CoV-GLUE Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF8 : CodonNum = 59

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORF	CodonNum	Mut	ORF1abMut	MutType	RefCodon	MutCodon	AACount	CodonCount	CodonProp	Genome Position
ORF8	59	E59X		nonsyn	Gaa	Taa	1955	1954	0.999488	28068-28070
ORF8	59	E59X		nonsyn	GaA	TaG	1955	1	0.000511509	28068-28070
ORF8	59	E59del		del	GAA	---	1232	1232	1	28068-28070
ORF8	59	E59D		nonsyn	gaA	gaC	534	304	0.569288	28068-28070
ORF8	59	E59D		nonsyn	gaA	gaT	534	230	0.430712	28068-28070
ORF8	59	E59del1		del	Gaa	-aa	530	528	0.996226	28068-28070
ORF8	59	E59del1		del	gaA	ga-	530	1	0.00188679	28068-28070
ORF8	59	E59del1		del	gAa	g-a	530	1	0.00188679	28068-28070
ORF8	59	E59E		syn	gaA	gaG	208	208	1	28068-28070
ORF8	59	E59G		nonsyn	gAa	gGa	195	172	0.882051	28068-28070
ORF8	59	E59G		nonsyn	gAA	gGG	195	19	0.0974359	28068-28070
ORF8	59	E59G		nonsyn	gAA	gGC	195	3	0.0153846	28068-28070
ORF8	59	E59G		nonsyn	gAA	gGT	195	1	0.00512821	28068-28070
ORF8	59	E59K		nonsyn	Gaa	Aaa	171	171	1	28068-28070
ORF8	59	E59Q		nonsyn	Gaa	Caa	107	104	0.971963	28068-28070
ORF8	59	E59Q		nonsyn	GaA	CaG	107	3	0.0280374	28068-28070
ORF8	59	E59A		nonsyn	gAa	gCa	77	75	0.974026	28068-28070
ORF8	59	E59A		nonsyn	gAA	gCC	77	2	0.025974	28068-28070
ORF8	59	E59V		nonsyn	gAa	gTa	49	41	0.836735	28068-28070
ORF8	59	E59V		nonsyn	gAA	gTC	49	4	0.0816327	28068-28070
ORF8	59	E59V		nonsyn	gAA	gTG	49	3	0.0612245	28068-28070
ORF8	59	E59V		nonsyn	gAA	gTT	49	1	0.0204082	28068-28070
ORF8	59	E59del2		del	gAA	g--	19	17	0.894737	28068-28070
ORF8	59	E59del2		del	GAa	--a	19	2	0.105263	28068-28070
ORF8	59	E59R		nonsyn	GAA	CGG	14	10	0.714286	28068-28070
ORF8	59	E59R		nonsyn	GAa	CGa	14	2	0.142857	28068-28070
ORF8	59	E59R		nonsyn	GAA	CGC	14	2	0.142857	28068-28070
ORF8	59	E59H		nonsyn	GaA	CaC	8	7	0.875	28068-28070
ORF8	59	E59H		nonsyn	GaA	CaT	8	1	0.125	28068-28070
ORF8	59	E59P		nonsyn	GAa	CCa	5	3	0.6	28068-28070
ORF8	59	E59P		nonsyn	GAA	CCC	5	2	0.4	28068-28070
ORF8	59	E59L		nonsyn	GAA	TTG	4	1	0.25	28068-28070
ORF8	59	E59L		nonsyn	GAa	TTa	4	1	0.25	28068-28070
ORF8	59	E59L		nonsyn	GAA	CTT	4	1	0.25	28068-28070
ORF8	59	E59L		nonsyn	GAA	CTC	4	1	0.25	28068-28070
ORF8	59	E59T		nonsyn	GAa	ACa	1	1	1	28068-28070
ORF8	59	E59M		nonsyn	GAA	ATG	1	1	1	28068-28070

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORF	CodonNum	Mut	RefCodon	MutCodon	CodonCount	AACount	Lineage	LineageCodonProp
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1954	1955	All	0.000374
ORF8	59	E59X	GaA	TaG	1	1955	All	0
ORF8	59	E59del	GAA	---	1232	1232	All	0.000236
ORF8	59	E59D	gaA	gaC	304	534	All	0.000058
ORF8	59	E59D	gaA	gaT	230	534	All	0.000044
ORF8	59	E59del1	Gaa	-aa	528	530	All	0.000101
ORF8	59	E59del1	gaA	ga-	1	530	All	0
ORF8	59	E59del1	gAa	g-a	1	530	All	0
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	504	504	AY.4	0.000784
ORF8	59	E59del1	Gaa	-aa	393	393	B.1.1.7	0.000352
ORF8	59	E59del	GAA	---	372	372	B.1.1.7	0.000333
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	208	208	All	0.00004
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	199	199	B.1.1.7	0.000178
ORF8	59	E59G	gAa	gGa	172	195	All	0.000033
ORF8	59	E59G	gAA	gGG	19	195	All	0.000004
ORF8	59	E59G	gAA	gGC	3	195	All	0.000001
ORF8	59	E59G	gAA	gGT	1	195	All	0
ORF8	59	E59K	Gaa	Aaa	171	171	All	0.000033
ORF8	59	E59D	gaA	gaT	165	165	AY.25	0.000992
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	156	156	B.1.177.86	0.028619
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	149	149	B.1.1.37	0.028737
ORF8	59	E59Q	Gaa	Caa	104	107	All	0.00002
ORF8	59	E59Q	GaA	CaG	3	107	All	0.000001
ORF8	59	E59D	gaA	gaC	70	98	AY.4	0.000109
ORF8	59	E59D	gaA	gaT	28	98	AY.4	0.000044
ORF8	59	E59del	GAA	---	86	86	AY.44	0.000523
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	82	82	B.1	0.000751
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	80	80	AY.29	0.001262
ORF8	59	E59G	gAa	gGa	77	80	B.1.1.7	0.000069
ORF8	59	E59G	gAA	gGG	3	80	B.1.1.7	0.000003
ORF8	59	E59A	gAa	gCa	75	77	All	0.000014
ORF8	59	E59A	gAA	gCC	2	77	All	0
ORF8	59	E59del1	Gaa	-aa	71	71	AY.25	0.000427
ORF8	59	E59D	gaA	gaC	69	69	AY.46.4	0.011351
ORF8	59	E59del	GAA	---	68	68	AY.4	0.000106
ORF8	59	E59del	GAA	---	66	66	AY.103	0.00041
ORF8	59	E59D	gaA	gaC	60	60	AY.102	0.001591
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	59	59	AY.9.2	0.002167
ORF8	59	E59del	GAA	---	58	58	B.1.1.294	0.073418
