CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF8 : CodonNum = 119

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF8119D119deldelGAT---26535792653579128248-28250
ORF8119D119VnonsyngAtgTt597259410.99480928248-28250
ORF8119D119VnonsyngATgTC5972310.0051908928248-28250
ORF8119D119InonsynGAtATt154213990.90726328248-28250
ORF8119D119InonsynGATATC15421430.092736728248-28250
ORF8119D119del2delGATA--142712550.87946728248-28250
ORF8119D119del2delGAt--t14271270.088997928248-28250
ORF8119D119del2delgATg--1427430.030133128248-28250
ORF8119D119del2delGAT--G142710.00070077128248-28250
ORF8119D119del2delGAT--N142710.00070077128248-28250
ORF8119D119del1delGaT-aN8734700.53837328248-28250
ORF8119D119del1delGat-at8732030.23253228248-28250
ORF8119D119del1delGAT-NN873850.097365428248-28250
ORF8119D119del1delgaTga-873370.042382628248-28250
ORF8119D119del1delGaTNa-873320.036655228248-28250
ORF8119D119del1delGaTAa-873230.026345928248-28250
ORF8119D119del1delGAt-Nt87390.010309328248-28250
ORF8119D119del1delgAtg-t87370.0080183328248-28250
ORF8119D119del1delGAt-Ct87330.0034364328248-28250
ORF8119D119del1delgATg-N87320.0022909528248-28250
ORF8119D119del1delGAt-Tt87310.0011454828248-28250
ORF8119D119del1delGAt-Gt87310.0011454828248-28250
ORF8119D119YnonsynGatTat6036020.99834228248-28250
ORF8119D119YnonsynGaTTaC60310.0016583728248-28250
ORF8119D119EnonsyngaTgaG4053960.97777828248-28250
ORF8119D119EnonsyngaTgaA40590.022222228248-28250
ORF8119D119NnonsynGatAat2332250.96566528248-28250
ORF8119D119NnonsynGaTAaC23380.034334828248-28250
ORF8119D119DsyngaTgaC158158128248-28250
ORF8119D119GnonsyngAtgGt1131110.98230128248-28250
ORF8119D119GnonsyngATgGA11310.0088495628248-28250
ORF8119D119GnonsyngATgGC11310.0088495628248-28250
ORF8119D119SnonsynGAtTCt57510.89473728248-28250
ORF8119D119SnonsynGATAGC5720.035087728248-28250
ORF8119D119SnonsynGAtAGt5720.035087728248-28250
ORF8119D119SnonsynGATTCA5720.035087728248-28250
ORF8119D119XnonsynGaTTaA55400.72727328248-28250
ORF8119D119XnonsynGaTTaG55150.27272728248-28250
ORF8119D119HnonsynGatCat3939128248-28250
ORF8119D119AnonsyngAtgCt1313128248-28250
ORF8119D119CnonsynGAtTGt88128248-28250
ORF8119D119RnonsynGATAGA77128248-28250
ORF8119D119KnonsynGaTAaA44128248-28250
ORF8119D119FnonsynGAtTTt22128248-28250
ORF8119D119LnonsynGATTTA11128248-28250
ORF8119D119TnonsynGAtACt11128248-28250

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF8119D119delGAT---26535792653579All0.507528
ORF8119D119delGAT---636527636527AY.40.990705
ORF8119D119delGAT---245510245510B.1.617.20.924447
ORF8119D119delGAT---219705219705AY.430.973395
ORF8119D119delGAT---160256160256AY.250.963911
ORF8119D119delGAT---156518156518AY.440.952688
ORF8119D119delGAT---154107154107AY.1030.956859
ORF8119D119delGAT---9820098200AY.30.976735
ORF8119D119delGAT---6274662746AY.290.989731
ORF8119D119delGAT---4761947619AY.50.983295
ORF8119D119delGAT---4577245772AY.4.20.992734
ORF8119D119delGAT---3954939549AY.390.977315
ORF8119D119delGAT---3460834608AY.1020.917595
ORF8119D119delGAT---3397633976AY.260.961866
ORF8119D119delGAT---3114231142AY.470.968677
ORF8119D119delGAT---2640326403AY.9.20.969772
ORF8119D119delGAT---2632626326AY.1200.978771
ORF8119D119delGAT---2620026200AY.1190.925076
ORF8119D119delGAT---2506525065AY.39.10.992909
ORF8119D119delGAT---2472724727AY.200.961018
ORF8119D119delGAT---2411524115AY.60.991815
