CoV-GLUE | Mutations | Mutation
Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):
ORF | CodonNum | Mut | ORF1abMut | MutType | RefCodon | MutCodon | AACount | CodonCount | CodonProp | Genome Position |
ORF8 | 18 | Q18X | nonsyn | Caa | Taa | 7565 | 7561 | 0.999471 | 27945-27947 | |
ORF8 | 18 | Q18X | nonsyn | CAa | TGa | 7565 | 3 | 0.000396563 | 27945-27947 | |
ORF8 | 18 | Q18X | nonsyn | CaA | TaG | 7565 | 1 | 0.000132188 | 27945-27947 | |
ORF8 | 18 | Q18del | del | CAA | --- | 1945 | 1945 | 1 | 27945-27947 | |
ORF8 | 18 | Q18H | nonsyn | caA | caT | 581 | 533 | 0.917384 | 27945-27947 | |
ORF8 | 18 | Q18H | nonsyn | caA | caC | 581 | 48 | 0.0826162 | 27945-27947 | |
ORF8 | 18 | Q18K | nonsyn | Caa | Aaa | 476 | 475 | 0.997899 | 27945-27947 | |
ORF8 | 18 | Q18K | nonsyn | CaA | AaG | 476 | 1 | 0.00210084 | 27945-27947 | |
ORF8 | 18 | Q18Q | syn | caA | caG | 216 | 216 | 1 | 27945-27947 | |
ORF8 | 18 | Q18R | nonsyn | cAa | cGa | 145 | 144 | 0.993103 | 27945-27947 | |
ORF8 | 18 | Q18R | nonsyn | cAA | cGG | 145 | 1 | 0.00689655 | 27945-27947 | |
ORF8 | 18 | Q18L | nonsyn | cAa | cTa | 84 | 82 | 0.97619 | 27945-27947 | |
ORF8 | 18 | Q18L | nonsyn | cAA | cTC | 84 | 2 | 0.0238095 | 27945-27947 | |
ORF8 | 18 | Q18E | nonsyn | Caa | Gaa | 58 | 58 | 1 | 27945-27947 | |
ORF8 | 18 | Q18P | nonsyn | cAa | cCa | 16 | 10 | 0.625 | 27945-27947 | |
ORF8 | 18 | Q18P | nonsyn | cAA | cCT | 16 | 4 | 0.25 | 27945-27947 | |
ORF8 | 18 | Q18P | nonsyn | cAA | cCC | 16 | 1 | 0.0625 | 27945-27947 | |
ORF8 | 18 | Q18P | nonsyn | cAA | cCG | 16 | 1 | 0.0625 | 27945-27947 | |
ORF8 | 18 | Q18del1 | del | Caa | -aa | 10 | 7 | 0.7 | 27945-27947 | |
ORF8 | 18 | Q18del1 | del | cAa | c-a | 10 | 2 | 0.2 | 27945-27947 | |
ORF8 | 18 | Q18del1 | del | caA | ca- | 10 | 1 | 0.1 | 27945-27947 | |
ORF8 | 18 | Q18V | nonsyn | CAA | GTT | 4 | 4 | 1 | 27945-27947 | |
ORF8 | 18 | Q18D | nonsyn | CaA | GaT | 4 | 3 | 0.75 | 27945-27947 | |
ORF8 | 18 | Q18D | nonsyn | CaA | GaC | 4 | 1 | 0.25 | 27945-27947 | |
ORF8 | 18 | Q18S | nonsyn | CAA | AGT | 3 | 2 | 0.666667 | 27945-27947 | |
ORF8 | 18 | Q18S | nonsyn | CAA | AGC | 3 | 1 | 0.333333 | 27945-27947 | |
ORF8 | 18 | Q18N | nonsyn | CaA | AaT | 2 | 2 | 1 | 27945-27947 | |
ORF8 | 18 | Q18I | nonsyn | CAA | ATT | 2 | 2 | 1 | 27945-27947 | |
ORF8 | 18 | Q18G | nonsyn | CAA | GGT | 2 | 2 | 1 | 27945-27947 | |
ORF8 | 18 | Q18Y | nonsyn | CaA | TaT | 2 | 2 | 1 | 27945-27947 | |
ORF8 | 18 | Q18C | nonsyn | CAA | TGT | 2 | 2 | 1 | 27945-27947 | |
ORF8 | 18 | Q18F | nonsyn | CAA | TTT | 2 | 2 | 1 | 27945-27947 | |
ORF8 | 18 | Q18del2 | del | CAa | --a | 1 | 1 | 1 | 27945-27947 |
Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):
ORF | CodonNum | Mut | RefCodon | MutCodon | CodonCount | AACount | Lineage | LineageCodonProp |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 7561 | 7565 | All | 0.001446 |
ORF8 | 18 | Q18X | CAa | TGa | 3 | 7565 | All | 0.000001 |
ORF8 | 18 | Q18X | CaA | TaG | 1 | 7565 | All | 0 |
ORF8 | 18 | Q18del | CAA | --- | 1945 | 1945 | All | 0.000372 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1843 | 1843 | B.1.1.7 | 0.00165 |
ORF8 | 18 | Q18del | CAA | --- | 1308 | 1308 | B.1.623 | 0.701717 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 980 | 980 | AY.4 | 0.001525 |