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	54	54	B.1.1	0.00098
ORF8	59	E59Q	Gaa	Caa	50	50	AY.44	0.000304
ORF8	59	E59V	gAa	gTa	41	49	All	0.000008
ORF8	59	E59V	gAA	gTC	4	49	All	0.000001
ORF8	59	E59V	gAA	gTG	3	49	All	0.000001
ORF8	59	E59V	gAA	gTT	1	49	All	0
ORF8	59	E59del	GAA	---	45	45	B.1.351	0.001338
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	45	45	B.1.617.2	0.000169
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	39	39	B.1.1.519	0.001549
ORF8	59	E59K	Gaa	Aaa	39	39	B.1.1.7	0.000035
ORF8	59	E59del	GAA	---	38	38	AY.29	0.000599
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	38	38	AY.44	0.000231
ORF8	59	E59del	GAA	---	37	37	B.1.1	0.000671
ORF8	59	E59del	GAA	---	34	34	B.1.1.222	0.006936
ORF8	59	E59del	GAA	---	34	34	B.1.243	0.002366
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	34	34	B.1.289	0.090426
ORF8	59	E59K	Gaa	Aaa	32	32	AY.4	0.00005
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	31	31	B.1.1.352	0.96875
ORF8	59	E59del1	Gaa	-aa	30	30	AY.44	0.000183
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	30	30	B.1.1.317	0.012351
ORF8	59	E59del	GAA	---	30	30	B.1.160	0.000936
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	28	28	AY.103	0.000174
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	28	28	AY.43	0.000124
ORF8	59	E59D	gaA	gaC	14	28	B.1.1.7	0.000013
ORF8	59	E59D	gaA	gaT	14	28	B.1.1.7	0.000013
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	28	28	B.1.170	0.12069
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	27	27	B.1.1.7	0.000024
ORF8	59	E59K	Gaa	Aaa	24	24	B.1.1.50	0.016293
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	22	22	AY.9.1	0.001842
ORF8	59	E59K	Gaa	Aaa	21	21	AY.25	0.000126
ORF8	59	E59del	GAA	---	21	21	P.1	0.000331
ORF8	59	E59K	Gaa	Aaa	20	20	AY.103	0.000124
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	20	20	B.1.1.337	0.071942
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	20	20	B.1.160	0.000624
ORF8	59	E59del2	gAA	g--	17	19	All	0.000003
ORF8	59	E59del2	GAa	--a	2	19	All	0
ORF8	59	E59del	GAA	---	19	19	B	0.002428
ORF8	59	E59del	GAA	---	18	18	AY.118	0.001128
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	18	18	B.1.1.447	0.642857
ORF8	59	E59del	GAA	---	17	17	AY.3	0.000169
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	17	17	AY.43	0.000075
ORF8	59	E59del	GAA	---	17	17	B.1.617.2	0.000064
ORF8	59	E59D	gaA	gaC	15	17	P.1	0.000236
ORF8	59	E59D	gaA	gaT	2	17	P.1	0.000032
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	16	16	B.1.177	0.000211
ORF8	59	E59R	GAA	CGG	10	14	All	0.000002
ORF8	59	E59R	GAa	CGa	2	14	All	0
ORF8	59	E59R	GAA	CGC	2	14	All	0
ORF8	59	E59del2	gAA	g--	14	14	B.1.1.7	0.000013
ORF8	59	E59D	gaA	gaC	11	14	B.1.617.2	0.000041
ORF8	59	E59D	gaA	gaT	3	14	B.1.617.2	0.000011
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	14	14	N.5	0.024735
ORF8	59	E59D	gaA	gaC	12	13	AY.3	0.000119
ORF8	59	E59D	gaA	gaT	1	13	AY.3	0.00001
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	13	13	B.1.1.222	0.002652
ORF8	59	E59G	gAa	gGa	13	13	B.1.617.2	0.000049
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	13	13	B.1.617.2	0.000049
ORF8	59	E59G	gAA	gGG	12	12	AY.94	0.005312
ORF8	59	E59del1	Gaa	-aa	12	12	B.1.2	0.000106
ORF8	59	E59del	GAA	---	12	12	B.1.2	0.000106
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	11	11	AY.25	0.000066
ORF8	59	E59G	gAa	gGa	11	11	B.1	0.000101
ORF8	59	E59del	GAA	---	11	11	B.1.1.318	0.003319
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	11	11	B.1.621.1	0.005564
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	11	11	P.1	0.000173
ORF8	59	E59G	gAa	gGa	10	10	AY.23	0.000697
ORF8	59	E59G	gAa	gGa	10	10	B.1.1	0.000181
ORF8	59	E59V	gAa	gTa	10	10	B.1.1.7	0.000009
ORF8	59	E59A	gAa	gCa	10	10	B.1.2	0.000088
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	9	9	AY.102	0.000239
ORF8	59	E59del	GAA	---	9	9	AY.113	0.001282
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	9	9	AY.121	0.001218
ORF8	59	E59A	gAa	gCa	9	9	AY.4	0.000014
ORF8	59	E59del	GAA	---	9	9	B.1.177	0.000119
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	9	9	B.1.517	0.003843
ORF8	59	E59H	GaA	CaC	7	8	All	0.000001
ORF8	59	E59H	GaA	CaT	1	8	All	0
ORF8	59	E59G	gAa	gGa	8	8	AY.120	0.000297
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	8	8	AY.98.1	0.000387
ORF8	59	E59D	gaA	gaC	7	8	B.1	0.000064
