CoV-GLUE | Mutations | Mutation
Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):
ORF | CodonNum | Mut | ORF1abMut | MutType | RefCodon | MutCodon | AACount | CodonCount | CodonProp | Genome Position |
ORF8 | 52 | R52I | nonsyn | aGa | aTa | 1139705 | 1139702 | 0.999997 | 28047-28049 | |
ORF8 | 52 | R52I | nonsyn | aGA | aTT | 1139705 | 2 | 0.00000175484 | 28047-28049 | |
ORF8 | 52 | R52I | nonsyn | aGA | aTC | 1139705 | 1 | 0.00000087742 | 28047-28049 | |
ORF8 | 52 | R52K | nonsyn | aGa | aAa | 3345 | 3344 | 0.999701 | 28047-28049 | |
ORF8 | 52 | R52K | nonsyn | aGA | aAG | 3345 | 1 | 0.000298954 | 28047-28049 | |
ORF8 | 52 | R52del | del | AGA | --- | 980 | 980 | 1 | 28047-28049 | |
ORF8 | 52 | R52S | nonsyn | agA | agT | 180 | 158 | 0.877778 | 28047-28049 | |
ORF8 | 52 | R52S | nonsyn | agA | agC | 180 | 20 | 0.111111 | 28047-28049 | |
ORF8 | 52 | R52S | nonsyn | AGa | TCa | 180 | 2 | 0.0111111 | 28047-28049 | |
ORF8 | 52 | R52T | nonsyn | aGa | aCa | 139 | 138 | 0.992806 | 28047-28049 | |
ORF8 | 52 | R52T | nonsyn | aGA | aCG | 139 | 1 | 0.00719424 | 28047-28049 | |
ORF8 | 52 | R52R | syn | agA | agG | 76 | 51 | 0.671053 | 28047-28049 | |
ORF8 | 52 | R52R | syn | Aga | Cga | 76 | 25 | 0.328947 | 28047-28049 | |
ORF8 | 52 | R52X | nonsyn | Aga | Tga | 74 | 73 | 0.986486 | 28047-28049 | |
ORF8 | 52 | R52X | nonsyn | AGa | TAa | 74 | 1 | 0.0135135 | 28047-28049 | |
ORF8 | 52 | R52G | nonsyn | Aga | Gga | 38 | 38 | 1 | 28047-28049 | |
ORF8 | 52 | R52V | nonsyn | AGa | GTa | 32 | 32 | 1 | 28047-28049 | |
ORF8 | 52 | R52del2 | del | AGa | --a | 26 | 24 | 0.923077 | 28047-28049 | |
ORF8 | 52 | R52del2 | del | AGA | --T | 26 | 1 | 0.0384615 | 28047-28049 | |
ORF8 | 52 | R52del2 | del | aGA | a-- | 26 | 1 | 0.0384615 | 28047-28049 | |
ORF8 | 52 | R52del1 | del | agA | ag- | 20 | 8 | 0.4 | 28047-28049 | |
ORF8 | 52 | R52del1 | del | aGa | a-a | 20 | 8 | 0.4 | 28047-28049 | |
ORF8 | 52 | R52del1 | del | aGA | a-T | 20 | 2 | 0.1 | 28047-28049 | |
ORF8 | 52 | R52del1 | del | AgA | Tg- | 20 | 1 | 0.05 | 28047-28049 | |
ORF8 | 52 | R52del1 | del | Aga | -ga | 20 | 1 | 0.05 | 28047-28049 | |
ORF8 | 52 | R52M | nonsyn | aGA | aTG | 16 | 16 | 1 | 28047-28049 | |
ORF8 | 52 | R52L | nonsyn | AGa | TTa | 6 | 5 | 0.833333 | 28047-28049 | |
ORF8 | 52 | R52L | nonsyn | AGa | CTa | 6 | 1 | 0.166667 | 28047-28049 | |
ORF8 | 52 | R52P | nonsyn | AGA | CCG | 3 | 2 | 0.666667 | 28047-28049 | |
ORF8 | 52 | R52P | nonsyn | AGa | CCa | 3 | 1 | 0.333333 | 28047-28049 | |
ORF8 | 52 | R52A | nonsyn | AGA | GCT | 2 | 1 | 0.5 | 28047-28049 | |
ORF8 | 52 | R52A | nonsyn | AGa | GCa | 2 | 1 | 0.5 | 28047-28049 | |
ORF8 | 52 | R52Q | nonsyn | AGA | CAG | 1 | 1 | 1 | 28047-28049 | |
ORF8 | 52 | R52F | nonsyn | AGA | TTC | 1 | 1 | 1 | 28047-28049 |
Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):
ORF | CodonNum | Mut | RefCodon | MutCodon | CodonCount | AACount | Lineage | LineageCodonProp |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1139702 | 1139705 | All | 0.217981 |
ORF8 | 52 | R52I | aGA | aTT | 2 | 1139705 | All | 0 |
ORF8 | 52 | R52I | aGA | aTC | 1 | 1139705 | All | 0 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1103842 | 1103843 | B.1.1.7 | 0.988185 |
ORF8 | 52 | R52I | aGA | aTT | 1 | 1103843 | B.1.1.7 | 0.000001 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 7833 | 7833 | Q.1 | 0.989515 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 6858 | 6858 | Q.3 | 0.994634 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 6056 | 6056 | Q.8 | 0.998681 |
ORF8 | 52 | R52K | aGa | aAa | 3344 | 3345 | All | 0.00064 |
ORF8 | 52 | R52K | aGA | aAG | 1 | 3345 | All | 0 |
ORF8 | 52 | R52K | aGa | aAa | 2675 | 2675 | B.1.628 | 0.942565 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 2193 | 2193 | Q.4 | 0.997271 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1524 | 1524 | B.1.1 | 0.027647 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1382 | 1382 | Q.2 | 0.847853 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1280 | 1280 | B.1 | 0.011724 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1256 | 1256 | AY.4 | 0.001955 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 980 | 980 | All | 0.000187 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 896 | 896 | Q.7 | 0.995556 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 594 | 596 | AY.43 | 0.002632 |
ORF8 | 52 | R52I | aGA | aTT | 1 | 596 | AY.43 | 0.000004 |
ORF8 | 52 | R52I | aGA | aTC | 1 | 596 | AY.43 | 0.000004 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 585 | 585 | B.1.617.2 | 0.002203 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 255 | 255 | B.1.258 | 0.016969 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 255 | 255 | B.1.637 | 0.018634 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 249 | 249 | AY.103 | 0.001546 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 231 | 231 | AY.44 | 0.001406 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 198 | 198 | B.1.1.7 | 0.000177 |