ORF8119D119delGAT---2408724087AY.420.969023
ORF8119D119delGAT---2073620736AY.1000.953993
ORF8119D119delGAT---2004920049AY.98.10.97099
ORF8119D119delGAT---1688716887AY.750.94605
ORF8119D119delGAT---1542615426AY.270.998382
ORF8119D119delGAT---1512215122AY.1180.947375
ORF8119D119delGAT---1466514665AY.90.99128
ORF8119D119delGAT---1423014230AY.330.95025
ORF8119D119delGAT---1331613316AY.46.60.961513
ORF8119D119delGAT---1250712507AY.980.987993
ORF8119D119delGAT---1242212422AY.230.86643
ORF8119D119delGAT---1170711707AY.9.10.980157
ORF8119D119delGAT---1136511365AY.3.10.968966
ORF8119D119delGAT---1123211232AY.1170.94929
ORF8119D119delGAT---1086510865AY.140.956258
ORF8119D119delGAT---1050410504AY.99.20.968021
ORF8119D119delGAT---1004510045AY.340.974013
ORF8119D119delGAT---99669966AY.540.950229
ORF8119D119delGAT---92209220AY.4.50.991078
ORF8119D119delGAT---91089108AY.460.94796
ORF8119D119delGAT---87888788AY.7.10.99042
ORF8119D119delGAT---87778777AY.1100.989069
ORF8119D119delGAT---85728572AY.740.991326
ORF8119D119delGAT---80058005AY.610.838747
ORF8119D119delGAT---77497749AY.450.94293
ORF8119D119delGAT---70917091AY.1210.95954
ORF8119D119delGAT---66776677AY.1130.950733
ORF8119D119delGAT---66396639AY.4.2.10.989124
ORF8119D119delGAT---64116411AY.360.9502
ORF8119D119VgAtgTt59415972All0.001136
ORF8119D119VgATgTC315972All0.000006
ORF8119D119delGAT---59675967AY.46.40.981576
ORF8119D119delGAT---55675567AY.130.896169
ORF8119D119delGAT---53785378AY.1110.984982
ORF8119D119delGAT---53315331AY.690.995147
ORF8119D119delGAT---51065106AY.75.10.920664
ORF8119D119delGAT---50645064AY.70.992552
ORF8119D119delGAT---50405040AY.46.51
ORF8119D119delGAT---46714671AY.700.973937
ORF8119D119delGAT---44084408AY.29.10.971996
ORF8119D119delGAT---41764176AY.1140.965103
ORF8119D119delGAT---36483648AY.930.996177
ORF8119D119delGAT---33003300AY.530.948821
ORF8119D119delGAT---32613261AY.410.958554
ORF8119D119delGAT---31873187AY.1160.913966
ORF8119D119delGAT---31803180AY.920.913531
ORF8119D119delGAT---31293129AY.120.988938
ORF8119D119delGAT---30643064AY.120.10.983628
ORF8119D119delGAT---30373037AY.116.10.945811
ORF8119D119delGAT---30143014AY.370.952592
ORF8119D119delGAT---29602960AY.5.40.819037
ORF8119D119delGAT---28162816AY.680.770873
ORF8119D119delGAT---27762776AY.1060.929672
ORF8119D119delGAT---27092709AY.5.30.913968
ORF8119D119delGAT---26382638AY.20.939459
ORF8119D119delGAT---25722572AY.630.994971
ORF8119D119delGAT---24372437AY.300.964385
ORF8119D119delGAT---23952395AY.23.10.999583
ORF8119D119delGAT---23582358AY.10.933122
ORF8119D119delGAT---23312331AY.4.40.953764
ORF8119D119delGAT---23142314AY.850.988466
ORF8119D119delGAT---22612261AY.240.974569
ORF8119D119delGAT---22132213AY.940.979637
ORF8119D119delGAT---21982198AY.620.957734
ORF8119D119delGAT---20372037AY.1070.949208
ORF8119D119delGAT---20102010AY.160.763098
ORF8119D119delGAT---19771977AY.670.917827
ORF8119D119delGAT---19731973AY.710.937292
ORF8119D119delGAT---19691969AY.120.2.10.981066
ORF8119D119delGAT---19561956AY.34.10.99745
ORF8119D119delGAT---19431943AY.380.970045
ORF8119D119delGAT---19391939AY.1010.950956
ORF8119D119delGAT---19291929AY.840.843832
ORF8119D119delGAT---18051805AY.100.956545
ORF8119D119delGAT---17661766AY.650.941365
ORF8119D119delGAT---17591759AY.590.931674
ORF8119D119delGAT---17361736AY.7.20.970917
ORF8119D119delGAT---17231723AY.320.917465
