CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF8 : CodonNum = 111

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF8111Y111YsyntaTtaC24402440128224-28226
ORF8111Y111CnonsyntAttGt729729128224-28226
ORF8111Y111deldelTAT---453453128224-28226
ORF8111Y111HnonsynTatCat231231128224-28226
ORF8111Y111FnonsyntAttTt1901850.97368428224-28226
ORF8111Y111FnonsyntATtTC19050.026315828224-28226
ORF8111Y111del1deltaTta-1071040.97196328224-28226
ORF8111Y111del1delTat-at10730.028037428224-28226
ORF8111Y111XnonsyntaTtaA36180.528224-28226
ORF8111Y111XnonsyntaTtaG36170.47222228224-28226
ORF8111Y111XnonsyntATtGA3610.027777828224-28226
ORF8111Y111del2delTAt--t34320.94117628224-28226
ORF8111Y111del2delTAT--G3420.058823528224-28226
ORF8111Y111NnonsynTatAat21120.57142928224-28226
ORF8111Y111NnonsynTaTAaC2190.42857128224-28226
ORF8111Y111SnonsyntAttCt1090.928224-28226
ORF8111Y111SnonsyntATtCA1010.128224-28226
ORF8111Y111DnonsynTatGat88128224-28226
ORF8111Y111LnonsyntATtTA630.528224-28226
ORF8111Y111LnonsynTAtCTt620.33333328224-28226
ORF8111Y111LnonsynTATCTG610.16666728224-28226
ORF8111Y111VnonsynTAtGTt520.428224-28226
ORF8111Y111VnonsynTATGTA520.428224-28226
ORF8111Y111VnonsynTATGTC510.228224-28226
ORF8111Y111QnonsynTaTCaA44128224-28226
ORF8111Y111EnonsynTaTGaA33128224-28226
ORF8111Y111PnonsynTATCCA320.66666728224-28226
ORF8111Y111PnonsynTAtCCt310.33333328224-28226
ORF8111Y111InonsynTAtATt210.528224-28226
ORF8111Y111InonsynTATATC210.528224-28226
ORF8111Y111KnonsynTaTAaA11128224-28226
ORF8111Y111WnonsyntATtGG11128224-28226

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF8111Y111YtaTtaC24402440All0.000467
ORF8111Y111CtAttGt729729All0.000139
ORF8111Y111YtaTtaC664664B.10.006082
ORF8111Y111YtaTtaC591591AY.40.00092
ORF8111Y111delTAT---453453All0.000087
ORF8111Y111YtaTtaC445445B.1.10.008073
ORF8111Y111HTatCat231231All0.000044
ORF8111Y111YtaTtaC218218B.1.1600.006799
ORF8111Y111CtAttGt193193B.1.1.70.000173
ORF8111Y111FtAttTt185190All0.000035
ORF8111Y111FtATtTC5190All0.000001
ORF8111Y111CtAttGt176176B.1.4290.004141
ORF8111Y111delTAT---151151B.1.1.70.000135
ORF8111Y111FtAttTt139139B.1.160.91
ORF8111Y111HTatCat130130AY.930.0355
ORF8111Y111del1taTta-104107All0.00002
ORF8111Y111del1Tat-at3107All0.000001
ORF8111Y111del1taTta-102102B.1.1.70.000091
ORF8111Y111CtAttGt9292B.1.4970.028958
ORF8111Y111YtaTtaC7272B.1.1.70.000064
ORF8111Y111YtaTtaC6161B.1.617.20.00023
ORF8111Y111YtaTtaC6060B.1.1.2240.857143