ORF8 | 52 | R52K | aGa | aAa | 193 | 193 | AY.25 | 0.001161 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 183 | 183 | AY.16.1 | 0.085996 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 183 | 183 | B.1.621 | 0.016199 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 181 | 181 | B.1.258.17 | 0.018819 |
ORF8 | 52 | R52S | agA | agT | 158 | 180 | All | 0.00003 |
ORF8 | 52 | R52S | agA | agC | 20 | 180 | All | 0.000004 |
ORF8 | 52 | R52S | AGa | TCa | 2 | 180 | All | 0 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 161 | 161 | P.1 | 0.002536 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 155 | 155 | B.1.177.73 | 0.087769 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 151 | 151 | Q.6 | 1 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 142 | 142 | B.1.576 | 0.12874 |
ORF8 | 52 | R52T | aGa | aCa | 138 | 139 | All | 0.000026 |
ORF8 | 52 | R52T | aGA | aCG | 1 | 139 | All | 0 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 125 | 125 | B.1.429 | 0.002941 |
ORF8 | 52 | R52S | agA | agT | 117 | 117 | AY.103 | 0.000726 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 114 | 114 | B.1.2 | 0.001004 |
ORF8 | 52 | R52K | aGa | aAa | 110 | 111 | B.1.1.7 | 0.000098 |
ORF8 | 52 | R52K | aGA | aAG | 1 | 111 | B.1.1.7 | 0.000001 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 109 | 109 | B.1.177 | 0.001435 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 107 | 107 | AY.102 | 0.002837 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 97 | 97 | AY.4 | 0.000151 |
ORF8 | 52 | R52K | aGa | aAa | 88 | 88 | B.1 | 0.000806 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 80 | 80 | B.1.596 | 0.006971 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 79 | 79 | AY.20 | 0.00307 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 78 | 78 | AY.12 | 0.024652 |
ORF8 | 52 | R52R | agA | agG | 51 | 76 | All | 0.00001 |
ORF8 | 52 | R52R | Aga | Cga | 25 | 76 | All | 0.000005 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 75 | 75 | AY.6 | 0.003085 |
ORF8 | 52 | R52X | Aga | Tga | 73 | 74 | All | 0.000014 |
ORF8 | 52 | R52X | AGa | TAa | 1 | 74 | All | 0 |
ORF8 | 52 | R52K | aGa | aAa | 72 | 72 | B.1.1.375 | 0.857143 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 71 | 71 | P.1.1 | 0.022554 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 64 | 64 | B.1.375 | 0.052459 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 61 | 61 | AY.25 | 0.000367 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 60 | 60 | AY.103 | 0.000373 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 59 | 59 | AY.3 | 0.000587 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 59 | 59 | B.1.1.294 | 0.074684 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 58 | 58 | Q.5 | 0.983051 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 53 | 53 | AY.3.1 | 0.004519 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 52 | 52 | AY.42 | 0.002092 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 51 | 51 | B.1.526 | 0.001199 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 50 | 50 | AY.100 | 0.0023 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 46 | 46 | B.1.36.31 | 0.08056 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 45 | 45 | AY.119 | 0.001589 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 45 | 45 | B.1.351 | 0.001338 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 45 | 45 | XA | 1 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 44 | 44 | B.1.351 | 0.001308 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 41 | 41 | P.1.17 | 0.006632 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 40 | 40 | B | 0.005112 |
ORF8 | 52 | R52G | Aga | Gga | 38 | 38 | All | 0.000007 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 38 | 38 | AY.29 | 0.000599 |
ORF8 | 52 | R52K | aGa | aAa | 38 | 38 | AY.44 | 0.000231 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 37 | 37 | B.1.621.1 | 0.018715 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 36 | 36 | B.1.160 | 0.001123 |
ORF8 | 52 | R52T | aGa | aCa | 34 | 35 | B.1.1.7 | 0.00003 |
ORF8 | 52 | R52T | aGA | aCG | 1 | 35 | B.1.1.7 | 0.000001 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 35 | 35 | B.1.620 | 0.033113 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 34 | 34 | AY.35 | 0.007924 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 34 | 34 | B.1.1 | 0.000617 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 34 | 34 | B.1.243 | 0.002366 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 33 | 33 | B.1.1.222 | 0.006732 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 33 | 33 | B.1.609 | 0.01582 |