ORF8 | 18 | Q18H | caA | caT | 533 | 581 | All | 0.000102 |
ORF8 | 18 | Q18H | caA | caC | 48 | 581 | All | 0.000009 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 508 | 508 | B.1.1.198 | 0.745962 |
ORF8 | 18 | Q18H | caA | caT | 476 | 483 | B.1.1.7 | 0.000426 |
ORF8 | 18 | Q18H | caA | caC | 7 | 483 | B.1.1.7 | 0.000006 |
ORF8 | 18 | Q18K | Caa | Aaa | 475 | 476 | All | 0.000091 |
ORF8 | 18 | Q18K | CaA | AaG | 1 | 476 | All | 0 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 340 | 340 | AY.44 | 0.002069 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 329 | 329 | AY.43 | 0.001458 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 255 | 255 | B.1.177 | 0.003358 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 245 | 245 | B.1.617.2 | 0.000923 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 219 | 219 | B.1.2 | 0.001928 |
ORF8 | 18 | Q18Q | caA | caG | 216 | 216 | All | 0.000041 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 195 | 195 | B.1.411 | 0.722222 |
ORF8 | 18 | Q18K | Caa | Aaa | 174 | 174 | AY.3 | 0.001731 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 152 | 152 | AY.103 | 0.000944 |
ORF8 | 18 | Q18R | cAa | cGa | 144 | 145 | All | 0.000028 |
ORF8 | 18 | Q18R | cAA | cGG | 1 | 145 | All | 0 |
ORF8 | 18 | Q18K | Caa | Aaa | 141 | 141 | B.1.160 | 0.004397 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 130 | 130 | B.1 | 0.001191 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 126 | 126 | AY.25 | 0.000758 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 124 | 124 | B.1.1 | 0.002249 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 108 | 108 | AY.3 | 0.001074 |
ORF8 | 18 | Q18del | CAA | --- | 98 | 98 | B.1.1.7 | 0.000088 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 88 | 88 | P.1 | 0.001386 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 87 | 87 | B.1.595 | 0.022704 |
ORF8 | 18 | Q18L | cAa | cTa | 82 | 84 | All | 0.000016 |
ORF8 | 18 | Q18L | cAA | cTC | 2 | 84 | All | 0 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 76 | 76 | C.1.2 | 0.323404 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 75 | 75 | B.1.160 | 0.002339 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 71 | 71 | AY.33 | 0.004741 |
ORF8 | 18 | Q18del | CAA | --- | 69 | 69 | AY.4 | 0.000107 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 65 | 65 | B.1.526 | 0.001528 |
ORF8 | 18 | Q18E | Caa | Gaa | 58 | 58 | All | 0.000011 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 54 | 54 | B.1.617.1 | 0.006964 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 53 | 53 | B.1.429 | 0.001247 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 47 | 47 | AY.99.2 | 0.004331 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 47 | 47 | B.1.1.519 | 0.001866 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 47 | 47 | B.1.177.35 | 0.032481 |
ORF8 | 18 | Q18del | CAA | --- | 47 | 47 | B.1.243 | 0.00327 |
ORF8 | 18 | Q18R | cAa | cGa | 40 | 40 | B.1.177 | 0.000527 |
ORF8 | 18 | Q18del | CAA | --- | 39 | 39 | AY.29 | 0.000615 |
ORF8 | 18 | Q18R | cAa | cGa | 39 | 39 | B.1.1.7 | 0.000035 |
ORF8 | 18 | Q18Q | caA | caG | 38 | 38 | AY.74 | 0.004395 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 37 | 37 | B.1.258 | 0.002462 |
