CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF8 : CodonNum = 60

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF860L60FnonsynttGttT69255692350.99971128071-28073
ORF860L60FnonsynttGttC69255200.00028878828071-28073
ORF860L60LsynttGttA12597020.55758528071-28073
ORF860L60LsynTtgCtg12594850.38522628071-28073
ORF860L60LsynTtGCtT1259690.054805428071-28073
ORF860L60LsynTtGCtC125920.0015885628071-28073
ORF860L60LsynTtGCtA125910.00079428128071-28073
ORF860L60deldelTTG---11671167128071-28073
ORF860L60XnonsyntTgtAg2652610.98490628071-28073
ORF860L60XnonsyntTGtGA26530.011320828071-28073
ORF860L60XnonsyntTGtAA26510.0037735828071-28073
ORF860L60del2delTTg--g88610.69318228071-28073
ORF860L60del2delTTG--N88110.12528071-28073
ORF860L60del2delTTG--T8870.079545528071-28073
ORF860L60del2deltTGt--8850.056818228071-28073
ORF860L60del2delTTG--A8840.045454528071-28073
ORF860L60MnonsynTtgAtg7676128071-28073
ORF860L60SnonsyntTgtCg73670.91780828071-28073
ORF860L60SnonsyntTGtCT7350.068493228071-28073
ORF860L60SnonsyntTGtCA7310.013698628071-28073
ORF860L60VnonsynTtgGtg61540.88524628071-28073
ORF860L60VnonsynTtGGtT6130.049180328071-28073
ORF860L60VnonsynTtGGtA6130.049180328071-28073
ORF860L60VnonsynTtGGtC6110.016393428071-28073
ORF860L60del1delttGtt-37340.91891928071-28073
ORF860L60del1delTtg-tg3730.081081128071-28073
ORF860L60WnonsyntTgtGg2626128071-28073
ORF860L60RnonsynTTGAGA18130.72222228071-28073
ORF860L60RnonsynTTgAGg1840.22222228071-28073
ORF860L60RnonsynTTGCGA1810.055555628071-28073
ORF860L60AnonsynTTgGCg1170.63636428071-28073
ORF860L60AnonsynTTGGCA1130.27272728071-28073
ORF860L60AnonsynTTGGCC1110.090909128071-28073
ORF860L60TnonsynTTgACg850.62528071-28073
ORF860L60TnonsynTTGACA820.2528071-28073
ORF860L60TnonsynTTGACC810.12528071-28073
ORF860L60InonsynTtGAtA540.828071-28073
ORF860L60InonsynTtGAtC510.228071-28073
ORF860L60EnonsynTTgGAg33128071-28073
ORF860L60CnonsyntTGtGC320.66666728071-28073
ORF860L60CnonsyntTGtGT310.33333328071-28073
ORF860L60QnonsynTTGCAA11128071-28073
ORF860L60YnonsyntTGtAT11128071-28073
ORF860L60PnonsynTTGCCC11128071-28073

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF860L60FttGttT6923569255All0.013242
ORF860L60FttGttC2069255All0.000004
ORF860L60FttGttT6541565420AY.440.398165
ORF860L60FttGttC565420AY.440.00003
ORF860L60FttGttT26102612B.1.617.20.009828
ORF860L60FttGttC22612B.1.617.20.000008
ORF860L60LttGttA7021259All0.000134
ORF860L60LTtgCtg4851259All0.000093
ORF860L60LTtGCtT691259All0.000013
ORF860L60LTtGCtC21259All0
ORF860L60LTtGCtA11259All0
ORF860L60delTTG---11671167All0.000223
ORF860L60LttGttA260466AY.40.000405
ORF860L60LTtgCtg206466AY.40.000321
ORF860L60FttGttT338344B.1.1.70.000303
ORF860L60FttGttC6344B.1.1.70.000005
ORF860L60delTTG---333333B.1.1.70.000298
ORF860L60XtTgtAg261265All0.00005
ORF860L60XtTGtGA3265All0.000001
ORF860L60XtTGtAA1265All0
ORF860L60LttGttA122125AY.250.000734
ORF860L60LTtgCtg3125AY.250.000018
ORF860L60FttGttT9191AY.40.000142
ORF860L60del2TTg--g6188All0.000012
ORF860L60del2TTG--N1188All0.000002
ORF860L60del2TTG--T788All0.000001
ORF860L60del2tTGt--588All0.000001
ORF860L60del2TTG--A488All0.000001
ORF860L60FttGttT8484AB.10.688525
ORF860L60FttGttT8282AY.1030.000509
ORF860L60LTtgCtg5682B.1.1.70.00005
ORF860L60LttGttA2582B.1.1.70.000022
