CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF8 : CodonNum = 24

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF824S24LnonsyntCatTa1416521416020.99964727963-27965
ORF824S24LnonsyntCAtTG141652380.00026826327963-27965
ORF824S24LnonsynTCaCTa141652120.000084714727963-27965
ORF824S24deldelTCA---526526127963-27965
ORF824S24SsyntcAtcG1921020.5312527963-27965
ORF824S24SsyntcAtcT192680.35416727963-27965
ORF824S24SsyntcAtcC192220.11458327963-27965
ORF824S24PnonsynTcaCca169169127963-27965
ORF824S24AnonsynTcaGca19160.84210527963-27965
ORF824S24AnonsynTcAGcG1920.10526327963-27965
ORF824S24AnonsynTcAGcC1910.052631627963-27965
ORF824S24FnonsyntCAtTT44127963-27965
ORF824S24XnonsyntCatAa44127963-27965
ORF824S24EnonsynTCaGAa420.527963-27965
ORF824S24EnonsynTCAGAG420.527963-27965
ORF824S24TnonsynTcaAca33127963-27965
ORF824S24CnonsyntCAtGT33127963-27965
ORF824S24RnonsynTCaCGa210.527963-27965
ORF824S24RnonsynTCaAGa210.527963-27965
ORF824S24YnonsyntCAtAT11127963-27965
ORF824S24KnonsynTCaAAa11127963-27965
ORF824S24del2delTCa--a11127963-27965

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF824S24LtCatTa141602141652All0.027083
ORF824S24LtCAtTG38141652All0.000007
ORF824S24LTCaCTa12141652All0.000002
ORF824S24LtCatTa109728109767B.1.20.966196
ORF824S24LtCAtTG37109767B.1.20.000326
ORF824S24LTCaCTa2109767B.1.20.000018
ORF824S24LtCatTa99529952B.1.5960.867201
ORF824S24LtCatTa79677974B.10.072974
ORF824S24LTCaCTa77974B.10.000064
ORF824S24LtCatTa36293629B.1.5950.947025
ORF824S24LtCatTa14211421B.1.5770.976632
ORF824S24LtCatTa10801080B.1.5880.982712
ORF824S24LtCatTa10541054B.1.160.160.979554
ORF824S24LtCatTa942942B.1.4260.950555
ORF824S24LtCatTa761761B.1.2650.966963
ORF824S24delTCA---526526All0.000101
ORF824S24LtCatTa519519B.1.5870.98482
ORF824S24LtCatTa361361B.1.3360.880488
ORF824S24LtCatTa300300B.1.4250.898204
ORF824S24LtCatTa288288B.1.5670.96
ORF824S24LtCatTa237237B.1.10.004299
ORF824S24LtCatTa202202B.1.5900.918182
ORF824S24StcAtcG102192All0.00002
ORF824S24StcAtcT68192All0.000013
ORF824S24StcAtcC22192All0.000004
ORF824S24LtCatTa188188B.1.5210.935323
ORF824S24PTcaCca169169All0.000032
ORF824S24LtCatTa167167B.1.3010.988166
ORF824S24LtCatTa148148B.1.595.10.865497
ORF824S24LtCatTa146146B.1.1600.004553
ORF824S24LtCatTa137137B.1.595.41
ORF824S24LtCatTa129129B.1.5890.977273
ORF824S24LtCatTa120120B.1.3700.96
ORF824S24LtCatTa117117B.1.4240.943548
ORF824S24LtCatTa114114AB.10.934426
ORF824S24LtCatTa9898B.1.4231
