CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF8 : CodonNum = 112

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF8112H112YnonsynCatTat28792879128227-28229
ORF8112H112deldelCAT---495495128227-28229
ORF8112H112RnonsyncAtcGt339339128227-28229
ORF8112H112LnonsyncAtcTt3063050.99673228227-28229
ORF8112H112LnonsyncATcTG30610.0032679728227-28229
ORF8112H112HsyncaTcaC291291128227-28229
ORF8112H112NnonsynCatAat47450.95744728227-28229
ORF8112H112NnonsynCaTAaC4720.042553228227-28229
ORF8112H112del1delcaTca-17120.70588228227-28229
ORF8112H112del1delCat-at1730.17647128227-28229
ORF8112H112del1delcAtc-t1710.058823528227-28229
ORF8112H112del1delcATc-C1710.058823528227-28229
ORF8112H112QnonsyncaTcaG1280.66666728227-28229
ORF8112H112QnonsyncaTcaA1240.33333328227-28229
ORF8112H112PnonsyncAtcCt740.57142928227-28229
ORF8112H112PnonsyncATcCA720.28571428227-28229
ORF8112H112PnonsyncATcCC710.14285728227-28229
ORF8112H112SnonsynCATTCC620.33333328227-28229
ORF8112H112SnonsynCATTCA620.33333328227-28229
ORF8112H112SnonsynCAtTCt620.33333328227-28229
ORF8112H112TnonsynCATACC540.828227-28229
ORF8112H112TnonsynCAtACt510.228227-28229
ORF8112H112del2delCAt--t33128227-28229
ORF8112H112XnonsynCaTTaA22128227-28229
ORF8112H112DnonsynCatGat22128227-28229
ORF8112H112InonsynCATATC210.528227-28229
ORF8112H112InonsynCAtATt210.528227-28229
ORF8112H112FnonsynCAtTTt11128227-28229
ORF8112H112MnonsynCATATG11128227-28229
ORF8112H112KnonsynCaTAaG11128227-28229

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF8112H112YCatTat28792879All0.000551
ORF8112H112YCatTat16111611Q.20.988344
ORF8112H112YCatTat10241024B.1.1.70.000917
ORF8112H112delCAT---495495All0.000095
ORF8112H112RcAtcGt339339All0.000065
ORF8112H112LcAtcTt305306All0.000058
ORF8112H112LcATcTG1306All0
ORF8112H112HcaTcaC291291All0.000056
ORF8112H112delCAT---215215B.1.1.70.000192
ORF8112H112LcAtcTt117117B.1.1.70.000105
ORF8112H112RcAtcGt110110B.1.2210.007814
ORF8112H112HcaTcaC100100AY.1180.006265
ORF8112H112RcAtcGt6767AY.40.000104
ORF8112H112delCAT---5757AY.40.000089
ORF8112H112NCatAat4547All0.000009
ORF8112H112NCaTAaC247All0
ORF8112H112LcAtcTt4646B.1.20.000405
ORF8112H112HcaTcaC4242B.1.1.70.000038
ORF8112H112YCatTat4141AY.390.001013
ORF8112H112LcAtcTt3838B.1.4290.000894
ORF8112H112delCAT---3737AY.290.000584
ORF8112H112YCatTat3636P.10.000567
ORF8112H112delCAT---3333B.1.2430.002296
ORF8112H112RcAtcGt2323B.1.1.70.000021
ORF8112H112NCatAat2222AY.910.01607
ORF8112H112RcAtcGt2121AY.390.000519
ORF8112H112YCatTat1818B.10.000165
ORF8112H112RcAtcGt1818B.10.000165
ORF8112H112del1caTca-1217All0.000002
ORF8112H112del1Cat-at317All0.000001
ORF8112H112del1cATc-C117All0
ORF8112H112del1cAtc-t117All0
ORF8112H112LcAtcTt1717B.1.2210.001208
ORF8112H112delCAT---1616B0.002045
ORF8112H112LcAtcTt1415B.1.4270.000707
ORF8112H112LcATcTG115B.1.4270.00005
ORF8112H112delCAT---1414AY.470.000435
ORF8112H112RcAtcGt1313AY.440.000079
ORF8112H112QcaTcaG812All0.000002
ORF8112H112QcaTcaA412All0.000001
ORF8112H112HcaTcaC1212AY.1010.005885
ORF8112H112RcAtcGt1212AY.250.000072
ORF8112H112delCAT---1212AY.39.10.000475
ORF8112H112HcaTcaC1212B.1.617.20.000045
ORF8112H112RcAtcGt1212B.1.617.20.000045
ORF8112H112LcAtcTt1111B.10.000101
ORF8112H112HcaTcaC1111B.10.000101
ORF8112H112YCatTat1111B.1.1.2160.009795