ORF8 | 18 | Q18Q | caA | caG | 34 | 34 | B.1.1.7 | 0.00003 |
ORF8 | 18 | Q18Q | caA | caG | 34 | 34 | B.1.177 | 0.000448 |
ORF8 | 18 | Q18del | CAA | --- | 33 | 33 | B.1.1.222 | 0.006732 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 31 | 31 | B.1.1.192 | 0.071594 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 31 | 31 | B.1.36 | 0.004523 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 30 | 30 | B.1.146 | 0.127119 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 30 | 30 | B.1.351 | 0.000892 |
ORF8 | 18 | Q18K | Caa | Aaa | 28 | 28 | AY.100 | 0.001288 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 28 | 28 | AY.118 | 0.001754 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 28 | 28 | B.1.240 | 0.006036 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 25 | 25 | B.1.621 | 0.002213 |
ORF8 | 18 | Q18del | CAA | --- | 24 | 24 | B.1 | 0.00022 |
ORF8 | 18 | Q18del | CAA | --- | 23 | 23 | B.1.1 | 0.000417 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 23 | 23 | B.1.1.526 | 0.08156 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 23 | 23 | B.1.221 | 0.001634 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 22 | 22 | AY.39 | 0.000544 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 22 | 22 | B.1.177.4 | 0.004643 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 22 | 22 | B.1.356 | 0.037997 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 21 | 21 | AY.100 | 0.000966 |
ORF8 | 18 | Q18K | Caa | Aaa | 21 | 21 | B.1.617.2 | 0.000079 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 20 | 20 | AY.102 | 0.00053 |
ORF8 | 18 | Q18K | Caa | Aaa | 20 | 20 | AY.4 | 0.000031 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 20 | 20 | AY.98 | 0.00158 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 19 | 19 | A.2.5 | 0.009481 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 19 | 19 | B.1.1.222 | 0.003876 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 19 | 19 | B.1.1.241 | 0.039337 |
ORF8 | 18 | Q18del | CAA | --- | 18 | 18 | B | 0.002301 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 18 | 18 | P.1.14 | 0.00086 |
ORF8 | 18 | Q18P | cAa | cCa | 10 | 16 | All | 0.000002 |
ORF8 | 18 | Q18P | cAA | cCT | 4 | 16 | All | 0.000001 |
ORF8 | 18 | Q18P | cAA | cCG | 1 | 16 | All | 0 |
ORF8 | 18 | Q18P | cAA | cCC | 1 | 16 | All | 0 |
ORF8 | 18 | Q18K | Caa | Aaa | 16 | 16 | AY.61 | 0.001676 |
ORF8 | 18 | Q18Q | caA | caG | 16 | 16 | B.1.1.216 | 0.014248 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 16 | 16 | B.1.525 | 0.001811 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 16 | 16 | P.2 | 0.002986 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 15 | 15 | AY.46.6 | 0.001083 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 15 | 15 | AY.98.1 | 0.000726 |
ORF8 | 18 | Q18L | cAa | cTa | 15 | 15 | B.1.1.7 | 0.000013 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 15 | 15 | B.1.177.81 | 0.00284 |
ORF8 | 18 | Q18R | cAa | cGa | 15 | 15 | B.1.2 | 0.000132 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 15 | 15 | B.1.243 | 0.001044 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 15 | 15 | C.37 | 0.001741 |
