CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF8 : CodonNum = 46

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF846Y46deldelTAT---20342034128029-28031
ORF846Y46YsyntaTtaC917917128029-28031
ORF846Y46CnonsyntAttGt460460128029-28031
ORF846Y46del2delTAt--t4244210.99292528029-28031
ORF846Y46del2deltATt--42420.0047169828029-28031
ORF846Y46del2delTAT--N42410.0023584928029-28031
ORF846Y46HnonsynTatCat209209128029-28031
ORF846Y46XnonsyntaTtaA42340.80952428029-28031
ORF846Y46XnonsyntaTtaG4280.19047628029-28031
ORF846Y46FnonsyntAttTt2020128029-28031
ORF846Y46del1delTat-at970.77777828029-28031
ORF846Y46del1deltaTta-920.22222228029-28031
ORF846Y46SnonsyntAttCt77128029-28031
ORF846Y46KnonsynTaTAaA760.85714328029-28031
ORF846Y46KnonsynTaTAaG710.14285728029-28031
ORF846Y46NnonsynTatAat66128029-28031
ORF846Y46DnonsynTatGat55128029-28031
ORF846Y46EnonsynTaTGaA44128029-28031
ORF846Y46GnonsynTAtGGt44128029-28031
ORF846Y46QnonsynTaTCaG33128029-28031
ORF846Y46VnonsynTATGTA22128029-28031
ORF846Y46RnonsynTATCGC210.528029-28031
ORF846Y46RnonsynTAtCGt210.528029-28031

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF846Y46delTAT---20342034All0.000389
ORF846Y46delTAT---991991B.1.1.70.000887
ORF846Y46YtaTtaC917917All0.000175
ORF846Y46CtAttGt460460All0.000088
ORF846Y46del2TAt--t421424All0.000081
ORF846Y46del2tATt--2424All0
ORF846Y46del2TAT--N1424All0
ORF846Y46YtaTtaC370370B.1.1.70.000331
ORF846Y46YtaTtaC266266R.10.023942
ORF846Y46del2TAt--t230230AY.250.001383
ORF846Y46HTatCat209209All0.00004
ORF846Y46del2TAt--t137137B.1.6050.815476
ORF846Y46delTAT---105105AY.40.000163
ORF846Y46delTAT---8282B.1.617.20.000309
ORF846Y46CtAttGt6969AY.440.00042
ORF846Y46delTAT---6767AY.1030.000416
ORF846Y46HTatCat6464B.1.3690.018254
ORF846Y46delTAT---5858B.1.1.2940.073418
ORF846Y46CtAttGt5757AY.1030.000354
ORF846Y46CtAttGt5656AY.40.000087
ORF846Y46CtAttGt5151B.1.1.70.000046
ORF846Y46delTAT---4545B.1.3510.001338
ORF846Y46delTAT---4343AY.30.000428
ORF846Y46XtaTtaA3442All0.000007
ORF846Y46XtaTtaG842All0.000002
ORF846Y46delTAT---4141AY.290.000647
ORF846Y46HTatCat3838B.1.1.70.000034
ORF846Y46delTAT---3737B.1.10.000671
ORF846Y46delTAT---3535AY.440.000213
ORF846Y46CtAttGt3434AY.250.000205
ORF846Y46delTAT---3434AY.430.000151
ORF846Y46delTAT---3434B.1.2430.002366
ORF846Y46delTAT---3333B.1.1.2220.006732
ORF846Y46delTAT---3333B.1.1600.001029
ORF846Y46delTAT---3131AY.1020.000822
ORF846Y46XtaTtaA2528B.1.1.70.000022
ORF846Y46XtaTtaG328B.1.1.70.000003
ORF846Y46YtaTtaC2525AY.60.001028
