CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF8 : CodonNum = 34

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF834D34DsyngaTgaC12791279127993-27995
ORF834D34deldelGAT---560560127993-27995
ORF834D34GnonsyngAtgGt538538127993-27995
ORF834D34YnonsynGatTat372372127993-27995
ORF834D34EnonsyngaTgaA2452360.96326527993-27995
ORF834D34EnonsyngaTgaG24590.036734727993-27995
ORF834D34VnonsyngAtgTt1351340.99259327993-27995
ORF834D34VnonsyngATgTA13510.0074074127993-27995
ORF834D34NnonsynGatAat121121127993-27995
ORF834D34del2delgATg--35340.97142927993-27995
ORF834D34del2delGAt--t3510.028571427993-27995
ORF834D34AnonsyngAtgCt30290.96666727993-27995
ORF834D34AnonsyngATgCG3010.033333327993-27995
ORF834D34HnonsynGatCat650.83333327993-27995
ORF834D34del1delGat-at630.527993-27995
ORF834D34del1delgaTga-630.527993-27995
ORF834D34HnonsynGaTCaC610.16666727993-27995
ORF834D34KnonsynGaTAaA22127993-27995
ORF834D34XnonsynGaTTaA11127993-27995
ORF834D34RnonsynGAtCGt11127993-27995

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF834D34DgaTgaC12791279All0.000245
ORF834D34delGAT---560560All0.000107
ORF834D34GgAtgGt538538All0.000103
ORF834D34YGatTat372372All0.000071
ORF834D34DgaTgaC335335B.1.1.70.0003
ORF834D34EgaTgaA236245All0.000045
ORF834D34EgaTgaG9245All0.000002
ORF834D34DgaTgaC183183B.1.2390.223443
ORF834D34DgaTgaC171171AY.40.000266
ORF834D34GgAtgGt140140B.1.1.5170.952381
ORF834D34VgAtgTt134135All0.000026
ORF834D34VgATgTA1135All0
ORF834D34NGatAat121121All0.000023
ORF834D34DgaTgaC118118AY.98.10.005715
ORF834D34EgaTgaA116116AY.30.001154
ORF834D34GgAtgGt109109B.1.1.70.000098
ORF834D34YGatTat107107R.10.009631
ORF834D34delGAT---102102B.1.1.70.000091
ORF834D34delGAT---7474AY.40.000115
ORF834D34DgaTgaC6767B.1.617.20.000252
ORF834D34DgaTgaC4848AY.250.000289
ORF834D34YGatTat4848B.1.617.20.000181
ORF834D34DgaTgaC4242AY.300.01662
ORF834D34GgAtgGt3939AY.430.000173
ORF834D34delGAT---3838AY.290.000599
ORF834D34DgaTgaC3636AY.1030.000224
ORF834D34del2gATg--3435All0.000007
ORF834D34del2GAt--t135All0
ORF834D34delGAT---3434B.1.2430.002366
ORF834D34VgAtgTt3333AY.30.000328
ORF834D34delGAT---3333B.1.1.2220.006732
ORF834D34GgAtgGt3232AY.40.00005
ORF834D34del2gATg--3131AY.430.000137
ORF834D34AgAtgCt2930All0.000006
ORF834D34AgATgCG130All0
ORF834D34YGatTat3030B.1.1.70.000027
ORF834D34GgAtgGt2929B.1.617.20.000109
ORF834D34EgaTgaA2828B.1.1.2220.005712
ORF834D34delGAT---2424AY.1030.000149
ORF834D34VgAtgTt2323B.1.1.70.000021