ORF824S24LtCatTa9393B.1.5910.989362
ORF824S24LtCatTa8888B.1.4351
ORF824S24LtCatTa8787B.1.5930.945652
ORF824S24delTCA---8686B.1.1.70.000077
ORF824S24LtCatTa7878B.1.4500.886364
ORF824S24LtCatTa7373B.4.50.869048
ORF824S24LtCatTa7070B.1.2430.004871
ORF824S24delTCA---6868AY.40.000106
ORF824S24LtCatTa6363B.1.2840.828947
ORF824S24LtCatTa5353B.1.177.730.030011
ORF824S24LtCatTa4444B.1.2340.005806
ORF824S24LtCatTa4142B.1.1.70.000037
ORF824S24LtCAtTG142B.1.1.70.000001
ORF824S24LtCatTa4141B.1.4290.000965
ORF824S24LtCatTa4141B.1.5660.788462
ORF824S24LtCatTa4040B.1.177.120.006068
ORF824S24delTCA---3939AY.290.000615
ORF824S24LtCatTa3838B.1.595.31
ORF824S24LtCatTa3636B.1.438.10.003861
ORF824S24delTCA---3434B.1.2430.002366
ORF824S24LtCatTa3434B.1.5260.000799
ORF824S24delTCA---3333B.1.1.2220.006732
ORF824S24LtCatTa3333B.1.5800.134146
ORF824S24PTcaCca3232B.1.6210.002833
ORF824S24LtCatTa3030B.1.2210.002131
ORF824S24LtCatTa3030B.1.5940.9375
ORF824S24LtCatTa2626B.1.588.11
ORF824S24LtCatTa2525B.1.5921
ORF824S24PTcaCca2424B.1.1.70.000021
ORF824S24delTCA---2222B.1.10.000399
ORF824S24LtCatTa2222B.1.1.3350.285714
ORF824S24LtCatTa2222B.1.177.440.011417
ORF824S24LtCatTa2222B.1.3690.006275
ORF824S24LtCatTa2222B.1.5760.019946
ORF824S24LtCatTa2121B0.002684
ORF824S24delTCA---2121B.10.000192
ORF824S24LtCatTa2121B.1.1.2220.004284
ORF824S24StcAtcT2020AE.40.869565
ORF824S24LtCatTa2020B.1.3960.014114
ORF824S24ATcaGca1619All0.000003
ORF824S24ATcAGcG219All0
ORF824S24ATcAGcC119All0
ORF824S24LtCatTa1919AY.440.000116
ORF824S24delTCA---1818B0.002301
ORF824S24LtCatTa1818B.1.595.20.72
ORF824S24LtCatTa1717B.1.3110.004668
ORF824S24LtCatTa1717B.1.3610.021907
ORF824S24LtCatTa1515AY.30.000149
ORF824S24PTcaCca1515B.1.10.000272
ORF824S24LtCatTa1415B.1.2060.011419
ORF824S24LTCaCTa115B.1.2060.000816
ORF824S24delTCA---1414AY.480.006512
ORF824S24LtCatTa1414B.1.1.5190.000556
ORF824S24LtCatTa1414B.1.3670.011094
ORF824S24PTcaCca1313AY.250.000078
ORF824S24PTcaCca1313B.1.2060.010604
ORF824S24LtCatTa1313B.1.4270.000656
ORF824S24LtCatTa1212B.1.1770.000158
ORF824S24StcAtcT712B.1.2580.000466
ORF824S24StcAtcC512B.1.2580.000333
ORF824S24StcAtcG1212B.1.258.160.01964
ORF824S24LtCatTa1212B.1.5640.005111
ORF824S24LtCatTa1212B.1.617.20.000045
ORF824S24StcAtcG1111B.1.10.0002
ORF824S24LtCatTa1111B.1.5820.005397
ORF824S24LtCatTa1010AY.40.000016
ORF824S24StcAtcG1010AY.4.20.000217
ORF824S24StcAtcG710B.1.1.70.000006
ORF824S24StcAtcC210B.1.1.70.000002
ORF824S24StcAtcT110B.1.1.70.000001