ORF846Y46CtAttGt2424AY.260.000679
ORF846Y46FtAttTt2020All0.000004
ORF846Y46delTAT---1919B0.002428
ORF846Y46YtaTtaC1818B.1.20.000158
ORF846Y46YtaTtaC1717B.1.2210.001208
ORF846Y46CtAttGt1616B.10.000147
ORF846Y46YtaTtaC1515AY.430.000066
ORF846Y46YtaTtaC1414AY.40.000022
ORF846Y46HTatCat1414AY.40.000022
ORF846Y46delTAT---1414B.1.160.160.013011
ORF846Y46CtAttGt1414B.1.617.20.000053
ORF846Y46YtaTtaC1414B.1.617.20.000053
ORF846Y46delTAT---1313B.1.1.3180.003923
ORF846Y46YtaTtaC1313B.1.2580.000865
ORF846Y46delTAT---1313P.10.000205
ORF846Y46YtaTtaC1212AY.230.000837
ORF846Y46delTAT---1212AY.270.000777
ORF846Y46delTAT---1212B.10.00011
ORF846Y46YtaTtaC1212B.10.00011
ORF846Y46YtaTtaC1111B.1.1.4020.122222
ORF846Y46delTAT---1111B.1.20.000097
ORF846Y46del2TAt--t1111R.10.00099
ORF846Y46CtAttGt1010B.1.20.000088
ORF846Y46CtAttGt1010B.1.4290.000235
ORF846Y46HTatCat1010B.1.617.20.000038
ORF846Y46del1Tat-at79All0.000001
ORF846Y46del1taTta-29All0
ORF846Y46delTAT---99AY.1180.000564
ORF846Y46delTAT---99AY.250.000054
ORF846Y46delTAT---99AY.260.000255
ORF846Y46YtaTtaC99AY.30.00009
ORF846Y46CtAttGt99AY.30.00009
ORF846Y46del2TAt--t99B.10.000082
ORF846Y46YtaTtaC99B.1.10.000163
ORF846Y46CtAttGt99C.370.001045
ORF846Y46YtaTtaC88AY.1030.00005
ORF846Y46del2TAt--t88AY.40.000012
ORF846Y46CtAttGt88AY.430.000035
ORF846Y46CtAttGt88B.1.10.000145
ORF846Y46delTAT---88B.1.1.2840.000859
ORF846Y46del2TAt--t88B.1.1.70.000007
ORF846Y46HTatCat88B.1.1770.000105
ORF846Y46delTAT---88B.1.2400.001725
ORF846Y46delTAT---88B.1.6280.002819
ORF846Y46StAttCt77All0.000001
ORF846Y46KTaTAaA67All0.000001
ORF846Y46KTaTAaG17All0
ORF846Y46HTatCat77AY.200.000272
ORF846Y46HTatCat77AY.260.000198
ORF846Y46delTAT---77AY.4.20.000152
ORF846Y46HTatCat77AY.430.000031
ORF846Y46delTAT---77B.1.1.2650.022082
ORF846Y46delTAT---77B.1.1.5190.000278
ORF846Y46FtAttTt77B.1.1.70.000006
ORF846Y46delTAT---77B.1.36.160.009972
ORF846Y46delTAT---77P.1.140.000335
ORF846Y46NTatAat66All0.000001
ORF846Y46YtaTtaC66AY.1020.000159
ORF846Y46delTAT---66AY.1190.000212
ORF846Y46delTAT---66AY.320.003195
ORF846Y46delTAT---66AY.350.001398
ORF846Y46YtaTtaC66AY.440.000037
ORF846Y46delTAT---66B.1.177.830.008889
ORF846Y46delTAT---66B.1.243.20.086957
ORF846Y46YtaTtaC66B.1.258.170.000624
ORF846Y46DTatGat55All0.000001
ORF846Y46CtAttGt55AY.200.000194
ORF846Y46HTatCat55AY.290.000079
ORF846Y46YtaTtaC55AY.290.000079
ORF846Y46delTAT---55AY.29.10.001103
ORF846Y46delTAT---55AY.390.000124
ORF846Y46delTAT---55AY.470.000156