ORF8 | 52 | R52V | AGa | GTa | 32 | 32 | All | 0.000006 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 32 | 32 | AY.39 | 0.000791 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 32 | 32 | AY.4.2 | 0.000694 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 32 | 32 | AY.98.1 | 0.00155 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 32 | 32 | B.1.160 | 0.000998 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 32 | 32 | B.1.177.7 | 0.005275 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 31 | 31 | AY.78 | 0.047766 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 31 | 31 | B.1.221 | 0.002202 |
ORF8 | 52 | R52V | AGa | GTa | 30 | 30 | B.1.1.7 | 0.000027 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 29 | 29 | P.1.14 | 0.001386 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 28 | 28 | A.2.5 | 0.013972 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 27 | 27 | B.1.160.19 | 0.964286 |
ORF8 | 52 | R52del2 | AGa | --a | 24 | 26 | All | 0.000005 |
ORF8 | 52 | R52del2 | AGA | --T | 1 | 26 | All | 0 |
ORF8 | 52 | R52del2 | aGA | a-- | 1 | 26 | All | 0 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 26 | 26 | P.1.10 | 0.007006 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 25 | 25 | AY.90 | 0.017112 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 24 | 24 | P.1.12 | 0.011617 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 23 | 23 | B.1.1.519 | 0.000913 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 22 | 22 | AY.117 | 0.001859 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 22 | 22 | AY.44 | 0.000134 |
ORF8 | 52 | R52del1 | aGa | a-a | 8 | 20 | All | 0.000002 |
ORF8 | 52 | R52del1 | agA | ag- | 8 | 20 | All | 0.000002 |
ORF8 | 52 | R52del1 | aGA | a-T | 2 | 20 | All | 0 |
ORF8 | 52 | R52del1 | AgA | Tg- | 1 | 20 | All | 0 |
ORF8 | 52 | R52del1 | Aga | -ga | 1 | 20 | All | 0 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 20 | 20 | B.1.243 | 0.001392 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 20 | 20 | B.1.36 | 0.002918 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 18 | 18 | AY.23 | 0.001255 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 18 | 18 | AY.33 | 0.001202 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 18 | 18 | B | 0.002301 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 18 | 18 | B.1.1.216 | 0.016028 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 18 | 18 | P.1.15 | 0.004182 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 17 | 17 | AY.4.5 | 0.001827 |
ORF8 | 52 | R52del2 | AGa | --a | 17 | 17 | B.1.1.7 | 0.000015 |
ORF8 | 52 | R52M | aGA | aTG | 16 | 16 | All | 0.000003 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 16 | 16 | AY.3 | 0.000159 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 16 | 16 | AY.39.1 | 0.000634 |
ORF8 | 52 | R52T | aGa | aCa | 16 | 16 | AY.4 | 0.000025 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 16 | 16 | P.1.16 | 0.005986 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 15 | 15 | AY.14 | 0.00132 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 15 | 15 | AY.26 | 0.000425 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 15 | 15 | AY.46 | 0.001561 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 15 | 15 | B.1.1.39 | 0.007645 |
ORF8 | 52 | R52M | aGA | aTG | 15 | 15 | B.1.1.7 | 0.000013 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 14 | 14 | AY.29 | 0.000221 |
ORF8 | 52 | R52S | agA | agC | 8 | 14 | AY.44 | 0.000049 |
ORF8 | 52 | R52S | agA | agT | 6 | 14 | AY.44 | 0.000037 |
ORF8 | 52 | R52K | aGa | aAa | 14 | 14 | B.1.627 | 0.028283 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 14 | 14 | P.1 | 0.000221 |
ORF8 | 52 | R52K | aGa | aAa | 13 | 13 | AY.43 | 0.000058 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 13 | 13 | AY.5 | 0.000268 |
ORF8 | 52 | R52T | aGa | aCa | 13 | 13 | AY.5.3 | 0.004386 |
ORF8 | 52 | R52K | aGa | aAa | 13 | 13 | B.1.1.319 | 0.22807 |
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ORF8 | 52 | R52K | aGa | aAa | 8 | 8 | B.1.177.10 | 0.007024 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 8 | 8 | B.1.240 | 0.001725 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 8 | 8 | B.1.525 | 0.000905 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 8 | 8 | B.1.617.2 | 0.00003 |
ORF8 | 52 | R52R | Aga | Cga | 5 | 7 | AY.3 | 0.00005 |
ORF8 | 52 | R52R | agA | agG | 2 | 7 | AY.3 | 0.00002 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 7 | 7 | AY.36 | 0.001037 |
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ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 6 | 6 | AY.9.1 | 0.000502 |
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ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 5 | 5 | A.23.1 | 0.003521 |
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ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 4 | 4 | AY.24 | 0.001724 |
ORF8 | 52 | R52R | agA | agG | 3 | 4 | AY.4 | 0.000005 |
ORF8 | 52 | R52R | Aga | Cga | 1 | 4 | AY.4 | 0.000002 |
