CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF7b : Mut = S5del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF7b5S5deldelTCA---639639127768-27770

Details of the mutation S5del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF7b5S5delTCA---639639All0.000122
ORF7b5S5delTCA---152152B.1.1.70.000136
ORF7b5S5delTCA---8484AY.40.000131
ORF7b5S5delTCA---4747B.1.20.000414
ORF7b5S5delTCA---3232B.1.5620.592593
ORF7b5S5delTCA---2828P.10.000441
ORF7b5S5delTCA---2222B.10.000202
ORF7b5S5delTCA---1515AY.290.000237
ORF7b5S5delTCA---1515B.1.4270.000757
ORF7b5S5delTCA---1313B.1.10.000236
ORF7b5S5delTCA---1212AY.470.000373
ORF7b5S5delTCA---1010B.1.2340.001319
ORF7b5S5delTCA---99AY.260.000255
ORF7b5S5delTCA---88AY.430.000035
ORF7b5S5delTCA---88B.1.617.20.00003
ORF7b5S5delTCA---77A0.002709
ORF7b5S5delTCA---77AY.1030.000043
ORF7b5S5delTCA---77B.1.1770.000092
ORF7b5S5delTCA---66AY.250.000036
ORF7b5S5delTCA---66B.1.1.5190.000238
ORF7b5S5delTCA---55AY.330.000334
ORF7b5S5delTCA---55B.1.1.2140.000277
ORF7b5S5delTCA---55B.1.1.3170.002058
ORF7b5S5delTCA---55B.1.36.290.002587
ORF7b5S5delTCA---44B0.000511
ORF7b5S5delTCA---44B.1.360.000584
ORF7b5S5delTCA---44B.1.4290.000094
ORF7b5S5delTCA---44P.1.140.000191
ORF7b5S5delTCA---33AY.1180.000188
ORF7b5S5delTCA---33AY.440.000018
ORF7b5S5delTCA---33B.1.1.2320.005445
ORF7b5S5delTCA---33B.1.1.2430.012245
ORF7b5S5delTCA---33B.1.1.3440.032258
ORF7b5S5delTCA---33B.1.1.370.000579
ORF7b5S5delTCA---33B.1.3510.000089
ORF7b5S5delTCA---33B.1.5950.000783
ORF7b5S5delTCA---33B.1.5960.000261
ORF7b5S5delTCA---33P.1.150.000697
ORF7b5S5delTCA---22AY.1080.002205
ORF7b5S5delTCA---22AY.1130.000285
ORF7b5S5delTCA---22AY.1200.000074
ORF7b5S5delTCA---22AY.200.000078
ORF7b5S5delTCA---22AY.300.000791
ORF7b5S5delTCA---22AY.390.000049
ORF7b5S5delTCA---22AY.4.20.000043
ORF7b5S5delTCA---22AY.650.001066
ORF7b5S5delTCA---22B.1.1.2220.000408
ORF7b5S5delTCA---22B.1.1.2840.000215
ORF7b5S5delTCA---22B.1.1.750.021277
ORF7b5S5delTCA---22B.1.177.600.000437
ORF7b5S5delTCA---22B.1.2430.000139
ORF7b5S5delTCA---22C.370.000232
ORF7b5S5delTCA---22P.1.10.000635
ORF7b5S5delTCA---22P.1.40.001953
ORF7b5S5delTCA---11A.10.000282
ORF7b5S5delTCA---11A.20.000662
ORF7b5S5delTCA---11A.2.20.001689
ORF7b5S5delTCA---11A.230.010526
ORF7b5S5delTCA---11AY.1000.000046
ORF7b5S5delTCA---11AY.120.000316
ORF7b5S5delTCA---11AY.20.000356
ORF7b5S5delTCA---11AY.240.000431
ORF7b5S5delTCA---11AY.370.000316
ORF7b5S5delTCA---11AY.4.2.10.000149
ORF7b5S5delTCA---11AY.530.000288
ORF7b5S5delTCA---11AY.600.000938
ORF7b5S5delTCA---11AY.700.000209
ORF7b5S5delTCA---11AY.75.10.00018
ORF7b5S5delTCA---11AY.790.001211
ORF7b5S5delTCA---11AY.9.20.000037
ORF7b5S5delTCA---11AY.98.10.000048
ORF7b5S5delTCA---11AZ.20.000821
ORF7b5S5delTCA---11AZ.30.00152
ORF7b5S5delTCA---11B.1.1.2160.00089
ORF7b5S5delTCA---11B.1.1.2310.003096
ORF7b5S5delTCA---11B.1.1.2540.011236
ORF7b5S5delTCA---11B.1.1.2650.003155
ORF7b5S5delTCA---11B.1.1.280.000311
ORF7b5S5delTCA---11B.1.1.4160.000905
ORF7b5S5delTCA---11B.1.1.500.000679
ORF7b5S5delTCA---11B.1.1.5250.005464
ORF7b5S5delTCA---11B.1.1.5260.003546
ORF7b5S5delTCA---11B.1.110.30.000718
ORF7b5S5delTCA---11B.1.1600.000031
ORF7b5S5delTCA---11B.1.177.120.000152
ORF7b5S5delTCA---11B.1.177.500.004695
ORF7b5S5delTCA---11B.1.177.570.000281
ORF7b5S5delTCA---11B.1.2190.009434
ORF7b5S5delTCA---11B.1.2580.000067
ORF7b5S5delTCA---11B.1.2650.001271
ORF7b5S5delTCA---11B.1.351.20.000303
ORF7b5S5delTCA---11B.1.351.30.000876
ORF7b5S5delTCA---11B.1.438.10.000107
ORF7b5S5delTCA---11B.1.4680.005714
ORF7b5S5delTCA---11B.1.5260.000024
ORF7b5S5delTCA---11B.1.6040.017241
ORF7b5S5delTCA---11B.1.617.10.000129
ORF7b5S5delTCA---11B.1.621.10.000506
ORF7b5S5delTCA---11B.1.6300.005236
ORF7b5S5delTCA---11B.60.00091
ORF7b5S5delTCA---11N.50.001767
ORF7b5S5delTCA---11P.1.120.000484
ORF7b5S5delTCA---11P.1.160.000374
ORF7b5S5delTCA---11P.1.70.000319
ORF7b5S5delTCA---11Q.10.000126
ORF7b5S5delTCA---11Q.80.000165
ORF7b5S5delTCA---11R.10.00009