ORF8111Y111delTAT---5757AY.40.000089
ORF8111Y111YtaTtaC5353AY.330.003539
ORF8111Y111CtAttGt3838B.1.617.20.000143
ORF8111Y111YtaTtaC3737AY.1030.00023
ORF8111Y111delTAT---3737AY.290.000584
ORF8111Y111XtaTtaA1836All0.000003
ORF8111Y111XtaTtaG1736All0.000003
ORF8111Y111XtATtGA136All0
ORF8111Y111del2TAt--t3234All0.000006
ORF8111Y111del2TAT--G234All0
ORF8111Y111delTAT---3333B.1.2430.002296
ORF8111Y111delTAT---3232B.1.1600.000998
ORF8111Y111CtAttGt3131AY.40.000048
ORF8111Y111del2TAt--t2426B.1.1.70.000021
ORF8111Y111del2TAT--G226B.1.1.70.000002
ORF8111Y111YtaTtaC2525B.1.5300.178571
ORF8111Y111NTatAat1221All0.000002
ORF8111Y111NTaTAaC921All0.000002
ORF8111Y111CtAttGt2020AY.7.10.002254
ORF8111Y111YtaTtaC2020B.1.3950.140845
ORF8111Y111CtAttGt1919AY.440.000116
ORF8111Y111YtaTtaC1818AY.440.00011
ORF8111Y111delTAT---1616B0.002045
ORF8111Y111CtAttGt1515AY.430.000066
ORF8111Y111delTAT---1414AY.470.000435
ORF8111Y111HTatCat1414B.1.20.000123
ORF8111Y111CtAttGt1313AY.1020.000345
ORF8111Y111CtAttGt1313B.10.000119
ORF8111Y111HTatCat1313B.1.1.70.000012
ORF8111Y111HTatCat1212AY.250.000072
ORF8111Y111YtaTtaC1212AY.39.10.000475
ORF8111Y111YtaTtaC1212AY.90.000811
ORF8111Y111CtAttGt1111AY.250.000066
ORF8111Y111CtAttGt1111AY.3.10.000938
ORF8111Y111FtAttTt1111AY.40.000017
ORF8111Y111HTatCat1111B.1.1770.000145
ORF8111Y111StAttCt910All0.000002
ORF8111Y111StATtCA110All0
ORF8111Y111YtaTtaC1010AY.430.000044
ORF8111Y111XtaTtaG510B.1.1.70.000004
ORF8111Y111XtaTtaA410B.1.1.70.000004
ORF8111Y111XtATtGA110B.1.1.70.000001
ORF8111Y111CtAttGt99AY.1030.000056
ORF8111Y111YtaTtaC99AY.1160.002581
ORF8111Y111YtaTtaC99B.1.1.4190.066667
ORF8111Y111DTatGat88All0.000002
ORF8111Y111delTAT---88AY.1020.000212
ORF8111Y111HTatCat88AY.1030.00005
ORF8111Y111YtaTtaC77AY.1020.000186
ORF8111Y111FtAttTt77B.10.000064
ORF8111Y111FtATtTC47B.1.2430.000278
ORF8111Y111FtAttTt37B.1.2430.000209
ORF8111Y111delTAT---77B.1.36.160.009972
ORF8111Y111delTAT---77B.1.617.20.000026
ORF8111Y111HTatCat77B.1.617.20.000026
ORF8111Y111CtAttGt77B.1.6210.00062
ORF8111Y111LtATtTA36All0.000001
ORF8111Y111LTAtCTt26All0
ORF8111Y111LTATCTG16All0
ORF8111Y111CtAttGt66AY.1180.000376
ORF8111Y111NTatAat66AY.250.000036
ORF8111Y111CtAttGt66AY.30.00006
ORF8111Y111YtaTtaC66AY.390.000148
ORF8111Y111delTAT---66AY.910.004383
ORF8111Y111delTAT---66B.1.1.2650.018927
ORF8111Y111FtAttTt66B.1.1600.000187
ORF8111Y111delTAT---66P.10.000095
ORF8111Y111VTATGTA25All0
ORF8111Y111VTAtGTt25All0
ORF8111Y111VTATGTC15All0