ORF8 | 18 | Q18del | CAA | --- | 14 | 14 | AY.48 | 0.006512 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 13 | 13 | B.1.177.17 | 0.010673 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 13 | 13 | B.1.480 | 0.032338 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 12 | 12 | AY.116.1 | 0.003737 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 12 | 12 | AY.42 | 0.000483 |
ORF8 | 18 | Q18del | CAA | --- | 12 | 12 | AZ.5 | 0.042105 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 12 | 12 | B.1.1.291 | 0.008909 |
ORF8 | 18 | Q18E | Caa | Gaa | 12 | 12 | B.1.1.406 | 0.077922 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 12 | 12 | B.1.177.79 | 0.028103 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 12 | 12 | B.1.427 | 0.000606 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 11 | 11 | AY.113 | 0.001566 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 11 | 11 | AY.119 | 0.000388 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 11 | 11 | AY.13 | 0.001771 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 11 | 11 | AY.29 | 0.000174 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 11 | 11 | AY.39.1 | 0.000436 |
ORF8 | 18 | Q18del | CAA | --- | 11 | 11 | AY.46 | 0.001145 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 11 | 11 | AY.74 | 0.001272 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 11 | 11 | B.1.619.1 | 0.007056 |
ORF8 | 18 | Q18del1 | Caa | -aa | 7 | 10 | All | 0.000001 |
ORF8 | 18 | Q18del1 | cAa | c-a | 2 | 10 | All | 0 |
ORF8 | 18 | Q18del1 | caA | ca- | 1 | 10 | All | 0 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 10 | 10 | AP.1 | 0.015015 |
ORF8 | 18 | Q18H | caA | caT | 9 | 10 | AY.3 | 0.00009 |
ORF8 | 18 | Q18H | caA | caC | 1 | 10 | AY.3 | 0.00001 |
ORF8 | 18 | Q18L | cAa | cTa | 10 | 10 | AY.4 | 0.000016 |
ORF8 | 18 | Q18H | caA | caT | 7 | 10 | AY.43 | 0.000031 |
ORF8 | 18 | Q18H | caA | caC | 3 | 10 | AY.43 | 0.000013 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 10 | 10 | B.1.1.524 | 0.208333 |
ORF8 | 18 | Q18E | Caa | Gaa | 10 | 10 | B.1.1.7 | 0.000009 |
ORF8 | 18 | Q18Q | caA | caG | 10 | 10 | B.1.429 | 0.000235 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 10 | 10 | C.36.3.1 | 0.027174 |
ORF8 | 18 | Q18del | CAA | --- | 9 | 9 | AD.1 | 0.037037 |
ORF8 | 18 | Q18del | CAA | --- | 9 | 9 | B.1.1.318 | 0.002716 |
ORF8 | 18 | Q18del | CAA | --- | 9 | 9 | B.1.160 | 0.000281 |
ORF8 | 18 | Q18del | CAA | --- | 9 | 9 | B.1.177 | 0.000119 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 9 | 9 | B.1.36.29 | 0.004656 |
ORF8 | 18 | Q18R | cAa | cGa | 8 | 8 | AY.4 | 0.000012 |
ORF8 | 18 | Q18L | cAa | cTa | 8 | 8 | AY.43 | 0.000035 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 8 | 8 | AY.5 | 0.000165 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 8 | 8 | AY.62 | 0.003486 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 8 | 8 | AY.75 | 0.000448 |
ORF8 | 18 | Q18del | CAA | --- | 8 | 8 | B.1.2 | 0.00007 |
ORF8 | 18 | Q18R | cAa | cGa | 8 | 8 | B.1.429 | 0.000188 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 8 | 8 | B.1.438.1 | 0.000858 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 8 | 8 | B.1.575 | 0.002427 |
ORF8 | 18 | Q18H | caA | caT | 6 | 8 | B.1.617.2 | 0.000023 |
ORF8 | 18 | Q18H | caA | caC | 2 | 8 | B.1.617.2 | 0.000008 |
ORF8 | 18 | Q18Q | caA | caG | 7 | 7 | AY.102 | 0.000186 |