ORF8	59	E59D	gaA	gaT	1	8	B.1	0.000009
ORF8	59	E59del	GAA	---	8	8	B.1.1.284	0.000859
ORF8	59	E59Q	Gaa	Caa	6	8	P.1	0.000095
ORF8	59	E59Q	GaA	CaG	2	8	P.1	0.000032
ORF8	59	E59A	gAa	gCa	8	8	P.1.14	0.000382
ORF8	59	E59del	GAA	---	7	7	AY.119	0.000247
ORF8	59	E59del	GAA	---	7	7	AY.25	0.000042
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	7	7	AY.4	0.000011
ORF8	59	E59A	gAa	gCa	7	7	AY.9.2	0.000257
ORF8	59	E59del	GAA	---	7	7	B.1	0.000064
ORF8	59	E59del	GAA	---	7	7	B.1.1.265	0.022082
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	7	7	B.1.1.63	0.002701
ORF8	59	E59Q	Gaa	Caa	7	7	B.1.1.7	0.000006
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	7	7	B.1.2	0.000062
ORF8	59	E59del	GAA	---	7	7	B.1.36.16	0.009972
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	7	7	B.1.427	0.000353
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	7	7	B.1.466.2	0.002739
ORF8	59	E59del	GAA	---	7	7	B.1.628	0.002467
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	7	7	P.1	0.00011
ORF8	59	E59H	GaA	CaC	6	7	P.1	0.000095
ORF8	59	E59H	GaA	CaT	1	7	P.1	0.000016
ORF8	59	E59del	GAA	---	7	7	P.1.14	0.000335
ORF8	59	E59del	GAA	---	6	6		0.333333
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	6	6	AY.116	0.001721
ORF8	59	E59del1	Gaa	-aa	6	6	AY.20	0.000233
ORF8	59	E59G	gAa	gGa	6	6	AY.4	0.000009
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	6	6	B.1.1.141	0.012072
ORF8	59	E59del	GAA	---	6	6	B.1.1.519	0.000238
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	6	6	B.1.236	0.01232
ORF8	59	E59del	GAA	---	6	6	B.1.243.2	0.086957
ORF8	59	E59del	GAA	---	6	6	P.1.17	0.000971
ORF8	59	E59P	GAa	CCa	3	5	All	0.000001
ORF8	59	E59P	GAA	CCC	2	5	All	0
ORF8	59	E59A	gAa	gCa	5	5	AY.103	0.000031
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	5	5	AY.119	0.000177
ORF8	59	E59del	GAA	---	5	5	AY.29.1	0.001103
ORF8	59	E59del	GAA	---	5	5	AY.39	0.000124
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	5	5	AY.47	0.000156
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	5	5	AY.53	0.001438
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	5	5	AY.59	0.002648
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	5	5	AY.98	0.000395
ORF8	59	E59D	gaA	gaC	4	5	B.1.1	0.000073
ORF8	59	E59D	gaA	gaT	1	5	B.1.1	0.000018
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	5	5	B.1.1.312	0.00956
ORF8	59	E59D	gaA	gaC	5	5	B.1.1.519	0.000199
ORF8	59	E59D	gaA	gaT	4	5	B.1.177	0.000053
ORF8	59	E59D	gaA	gaC	1	5	B.1.177	0.000013
ORF8	59	E59del	GAA	---	5	5	B.1.240	0.001078
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	5	5	B.1.526	0.000118
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	5	5	B.1.595	0.001305
ORF8	59	E59del	GAA	---	5	5	C.37	0.00058
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	5	5	C.37	0.00058
ORF8	59	E59G	gAA	gGC	2	5	P.1	0.000032
ORF8	59	E59G	gAa	gGa	2	5	P.1	0.000032
ORF8	59	E59R	GAA	CGC	2	5	P.1	0.000032
ORF8	59	E59R	GAa	CGa	2	5	P.1	0.000032
ORF8	59	E59G	gAA	gGG	1	5	P.1	0.000016
ORF8	59	E59R	GAA	CGG	1	5	P.1	0.000016
ORF8	59	E59del	GAA	---	5	5	P.1.1	0.001588
ORF8	59	E59L	GAA	CTT	1	4	All	0
ORF8	59	E59L	GAA	CTC	1	4	All	0
ORF8	59	E59L	GAa	TTa	1	4	All	0
ORF8	59	E59L	GAA	TTG	1	4	All	0
ORF8	59	E59D	gaA	gaC	4	4	AY.120	0.000149
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	4	4	AY.20	0.000155
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	4	4	AY.23	0.000279
ORF8	59	E59G	gAa	gGa	4	4	AY.3	0.00004
ORF8	59	E59V	gAA	gTC	2	4	AY.3	0.00002
ORF8	59	E59V	gAa	gTa	2	4	AY.3	0.00002
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	4	4	AY.3.1	0.000341
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	4	4	AY.33	0.000267
ORF8	59	E59D	gaA	gaC	4	4	AY.39.1	0.000158
ORF8	59	E59del	GAA	---	4	4	AY.4.2	0.000087
ORF8	59	E59V	gAa	gTa	3	4	AY.43	0.000013
ORF8	59	E59G	gAa	gGa	3	4	AY.43	0.000013
ORF8	59	E59G	gAA	gGC	1	4	AY.43	0.000004
ORF8	59	E59V	gAA	gTG	1	4	AY.43	0.000004
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	4	4	AY.46	0.000416
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	4	4	AY.46.6	0.000289
ORF8	59	E59del	GAA	---	4	4	AY.7.2	0.002237
ORF8	59	E59A	gAa	gCa	4	4	AY.75	0.000224
ORF8	59	E59A	gAa	gCa	4	4	AZ.2	0.003284
ORF8	59	E59del	GAA	---	4	4	B.1.1.214	0.000222
ORF8	59	E59Q	Gaa	Caa	4	4	B.1.1.219	0.02
ORF8	59	E59R	GAA	CGG	4	4	B.1.1.7	0.000004
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	4	4	B.1.160	0.000125
