005917
ORF862V62VgtGgtT88AY.1170.000676
ORF862V62VgtGgtT88AY.46.50.001587
ORF862V62VgtGgtT88AY.790.009685
ORF862V62VgtGgtT88AY.930.002185
ORF862V62VgtGgtT88B.1.1.1890.012103
ORF862V62VgtGgtT88B.1.1.3260.014085
ORF862V62VgtGgtT88B.1.2210.000568
ORF862V62VgtGgtT88B.1.36.80.008
ORF862V62VgtGgtT88B.1.617.10.001032
ORF862V62VgtGgtT88P.1.150.001859
ORF862V62VgtGgtT67AY.1100.000676
ORF862V62VgtGgtT77AY.5.40.001937
ORF862V62VgtGgtT77B0.000895
ORF862V62VgtGgtT77B.1.1.580.037634
ORF862V62VgtGgtT67C.370.000696
ORF862V62VgtGgtT66A.2.5.20.009434
ORF862V62VgtGgtT66AY.1080.006615
ORF862V62VgtGgtT56AY.1130.000712
ORF862V62VgtGgtT66AY.140.000528
ORF862V62VgtGgtT66AY.240.002586
ORF862V62VgtGgtT66B.1.1.1980.008811
ORF862V62VgtGgtT66B.1.1.2160.005343
ORF862V62VgtGgtT66B.1.1.4340.002091
ORF862V62VgtGgtT66B.1.6050.035714
ORF862V62VgtGgtT66P.1.160.002245
ORF862V62VgtGgtT66Q.30.00087
ORF862V62VgtGgtT66Q.80.000989
ORF862V62VgtGgtT55A.2.50.002495
ORF862V62VgtGgtT55AY.3.10.000426
ORF862V62VgtGgtT55AY.4.40.002046
ORF862V62VgtGgtT55AY.530.001438
ORF862V62VgtGgtT45AY.990.004197
ORF862V62VgtGgtT45B.1.1.2140.000222
ORF862V62VgtGgtT55B.1.1.2980.00431
ORF862V62VgtGgtT55B.1.1.500.003394
ORF862V62VgtGgtT55B.1.177.120.000758
ORF862V62VgtGgtT55B.1.177.810.000947
ORF862V62VgtGgtT55B.1.6280.001762
ORF862V62VgtGgtT55C.300.008636
ORF862V62VgtGgtT44AY.1160.001147
ORF862V62VgtGgtT44AY.16.10.00188
ORF862V62VgtGgtT34AY.360.000445
ORF862V62VgtGgtT24AY.370.000632
ORF862V62VgtGgtT44AY.4.2.10.000596
ORF862V62VgtGgtT34AY.950.002283
ORF862V62VgtGgtT44B.1.1.2190.02
ORF862V62VgtGgtT44B.1.1.330.001684
ORF862V62VgtGgtT44B.1.1.630.001543
ORF862V62VgtGgtT44B.1.177.650.002661
ORF862V62VgtGgtT44B.1.258.170.000416
ORF862V62VgtGgtT44B.1.30.010471
ORF862V62VgtGgtT24B.1.5640.000852
ORF862V62VgtGgtT44L.30.014184
ORF862V62VgtGgtT33AY.100.00159
ORF862V62VgtGgtT33AY.120.20.003856
ORF862V62VgtGgtT33AY.160.001139
ORF862V62VgtGgtT23AY.300.000791
ORF862V62VgtGgtT33AY.34.10.00153
ORF862V62VgtGgtT33AY.400.002893
ORF862V62VgtGgtT33AY.410.000882
ORF862V62VgtGgtT33AY.5.30.001012
ORF862V62VgtGgtT33AY.730.001996
ORF862V62VgtGgtT23AY.840.000875
ORF862V62VgtGgtT33AZ.10.002602
ORF862V62VgtGgtT33B.1.1.1740.010135
ORF862V62VgtGgtT33B.1.1.2910.002227
ORF862V62VgtGgtT33B.1.1.3120.005736
ORF862V62VgtGgtT33B.1.1.3160.002775
ORF862V62VgtGgtT33B.1.1.3770.004144
ORF862V62VgtGgtT33B.1.1.3800.029412
ORF862V62VgtGgtT33B.1.1.4210.090909
ORF862V62VgtGgtT33B.1.110.30.002155
ORF862V62VgtGgtT33B.1.351.10.115385
ORF862V62VgtGgtT23B.1.351.30.001753
ORF862V62VgtGgtT33B.1.36.270.00229
ORF862V62VgtGgtT33B.1.36.90.009646