ORF860L60LTtGCtC182B.1.1.70.000001
ORF860L60LttGttA7680B.1.20.000669
ORF860L60LTtgCtg480B.1.20.000035
ORF860L60LTtGCtT6979AY.440.00042
ORF860L60LttGttA979AY.440.000055
ORF860L60LTtGCtA179AY.440.000006
ORF860L60XtTgtAg7878B.1.617.20.000294
ORF860L60MTtgAtg7676All0.000015
ORF860L60delTTG---7676AY.440.000463
ORF860L60StTgtCg6773All0.000013
ORF860L60StTGtCT573All0.000001
ORF860L60StTGtCA173All0
ORF860L60delTTG---6868AY.40.000106
ORF860L60delTTG---6767AY.1030.000416
ORF860L60XtTgtAg6364B.1.1.70.000056
ORF860L60XtTGtGA164B.1.1.70.000001
ORF860L60VTtgGtg5461All0.00001
ORF860L60VTtGGtT361All0.000001
ORF860L60VTtGGtA361All0.000001
ORF860L60VTtGGtC161All0
ORF860L60delTTG---5858B.1.1.2940.073418
ORF860L60del2TTg--g4253B.1.1.70.000038
ORF860L60del2TTG--N1153B.1.1.70.00001
ORF860L60FttGttT5050AY.1170.004226
ORF860L60LttGttA3849B.1.617.20.000143
ORF860L60LTtgCtg1149B.1.617.20.000041
ORF860L60delTTG---4545B.1.3510.001338
ORF860L60XtTgtAg4343AY.610.004505
ORF860L60LTtgCtg4141AY.3.10.003496
ORF860L60LTtgCtg4040B.1.177.210.003059
ORF860L60delTTG---3838AY.290.000599
ORF860L60del1ttGtt-3437All0.000007
ORF860L60del1Ttg-tg337All0.000001
ORF860L60delTTG---3737B.1.10.000671
ORF860L60FttGttT3436AY.430.000151
ORF860L60FttGttC236AY.430.000009
ORF860L60delTTG---3434B.1.1.2220.006936
ORF860L60delTTG---3434B.1.2430.002366
ORF860L60del1ttGtt-3031B.1.1.70.000027
ORF860L60del1Ttg-tg131B.1.1.70.000001
ORF860L60FttGttT3030AY.390.000741
ORF860L60delTTG---3030B.1.1600.000936
ORF860L60FttGttT3030P.10.000473
ORF860L60FttGttT2929B.1.258.230.690476
ORF860L60FttGttT2727AY.250.000162
ORF860L60MTtgAtg2727AY.40.000042
ORF860L60WtTgtGg2626All0.000005
ORF860L60FttGttT2424B.1.5170.010248
ORF860L60VTtgGtg1822P.10.000284
ORF860L60VTtGGtA322P.10.000047
ORF860L60VTtGGtC122P.10.000016
ORF860L60delTTG---2121P.10.000331
ORF860L60StTgtCg2020AY.1180.001253
ORF860L60FttGttT2020AY.450.002434
ORF860L60delTTG---1919B0.002428
ORF860L60LTtgCtg1919B.1.1.3740.045131
ORF860L60RTTGAGA1318All0.000002
ORF860L60RTTgAGg418All0.000001
ORF860L60RTTGCGA118All0
ORF860L60delTTG---1818AY.1180.001128
ORF860L60MTtgAtg1818B.1.1.500.01222
ORF860L60delTTG---1717AY.30.000169
ORF860L60FttGttT1616AY.460.001665
ORF860L60FttGttT1515AY.1180.00094
ORF860L60WtTgtGg1414AY.470.000435
ORF860L60FttGttT1314B.10.000119
ORF860L60FttGttC114B.10.000009
ORF860L60LTtgCtg1314B.1.1770.000171
ORF860L60LttGttA114B.1.1770.000013
ORF860L60LttGttA1414B.1.4270.000707
ORF860L60FttGttT1414B.1.4290.000329
ORF860L60FttGttT1313B.1.2340.001715
ORF860L60delTTG---1313B.1.617.20.000049
ORF860L60MTtgAtg1313B.1.617.20.000049
ORF860L60FttGttT1212AY.1100.001352
ORF860L60FttGttT1212AY.1190.000424
ORF860L60LttGttA1112AY.390.000272
ORF860L60LTtgCtg112AY.390.000025
ORF860L60XtTgtAg1212AY.940.005312
ORF860L60LttGttA1212B.10.00011
ORF860L60delTTG---1212B.1.20.000106
ORF860L60LttGttA912P.10.000142
ORF860L60LTtgCtg312P.10.000047
ORF860L60ATTgGCg711All0.000001
ORF860L60ATTGGCA311All0.000001
ORF860L60ATTGGCC111All0
ORF860L60LttGttA1011AY.1000.00046
ORF860L60LTtgCtg111AY.1000.000046
ORF860L60FttGttT1111AY.1020.000292
ORF860L60StTgtCg1111AY.1030.000068
ORF860L60FttGttT1111AY.750.000616
ORF860L60delTTG---1111B.1.1.3180.003319
ORF860L60LTtgCtg1010B.1.4290.000235
ORF860L60ATTgGCg610P.10.000095