ORF8	59	E59del	GAA	---	4	4	B.1.177.80	0.007648
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	4	4	B.1.177.81	0.000757
ORF8	59	E59del	GAA	---	4	4	B.1.258	0.000266
ORF8	59	E59del	GAA	---	4	4	B.1.429	0.000094
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	4	4	B.1.525	0.000453
ORF8	59	E59del1	Gaa	-aa	4	4	B.1.617.2	0.000015
ORF8	59	E59K	Gaa	Aaa	4	4	D.2	0.0003
ORF8	59	E59del1	Gaa	-aa	4	4	Q.8	0.00066
ORF8	59	E59D	gaA	gaC	3	3	AY.103	0.000019
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	3	3	AY.111	0.000549
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	3	3	AY.117	0.000254
ORF8	59	E59Q	Gaa	Caa	3	3	AY.117	0.000254
ORF8	59	E59del	GAA	---	3	3	AY.26	0.000085
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	3	3	AY.3	0.00003
ORF8	59	E59K	Gaa	Aaa	3	3	AY.3	0.00003
ORF8	59	E59G	gAa	gGa	3	3	AY.39	0.000074
ORF8	59	E59D	gaA	gaC	2	3	AY.39	0.000049
ORF8	59	E59D	gaA	gaT	1	3	AY.39	0.000025
ORF8	59	E59Q	Gaa	Caa	3	3	AY.4	0.000005
ORF8	59	E59D	gaA	gaC	2	3	AY.4.2	0.000043
ORF8	59	E59D	gaA	gaT	1	3	AY.4.2	0.000022
ORF8	59	E59G	gAa	gGa	3	3	AY.61	0.000314
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	3	3	AY.75	0.000168
ORF8	59	E59D	gaA	gaT	3	3	AY.85	0.001282
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	3	3	AY.98	0.000237
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	3	3	AZ.3	0.004559
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	3	3	B.1	0.000027
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	3	3	B.1.1	0.000054
ORF8	59	E59K	Gaa	Aaa	3	3	B.1.1	0.000054
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	3	3	B.1.1.214	0.000166
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	3	3	B.1.1.291	0.002227
ORF8	59	E59Q	Gaa	Caa	3	3	B.1.1.407	0.125
ORF8	59	E59A	gAa	gCa	3	3	B.1.1.7	0.000003
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	3	3	B.1.177	0.00004
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	3	3	B.1.214.2	0.001799
ORF8	59	E59del	GAA	---	3	3	B.1.22	0.003953
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	3	3	B.1.243	0.000209
ORF8	59	E59V	gAa	gTa	3	3	B.1.258.21	0.023256
ORF8	59	E59del	GAA	---	3	3	B.1.438.1	0.000322
ORF8	59	E59del	GAA	---	3	3	B.1.509	0.002597
ORF8	59	E59G	gAa	gGa	3	3	B.1.526	0.000071
ORF8	59	E59A	gAa	gCa	3	3	B.1.526	0.000071
ORF8	59	E59Q	Gaa	Caa	3	3	B.1.617.2	0.000011
ORF8	59	E59A	gAa	gCa	3	3	B.1.617.2	0.000011
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	3	3	B.1.9.5	0.017045
ORF8	59	E59del	GAA	---	3	3	P.1.15	0.000697
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	3	3	P.1.7	0.000958
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	3	3	P.2	0.00056
ORF8	59	E59del	GAA	---	3	3	Q.8	0.000495
ORF8	59	E59D	gaA	gaC	2	2		0.111111
ORF8	59	E59G	gAa	gGa	2	2	A	0.000774
ORF8	59	E59G	gAa	gGa	2	2	AY.1	0.000791
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	2	2	AY.100	0.000092
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	2	2	AY.102	0.000053
ORF8	59	E59Q	Gaa	Caa	2	2	AY.102	0.000053
ORF8	59	E59del	GAA	---	2	2	AY.102	0.000053
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	2	2	AY.106	0.00067
ORF8	59	E59L	GAa	TTa	1	2	AY.113	0.000142
ORF8	59	E59V	gAA	gTG	1	2	AY.113	0.000142
ORF8	59	E59V	gAa	gTa	1	2	AY.113	0.000142
ORF8	59	E59L	GAA	TTG	1	2	AY.113	0.000142
ORF8	59	E59X	GaA	TaG	1	2	AY.113	0.000142
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	2	AY.113	0.000142
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	2	2	AY.116	0.000574
ORF8	59	E59G	gAa	gGa	2	2	AY.13	0.000322
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	2	2	AY.19	0.002281
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	2	2	AY.20	0.000078
ORF8	59	E59V	gAa	gTa	2	2	AY.20	0.000078
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	2	2	AY.23	0.000139
ORF8	59	E59del	GAA	---	2	2	AY.23	0.000139
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	2	2	AY.25	0.000012
ORF8	59	E59Q	Gaa	Caa	2	2	AY.25	0.000012
ORF8	59	E59V	gAa	gTa	2	2	AY.25	0.000012
ORF8	59	E59A	gAa	gCa	2	2	AY.25	0.000012
ORF8	59	E59G	gAa	gGa	2	2	AY.26	0.000057
ORF8	59	E59G	gAa	gGa	2	2	AY.29	0.000032
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	2	2	AY.39	0.000049
ORF8	59	E59del	GAA	---	2	2	AY.39.1	0.000079
ORF8	59	E59V	gAa	gTa	2	2	AY.4	0.000003
ORF8	59	E59A	gAa	gCa	2	2	AY.4.2	0.000043
ORF8	59	E59A	gAa	gCa	2	2	AY.43	0.000009
ORF8	59	E59D	gaA	gaC	2	2	AY.43	0.000009
ORF8	59	E59R	GAA	CGG	2	2	AY.43	0.000009