ORF846Y46CtAttGt55AY.50.000103
ORF846Y46delTAT---55B.1.1.3890.030303
ORF846Y46delTAT---55B.1.1770.000066
ORF846Y46YtaTtaC55B.1.4270.000252
ORF846Y46HTatCat55B.1.5960.000436
ORF846Y46CtAttGt55P.10.000079
ORF846Y46GTAtGGt44All0.000001
ORF846Y46ETaTGaA44All0.000001
ORF846Y46CtAttGt44AY.270.000259
ORF846Y46delTAT---44AY.340.000388
ORF846Y46YtaTtaC44AY.39.10.000158
ORF846Y46HTatCat44AY.420.000161
ORF846Y46CtAttGt44AY.540.000381
ORF846Y46delTAT---44AY.60.000165
ORF846Y46delTAT---44AY.7.20.002237
ORF846Y46YtaTtaC44AY.9.20.000147
ORF846Y46delTAT---44B.1.1.2140.000222
ORF846Y46YtaTtaC44B.1.1.3170.001647
ORF846Y46delTAT---44B.1.4290.000094
ORF846Y46YtaTtaC44B.1.5250.000453
ORF846Y46delTAT---44B.1.5260.000094
ORF846Y46HTatCat33A.2.50.001497
ORF846Y46QTaTCaG33All0.000001
ORF846Y46CtAttGt33AY.1020.00008
ORF846Y46CtAttGt33AY.1090.002219
ORF846Y46YtaTtaC33AY.1110.000549
ORF846Y46YtaTtaC33AY.1130.000427
ORF846Y46YtaTtaC33AY.250.000018
ORF846Y46HTatCat33AY.250.000018
ORF846Y46YtaTtaC33AY.360.000445
ORF846Y46CtAttGt33AY.39.10.000119
ORF846Y46CtAttGt33AY.4.50.000322
ORF846Y46CtAttGt33AY.450.000365
ORF846Y46delTAT---33AY.50.000062
ORF846Y46HTatCat33AY.610.000314
ORF846Y46CtAttGt33AY.99.20.000276
ORF846Y46YtaTtaC33B0.000383
ORF846Y46KTaTAaA33B.1.10.000054
ORF846Y46delTAT---33B.1.1.3980.009677
ORF846Y46del2TAt--t33B.1.20.000026
ORF846Y46FtAttTt33B.1.20.000026
ORF846Y46delTAT---33B.1.220.003953
ORF846Y46YtaTtaC33B.1.360.000438
ORF846Y46delTAT---33B.1.5090.002597
ORF846Y46YtaTtaC33C.360.002732
ORF846Y46XtaTtaA33P.10.000047
ORF846Y46delTAT---33P.1.10.000953
ORF846Y46delTAT---33P.1.150.000697
ORF846Y46XtaTtaA220.111111
ORF846Y46delTAT---220.111111
ORF846Y46QTaTCaG220.111111
ORF846Y46del2tATt--220.111111
ORF846Y46VTATGTA22All0
ORF846Y46RTAtCGt12All0
ORF846Y46RTATCGC12All0
ORF846Y46delTAT---22AY.1000.000092
ORF846Y46HTatCat22AY.1020.000053
ORF846Y46HTatCat22AY.1030.000012
ORF846Y46del2TAt--t22AY.1030.000012
ORF846Y46delTAT---22AY.1080.002205
ORF846Y46del1Tat-at22AY.1190.000071
ORF846Y46CtAttGt22AY.1190.000071
ORF846Y46CtAttGt22AY.230.000139
ORF846Y46del1Tat-at22AY.30.00002
ORF846Y46HTatCat22AY.30.00002
ORF846Y46CtAttGt22AY.330.000134
ORF846Y46del2TAt--t22AY.390.000049
ORF846Y46HTatCat22AY.4.20.000043
ORF846Y46delTAT---22AY.460.000208
ORF846Y46delTAT---22AY.480.00093
ORF846Y46CtAttGt22AY.75.10.000361
ORF846Y46delTAT---22AY.840.000875
ORF846Y46delTAT---22AY.98.10.000097
ORF846Y46HTatCat22B.1.10.000036
ORF846Y46YtaTtaC22B.1.1.1940.009901
ORF846Y46GTAtGGt22B.1.1.2940.002532