ORF860L60ATTGGCA310P.10.000047
ORF860L60ATTGGCC110P.10.000016
ORF860L60MTtgAtg99AY.1000.000414
ORF860L60FttGttT99AY.230.000628
ORF860L60FttGttT99AY.30.00009
ORF860L60LttGttA99AY.90.000608
ORF860L60delTTG---99B.1.1770.000119
ORF860L60FttGttT99B.1.5960.000784
ORF860L60TTTgACg58All0.000001
ORF860L60TTTGACA28All0
ORF860L60TTTGACC18All0
ORF860L60LttGttA68AY.1200.000223
ORF860L60LTtgCtg28AY.1200.000074
ORF860L60LttGttA48AY.430.000018
ORF860L60LTtgCtg38AY.430.000013
ORF860L60LTtGCtC18AY.430.000004
ORF860L60del2TTG--T58AY.440.00003
ORF860L60del2tTGt--28AY.440.000012
ORF860L60del2TTg--g18AY.440.000006
ORF860L60LTtgCtg88AY.540.000763
ORF860L60delTTG---88B.1.1.2840.000859
ORF860L60StTgtCg88B.1.1.70.000007
ORF860L60LTtgCtg88B.1.177.860.001468
ORF860L60FttGttT88B.1.20.00007
ORF860L60LttGttA88B.1.3110.002197
ORF860L60FttGttT88B.1.3510.000238
ORF860L60XtTgtAg88B.1.360.001167
ORF860L60LttGttA57AY.1030.000031
ORF860L60LTtgCtg27AY.1030.000012
ORF860L60delTTG---77AY.1190.000247
ORF860L60delTTG---77AY.250.000042
ORF860L60FttGttT77AY.260.000198
ORF860L60LttGttA67AY.610.000629
ORF860L60LTtgCtg17AY.610.000105
ORF860L60delTTG---77B.1.1.2650.022082
ORF860L60VTtgGtg77B.1.20.000062
ORF860L60delTTG---77B.1.36.160.009972
ORF860L60delTTG---77B.1.6280.002467
ORF860L60LttGttA77B.60.006369
ORF860L60delTTG---77P.1.140.000335
ORF860L60FttGttT77P.1.70.002235
ORF860L60delTTG---660.333333
ORF860L60del2TTg--g56AY.1130.000712
ORF860L60del2TTG--A16AY.1130.000142
ORF860L60FttGttT66AY.200.000233
ORF860L60LttGttA56AY.30.00005
ORF860L60LTtgCtg16AY.30.00001
ORF860L60FttGttT66AY.3.10.000512
ORF860L60FttGttT66AY.50.000124
ORF860L60LttGttA66AY.99.20.000553
ORF860L60delTTG---66B.10.000055
ORF860L60LTtgCtg66B.1.1.4160.00543
ORF860L60delTTG---66B.1.1.5190.000238
ORF860L60delTTG---66B.1.243.20.086957
ORF860L60LttGttA66B.1.5170.002562
ORF860L60TTTgACg36P.10.000047
ORF860L60TTTGACA26P.10.000032
ORF860L60TTTGACC16P.10.000016
ORF860L60delTTG---66P.1.170.000971
ORF860L60ITtGAtA45All0.000001
ORF860L60ITtGAtC15All0
ORF860L60FttGttT55AY.1000.00023
ORF860L60LttGttA35AY.1020.00008
ORF860L60LTtgCtg25AY.1020.000053
ORF860L60VTtgGtg55AY.1030.000031
ORF860L60FttGttT45AY.1130.00057
ORF860L60FttGttC15AY.1130.000142
ORF860L60FttGttT55AY.130.000805
ORF860L60VTtgGtg55AY.250.00003
ORF860L60delTTG---55AY.29.10.001103
ORF860L60LttGttA55AY.360.000741
ORF860L60delTTG---55AY.390.000124
ORF860L60FttGttT55AY.470.000156
ORF860L60LTtgCtg45AY.50.000083
ORF860L60LttGttA15AY.50.000021
ORF860L60XtTgtAg55AY.75.10.000902
ORF860L60FttGttT55AY.920.001436
ORF860L60FttGttT55B0.000639
ORF860L60LTtgCtg55B.1.10.000091
ORF860L60delTTG---55B.1.2400.001078
ORF860L60delTTG---55C.370.00058
ORF860L60StTgtCg45P.10.000063
ORF860L60StTGtCA15P.10.000016
ORF860L60delTTG---55P.1.10.001588
ORF860L60FttGttT55Q.80.000825
ORF860L60XtTgtAg55R.10.00045
ORF860L60XtTgtAg44AY.100.00212
ORF860L60XtTgtAg44AY.1160.001147
ORF860L60FttGttT44AY.140.000352
ORF860L60del2TTg--g44AY.200.000155
ORF860L60LttGttA24AY.260.000057
ORF860L60LTtgCtg24AY.260.000057
ORF860L60delTTG---44AY.4.20.000087
ORF860L60FttGttT44AY.540.000381
ORF860L60XtTgtAg44AY.650.002132
ORF860L60delTTG---44AY.7.20.002237
ORF860L60FttGttT44AY.930.001092
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