ORF8	59	E59del	GAA	---	2	2	AY.43	0.000009
ORF8	59	E59V	gAa	gTa	2	2	AY.44	0.000012
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	2	2	AY.44	0.000012
ORF8	59	E59A	gAa	gCa	2	2	AY.44	0.000012
ORF8	59	E59K	Gaa	Aaa	2	2	AY.44	0.000012
ORF8	59	E59D	gaA	gaT	1	2	AY.44	0.000006
ORF8	59	E59D	gaA	gaC	1	2	AY.44	0.000006
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	2	2	AY.45	0.000243
ORF8	59	E59del	GAA	---	2	2	AY.47	0.000062
ORF8	59	E59del	GAA	---	2	2	AY.48	0.00093
ORF8	59	E59G	gAa	gGa	2	2	AY.6	0.000082
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	2	2	AY.61	0.00021
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	2	2	AY.65	0.001066
ORF8	59	E59del	GAA	---	2	2	AY.84	0.000875
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	2	2	AY.92	0.000575
ORF8	59	E59del	GAA	---	2	2	AY.98.1	0.000097
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	2	2	AZ.1	0.001735
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	2	2	B	0.000256
ORF8	59	E59K	Gaa	Aaa	2	2	B.1	0.000018
ORF8	59	E59V	gAa	gTa	2	2	B.1	0.000018
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	2	2	B.1.1.216	0.001781
ORF8	59	E59K	Gaa	Aaa	2	2	B.1.1.25	0.001137
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	2	2	B.1.1.326	0.003521
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	2	2	B.1.1.409	0.005666
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	2	2	B.1.1.50	0.001358
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	2	2	B.1.177.43	0.002954
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	2	2	B.1.2	0.000018
ORF8	59	E59del	GAA	---	2	2	B.1.210	0.004264
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	2	2	B.1.210	0.004264
ORF8	59	E59del	GAA	---	2	2	B.1.234	0.000264
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	2	2	B.1.258	0.000133
ORF8	59	E59del	GAA	---	2	2	B.1.258.17	0.000208
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	2	2	B.1.351	0.000059
ORF8	59	E59Q	GaA	CaG	1	2	B.1.351	0.00003
ORF8	59	E59Q	Gaa	Caa	1	2	B.1.351	0.00003
ORF8	59	E59del	GAA	---	2	2	B.1.36	0.000292
ORF8	59	E59K	Gaa	Aaa	2	2	B.1.36.8	0.002
ORF8	59	E59Q	Gaa	Caa	2	2	B.1.375	0.001639
ORF8	59	E59del	GAA	---	2	2	B.1.427	0.000101
ORF8	59	E59D	gaA	gaC	2	2	B.1.497	0.00063
ORF8	59	E59del	GAA	---	2	2	B.1.526	0.000047
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	2	2	B.1.609	0.000959
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	2	2	B.1.617.1	0.000258
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	2	2	B.1.621	0.000177
ORF8	59	E59del2	GAa	--a	2	2	B.1.637	0.000146
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	2	2	B.1.9.5	0.011364
ORF8	59	E59del	GAA	---	2	2	B.40	0.000729
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	2	2	B.6	0.00182
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	2	2	C.36	0.001821
ORF8	59	E59K	Gaa	Aaa	2	2	C.37	0.000232
ORF8	59	E59K	Gaa	Aaa	2	2	P.1	0.000032
ORF8	59	E59L	GAA	CTT	1	2	P.1	0.000016
ORF8	59	E59L	GAA	CTC	1	2	P.1	0.000016
ORF8	59	E59V	gAA	gTC	1	2	P.1	0.000016
ORF8	59	E59V	gAA	gTT	1	2	P.1	0.000016
ORF8	59	E59A	gAA	gCC	1	2	P.1	0.000016
ORF8	59	E59A	gAa	gCa	1	2	P.1	0.000016
ORF8	59	E59P	GAA	CCC	1	2	P.1	0.000016
ORF8	59	E59P	GAa	CCa	1	2	P.1	0.000016
ORF8	59	E59del	GAA	---	2	2	P.1.12	0.000968
ORF8	59	E59del	GAA	---	2	2	P.1.7	0.000639
ORF8	59	E59A	gAA	gCC	1	2	P.2	0.000187
ORF8	59	E59P	GAa	CCa	1	2	P.2	0.000187
ORF8	59	E59A	gAa	gCa	1	2	P.2	0.000187
ORF8	59	E59P	GAA	CCC	1	2	P.2	0.000187
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	A	0.000387
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	A.1	0.000282
ORF8	59	E59V	gAa	gTa	1	1	A.2.5	0.000499
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	AD.2	0.000219
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	AE.4	0.043478
ORF8	59	E59T	GAa	ACa	1	1	All	0
ORF8	59	E59M	GAA	ATG	1	1	All	0
ORF8	59	E59V	gAa	gTa	1	1	AT.1	0.005128
ORF8	59	E59D	gaA	gaC	1	1	AY.1	0.000396
ORF8	59	E59del2	gAA	g--	1	1	AY.103	0.000006
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	AY.108	0.001103
ORF8	59	E59A	gAa	gCa	1	1	AY.110	0.000113
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	AY.111	0.000183
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	1	1	AY.113	0.000142
ORF8	59	E59Q	Gaa	Caa	1	1	AY.116	0.000287
ORF8	59	E59D	gaA	gaC	1	1	AY.117	0.000085
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	1	1	AY.117	0.000085