ORF8 | 18 | Q18Q | caA | caG | 7 | 7 | AY.120.1 | 0.002247 |
ORF8 | 18 | Q18H | caA | caC | 7 | 7 | AY.121 | 0.000947 |
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ORF8 | 18 | Q18I | CAA | ATT | 2 | 2 | All | 0 |
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ORF8 | 18 | Q18del1 | cAa | c-a | 1 | 1 | B.1.1.318 | 0.000302 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.1.33 | 0.000421 |
ORF8 | 18 | Q18E | Caa | Gaa | 1 | 1 | B.1.1.354 | 0.004386 |
ORF8 | 18 | Q18del | CAA | --- | 1 | 1 | B.1.1.354 | 0.004386 |
ORF8 | 18 | Q18Q | caA | caG | 1 | 1 | B.1.1.368 | 0.003086 |
ORF8 | 18 | Q18del | CAA | --- | 1 | 1 | B.1.1.39 | 0.00051 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.1.39 | 0.00051 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.1.398 | 0.003226 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.1.400 | 0.05 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.1.406 | 0.006494 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.1.409 | 0.002833 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.1.419 | 0.007407 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.1.420 | 0.001006 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.1.432 | 0.001266 |
ORF8 | 18 | Q18Q | caA | caG | 1 | 1 | B.1.1.432 | 0.001266 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.1.433 | 0.001425 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.1.448 | 0.002033 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.1.456 | 0.055556 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.1.46 | 0.004367 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.1.50 | 0.000679 |
ORF8 | 18 | Q18del | CAA | --- | 1 | 1 | B.1.1.50 | 0.000679 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.1.51 | 0.001718 |
ORF8 | 18 | Q18K | Caa | Aaa | 1 | 1 | B.1.1.519 | 0.00004 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.1.521 | 0.005348 |
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ORF8 | 18 | Q18H | caA | caC | 1 | 1 | B.1.110.3 | 0.000718 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.110.3 | 0.000718 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.149 | 0.003425 |
ORF8 | 18 | Q18H | caA | caC | 1 | 1 | B.1.160 | 0.000031 |
ORF8 | 18 | Q18H | caA | caT | 1 | 1 | B.1.177 | 0.000013 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.177.15 | 0.000631 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.177.2 | 0.004545 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.177.44 | 0.000519 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.177.56 | 0.000668 |
ORF8 | 18 | Q18P | cAa | cCa | 1 | 1 | B.1.177.56 | 0.000668 |
ORF8 | 18 | Q18E | Caa | Gaa | 1 | 1 | B.1.177.60 | 0.000218 |
ORF8 | 18 | Q18R | cAa | cGa | 1 | 1 | B.1.177.63 | 0.002703 |
ORF8 | 18 | Q18del | CAA | --- | 1 | 1 | B.1.177.7 | 0.000165 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.177.7 | 0.000165 |
ORF8 | 18 | Q18del | CAA | --- | 1 | 1 | B.1.177.83 | 0.001481 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.177.88 | 0.012346 |
ORF8 | 18 | Q18del | CAA | --- | 1 | 1 | B.1.195 | 0.005025 |
ORF8 | 18 | Q18Q | caA | caG | 1 | 1 | B.1.2 | 0.000009 |
ORF8 | 18 | Q18K | Caa | Aaa | 1 | 1 | B.1.2 | 0.000009 |
ORF8 | 18 | Q18del | CAA | --- | 1 | 1 | B.1.210 | 0.002132 |