ORF824S24LtCatTa1010B.1.3750.008197
ORF824S24LtCatTa1010B.1.621.10.005058
ORF824S24StcAtcT49AY.440.000024
ORF824S24StcAtcG39AY.440.000018
ORF824S24StcAtcC29AY.440.000012
ORF824S24PTcaCca99B.10.000082
ORF824S24LtCatTa99B.1.1.2650.028391
ORF824S24delTCA---99B.1.1600.000281
ORF824S24PTcaCca99B.1.177.860.001651
ORF824S24PTcaCca99B.1.617.20.000034
ORF824S24StcAtcG68AY.30.00006
ORF824S24StcAtcT28AY.30.00002
ORF824S24StcAtcG68AY.40.000009
ORF824S24StcAtcT28AY.40.000003
ORF824S24LtCatTa88B.1.1.5070.069565
ORF824S24LtCatTa88B.1.1260.010204
ORF824S24delTCA---88B.1.1770.000105
ORF824S24delTCA---88B.1.20.00007
ORF824S24LtCatTa88B.1.3620.012327
ORF824S24LtCatTa88B.1.5170.003416
ORF824S24LtCatTa77AY.1030.000043
ORF824S24delTCA---77AY.30.00007
ORF824S24delTCA---77AY.440.000043
ORF824S24delTCA---77B.1.1.2650.022082
ORF824S24LtCatTa77B.1.3490.005004
ORF824S24delTCA---77B.1.36.160.009972
ORF824S24delTCA---77B.1.617.20.000026
ORF824S24delTCA---77P.10.00011
ORF824S24delTCA---77P.1.140.000335
ORF824S24delTCA---66AY.29.10.001323
ORF824S24delTCA---66AY.3.10.000512
ORF824S24LtCatTa66B.1.160.140.012712
ORF824S24LtCatTa66B.1.2400.001293
ORF824S24delTCA---66B.1.243.20.086957
ORF824S24ATcaGca350.166667
ORF824S24ATcAGcG250.111111
ORF824S24StcAtcG35AY.1030.000019
ORF824S24StcAtcT25AY.1030.000012
ORF824S24StcAtcC45AY.250.000024
ORF824S24StcAtcG15AY.250.000006
ORF824S24StcAtcG35B.10.000027
ORF824S24StcAtcT15B.10.000009
ORF824S24StcAtcC15B.10.000009
ORF824S24LtCatTa55B.1.1.280.001556
ORF824S24PTcaCca55B.1.1600.000156
ORF824S24StcAtcT55B.1.2370.024876
ORF824S24LtCatTa55B.1.2640.061728
ORF824S24LtCatTa55B.1.3020.066667
ORF824S24LtCatTa55B.1.6120.013263
ORF824S24LtCatTa55P.10.000079
ORF824S24FtCAtTT440.222222
ORF824S24ETCaGAa240.111111
ORF824S24ETCAGAG240.111111
ORF824S24StcAtcG44A.2.5.30.041237
ORF824S24FtCAtTT44All0.000001
ORF824S24XtCatAa44All0.000001
ORF824S24ETCAGAG24All0
ORF824S24ETCaGAa24All0
ORF824S24PTcaCca44AY.1210.000541
ORF824S24LtCatTa44AY.330.000267
ORF824S24delTCA---44AY.340.000388
ORF824S24PTcaCca44AY.50.000083
ORF824S24StcAtcG44AY.750.000224
ORF824S24StcAtcG44B.1.1.3170.001647
ORF824S24delTCA---44B.1.1.5190.000159
ORF824S24LtCatTa44B.1.1390.002933
ORF824S24StcAtcG44B.1.177.730.002265
ORF824S24LtCatTa44B.1.3240.006421
ORF824S24LtCatTa44B.1.3300.114286
ORF824S24LtCatTa44B.1.4460.08
ORF824S24delTCA---44B.1.5260.000094
ORF824S24LtCatTa44B.1.6060.024096
ORF824S24StcAtcG34B.1.617.20.000011
ORF824S24StcAtcT14B.1.617.20.000004