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	AY.118	0.000063
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	AY.120	0.000037
ORF8	59	E59V	gAa	gTa	1	1	AY.120	0.000037
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	AY.120.1	0.000321
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	AY.16	0.00038
ORF8	59	E59Q	Gaa	Caa	1	1	AY.16	0.00038
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	AY.16.1	0.00047
ORF8	59	E59K	Gaa	Aaa	1	1	AY.20	0.000039
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	AY.20	0.000039
ORF8	59	E59A	gAa	gCa	1	1	AY.23	0.00007
ORF8	59	E59Q	Gaa	Caa	1	1	AY.23	0.00007
ORF8	59	E59K	Gaa	Aaa	1	1	AY.26	0.000028
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	AY.26	0.000028
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	1	1	AY.26	0.000028
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	AY.27	0.000065
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	1	1	AY.28	0.00189
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	1	1	AY.29	0.000016
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	AY.29.1	0.000221
ORF8	59	E59del1	Gaa	-aa	1	1	AY.3	0.00001
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	AY.3.1	0.000085
ORF8	59	E59D	gaA	gaT	1	1	AY.32	0.000532
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	AY.32	0.000532
ORF8	59	E59G	gAa	gGa	1	1	AY.33	0.000067
ORF8	59	E59K	Gaa	Aaa	1	1	AY.34	0.000097
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	AY.34	0.000097
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	AY.36	0.000148
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	AY.38	0.000499
ORF8	59	E59K	Gaa	Aaa	1	1	AY.39.1	0.00004
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	1	1	AY.4.2.1	0.000149
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	AY.4.4	0.000409
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	AY.4.4	0.000409
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	AY.41	0.000294
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	AY.42	0.00004
ORF8	59	E59Q	Gaa	Caa	1	1	AY.43	0.000004
ORF8	59	E59K	Gaa	Aaa	1	1	AY.43	0.000004
ORF8	59	E59R	GAA	CGG	1	1	AY.44	0.000006
ORF8	59	E59G	gAA	gGG	1	1	AY.44	0.000006
ORF8	59	E59M	GAA	ATG	1	1	AY.44	0.000006
ORF8	59	E59del2	gAA	g--	1	1	AY.44	0.000006
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	1	1	AY.46	0.000104
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	AY.46.1	0.001027
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	AY.46.2	0.000635
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	AY.46.6	0.000072
ORF8	59	E59D	gaA	gaC	1	1	AY.47	0.000031
ORF8	59	E59K	Gaa	Aaa	1	1	AY.48	0.000465
ORF8	59	E59A	gAa	gCa	1	1	AY.5	0.000021
ORF8	59	E59K	Gaa	Aaa	1	1	AY.5	0.000021
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	AY.5.4	0.000277
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	1	1	AY.54	0.000095
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	AY.6	0.000041
ORF8	59	E59A	gAa	gCa	1	1	AY.6	0.000041
ORF8	59	E59A	gAa	gCa	1	1	AY.61	0.000105
ORF8	59	E59A	gAa	gCa	1	1	AY.62	0.000436
ORF8	59	E59K	Gaa	Aaa	1	1	AY.65	0.000533
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	AY.67	0.000464
ORF8	59	E59G	gAA	gGT	1	1	AY.67	0.000464
ORF8	59	E59Q	Gaa	Caa	1	1	AY.68	0.000274
ORF8	59	E59G	gAa	gGa	1	1	AY.68	0.000274
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	AY.69	0.000187
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	AY.7.1	0.000113
ORF8	59	E59D	gaA	gaC	1	1	AY.70	0.000209
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	AY.70	0.000209
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	AY.74	0.000116
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	1	1	AY.75	0.000056
ORF8	59	E59Q	Gaa	Caa	1	1	AY.85	0.000427
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	AY.9	0.000068
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	AY.9	0.000068
ORF8	59	E59D	gaA	gaC	1	1	AY.9.2	0.000037
ORF8	59	E59V	gAA	gTC	1	1	AY.9.2	0.000037
ORF8	59	E59Q	Gaa	Caa	1	1	AY.9.2	0.000037
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	AY.90	0.000684
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	1	1	AY.93	0.000273
ORF8	59	E59V	gAa	gTa	1	1	AY.98.1	0.000048
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	AY.99	0.001049
ORF8	59	E59V	gAa	gTa	1	1	AY.99.2	0.000092
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	AY.99.2	0.000092
ORF8	59	E59V	gAa	gTa	1	1	AZ.2	0.000821