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ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 4 | 4 | AY.6 | 0.000165 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 4 | 4 | AY.7.2 | 0.002237 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 4 | 4 | AY.75.1 | 0.000721 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 4 | 4 | AZ.2 | 0.003284 |
ORF8 | 52 | R52del1 | aGa | a-a | 3 | 4 | B.1 | 0.000027 |
ORF8 | 52 | R52del1 | agA | ag- | 1 | 4 | B.1 | 0.000009 |
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ORF8 | 52 | R52del1 | aGA | a-T | 2 | 4 | B.1.1.7 | 0.000002 |
ORF8 | 52 | R52del1 | aGa | a-a | 2 | 4 | B.1.1.7 | 0.000002 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 4 | 4 | B.1.177 | 0.000053 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 4 | 4 | B.1.177.17 | 0.003284 |
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ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 4 | 4 | B.1.36.8 | 0.004 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 4 | 4 | B.1.429 | 0.000094 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 4 | 4 | B.1.575 | 0.001214 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 4 | 4 | B.1.599 | 0.014599 |
ORF8 | 52 | R52R | agA | agG | 3 | 4 | B.1.617.2 | 0.000011 |
ORF8 | 52 | R52R | Aga | Cga | 1 | 4 | B.1.617.2 | 0.000004 |
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ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 4 | 4 | N.5 | 0.007067 |
ORF8 | 52 | R52G | Aga | Gga | 4 | 4 | P.1 | 0.000063 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 4 | 4 | P.1.1 | 0.001271 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 4 | 4 | P.1.2 | 0.004624 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 4 | 4 | P.2 | 0.000747 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 4 | 4 | R.1 | 0.00036 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 3 | 3 | A | 0.001161 |
ORF8 | 52 | R52P | AGA | CCG | 2 | 3 | All | 0 |
ORF8 | 52 | R52P | AGa | CCa | 1 | 3 | All | 0 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 3 | 3 | AY.116 | 0.00086 |
ORF8 | 52 | R52K | aGa | aAa | 3 | 3 | AY.118 | 0.000188 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 3 | 3 | AY.118 | 0.000188 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 3 | 3 | AY.13 | 0.000483 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 3 | 3 | AY.25 | 0.000018 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 3 | 3 | AY.26 | 0.000085 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 3 | 3 | AY.29.1 | 0.000662 |
ORF8 | 52 | R52T | aGa | aCa | 3 | 3 | AY.3 | 0.00003 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 3 | 3 | AY.37 | 0.000948 |
ORF8 | 52 | R52G | Aga | Gga | 3 | 3 | AY.39 | 0.000074 |
ORF8 | 52 | R52X | Aga | Tga | 3 | 3 | AY.4 | 0.000005 |
ORF8 | 52 | R52R | agA | agG | 3 | 3 | AY.4.2 | 0.000065 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 3 | 3 | AY.41 | 0.000882 |
ORF8 | 52 | R52G | Aga | Gga | 3 | 3 | AY.44 | 0.000018 |
ORF8 | 52 | R52R | agA | agG | 3 | 3 | AY.44 | 0.000018 |
ORF8 | 52 | R52T | aGa | aCa | 3 | 3 | AY.48 | 0.001395 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 3 | 3 | AY.52 | 0.002443 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 3 | 3 | AY.54 | 0.000286 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 3 | 3 | AY.7 | 0.000588 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 3 | 3 | AY.93 | 0.000819 |
ORF8 | 52 | R52S | agA | agT | 2 | 3 | B.1 | 0.000018 |
ORF8 | 52 | R52S | agA | agC | 1 | 3 | B.1 | 0.000009 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 3 | 3 | B.1.1.141 | 0.006036 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 3 | 3 | B.1.1.219 | 0.015 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 3 | 3 | B.1.1.317 | 0.001235 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 3 | 3 | B.1.1.33 | 0.001263 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 3 | 3 | B.1.1.434 | 0.001046 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 3 | 3 | B.1.111 | 0.003525 |
ORF8 | 52 | R52K | aGa | aAa | 3 | 3 | B.1.177 | 0.00004 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 3 | 3 | B.1.177.4 | 0.000633 |
ORF8 | 52 | R52R | agA | agG | 3 | 3 | B.1.2 | 0.000026 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 3 | 3 | B.1.22 | 0.003953 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 3 | 3 | B.1.234 | 0.000396 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 3 | 3 | B.1.236 | 0.00616 |
ORF8 | 52 | R52X | Aga | Tga | 3 | 3 | B.1.351.3 | 0.002629 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 3 | 3 | B.1.36.17 | 0.001482 |
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ORF8 | 52 | R52R | agA | agG | 1 | 2 | AY.43 | 0.000004 |
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ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 2 | 2 | AY.84 | 0.000875 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 2 | 2 | AY.9 | 0.000135 |
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ORF8 | 52 | R52G | Aga | Gga | 2 | 2 | B.1 | 0.000018 |