ORF862V62VgtGgtT33B.1.4000.001287
ORF862V62VgtGgtT33B.1.5380.024194
ORF862V62VgtGgtT33B.1.5490.021583
ORF862V62VgtGgtT33B.1.6200.002838
ORF862V62VgtGgtT33B.1.6230.001609
ORF862V62VgtGgtT33B.400.001093
ORF862V62VgtGgtT33B.6.60.002667
ORF862V62VgtGgtT33P.1.10.000953
ORF862V62VgtGgtT33R.10.00027
ORF862V62VgtGgtT22A0.000774
ORF862V62VgtGgtT22A.2.20.003378
ORF862V62VgtGgtT22AE.80.000978
ORF862V62VgtGgtT22AY.1010.000981
ORF862V62VgtGgtT22AY.1070.000932
ORF862V62VgtGgtT22AY.1110.000366
ORF862V62VgtGgtT22AY.1140.000462
ORF862V62VgtGgtT22AY.120.10.000642
ORF862V62VgtGgtT22AY.20.000712
ORF862V62VgtGgtT22AY.29.10.000441
ORF862V62VgtGgtT22AY.510.001818
ORF862V62VgtGgtT12AY.680.000274
ORF862V62VgtGgtT22AY.910.001461
ORF862V62VgtGgtT22B.1.1.1530.002191
ORF862V62VgtGgtT22B.1.1.1760.000879
ORF862V62VgtGgtT22B.1.1.3700.025316
ORF862V62VgtGgtT12B.1.1.390.00051
ORF862V62VgtGgtT22B.1.1200.015385
ORF862V62VgtGgtT22B.1.1390.001466
ORF862V62VgtGgtT22B.1.177.190.002861
ORF862V62VgtGgtT22B.1.177.210.000153
ORF862V62VgtGgtT22B.1.177.570.000562
ORF862V62VgtGgtT22B.1.177.60.001953
ORF862V62VgtGgtT22B.1.177.870.001456
ORF862V62VgtGgtT22B.1.2060.001631
ORF862V62VgtGgtT22B.1.258.110.000793
ORF862V62VgtGgtT22B.1.36.180.00084
ORF862V62VgtGgtT22B.1.4390.011834
ORF862V62VgtGgtT22B.1.4480.005249
ORF862V62VgtGgtT22B.1.4740.003802
ORF862V62VgtGgtT22B.1.5160.003914
ORF862V62VgtGgtT22B.1.6190.001742
ORF862V62VgtGgtT22B.1.621.10.001012
ORF862V62VgtGgtT22B.1.6250.004706
ORF862V62VgtGgtT12B.1.780.008547
ORF862V62VgtGgtT22B.1.90.012346
ORF862V62VgtGgtT22B.4.50.02381
ORF862V62VgtGgtT12P.1.100.000269
ORF862V62VgtGgtT22P.1.40.001953
ORF862V62VgtGgtT22P.1.70.000639
ORF862V62VgtGgtT22P.40.007605
ORF862V62VgtGgtT22Q.40.00091
ORF862V62VgtGgtT110.055556
ORF862V62VgtGgtT11A.2.5.10.004808
ORF862V62VgtGgtT11A.210.00277
ORF862V62VgtGgtT11A.270.001656
ORF862V62VgtGgtT11AA.70.009174
ORF862V62VgtGgtT11AD.20.000219
ORF862V62VgtGgtT11AK.10.012658
ORF862V62VgtGgtT11AU.20.002421
ORF862V62VgtGgtT11AV.10.005051
ORF862V62VgtGgtT11AY.10.000396
ORF862V62VgtGgtT11AY.1040.001984
ORF862V62VgtGgtT11AY.130.000161
ORF862V62VgtGgtT11AY.190.00114
ORF862V62VgtGgtT11AY.220.002092
ORF862V62VgtGgtT11AY.350.000233
ORF862V62VgtGgtT11AY.380.000499
ORF862V62VgtGgtT11AY.4.10.000737
ORF862V62VgtGgtT11AY.4.30.000842
ORF862V62VgtGgtT11AY.46.20.000635
ORF862V62VgtGgtT11AY.46.40.000165
ORF862V62VgtGgtT11AY.5.10.003759
ORF862V62VgtGgtT11AY.500.000799
ORF862V62VgtGgtT11AY.520.000814
ORF862V62VgtGgtT11AY.590.00053
ORF862V62VgtGgtT11AY.630.000387
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