ORF834D34GgAtgGt2323B.1.177.790.053864
ORF834D34delGAT---2222B.1.10.000399
ORF834D34NGatAat2121B.1.1.770.875
ORF834D34DgaTgaC2020AY.440.000122
ORF834D34DgaTgaC1818AY.430.00008
ORF834D34delGAT---1818B0.002301
ORF834D34DgaTgaC1818B.10.000165
ORF834D34DgaTgaC1818B.1.2580.001198
ORF834D34GgAtgGt1818B.1.36.80.018
ORF834D34YGatTat1717AY.230.001186
ORF834D34EgaTgaA1717B.1.20.00015
ORF834D34NGatAat1717B.280.055738
ORF834D34YGatTat1616AY.920.004596
ORF834D34GgAtgGt1616B.1.177.820.007637
ORF834D34NGatAat1414B.10.000128
ORF834D34delGAT---1414B.1.617.20.000053
ORF834D34GgAtgGt1212AY.1030.000075
ORF834D34YGatTat1212AY.40.000019
ORF834D34NGatAat1212AY.40.000019
ORF834D34GgAtgGt1212AY.98.10.000581
ORF834D34EgaTgaA1012B.1.617.20.000038
ORF834D34EgaTgaG212B.1.617.20.000008
ORF834D34delGAT---1111AY.4.20.000239
ORF834D34GgAtgGt1010AY.390.000247
ORF834D34delGAT---1010B.10.000092
ORF834D34YGatTat1010B.1.10.000181
ORF834D34NGatAat1010B.1.1.70.000009
ORF834D34delGAT---1010B.1.1600.000312
ORF834D34VgAtgTt99AY.250.000054
ORF834D34VgAtgTt99AY.460.000937
ORF834D34YGatTat99B.1.1.1760.003954
ORF834D34DgaTgaC88AY.390.000198
ORF834D34EgaTgaA88AY.690.001493
ORF834D34delGAT---88B.1.1.2840.000859
ORF834D34DgaTgaC88B.1.1.5190.000318
ORF834D34EgaTgaA88B.1.1.70.000007
ORF834D34DgaTgaC88B.1.258.40.027586
ORF834D34DgaTgaC88B.1.5260.000188
ORF834D34DgaTgaC88Q.40.003638
ORF834D34YGatTat77AY.1020.000186
ORF834D34EgaTgaG67AY.1170.000507
ORF834D34EgaTgaA17AY.1170.000085
ORF834D34AgAtgCt77AY.390.000173
ORF834D34VgAtgTt77AY.790.008475
ORF834D34YGatTat77B.10.000064
ORF834D34VgAtgTt77B.1.1.250.00398
ORF834D34delGAT---77B.1.1.2650.022082
ORF834D34delGAT---77B.1.36.160.009972
ORF834D34YGatTat77B.1.4000.003003
ORF834D34DgaTgaC77B.1.617.10.000903
ORF834D34DgaTgaC77P.10.00011
ORF834D34delGAT---77P.10.00011
ORF834D34delGAT---77P.1.140.000335
ORF834D34delGAT---660.333333
ORF834D34HGatCat56All0.000001
ORF834D34del1Gat-at36All0.000001
ORF834D34del1gaTga-36All0.000001
ORF834D34HGaTCaC16All0
ORF834D34DgaTgaC66AY.1020.000159
ORF834D34NGatAat66AY.250.000036
ORF834D34delGAT---66AY.29.10.001323
ORF834D34delGAT---66AY.30.00006
ORF834D34GgAtgGt66B.10.000055
ORF834D34GgAtgGt66B.1.10.000109
ORF834D34delGAT---66B.1.20.000053
ORF834D34delGAT---66B.1.243.20.086957
ORF834D34GgAtgGt66B.1.5960.000523
ORF834D34VgAtgTt66B.1.619.10.003849
ORF834D34YGatTat55AY.1180.000313
ORF834D34YGatTat55AY.250.00003
ORF834D34DgaTgaC55AY.30.00005