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ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 2 | 2 | B.1.427 | 0.000101 |
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ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 2 | 2 | B.1.637 | 0.000146 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 2 | 2 | B.1.78 | 0.017094 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 2 | 2 | B.1.94 | 0.054054 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 2 | 2 | B.40 | 0.000729 |
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ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 2 | 2 | C.16 | 0.002121 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 2 | 2 | C.36 | 0.001821 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 2 | 2 | C.38 | 0.016129 |
ORF8 | 52 | R52K | aGa | aAa | 2 | 2 | C.6 | 0.074074 |
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ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 2 | 2 | P.1.7 | 0.000639 |
ORF8 | 52 | R52G | Aga | Gga | 1 | 1 | A.1 | 0.000282 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | A.2.2 | 0.001689 |
ORF8 | 52 | R52K | aGa | aAa | 1 | 1 | A.2.5 | 0.000499 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | A.21 | 0.00277 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | A.23.1 | 0.000704 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | A.7 | 0.055556 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | AB.1 | 0.008197 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | AD.2 | 0.000219 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | AE.1 | 0.011364 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | AE.4 | 0.043478 |
ORF8 | 52 | R52Q | AGA | CAG | 1 | 1 | All | 0 |
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ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | AT.1 | 0.005128 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | AU.2 | 0.002421 |
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ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | AY.101 | 0.00049 |
ORF8 | 52 | R52S | agA | agT | 1 | 1 | AY.102 | 0.000027 |
ORF8 | 52 | R52R | agA | agG | 1 | 1 | AY.102 | 0.000027 |
ORF8 | 52 | R52del2 | AGa | --a | 1 | 1 | AY.103 | 0.000006 |
ORF8 | 52 | R52R | Aga | Cga | 1 | 1 | AY.103 | 0.000006 |
ORF8 | 52 | R52T | aGa | aCa | 1 | 1 | AY.103 | 0.000006 |
ORF8 | 52 | R52T | aGa | aCa | 1 | 1 | AY.106 | 0.000335 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | AY.107 | 0.000466 |
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ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | AY.114 | 0.000231 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | AY.120.1 | 0.000321 |
ORF8 | 52 | R52K | aGa | aAa | 1 | 1 | AY.121 | 0.000135 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | AY.17 | 0.008197 |
ORF8 | 52 | R52R | agA | agG | 1 | 1 | AY.19 | 0.00114 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | AY.19 | 0.00114 |
ORF8 | 52 | R52K | aGa | aAa | 1 | 1 | AY.19 | 0.00114 |
ORF8 | 52 | R52S | agA | agC | 1 | 1 | AY.23 | 0.00007 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | AY.23 | 0.00007 |
ORF8 | 52 | R52R | Aga | Cga | 1 | 1 | AY.24 | 0.000431 |
ORF8 | 52 | R52G | Aga | Gga | 1 | 1 | AY.25 | 0.000006 |
ORF8 | 52 | R52S | agA | agC | 1 | 1 | AY.25 | 0.000006 |
ORF8 | 52 | R52R | agA | agG | 1 | 1 | AY.25 | 0.000006 |
ORF8 | 52 | R52del1 | aGa | a-a | 1 | 1 | AY.25 | 0.000006 |
ORF8 | 52 | R52S | agA | agT | 1 | 1 | AY.26 | 0.000028 |
ORF8 | 52 | R52R | agA | agG | 1 | 1 | AY.26 | 0.000028 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | AY.27 | 0.000065 |
ORF8 | 52 | R52G | Aga | Gga | 1 | 1 | AY.27 | 0.000065 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | AY.28 | 0.00189 |
ORF8 | 52 | R52R | agA | agG | 1 | 1 | AY.29 | 0.000016 |
ORF8 | 52 | R52P | AGA | CCG | 1 | 1 | AY.3 | 0.00001 |
ORF8 | 52 | R52X | Aga | Tga | 1 | 1 | AY.3 | 0.00001 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | AY.34.1 | 0.00051 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | AY.38 | 0.000499 |
ORF8 | 52 | R52K | aGa | aAa | 1 | 1 | AY.39 | 0.000025 |
ORF8 | 52 | R52T | aGa | aCa | 1 | 1 | AY.39 | 0.000025 |
ORF8 | 52 | R52R | agA | agG | 1 | 1 | AY.39 | 0.000025 |
ORF8 | 52 | R52X | Aga | Tga | 1 | 1 | AY.39.1 | 0.00004 |
ORF8 | 52 | R52T | aGa | aCa | 1 | 1 | AY.39.1 | 0.00004 |
ORF8 | 52 | R52G | Aga | Gga | 1 | 1 | AY.4 | 0.000002 |
ORF8 | 52 | R52G | Aga | Gga | 1 | 1 | AY.4.2 | 0.000022 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | AY.4.3 | 0.000842 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | AY.4.4 | 0.000409 |
ORF8 | 52 | R52del1 | aGa | a-a | 1 | 1 | AY.42 | 0.00004 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | AY.43 | 0.000004 |
ORF8 | 52 | R52del2 | AGA | --T | 1 | 1 | AY.43 | 0.000004 |
ORF8 | 52 | R52G | Aga | Gga | 1 | 1 | AY.43 | 0.000004 |
ORF8 | 52 | R52K | aGa | aAa | 1 | 1 | AY.45 | 0.000122 |
ORF8 | 52 | R52del2 | AGa | --a | 1 | 1 | AY.46 | 0.000104 |