ORF8111Y111delTAT---55AY.29.10.001103
ORF8111Y111HTatCat55AY.30.00005
ORF8111Y111XtaTtaA55AY.30.00005
ORF8111Y111YtaTtaC55B.1.20.000044
ORF8111Y111HTatCat55B.1.2400.001078
ORF8111Y111FtAttTt55B.1.4290.000118
ORF8111Y111QTaTCaA44All0.000001
ORF8111Y111YtaTtaC44AY.1060.00134
ORF8111Y111HTatCat44AY.1160.001147
ORF8111Y111delTAT---44AY.260.000113
ORF8111Y111CtAttGt44AY.330.000267
ORF8111Y111CtAttGt44AY.390.000099
ORF8111Y111XtaTtaG44AY.40.000006
ORF8111Y111XtaTtaG44AY.440.000024
ORF8111Y111CtAttGt44AY.60.000165
ORF8111Y111delTAT---44B.1.10.000073
ORF8111Y111YtaTtaC44B.1.1.3160.0037
ORF8111Y111YtaTtaC44B.1.1.700.001364
ORF8111Y111CtAttGt44B.1.20.000035
ORF8111Y111YtaTtaC44B.1.2430.000278
ORF8111Y111FtAttTt34B.1.4270.000151
ORF8111Y111VTATGTA24B.1.4270.000101
ORF8111Y111VTAtGTt24B.1.4270.000101
ORF8111Y111FtATtTC14B.1.4270.00005
ORF8111Y111YtaTtaC44B.1.5640.001704
ORF8111Y111YtaTtaC44P.10.000063
ORF8111Y111delTAT---44P.1.10.001271
ORF8111Y111ETaTGaA33All0.000001
ORF8111Y111PTATCCA23All0
ORF8111Y111PTAtCCt13All0
ORF8111Y111YtaTtaC33AY.1130.000427
ORF8111Y111YtaTtaC33AY.1180.000188
ORF8111Y111delTAT---33AY.1180.000188
ORF8111Y111CtAttGt33AY.1200.000112
ORF8111Y111CtAttGt33AY.290.000047
ORF8111Y111YtaTtaC33AY.290.000047
ORF8111Y111YtaTtaC33AY.46.20.001906
ORF8111Y111YtaTtaC33AY.480.001395
ORF8111Y111YtaTtaC33AY.610.000314
ORF8111Y111CtAttGt33AY.660.003209
ORF8111Y111delTAT---33B.10.000027
ORF8111Y111CtAttGt33B.1.1.3180.000905
ORF8111Y111delTAT---33B.1.1.5190.000119
ORF8111Y111DTatGat33B.1.1.70.000003
ORF8111Y111NTatAat23B.1.1.70.000002
ORF8111Y111NTaTAaC13B.1.1.70.000001
ORF8111Y111delTAT---33B.1.220.003953
ORF8111Y111YtaTtaC33B.1.221.30.0025
ORF8111Y111YtaTtaC33B.1.3980.008929
ORF8111Y111YtaTtaC33B.1.4270.000151
ORF8111Y111YtaTtaC33B.1.4650.011407
ORF8111Y111YtaTtaC33B.1.5250.000339
ORF8111Y111NTaTAaC33C.36.30.001702
ORF8111Y111YtaTtaC33P.1.140.000143
ORF8111Y111LTAtCTt220.111111
ORF8111Y111ITAtATt12All0
ORF8111Y111ITATATC12All0
ORF8111Y111CtAttGt22AY.1210.000271
ORF8111Y111XtaTtaG22AY.250.000012
ORF8111Y111del2TAt--t22AY.250.000012
ORF8111Y111delTAT---22AY.390.000049
ORF8111Y111del2TAt--t22AY.40.000003
ORF8111Y111delTAT---22AY.4.20.000043
ORF8111Y111CtAttGt22AY.4.2.10.000298
ORF8111Y111YtaTtaC22AY.420.00008
ORF8111Y111FtAttTt22AY.430.000009
ORF8111Y111delTAT---22AY.430.000009
ORF8111Y111XtaTtaA22AY.430.000009
ORF8111Y111delTAT---22AY.480.00093
ORF8111Y111YtaTtaC22AY.50.000041
ORF8111Y111HTatCat22AY.60.000082