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	1	1	B	0.000128
ORF8	59	E59V	gAa	gTa	1	1	B	0.000128
ORF8	59	E59Q	Gaa	Caa	1	1	B.1	0.000009
ORF8	59	E59del1	gAa	g-a	1	1	B.1	0.000009
ORF8	59	E59del1	gaA	ga-	1	1	B.1.1	0.000018
ORF8	59	E59Q	Gaa	Caa	1	1	B.1.1	0.000018
ORF8	59	E59A	gAa	gCa	1	1	B.1.1.1	0.000327
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	B.1.1.174	0.003378
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	B.1.1.189	0.001513
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	1	1	B.1.1.198	0.001468
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	B.1.1.205	0.003717
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	B.1.1.216	0.00089
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	B.1.1.25	0.000569
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	B.1.1.25	0.000569
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	B.1.1.269	0.001353
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	B.1.1.28	0.000311
ORF8	59	E59D	gaA	gaT	1	1	B.1.1.282	0.011628
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	B.1.1.286	0.002899
ORF8	59	E59D	gaA	gaC	1	1	B.1.1.294	0.001266
ORF8	59	E59G	gAA	gGG	1	1	B.1.1.294	0.001266
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	B.1.1.297	0.002237
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	B.1.1.322	0.008772
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	B.1.1.33	0.000421
ORF8	59	E59K	Gaa	Aaa	1	1	B.1.1.339	0.010526
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	B.1.1.354	0.004386
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	B.1.1.37	0.000193
ORF8	59	E59G	gAa	gGa	1	1	B.1.1.409	0.002833
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	B.1.1.433	0.001425
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	B.1.1.484	0.1
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	B.1.1.52	0.012195
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	B.1.1.526	0.003546
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	B.1.1.63	0.000386
ORF8	59	E59P	GAa	CCa	1	1	B.1.1.7	0.000001
ORF8	59	E59T	GAa	ACa	1	1	B.1.1.7	0.000001
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	B.1.111	0.001175
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	B.1.126	0.001276
ORF8	59	E59del1	Gaa	-aa	1	1	B.1.160	0.000031
ORF8	59	E59R	GAA	CGG	1	1	B.1.177	0.000013
ORF8	59	E59R	GAA	CGG	1	1	B.1.177.15	0.000631
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	B.1.177.17	0.000821
ORF8	59	E59D	gaA	gaC	1	1	B.1.177.44	0.000519
ORF8	59	E59D	gaA	gaT	1	1	B.1.177.46	0.000918
ORF8	59	E59V	gAA	gTG	1	1	B.1.177.63	0.002703
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	B.1.177.7	0.000165
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	B.1.177.7	0.000165
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	B.1.177.73	0.000566
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	B.1.177.83	0.001481
ORF8	59	E59A	gAa	gCa	1	1	B.1.177.86	0.000183
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	B.1.195	0.005025
ORF8	59	E59D	gaA	gaT	1	1	B.1.2	0.000009
ORF8	59	E59V	gAa	gTa	1	1	B.1.2	0.000009
ORF8	59	E59K	Gaa	Aaa	1	1	B.1.221	0.000071
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	B.1.221	0.000071
ORF8	59	E59A	gAa	gCa	1	1	B.1.243	0.00007
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	1	1	B.1.258	0.000067
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	B.1.258.12	0.007874
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	1	1	B.1.258.17	0.000104
ORF8	59	E59Q	Gaa	Caa	1	1	B.1.258.7	0.001912
ORF8	59	E59V	gAa	gTa	1	1	B.1.311	0.000275
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	B.1.340	0.004292
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	B.1.35	0.008475
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	B.1.351.2	0.000303
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	B.1.36	0.000146
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	B.1.36.17	0.000494
ORF8	59	E59K	Gaa	Aaa	1	1	B.1.36.29	0.000517
ORF8	59	E59G	gAa	gGa	1	1	B.1.366	0.004878
ORF8	59	E59del1	Gaa	-aa	1	1	B.1.369	0.000285
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	B.1.369	0.000285
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	B.1.369	0.000285
ORF8	59	E59V	gAa	gTa	1	1	B.1.370	0.008
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	B.1.411	0.003704
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	B.1.428	0.00102