ORF8 | 18 | Q18del | CAA | --- | 1 | 1 | B.1.258.12 | 0.007874 |
ORF8 | 18 | Q18del | CAA | --- | 1 | 1 | B.1.258.17 | 0.000104 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.260 | 0.003344 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.270 | 0.005618 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.284 | 0.013158 |
ORF8 | 18 | Q18del1 | Caa | -aa | 1 | 1 | B.1.306 | 0.005714 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.311 | 0.000275 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.320 | 0.001245 |
ORF8 | 18 | Q18del2 | CAa | --a | 1 | 1 | B.1.324 | 0.001605 |
ORF8 | 18 | Q18del1 | Caa | -aa | 1 | 1 | B.1.324 | 0.001605 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.324 | 0.001605 |
ORF8 | 18 | Q18E | Caa | Gaa | 1 | 1 | B.1.341 | 0.022727 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.343 | 0.020833 |
ORF8 | 18 | Q18del | CAA | --- | 1 | 1 | B.1.351 | 0.00003 |
ORF8 | 18 | Q18Q | caA | caG | 1 | 1 | B.1.351 | 0.00003 |
ORF8 | 18 | Q18del | CAA | --- | 1 | 1 | B.1.351.2 | 0.000303 |
ORF8 | 18 | Q18E | Caa | Gaa | 1 | 1 | B.1.36 | 0.000146 |
ORF8 | 18 | Q18K | Caa | Aaa | 1 | 1 | B.1.36 | 0.000146 |
ORF8 | 18 | Q18Q | caA | caG | 1 | 1 | B.1.36.29 | 0.000517 |
ORF8 | 18 | Q18del | CAA | --- | 1 | 1 | B.1.36.29 | 0.000517 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.36.31 | 0.001751 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.36.36 | 0.000602 |
ORF8 | 18 | Q18K | Caa | Aaa | 1 | 1 | B.1.362 | 0.001541 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.367 | 0.000792 |
ORF8 | 18 | Q18Q | caA | caG | 1 | 1 | B.1.367 | 0.000792 |
ORF8 | 18 | Q18del1 | caA | ca- | 1 | 1 | B.1.369 | 0.000285 |
ORF8 | 18 | Q18E | Caa | Gaa | 1 | 1 | B.1.377 | 0.004566 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.400 | 0.000429 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.402 | 0.009804 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.403 | 0.003268 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.428.3 | 0.012821 |
ORF8 | 18 | Q18del1 | cAa | c-a | 1 | 1 | B.1.429 | 0.000024 |
ORF8 | 18 | Q18H | caA | caT | 1 | 1 | B.1.438.1 | 0.000107 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.446 | 0.02 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.450 | 0.011364 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.459 | 0.004082 |
ORF8 | 18 | Q18del | CAA | --- | 1 | 1 | B.1.468 | 0.005714 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.470 | 0.001404 |
ORF8 | 18 | Q18Q | caA | caG | 1 | 1 | B.1.497 | 0.000315 |
ORF8 | 18 | Q18P | cAa | cCa | 1 | 1 | B.1.497 | 0.000315 |
ORF8 | 18 | Q18E | Caa | Gaa | 1 | 1 | B.1.503 | 0.002488 |
ORF8 | 18 | Q18del | CAA | --- | 1 | 1 | B.1.506 | 0.02381 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.517 | 0.000427 |
ORF8 | 18 | Q18L | cAa | cTa | 1 | 1 | B.1.524 | 0.001406 |
ORF8 | 18 | Q18H | caA | caT | 1 | 1 | B.1.525 | 0.000113 |
ORF8 | 18 | Q18del1 | Caa | -aa | 1 | 1 | B.1.526 | 0.000024 |
ORF8 | 18 | Q18H | caA | caT | 1 | 1 | B.1.526 | 0.000024 |
ORF8 | 18 | Q18K | Caa | Aaa | 1 | 1 | B.1.526 | 0.000024 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.530 | 0.007143 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.540 | 0.009709 |