ORF8111Y111HTatCat22AY.9.10.000167
ORF8111Y111StAttCt22AY.9.10.000167
ORF8111Y111YtaTtaC22AY.99.20.000184
ORF8111Y111StAttCt22B.1.10.000036
ORF8111Y111HTatCat22B.1.10.000036
ORF8111Y111CtAttGt22B.1.1.2310.006192
ORF8111Y111DTatGat22B.1.1600.000062
ORF8111Y111delTAT---22B.1.1770.000026
ORF8111Y111CtAttGt22B.1.1770.000026
ORF8111Y111FtAttTt22B.1.1770.000026
ORF8111Y111StAttCt12B.1.177.810.000189
ORF8111Y111StATtCA12B.1.177.810.000189
ORF8111Y111PTAtCCt12B.1.177.810.000189
ORF8111Y111PTATCCA12B.1.177.810.000189
ORF8111Y111delTAT---22B.1.20.000018
ORF8111Y111delTAT---22B.1.360.000292
ORF8111Y111CtAttGt22B.1.4270.000101
ORF8111Y111XtaTtaA22B.1.4270.000101
ORF8111Y111LtATtTA22B.1.4270.000101
ORF8111Y111ETaTGaA22B.1.4270.000101
ORF8111Y111DTatGat22B.1.4270.000101
ORF8111Y111ITATATC12B.1.4270.00005
ORF8111Y111ITAtATt12B.1.4270.00005
ORF8111Y111NTaTAaC12B.1.4270.00005
ORF8111Y111NTatAat12B.1.4270.00005
ORF8111Y111YtaTtaC22B.1.4290.000047
ORF8111Y111YtaTtaC22B.1.4970.00063
ORF8111Y111StAttCt22B.1.5090.001732
ORF8111Y111YtaTtaC22B.1.5750.000607
ORF8111Y111YtaTtaC22B.1.5960.000174
ORF8111Y111YtaTtaC22B.1.6090.000959
ORF8111Y111CtAttGt22C.370.000232
ORF8111Y111WtATtGG11All0
ORF8111Y111KTaTAaA11All0
ORF8111Y111delTAT---11AY.1030.000006
ORF8111Y111delTAT---11AY.1050.000643
ORF8111Y111delTAT---11AY.1080.001103
ORF8111Y111CtAttGt11AY.1110.000183
ORF8111Y111CtAttGt11AY.1130.000142
ORF8111Y111CtAttGt11AY.1190.000035
ORF8111Y111CtAttGt11AY.120.000316
ORF8111Y111delTAT---11AY.1200.000037
ORF8111Y111del2TAt--t11AY.1200.000037
ORF8111Y111CtAttGt11AY.120.20.001285
ORF8111Y111YtaTtaC11AY.1210.000135
ORF8111Y111YtaTtaC11AY.140.000088
ORF8111Y111CtAttGt11AY.150.002222
ORF8111Y111YtaTtaC11AY.16.10.00047
ORF8111Y111YtaTtaC11AY.200.000039
ORF8111Y111CtAttGt11AY.230.00007
ORF8111Y111HTatCat11AY.240.000431
ORF8111Y111delTAT---11AY.250.000006
ORF8111Y111YtaTtaC11AY.270.000065
ORF8111Y111HTatCat11AY.290.000016
ORF8111Y111delTAT---11AY.30.00001
ORF8111Y111YtaTtaC11AY.30.00001
ORF8111Y111YtaTtaC11AY.340.000097
ORF8111Y111HTatCat11AY.390.000025
ORF8111Y111CtAttGt11AY.39.10.00004
ORF8111Y111NTatAat11AY.40.000002
ORF8111Y111HTatCat11AY.40.000002
ORF8111Y111YtaTtaC11AY.4.20.000022
ORF8111Y111delTAT---11AY.4.50.000107
ORF8111Y111YtaTtaC11AY.4.50.000107
ORF8111Y111YtaTtaC11AY.410.000294
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ORF8111Y111del2TAt--t11AY.430.000004
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