ORF8	59	E59D	gaA	gaC	1	1	B.1.429	0.000024
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	B.1.429	0.000024
ORF8	59	E59G	gAA	gGG	1	1	B.1.445	0.011765
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	B.1.446	0.02
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	B.1.453	0.003236
ORF8	59	E59G	gAa	gGa	1	1	B.1.466.2	0.000391
ORF8	59	E59del1	Gaa	-aa	1	1	B.1.468	0.005714
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	B.1.468	0.005714
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	B.1.480	0.002488
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	B.1.499	0.00105
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	B.1.503	0.002488
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	B.1.509	0.000866
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	B.1.517	0.000427
ORF8	59	E59Q	Gaa	Caa	1	1	B.1.524	0.001406
ORF8	59	E59Q	Gaa	Caa	1	1	B.1.525	0.000113
ORF8	59	E59D	gaA	gaC	1	1	B.1.538	0.008065
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	B.1.540	0.009709
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	B.1.549	0.007194
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	B.1.560	0.00463
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	B.1.561	0.000397
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	B.1.564	0.000426
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	B.1.580	0.004065
ORF8	59	E59Q	Gaa	Caa	1	1	B.1.582	0.000491
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	1	1	B.1.596	0.000087
ORF8	59	E59D	gaA	gaT	1	1	B.1.596	0.000087
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	B.1.596	0.000087
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	B.1.597	0.00463
ORF8	59	E59Q	Gaa	Caa	1	1	B.1.617.1	0.000129
ORF8	59	E59V	gAa	gTa	1	1	B.1.617.2	0.000004
ORF8	59	E59K	Gaa	Aaa	1	1	B.1.617.2	0.000004
ORF8	59	E59del1	Gaa	-aa	1	1	B.1.621	0.000089
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	B.1.621	0.000089
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	B.1.625	0.002353
ORF8	59	E59V	gAa	gTa	1	1	B.23	0.002924
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	B.34	0.013699
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	B.6.6	0.000889
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	C.26	0.007353
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	C.36	0.000911
ORF8	59	E59del1	Gaa	-aa	1	1	C.37	0.000116
ORF8	59	E59Q	Gaa	Caa	1	1	D.2	0.000075
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	M.3	0.076923
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	N.6	0.007092
ORF8	59	E59del1	Gaa	-aa	1	1	P.1	0.000016
ORF8	59	E59Q	Gaa	Caa	1	1	P.1.1	0.000318
ORF8	59	E59Q	Gaa	Caa	1	1	P.1.12	0.000484
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	P.1.14	0.000048
ORF8	59	E59K	Gaa	Aaa	1	1	P.1.15	0.000232
ORF8	59	E59G	gAa	gGa	1	1	P.1.17	0.000162
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	1	1	P.1.17	0.000162
ORF8	59	E59D	gaA	gaC	1	1	P.1.2	0.001156
ORF8	59	E59del1	Gaa	-aa	1	1	P.1.7	0.000319
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	P.1.8	0.004785
ORF8	59	E59Q	Gaa	Caa	1	1	P.2	0.000187
ORF8	59	E59D	gaA	gaC	1	1	P.2	0.000187
ORF8	59	E59H	GaA	CaC	1	1	P.2	0.000187
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	1	1	Q.1	0.000126
ORF8	59	E59D	gaA	gaC	1	1	Q.2	0.000613
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	Q.3	0.000145
ORF8	59	E59X	Gaa	Taa	1	1	Q.4	0.000455
ORF8	59	E59D	gaA	gaC	1	1	Q.4	0.000455
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	Q.4	0.000455
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	Q.7	0.001111
ORF8	59	E59G	gAa	gGa	1	1	Q.8	0.000165
ORF8	59	E59E	gaA	gaG	1	1	Q.8	0.000165
ORF8	59	E59D	gaA	gaC	1	1	Q.8	0.000165
ORF8	59	E59del2	gAA	g--	1	1	Q.8	0.000165
ORF8	59	E59del	GAA	---	1	1	R.1	0.00009

CoV-GLUE is still in development. CoV-GLUE was originally developed as part of COG-UK by Josh Singer using the GLUE framework at the MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research (CVR). In 2021 it was redeveloped by Richard Orton to scale to the millions of genome sequences available. We acknowledge support from the MRC (MC_UU_12014/12), WT (220977/Z/20/Z) and UKRI G2P (MR/W005611/1). Please contact Richard Orton with any queries: Richard.Orton@glasgow.ac.uk

CoV-GLUE uses sequence data from GISAID. GISAID data provided via this web application is subject to GISAID's Terms and Conditions.