ORF846Y46CtAttGt22B.1.1.3480.001592
ORF846Y46YtaTtaC22B.1.1.5190.000079
ORF846Y46delTAT---22B.1.1260.002551
ORF846Y46VTATGTA22B.1.1600.000062
ORF846Y46YtaTtaC22B.1.1770.000026
ORF846Y46delTAT---22B.1.177.770.001452
ORF846Y46delTAT---22B.1.2060.001631
ORF846Y46delTAT---22B.1.2100.004264
ORF846Y46delTAT---22B.1.258.170.000208
ORF846Y46delTAT---22B.1.360.000292
ORF846Y46delTAT---22B.1.4270.000101
ORF846Y46del2TAt--t22B.1.5950.000522
ORF846Y46CtAttGt22B.1.5960.000174
ORF846Y46FtAttTt22B.1.617.20.000008
ORF846Y46delTAT---22B.400.000729
ORF846Y46DTatGat22P.10.000032
ORF846Y46ETaTGaA22P.10.000032
ORF846Y46delTAT---22P.1.170.000324
ORF846Y46delTAT---22Q.80.00033
ORF846Y46DTatGat11A.2.40.003367
ORF846Y46YtaTtaC11A.2.50.000499
ORF846Y46delTAT---11A.230.010526
ORF846Y46YtaTtaC11AA.70.009174
ORF846Y46delTAT---11AE.40.043478
ORF846Y46CtAttGt11AY.1000.000046
ORF846Y46FtAttTt11AY.1000.000046
ORF846Y46del2TAt--t11AY.1020.000027
ORF846Y46XtaTtaA11AY.1030.000006
ORF846Y46del2TAt--t11AY.1050.000643
ORF846Y46HTatCat11AY.1060.000335
ORF846Y46CtAttGt11AY.1110.000183
ORF846Y46HTatCat11AY.1130.000142
ORF846Y46CtAttGt11AY.1130.000142
ORF846Y46CtAttGt11AY.1160.000287
ORF846Y46YtaTtaC11AY.1160.000287
ORF846Y46YtaTtaC11AY.1170.000085
ORF846Y46YtaTtaC11AY.120.000316
ORF846Y46CtAttGt11AY.1200.000037
ORF846Y46delTAT---11AY.130.000161
ORF846Y46YtaTtaC11AY.130.000161
ORF846Y46delTAT---11AY.140.000088
ORF846Y46HTatCat11AY.160.00038
ORF846Y46YtaTtaC11AY.16.10.00047
ORF846Y46delTAT---11AY.200.000039
ORF846Y46FtAttTt11AY.200.000039
ORF846Y46YtaTtaC11AY.200.000039
ORF846Y46delTAT---11AY.230.00007
ORF846Y46XtaTtaA11AY.23.10.000417
ORF846Y46FtAttTt11AY.250.000006
ORF846Y46YtaTtaC11AY.260.000028
ORF846Y46YtaTtaC11AY.270.000065
ORF846Y46CtAttGt11AY.290.000016
ORF846Y46CtAttGt11AY.320.000532
ORF846Y46HTatCat11AY.330.000067
ORF846Y46YtaTtaC11AY.340.000097
ORF846Y46HTatCat11AY.360.000148
ORF846Y46HTatCat11AY.390.000025
ORF846Y46HTatCat11AY.39.10.00004
ORF846Y46del1Tat-at11AY.40.000002
ORF846Y46FtAttTt11AY.40.000002
ORF846Y46FtAttTt11AY.4.10.000737
ORF846Y46CtAttGt11AY.4.20.000022
ORF846Y46YtaTtaC11AY.4.20.000022
ORF846Y46delTAT---11AY.4.40.000409
ORF846Y46YtaTtaC11AY.4.50.000107
ORF846Y46delTAT---11AY.420.00004
ORF846Y46XtaTtaG11AY.430.000004
ORF846Y46KTaTAaG11AY.430.000004
ORF846Y46FtAttTt11AY.430.000004
ORF846Y46del2TAt--t11AY.440.000006
ORF846Y46HTatCat11AY.440.000006
ORF846Y46delTAT---11AY.450.000122
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