ORF824S24LtCatTa44B.1.6210.000354
ORF824S24LtCatTa44B.1.780.034188
ORF824S24LtCatTa44P.1.170.000647
ORF824S24PTcaCca44Q.10.000505
ORF824S24TTcaAca33All0.000001
ORF824S24CtCAtGT33All0.000001
ORF824S24LtCatTa33AY.250.000018
ORF824S24PTcaCca33AY.40.000005
ORF824S24delTCA---33AY.4.20.000065
ORF824S24delTCA---33AY.430.000013
ORF824S24LtCatTa33AY.430.000013
ORF824S24StcAtcC23AY.60.000082
ORF824S24StcAtcG13AY.60.000041
ORF824S24delTCA---33AY.98.10.000145
ORF824S24LtCatTa33B.1.1.5260.010638
ORF824S24PTcaCca33B.1.1770.00004
ORF824S24LtCatTa33B.1.177.520.005272
ORF824S24LtCatTa33B.1.2100.006397
ORF824S24LtCatTa33B.1.2140.010989
ORF824S24LtCatTa33B.1.2580.0002
ORF824S24LtCatTa33B.1.2600.010033
ORF824S24LtCatTa33B.1.2980.006342
ORF824S24LtCatTa33B.1.3380.025862
ORF824S24LtCatTa33B.1.3540.130435
ORF824S24LtCatTa33B.1.4000.001287
ORF824S24LtCatTa33B.1.4130.012766
ORF824S24delTCA---33B.1.4290.000071
ORF824S24delTCA---33B.1.5090.002597
ORF824S24LtCatTa33B.1.5500.041096
ORF824S24LtCatTa33B.1.88.10.014423
ORF824S24LtCatTa33B.1.9.50.017045
ORF824S24delTCA---33P.1.10.000953
ORF824S24LtCatTa33P.1.120.001452
ORF824S24LtCatTa33R.10.00027
ORF824S24CtCAtGT220.111111
ORF824S24delTCA---220.111111
ORF824S24LtCatTa22A.10.000564
ORF824S24delTCA---22A.2.20.003378
ORF824S24PTcaCca22A.2.40.006734
ORF824S24LTCaCTa12A.2.40.003367
ORF824S24LtCatTa12A.2.40.003367
ORF824S24LtCatTa22A.210.00554
ORF824S24LtCatTa22A.30.004193
ORF824S24RTCaAGa12All0
ORF824S24RTCaCGa12All0
ORF824S24delTCA---22AY.1140.000462
ORF824S24delTCA---22AY.1180.000125
ORF824S24delTCA---22AY.250.000012
ORF824S24delTCA---22AY.260.000057
ORF824S24StcAtcT22AY.290.000032
ORF824S24delTCA---22AY.370.000632
ORF824S24LtCatTa22AY.420.00008
ORF824S24delTCA---22AY.470.000062
ORF824S24delTCA---22AY.840.000875
ORF824S24LtCatTa22B.1.1.1610.007067
ORF824S24LtCatTa22B.1.1.2100.011429
ORF824S24delTCA---22B.1.1.2140.000111
ORF824S24LtCatTa22B.1.1.2200.003717
ORF824S24LtCatTa22B.1.1.2510.015873
ORF824S24LtCatTa22B.1.1.390.001019
ORF824S24LtCatTa22B.1.1.4160.00181
ORF824S24LtCatTa22B.1.1.500.001358
ORF824S24ATcaGca22B.1.1.70.000002
ORF824S24delTCA---22B.1.1.700.000682
ORF824S24LtCatTa22B.1.1040.00738
ORF824S24LtCatTa22B.1.1100.00905
ORF824S24LtCatTa22B.1.1110.00235
ORF824S24delTCA---22B.1.1260.002551
ORF824S24LtCatTa22B.1.1570.00597
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ORF824S24StcAtcG22B.1.177.210.000153
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