ORF8 | 52 | R52R | Aga | Cga | 1 | 1 | AY.46 | 0.000104 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | AY.46.2 | 0.000635 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | AY.46.4 | 0.000165 |
ORF8 | 52 | R52T | aGa | aCa | 1 | 1 | AY.46.6 | 0.000072 |
ORF8 | 52 | R52X | Aga | Tga | 1 | 1 | AY.47 | 0.000031 |
ORF8 | 52 | R52X | Aga | Tga | 1 | 1 | AY.5 | 0.000021 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | AY.5.3 | 0.000337 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | AY.54 | 0.000095 |
ORF8 | 52 | R52T | aGa | aCa | 1 | 1 | AY.55 | 0.000917 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | AY.55 | 0.000917 |
ORF8 | 52 | R52X | Aga | Tga | 1 | 1 | AY.61 | 0.000105 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | AY.63 | 0.000387 |
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ORF8 | 52 | R52P | AGA | CCG | 1 | 1 | AY.67 | 0.000464 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | AY.69 | 0.000187 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | AY.69 | 0.000187 |
ORF8 | 52 | R52K | aGa | aAa | 1 | 1 | AY.71 | 0.000475 |
ORF8 | 52 | R52K | aGa | aAa | 1 | 1 | AY.73 | 0.000665 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | AY.74 | 0.000116 |
ORF8 | 52 | R52S | agA | agT | 1 | 1 | AY.74 | 0.000116 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | AY.77 | 0.001127 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | AY.79 | 0.001211 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | AY.8 | 0.000606 |
ORF8 | 52 | R52G | Aga | Gga | 1 | 1 | AY.83 | 0.001724 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | AY.86 | 0.00083 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | AY.88 | 0.000884 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | AY.89 | 0.004902 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | AY.9 | 0.000068 |
ORF8 | 52 | R52del1 | AgA | Tg- | 1 | 1 | AY.9.2 | 0.000037 |
ORF8 | 52 | R52R | agA | agG | 1 | 1 | AY.9.2 | 0.000037 |
ORF8 | 52 | R52S | agA | agC | 1 | 1 | AY.9.2 | 0.000037 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | AY.98.1 | 0.000048 |
ORF8 | 52 | R52K | aGa | aAa | 1 | 1 | AY.98.1 | 0.000048 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | AY.99 | 0.001049 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | AY.99 | 0.001049 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | AZ.2 | 0.000821 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | AZ.2.1 | 0.00813 |
ORF8 | 52 | R52R | agA | agG | 1 | 1 | B | 0.000128 |
ORF8 | 52 | R52M | aGA | aTG | 1 | 1 | B.1 | 0.000009 |
ORF8 | 52 | R52del2 | AGa | --a | 1 | 1 | B.1 | 0.000009 |
ORF8 | 52 | R52T | aGa | aCa | 1 | 1 | B.1 | 0.000009 |
ORF8 | 52 | R52V | AGa | GTa | 1 | 1 | B.1.1 | 0.000018 |
ORF8 | 52 | R52R | agA | agG | 1 | 1 | B.1.1 | 0.000018 |
ORF8 | 52 | R52F | AGA | TTC | 1 | 1 | B.1.1 | 0.000018 |
ORF8 | 52 | R52X | Aga | Tga | 1 | 1 | B.1.1 | 0.000018 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.1.101 | 0.01 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.1.135 | 0.004695 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.1.145 | 0.037037 |
ORF8 | 52 | R52K | aGa | aAa | 1 | 1 | B.1.1.169 | 0.018182 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | B.1.1.174 | 0.003378 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.1.187 | 0.00885 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.1.198 | 0.001468 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | B.1.1.216 | 0.00089 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.1.221 | 0.010101 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.1.236 | 0.006897 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.1.237 | 0.005405 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | B.1.1.25 | 0.000569 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.1.254 | 0.011236 |
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ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | B.1.1.269 | 0.001353 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.1.277 | 0.000759 |
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ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.1.311 | 0.000358 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | B.1.1.322 | 0.008772 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.1.340 | 0.045455 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.1.343 | 0.020833 |
ORF8 | 52 | R52G | Aga | Gga | 1 | 1 | B.1.1.348 | 0.000796 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | B.1.1.354 | 0.004386 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.1.365 | 0.005587 |
ORF8 | 52 | R52R | agA | agG | 1 | 1 | B.1.1.369 | 0.000446 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | B.1.1.37 | 0.000193 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.1.37 | 0.000193 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.1.370 | 0.012658 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.1.372 | 0.000689 |