ORF8112H112HcaTcaC1111B.1.1.3620.061798
ORF8112H112YCatTat1111B.1.1.5190.000437
ORF8112H112NCatAat1111B.1.1.70.00001
ORF8112H112HcaTcaC1010AY.1100.001127
ORF8112H112YCatTat1010AY.1110.001832
ORF8112H112YCatTat1010B.1.1600.000312
ORF8112H112YCatTat1010B.1.20.000088
ORF8112H112LcAtcTt99B.1.2430.000626
ORF8112H112YCatTat99C.370.001045
ORF8112H112delCAT---88AY.1020.000212
ORF8112H112HcaTcaC88AY.5.20.019704
ORF8112H112HcaTcaC88B.1.1.5190.000318
ORF8112H112delCAT---88B.1.617.20.00003
ORF8112H112PcAtcCt47All0.000001
ORF8112H112PcATcCA27All0
ORF8112H112PcATcCC17All0
ORF8112H112RcAtcGt77AY.1020.000186
ORF8112H112HcaTcaC77B.1.1700.030172
ORF8112H112RcAtcGt77B.1.20.000062
ORF8112H112delCAT---77B.1.36.160.009972
ORF8112H112HcaTcaC77B.1.5240.009845
ORF8112H112SCATTCA26All0
ORF8112H112SCATTCC26All0
ORF8112H112SCAtTCt26All0
ORF8112H112HcaTcaC66AY.40.000009
ORF8112H112delCAT---66AY.910.004383
ORF8112H112delCAT---66B.1.1.2650.018927
ORF8112H112YCatTat66B.1.3660.029268
ORF8112H112RcAtcGt66B.1.4290.000141
ORF8112H112LcAtcTt66B.1.5960.000523
ORF8112H112RcAtcGt66B.1.6370.000438
ORF8112H112TCATACC45All0.000001
ORF8112H112TCAtACt15All0
ORF8112H112YCatTat55AY.250.00003
ORF8112H112delCAT---55AY.29.10.001103
ORF8112H112YCatTat55AY.40.000008
ORF8112H112YCatTat55B.1.617.20.000019
ORF8112H112delCAT---55P.10.000079
ORF8112H112LcAtcTt55P.1.160.001871
ORF8112H112RcAtcGt44AY.30.00004
ORF8112H112RcAtcGt44AY.430.000018
ORF8112H112HcaTcaC44AY.470.000124
ORF8112H112HcaTcaC44B.1.10.000073
ORF8112H112PcATcCA24B.1.4270.000101
ORF8112H112SCATTCA24B.1.4270.000101
ORF8112H112SCAtTCt24B.1.4270.000101
ORF8112H112PcAtcCt24B.1.4270.000101
ORF8112H112LcAtcTt44B.1.5610.001588
ORF8112H112delCAT---44P.1.10.001271
ORF8112H112del2CAt--t33All0.000001
ORF8112H112YCatTat33AY.1030.000019
ORF8112H112delCAT---33AY.1180.000188
ORF8112H112HcaTcaC33AY.1200.000112
ORF8112H112RcAtcGt33AY.290.000047
ORF8112H112HcaTcaC33AY.430.000013
ORF8112H112YCatTat33AY.470.000093
ORF8112H112delCAT---33AY.50.000062
ORF8112H112RcAtcGt33AY.9.20.00011
ORF8112H112delCAT---33B.10.000027
ORF8112H112RcAtcGt33B.1.10.000054
ORF8112H112delCAT---33B.1.10.000054
ORF8112H112YCatTat33B.1.10.000054
ORF8112H112delCAT---33B.1.1.5190.000119
ORF8112H112HcaTcaC33B.1.1770.00004
ORF8112H112delCAT---33B.1.220.003953
ORF8112H112QcaTcaA23B.1.4270.000101
ORF8112H112QcaTcaG13B.1.4270.00005
ORF8112H112LcAtcTt33B.1.5260.000071
ORF8112H112YCatTat33B.1.6280.001057
ORF8112H112del1caTca-33C.36.30.001702
ORF8112H112YCatTat33P.1.10.000953
ORF8112H112SCATTCC220.111111
ORF8112H112QcaTcaG22A0.000774
ORF8112H112QcaTcaG22A.10.000564
ORF8112H112DCatGat22All0
ORF8112H112XCaTTaA22All0
ORF8112H112ICAtATt12All0
ORF8112H112ICATATC12All0
ORF8112H112HcaTcaC22AY.1030.000012
ORF8112H112delCAT---22AY.1130.000285
ORF8112H112YCatTat22AY.1180.000125
ORF8112H112RcAtcGt22AY.1200.000074
ORF8112H112HcaTcaC22AY.30.00002
ORF8112H112delCAT---22AY.4.20.000043
ORF8112H112delCAT---22AY.430.000009
ORF8112H112delCAT---22AY.480.00093
ORF8112H112NCatAat22B.10.000018
ORF8112H112NCatAat22B.1.10.000036
ORF8112H112LcAtcTt22B.1.1.1630.015267
ORF8112H112LcAtcTt22B.1.1.4320.002532
ORF8112H112del2CAt--t22B.1.1.70.000002
ORF8112H112DCatGat22B.1.1.70.000002
ORF8112H112del1caTca-12B.1.1.70.000001
ORF8112H112del1Cat-at12B.1.1.70.000001