ORF834D34delGAT---55AY.440.00003
ORF834D34YGatTat55AY.440.00003
ORF834D34GgAtgGt55AY.440.00003
ORF834D34YGatTat55AY.98.10.000242
ORF834D34VgAtgTt55B.1.10.000091
ORF834D34delGAT---55B.1.1.3890.030303
ORF834D34GgAtgGt55B.1.1.5190.000199
ORF834D34AgAtgCt55B.1.177.320.006748
ORF834D34NGatAat55B.1.3510.000149
ORF834D34DgaTgaC55B.1.36.180.002101
ORF834D34YGatTat55B.1.5110.172414
ORF834D34VgAtgTt55B.1.617.20.000019
ORF834D34EgaTgaA55B.40.011038
ORF834D34DgaTgaC44AY.1180.000251
ORF834D34delGAT---44AY.250.000024
ORF834D34GgAtgGt44AY.290.000063
ORF834D34GgAtgGt44AY.30.00004
ORF834D34delGAT---44AY.340.000388
ORF834D34delGAT---44AY.430.000018
ORF834D34delGAT---44AY.50.000083
ORF834D34GgAtgGt44B.1.1.1010.04
ORF834D34DgaTgaC44B.1.1.630.001543
ORF834D34DgaTgaC44B.1.1600.000125
ORF834D34DgaTgaC44B.1.1770.000053
ORF834D34delGAT---44B.1.1770.000053
ORF834D34YGatTat44B.1.177.70.000659
ORF834D34DgaTgaC44C.110.042553
ORF834D34YGatTat44P.1.140.000191
ORF834D34VgAtgTt33AY.1030.000019
ORF834D34YGatTat33AY.1030.000019
ORF834D34YGatTat33AY.1140.000693
ORF834D34GgAtgGt33AY.250.000018
ORF834D34DgaTgaC33AY.260.000085
ORF834D34VgAtgTt33AY.40.000005
ORF834D34DgaTgaC33AY.4.20.000065
ORF834D34DgaTgaC33AY.420.000121
ORF834D34EgaTgaA33AY.450.000365
ORF834D34YGatTat33AY.46.60.000217
ORF834D34DgaTgaC33AY.50.000062
ORF834D34DgaTgaC33AY.60.000123
ORF834D34DgaTgaC33AY.740.000347
ORF834D34DgaTgaC33AY.99.20.000276
ORF834D34AgAtgCt33B.10.000027
ORF834D34DgaTgaC33B.1.10.000054
ORF834D34NGatAat33B.1.10.000054
ORF834D34EgaTgaA33B.1.10.000054
ORF834D34GgAtgGt33B.1.1.1890.004539
ORF834D34delGAT---33B.1.1.2140.000166
ORF834D34DgaTgaC33B.1.1.3930.333333
ORF834D34delGAT---33B.1.1.5190.000119
ORF834D34GgAtgGt33B.1.110.30.002155
ORF834D34GgAtgGt33B.1.1600.000094
ORF834D34DgaTgaC33B.1.20.000026
ORF834D34EgaTgaA33B.1.3690.000856
ORF834D34GgAtgGt33B.1.4160.003807
ORF834D34GgAtgGt33B.1.4270.000151
ORF834D34YGatTat33B.1.4290.000071
ORF834D34GgAtgGt33B.1.4290.000071
ORF834D34delGAT---33B.1.4290.000071
ORF834D34delGAT---33B.1.5090.002597
ORF834D34NGatAat33B.1.5170.001281
ORF834D34GgAtgGt33B.1.5610.001191
ORF834D34delGAT---33P.1.10.000953
ORF834D34KGaTAaA220.111111
ORF834D34NGatAat22A.2.50.000998
ORF834D34KGaTAaA22All0
ORF834D34DgaTgaC22AY.10.000791
ORF834D34HGatCat22AY.1000.000092
ORF834D34DgaTgaC22AY.1000.000092
ORF834D34delGAT---22AY.1000.000092
ORF834D34VgAtgTt22AY.1020.000053
ORF834D34EgaTgaA22AY.1020.000053
ORF834D34NGatAat22AY.1130.000285