ORF8 | 52 | R52K | aGa | aAa | 1 | 1 | B.1.1.372 | 0.000689 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.1.389 | 0.006061 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.1.417 | 0.002703 |
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ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.1.44 | 0.00241 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.1.440 | 0.011765 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.1.448 | 0.002033 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.1.46 | 0.004367 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.1.55 | 0.012987 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.1.56 | 0.017857 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | B.1.1.63 | 0.000386 |
ORF8 | 52 | R52G | Aga | Gga | 1 | 1 | B.1.1.7 | 0.000001 |
ORF8 | 52 | R52X | AGa | TAa | 1 | 1 | B.1.1.7 | 0.000001 |
ORF8 | 52 | R52del2 | AGa | --a | 1 | 1 | B.1.1.70 | 0.000341 |
ORF8 | 52 | R52K | aGa | aAa | 1 | 1 | B.1.1.70 | 0.000341 |
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ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | B.1.177.12 | 0.000152 |
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ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.177.21 | 0.000076 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.177.33 | 0.001645 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.177.41 | 0.0025 |
ORF8 | 52 | R52K | aGa | aAa | 1 | 1 | B.1.177.44 | 0.000519 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.177.46 | 0.000918 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.177.51 | 0.004566 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.177.52 | 0.001757 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.177.54 | 0.000606 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.177.60 | 0.000218 |
ORF8 | 52 | R52del2 | aGA | a-- | 1 | 1 | B.1.177.63 | 0.002703 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.177.65 | 0.000665 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.177.67 | 0.007634 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | B.1.177.7 | 0.000165 |
ORF8 | 52 | R52K | aGa | aAa | 1 | 1 | B.1.177.73 | 0.000566 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.177.77 | 0.000726 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | B.1.177.83 | 0.001481 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | B.1.195 | 0.005025 |
ORF8 | 52 | R52del1 | Aga | -ga | 1 | 1 | B.1.2 | 0.000009 |
ORF8 | 52 | R52K | aGa | aAa | 1 | 1 | B.1.237 | 0.004975 |
ORF8 | 52 | R52K | aGa | aAa | 1 | 1 | B.1.239 | 0.001221 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.239 | 0.001221 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.241 | 0.000812 |
ORF8 | 52 | R52R | agA | agG | 1 | 1 | B.1.243 | 0.00007 |
ORF8 | 52 | R52P | AGa | CCa | 1 | 1 | B.1.243 | 0.00007 |
ORF8 | 52 | R52K | aGa | aAa | 1 | 1 | B.1.247 | 0.014925 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | B.1.258 | 0.000067 |
ORF8 | 52 | R52R | agA | agG | 1 | 1 | B.1.258 | 0.000067 |
ORF8 | 52 | R52G | Aga | Gga | 1 | 1 | B.1.258 | 0.000067 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.258.11 | 0.000396 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | B.1.258.12 | 0.007874 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.258.14 | 0.00098 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.258.15 | 0.018868 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.258.21 | 0.007752 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.258.7 | 0.001912 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | B.1.258.9 | 0.005 |
ORF8 | 52 | R52S | agA | agC | 1 | 1 | B.1.279 | 0.000514 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.306 | 0.005714 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.332 | 0.003497 |
ORF8 | 52 | R52K | aGa | aAa | 1 | 1 | B.1.351 | 0.00003 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | B.1.351.2 | 0.000303 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.351.5 | 0.0006 |
ORF8 | 52 | R52K | aGa | aAa | 1 | 1 | B.1.36 | 0.000146 |
ORF8 | 52 | R52X | Aga | Tga | 1 | 1 | B.1.36 | 0.000146 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.36.1 | 0.00114 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.36.10 | 0.004785 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.36.2 | 0.010753 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.36.22 | 0.001208 |
ORF8 | 52 | R52X | Aga | Tga | 1 | 1 | B.1.36.31 | 0.001751 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.362 | 0.001541 |
ORF8 | 52 | R52del1 | agA | ag- | 1 | 1 | B.1.375 | 0.00082 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.393 | 0.028571 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.397 | 0.004854 |
ORF8 | 52 | R52G | Aga | Gga | 1 | 1 | B.1.398 | 0.002976 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.400 | 0.000429 |
ORF8 | 52 | R52K | aGa | aAa | 1 | 1 | B.1.406 | 0.006061 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.416 | 0.001269 |