ORF8112H112delCAT---22B.1.1600.000062
ORF8112H112YCatTat22B.1.1640.029851
ORF8112H112delCAT---22B.1.1770.000026
ORF8112H112HcaTcaC22B.1.177.120.000303
ORF8112H112TCATACC12B.1.177.810.000189
ORF8112H112PcATcCC12B.1.177.810.000189
ORF8112H112PcAtcCt12B.1.177.810.000189
ORF8112H112TCAtACt12B.1.177.810.000189
ORF8112H112NCatAat12B.1.177.810.000189
ORF8112H112NCaTAaC12B.1.177.810.000189
ORF8112H112HcaTcaC22B.1.20.000018
ORF8112H112delCAT---22B.1.20.000018
ORF8112H112LcAtcTt22B.1.2340.000264
ORF8112H112HcaTcaC22B.1.3110.000549
ORF8112H112RcAtcGt22B.1.3460.002621
ORF8112H112delCAT---22B.1.360.000292
ORF8112H112YCatTat22B.1.3690.00057
ORF8112H112HcaTcaC22B.1.4170.057143
ORF8112H112YCatTat22B.1.4270.000101
ORF8112H112HcaTcaC22B.1.4270.000101
ORF8112H112XCaTTaA22B.1.4270.000101
ORF8112H112RcAtcGt22B.1.4700.002809
ORF8112H112RcAtcGt22B.1.5260.000047
ORF8112H112NCaTAaC12B.1.617.20.000004
ORF8112H112NCatAat12B.1.617.20.000004
ORF8112H112del1caTca-22B.1.6210.000177
ORF8112H112YCatTat22B.1.6370.000146
ORF8112H112YCatTat22D.20.00015
ORF8112H112RcAtcGt22P.10.000032
ORF8112H112del1caTca-12P.10.000016
ORF8112H112del1Cat-at12P.10.000016
ORF8112H112YCatTat22Q.10.000253
ORF8112H112YCatTat22Q.80.00033
ORF8112H112NCatAat11A0.000387
ORF8112H112HcaTcaC11A.10.000282
ORF8112H112LcAtcTt11A.2.50.000499
ORF8112H112FCAtTTt11All0
ORF8112H112KCaTAaG11All0
ORF8112H112MCATATG11All0
ORF8112H112HcaTcaC11AY.1000.000046
ORF8112H112HcaTcaC11AY.1020.000027
ORF8112H112del2CAt--t11AY.1030.000006
ORF8112H112RcAtcGt11AY.1080.001103
ORF8112H112delCAT---11AY.1080.001103
ORF8112H112HcaTcaC11AY.1140.000231
ORF8112H112HcaTcaC11AY.1160.000287
ORF8112H112LcAtcTt11AY.116.10.000311
ORF8112H112RcAtcGt11AY.1170.000085
ORF8112H112HcaTcaC11AY.1190.000035
ORF8112H112delCAT---11AY.1200.000037
ORF8112H112YCatTat11AY.190.00114
ORF8112H112YCatTat11AY.200.000039
ORF8112H112LcAtcTt11AY.200.000039
ORF8112H112LcAtcTt11AY.250.000006
ORF8112H112HcaTcaC11AY.250.000006
ORF8112H112YCatTat11AY.260.000028
ORF8112H112delCAT---11AY.260.000028
ORF8112H112delCAT---11AY.30.00001
ORF8112H112YCatTat11AY.30.00001
ORF8112H112QcaTcaG11AY.380.000499
ORF8112H112HcaTcaC11AY.390.000025
ORF8112H112delCAT---11AY.390.000025
ORF8112H112HcaTcaC11AY.39.10.00004
ORF8112H112PcAtcCt11AY.40.000002
ORF8112H112NCatAat11AY.40.000002
ORF8112H112HcaTcaC11AY.4.20.000022
ORF8112H112delCAT---11AY.4.50.000107
ORF8112H112LcAtcTt11AY.400.000964
ORF8112H112LcAtcTt11AY.420.00004
ORF8112H112NCatAat11AY.430.000004
ORF8112H112YCatTat11AY.430.000004
ORF8112H112del1cAtc-t11AY.430.000004
ORF8112H112delCAT---11AY.440.000006
ORF8112H112LcAtcTt11AY.440.000006
ORF8112H112YCatTat11AY.440.000006
ORF8112H112HcaTcaC11AY.440.000006
ORF8112H112RcAtcGt11AY.46.20.000635
ORF8112H112HcaTcaC11AY.46.40.000165
ORF8112H112RcAtcGt11AY.470.000031
ORF8112H112YCatTat11AY.50.000021
ORF8112H112del1caTca-11AY.5.30.000337
ORF8112H112LcAtcTt11AY.550.000917
ORF8112H112YCatTat11AY.60.000041
ORF8112H112HcaTcaC11AY.60.000041
ORF8112H112HcaTcaC11AY.600.000938
ORF8112H112YCatTat11AY.610.000105
ORF8112H112NCatAat11AY.620.000436
ORF8112H112LcAtcTt11AY.680.000274
ORF8112H112LcAtcTt11AY.7.10.000113
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ORF8112H112YCatTat11AY.9.10.000084
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