ORF834D34delGAT---22AY.1140.000462
ORF834D34DgaTgaC22AY.1170.000169
ORF834D34delGAT---22AY.1180.000125
ORF834D34EgaTgaA22AY.200.000078
ORF834D34AgAtgCt22AY.260.000057
ORF834D34delGAT---22AY.260.000057
ORF834D34DgaTgaC22AY.270.000129
ORF834D34DgaTgaC22AY.290.000032
ORF834D34VgAtgTt22AY.340.000194
ORF834D34GgAtgGt22AY.340.000194
ORF834D34VgAtgTt22AY.350.000466
ORF834D34DgaTgaC22AY.39.10.000079
ORF834D34YGatTat22AY.39.10.000079
ORF834D34EgaTgaA22AY.430.000009
ORF834D34VgAtgTt22AY.430.000009
ORF834D34EgaTgaA22AY.440.000012
ORF834D34DgaTgaC22AY.450.000243
ORF834D34delGAT---22AY.480.00093
ORF834D34YGatTat22AY.50.000041
ORF834D34DgaTgaC22AY.610.00021
ORF834D34GgAtgGt22AY.750.000112
ORF834D34delGAT---22AY.840.000875
ORF834D34VgAtgTt22B.10.000018
ORF834D34EgaTgaG12B.10.000009
ORF834D34EgaTgaA12B.10.000009
ORF834D34EgaTgaA22B.1.1.2160.001781
ORF834D34GgAtgGt22B.1.1.2220.000408
ORF834D34YGatTat22B.1.1.2320.00363
ORF834D34YGatTat22B.1.1.330.000842
ORF834D34DgaTgaC22B.1.1.4160.00181
ORF834D34AgAtgCt22B.1.1.70.000002
ORF834D34VgAtgTt22B.1.1110.00235
ORF834D34delGAT---22B.1.1260.002551
ORF834D34YGatTat22B.1.1770.000026
ORF834D34YGatTat22B.1.177.520.003515
ORF834D34DgaTgaC22B.1.177.810.000379
ORF834D34EgaTgaA22B.1.177.870.001456
ORF834D34NGatAat22B.1.20.000018
ORF834D34GgAtgGt22B.1.20.000018
ORF834D34YGatTat22B.1.20.000018
ORF834D34del1gaTga-12B.1.20.000009
ORF834D34del1Gat-at12B.1.20.000009
ORF834D34VgAtgTt22B.1.2210.000142
ORF834D34YGatTat22B.1.2320.001075
ORF834D34delGAT---22B.1.258.170.000208
ORF834D34GgAtgGt22B.1.258.60.039216
ORF834D34delGAT---22B.1.360.000292
ORF834D34VgAtgTt22B.1.360.000292
ORF834D34DgaTgaC22B.1.36.290.001035
ORF834D34DgaTgaC22B.1.3610.002577
ORF834D34NGatAat22B.1.3750.001639
ORF834D34delGAT---22B.1.4270.000101
ORF834D34VgAtgTt22B.1.4270.000101
ORF834D34DgaTgaC22B.1.438.10.000215
ORF834D34YGatTat22B.1.4990.002101
ORF834D34EgaTgaA22B.1.5110.068966
ORF834D34NGatAat22B.1.5250.000226
ORF834D34AgAtgCt22B.1.5260.000047
ORF834D34GgAtgGt22B.1.5260.000047
ORF834D34NGatAat22B.1.5410.00885
ORF834D34YGatTat22B.1.5640.000852
ORF834D34GgAtgGt22B.1.6090.000959
ORF834D34DgaTgaC22B.1.6100.007092
ORF834D34YGatTat22B.1.617.10.000258
ORF834D34EgaTgaA22B.1.6280.000705
ORF834D34del2gATg--22B.1.6280.000705
ORF834D34GgAtgGt22B.1.6370.000146
ORF834D34delGAT---22B.400.000729
ORF834D34DgaTgaC22C.30.015267
ORF834D34EgaTgaA22C.370.000232
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