ORF8119D119delGAT---16491649AY.80.999394
ORF8119D119delGAT---16351635AY.640.973214
ORF8119D119delGAT---15501550AY.46.20.984752
ORF8119D119IGAtATt13991542All0.000268
ORF8119D119IGATATC1431542All0.000027
ORF8119D119delGAT---15171517AY.1050.975563
ORF8119D119delGAT---15131513AY.570.992782
ORF8119D119delGAT---14851485AY.730.988024
ORF8119D119delGAT---14531453AY.900.994524
ORF8119D119del2GATA--12551427All0.00024
ORF8119D119del2GAt--t1271427All0.000024
ORF8119D119del2gATg--431427All0.000008
ORF8119D119del2GAT--N11427All0
ORF8119D119del2GAT--G11427All0
ORF8119D119delGAT---13771377AY.39.1.10.997826
ORF8119D119delGAT---13471347AY.4.10.993363
ORF8119D119delGAT---13241324AY.910.967129
ORF8119D119delGAT---13231323AY.1090.97855
ORF8119D119delGAT---11921192AY.860.989212
ORF8119D119delGAT---11721172AY.870.975853
ORF8119D119delGAT---11551155AY.500.923261
ORF8119D119delGAT---11101110AY.4.30.934343
ORF8119D119VgAtgTt10971098AY.1030.006811
ORF8119D119VgATgTC11098AY.1030.000006
ORF8119D119delGAT---10881088AY.880.961981
ORF8119D119delGAT---10641064AY.46.30.993464
ORF8119D119delGAT---10601060AY.510.963636
ORF8119D119delGAT---10501050AY.580.952813
ORF8119D119delGAT---10461046AY.520.851792
ORF8119D119delGAT---996996AY.600.934334
ORF8119D119delGAT---967967AY.46.10.992813
ORF8119D119VgAtgTt942943B.1.617.20.003547
ORF8119D119VgATgTC1943B.1.617.20.000004
ORF8119D119delGAT---900900AY.400.867888
ORF8119D119delGAT---883883AY.660.944385
ORF8119D119delGAT---882882AY.800.995485
ORF8119D119del1GaT-aN470873All0.00009
ORF8119D119del1Gat-at203873All0.000039
ORF8119D119del1GAT-NN85873All0.000016
ORF8119D119del1gaTga-37873All0.000007
ORF8119D119del1GaTNa-32873All0.000006
ORF8119D119del1GaTAa-23873All0.000004
ORF8119D119del1GAt-Nt9873All0.000002
ORF8119D119del1gAtg-t7873All0.000001
ORF8119D119del1GAt-Ct3873All0.000001
ORF8119D119del1gATg-N2873All0
ORF8119D119del1GAt-Gt1873All0
ORF8119D119del1GAt-Tt1873All0
ORF8119D119delGAT---849849AY.950.646119
ORF8119D119delGAT---822822AY.190.937286
ORF8119D119delGAT---817817AY.790.989104
ORF8119D119delGAT---811811AY.16.10.381109
ORF8119D119delGAT---794794AY.990.833158
ORF8119D119delGAT---749749AY.120.20.962725
ORF8119D119delGAT---741741AY.110.991968
ORF8119D119delGAT---733733AY.1080.808159
ORF8119D119delGAT---728728AY.720.990476
ORF8119D119delGAT---636636AY.770.717024
ORF8119D119delGAT---633633AY.39.20.975347
ORF8119D119delGAT---619619AY.820.839891
ORF8119D119delGAT---616616AY.99.10.956522
ORF8119D119YGatTat602603All0.000115
ORF8119D119YGaTTaC1603All0
ORF8119D119delGAT---595595AY.780.916795
ORF8119D119delGAT---577577AY.830.994828
ORF8119D119delGAT---574574A.270.950331
ORF8119D119delGAT---547547AY.560.87801
ORF8119D119delGAT---543543AY.970.923469
ORF8119D119delGAT---538538B0.068763
ORF8119D119delGAT---506506AY.9.2.11
ORF8119D119delGAT---500500AY.810.996016
ORF8119D119delGAT---499499AY.1040.990079
ORF8119D119delGAT---499499AY.210.946869
ORF8119D119delGAT---488488AY.280.922495
ORF8119D119delGAT---470470B.10.004305
ORF8119D119delGAT---469469AY.220.981172
ORF8119D119VgAtgTt442443AY.1020.011719
ORF8119D119VgATgTC1443AY.1020.000027
ORF8119D119delGAT---437437AY.150.971111
ORF8119D119VgAtgTt434434AY.440.002642
ORF8119D119EgaTgaG396405All0.000076
ORF8119D119EgaTgaA9405All0.000002
ORF8119D119delGAT---402402AY.5.20.990148
ORF8119D119delGAT---402402B.1.1.70.00036
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