ORF8 | 52 | R52T | aGa | aCa | 1 | 1 | B.1.427 | 0.00005 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.428.3 | 0.012821 |
ORF8 | 52 | R52R | agA | agG | 1 | 1 | B.1.438.1 | 0.000107 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.439 | 0.005917 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | B.1.445 | 0.011765 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.456 | 0.003268 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | B.1.468 | 0.005714 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.468 | 0.005714 |
ORF8 | 52 | R52A | AGa | GCa | 1 | 1 | B.1.497 | 0.000315 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.521 | 0.004975 |
ORF8 | 52 | R52G | Aga | Gga | 1 | 1 | B.1.526 | 0.000024 |
ORF8 | 52 | R52K | aGa | aAa | 1 | 1 | B.1.526 | 0.000024 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.530 | 0.007143 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | B.1.540 | 0.009709 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.544 | 0.006024 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | B.1.549 | 0.007194 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.560 | 0.00463 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | B.1.564 | 0.000426 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.565 | 0.00081 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.568 | 0.001111 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.575.1 | 0.002439 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.582 | 0.000491 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.595 | 0.000261 |
ORF8 | 52 | R52R | agA | agG | 1 | 1 | B.1.595 | 0.000261 |
ORF8 | 52 | R52T | aGa | aCa | 1 | 1 | B.1.596 | 0.000087 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | B.1.596 | 0.000087 |
ORF8 | 52 | R52S | agA | agT | 1 | 1 | B.1.617.2 | 0.000004 |
ORF8 | 52 | R52X | Aga | Tga | 1 | 1 | B.1.617.2 | 0.000004 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | B.1.621 | 0.000089 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.627 | 0.00202 |
ORF8 | 52 | R52del1 | aGa | a-a | 1 | 1 | B.1.628 | 0.000352 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.634 | 0.003425 |
ORF8 | 52 | R52K | aGa | aAa | 1 | 1 | B.1.76 | 0.011364 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.1.88.1 | 0.004808 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.11 | 0.005128 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | B.34 | 0.013699 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | B.35 | 0.007812 |
ORF8 | 52 | R52K | aGa | aAa | 1 | 1 | B.46 | 0.020833 |
ORF8 | 52 | R52K | aGa | aAa | 1 | 1 | C.1 | 0.002392 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | C.26 | 0.007353 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | C.35 | 0.000774 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | C.37 | 0.000116 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | C.37.1 | 0.002618 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | C.40 | 0.027778 |
ORF8 | 52 | R52del2 | AGa | --a | 1 | 1 | D.2 | 0.000075 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | K.3 | 0.006173 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | L.3 | 0.003546 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | M.3 | 0.076923 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | N.6 | 0.007092 |
ORF8 | 52 | R52A | AGA | GCT | 1 | 1 | P.1 | 0.000016 |
ORF8 | 52 | R52del1 | agA | ag- | 1 | 1 | P.1 | 0.000016 |
ORF8 | 52 | R52Q | AGA | CAG | 1 | 1 | P.1 | 0.000016 |
ORF8 | 52 | R52T | aGa | aCa | 1 | 1 | P.1 | 0.000016 |
ORF8 | 52 | R52X | Aga | Tga | 1 | 1 | P.1 | 0.000016 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | P.1.12 | 0.000484 |
ORF8 | 52 | R52K | aGa | aAa | 1 | 1 | P.1.13 | 0.000898 |
ORF8 | 52 | R52K | aGa | aAa | 1 | 1 | P.1.14 | 0.000048 |
ORF8 | 52 | R52X | Aga | Tga | 1 | 1 | P.1.14 | 0.000048 |
ORF8 | 52 | R52S | agA | agC | 1 | 1 | P.1.17 | 0.000162 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | P.1.17 | 0.000162 |
ORF8 | 52 | R52T | aGa | aCa | 1 | 1 | Q.1 | 0.000126 |
ORF8 | 52 | R52V | AGa | GTa | 1 | 1 | Q.8 | 0.000165 |
ORF8 | 52 | R52T | aGa | aCa | 1 | 1 | R.1 | 0.00009 |
ORF8 | 52 | R52del | AGA | --- | 1 | 1 | R.1 | 0.00009 |
ORF8 | 52 | R52I | aGa | aTa | 1 | 1 | U.3 | 0.003861 |
ORF8 | 52 | R52S | agA | agT | 1 | 1 | W.4 | 0.001351 |
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CoV-GLUE is still in development. CoV-GLUE was originally developed as part of COG-UK by Josh Singer using the GLUE framework at the MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research (CVR). In 2021 it was redeveloped by Richard Orton to scale to the millions of genome sequences available. We acknowledge support from the MRC (MC_UU_12014/12), WT (220977/Z/20/Z) and UKRI G2P (MR/W005611/1). Please contact Richard Orton with any queries: Richard.Orton@glasgow.ac.uk
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