ORF8 | 18 | Q18E | Caa | Gaa | 1 | 1 | B.1.554 | 0.004405 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.567 | 0.003333 |
ORF8 | 18 | Q18V | CAA | GTT | 1 | 1 | B.1.582 | 0.000491 |
ORF8 | 18 | Q18D | CaA | GaT | 1 | 1 | B.1.582 | 0.000491 |
ORF8 | 18 | Q18Q | caA | caG | 1 | 1 | B.1.603 | 0.010638 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.609 | 0.000479 |
ORF8 | 18 | Q18del | CAA | --- | 1 | 1 | B.1.609 | 0.000479 |
ORF8 | 18 | Q18L | cAa | cTa | 1 | 1 | B.1.617.1 | 0.000129 |
ORF8 | 18 | Q18H | caA | caT | 1 | 1 | B.1.621 | 0.000089 |
ORF8 | 18 | Q18L | cAa | cTa | 1 | 1 | B.1.621 | 0.000089 |
ORF8 | 18 | Q18E | Caa | Gaa | 1 | 1 | B.1.621.1 | 0.000506 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.628 | 0.000352 |
ORF8 | 18 | Q18del | CAA | --- | 1 | 1 | B.1.630 | 0.005236 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.9 | 0.006173 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.9.5 | 0.005682 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.3 | 0.000831 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.6.6 | 0.000889 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | C.14 | 0.004329 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | C.16 | 0.00106 |
ORF8 | 18 | Q18H | caA | caT | 1 | 1 | C.17 | 0.055556 |
ORF8 | 18 | Q18del | CAA | --- | 1 | 1 | C.26 | 0.007353 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | C.36 | 0.000911 |
ORF8 | 18 | Q18L | cAa | cTa | 1 | 1 | C.37 | 0.000116 |
ORF8 | 18 | Q18K | Caa | Aaa | 1 | 1 | C.37 | 0.000116 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | C.37.1 | 0.002618 |
ORF8 | 18 | Q18L | cAa | cTa | 1 | 1 | C.37.1 | 0.002618 |
ORF8 | 18 | Q18K | Caa | Aaa | 1 | 1 | D.2 | 0.000075 |
ORF8 | 18 | Q18del | CAA | --- | 1 | 1 | N.3 | 0.005814 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | N.5 | 0.001767 |
ORF8 | 18 | Q18del | CAA | --- | 1 | 1 | N.6 | 0.007092 |
ORF8 | 18 | Q18R | cAa | cGa | 1 | 1 | P.1 | 0.000016 |
ORF8 | 18 | Q18K | Caa | Aaa | 1 | 1 | P.1.1 | 0.000318 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | P.1.10 | 0.000269 |
ORF8 | 18 | Q18del | CAA | --- | 1 | 1 | P.1.12 | 0.000484 |
ORF8 | 18 | Q18L | cAa | cTa | 1 | 1 | P.1.15 | 0.000232 |
ORF8 | 18 | Q18del | CAA | --- | 1 | 1 | P.1.17 | 0.000162 |
ORF8 | 18 | Q18L | cAa | cTa | 1 | 1 | P.1.7 | 0.000319 |
ORF8 | 18 | Q18H | caA | caC | 1 | 1 | P.1.7 | 0.000319 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | P.1.8 | 0.004785 |
ORF8 | 18 | Q18Q | caA | caG | 1 | 1 | P.2 | 0.000187 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | P.6 | 0.003145 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | Q.1 | 0.000126 |
ORF8 | 18 | Q18del | CAA | --- | 1 | 1 | Q.2 | 0.000613 |
ORF8 | 18 | Q18X | Caa | Taa | 1 | 1 | Q.3 | 0.000145 |
CoV-GLUE is still in development. CoV-GLUE was originally developed as part of COG-UK by Josh Singer using the GLUE framework at the MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research (CVR). In 2021 it was redeveloped by Richard Orton to scale to the millions of genome sequences available. We acknowledge support from the MRC (MC_UU_12014/12), WT (220977/Z/20/Z) and UKRI G2P (MR/W005611/1). Please contact Richard Orton with any queries: Richard.Orton@glasgow.ac.uk
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