CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF7b : Mut = F13del2

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF7b13F13del2delTTt--t511547920.93685227792-27794
ORF7b13F13del2deltTTt--51152930.057282527792-27794
ORF7b13F13del2delTTT--N5115300.005865127792-27794

Details of the mutation F13del2 within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF7b13F13del2TTt--t47925115All0.000917
ORF7b13F13del2tTTt--2935115All0.000056
ORF7b13F13del2TTT--N305115All0.000006
ORF7b13F13del2TTt--t16751675AY.1200.062275
ORF7b13F13del2TTt--t859873AY.40.001337
ORF7b13F13del2tTTt--14873AY.40.000022
ORF7b13F13del2TTt--t415426B.1.1.70.000372
ORF7b13F13del2tTTt--11426B.1.1.70.00001
ORF7b13F13del2TTt--t293294B.10.002684
ORF7b13F13del2tTTt--1294B.10.000009
ORF7b13F13del2TTt--t108124AY.250.00065
ORF7b13F13del2tTTt--15124AY.250.00009
ORF7b13F13del2TTT--N1124AY.250.000006
ORF7b13F13del2TTt--t94116B.1.617.20.000354
ORF7b13F13del2TTT--N19116B.1.617.20.000072
ORF7b13F13del2tTTt--3116B.1.617.20.000011
ORF7b13F13del2TTt--t9394AY.430.000412
ORF7b13F13del2tTTt--194AY.430.000004
ORF7b13F13del2tTTt--8993B.1.360.012985
ORF7b13F13del2TTt--t493B.1.360.000584
ORF7b13F13del2TTt--t7676C.1.20.323404
ORF7b13F13del2TTt--t7373B.1.5250.008261
ORF7b13F13del2TTt--t6162P.10.000961
ORF7b13F13del2tTTt--162P.10.000016
ORF7b13F13del2TTt--t5556AY.30.000547
ORF7b13F13del2tTTt--156AY.30.00001
ORF7b13F13del2tTTt--3855AY.470.001182
ORF7b13F13del2TTt--t1755AY.470.000529
ORF7b13F13del2TTt--t5252AY.290.00082
ORF7b13F13del2TTt--t4850B.1.20.000423
ORF7b13F13del2tTTt--250B.1.20.000018
ORF7b13F13del2TTt--t4848B.1.2210.00341
ORF7b13F13del2TTt--t4043AY.440.000243
ORF7b13F13del2tTTt--343AY.440.000018
ORF7b13F13del2TTt--t3838AY.420.001529
ORF7b13F13del2TTt--t3838B.1.177.330.0625
ORF7b13F13del2tTTt--2837B.1.5260.000658
ORF7b13F13del2TTt--t937B.1.5260.000212
ORF7b13F13del2TTt--t3636AY.390.00089
ORF7b13F13del2TTt--t3435AY.1030.000211
ORF7b13F13del2tTTt--135AY.1030.000006
ORF7b13F13del2TTt--t3434AY.46.60.002455
ORF7b13F13del2TTt--t2930AY.4.20.000629
ORF7b13F13del2tTTt--130AY.4.20.000022
ORF7b13F13del2tTTt--2830AY.9.10.002344
ORF7b13F13del2TTt--t230AY.9.10.000167
ORF7b13F13del2TTt--t3030B.1.1.2690.040595
ORF7b13F13del2TTt--t2528B.1.4290.000588
ORF7b13F13del2tTTt--328B.1.4290.000071
ORF7b13F13del2TTt--t2525AY.99.20.002304
ORF7b13F13del2tTTt--1223B.1.10.000218
ORF7b13F13del2TTt--t1123B.1.10.0002
ORF7b13F13del2TTt--t1717R.10.00153
ORF7b13F13del2TTt--t1616B.1.1.2410.033126
ORF7b13F13del2TTt--t1616B.1.2430.001113
ORF7b13F13del2TTt--t1115B.1.1770.000145
ORF7b13F13del2tTTt--415B.1.1770.000053
ORF7b13F13del2TTt--t1414B.1.1.5190.000556
ORF7b13F13del2TTt--t1414B.1.214.20.008393
ORF7b13F13del2TTt--t1414B.1.5960.00122
ORF7b13F13del2TTt--t1414B.1.6370.001023
ORF7b13F13del2TTt--t1313AY.1020.000345
ORF7b13F13del2TTt--t1212AY.50.000248
ORF7b13F13del2TTt--t1111B.1.1.10.003594
ORF7b13F13del2TTt--t1010AY.140.00088
ORF7b13F13del2TTt--t1010B.1.177.810.001893
ORF7b13F13del2TTt--t1010B.1.2790.005136
ORF7b13F13del2TTt--t99AY.200.00035
ORF7b13F13del2TTt--t99AY.540.000858
ORF7b13F13del2TTt--t99B.1.177.210.000688
ORF7b13F13del2TTt--t88AY.1130.001139
ORF7b13F13del2TTt--t68AY.1190.000212
ORF7b13F13del2tTTt--28AY.1190.000071
ORF7b13F13del2TTT--N88B.1.177.650.005323
ORF7b13F13del2TTt--t47AY.260.000113
ORF7b13F13del2tTTt--37AY.260.000085
ORF7b13F13del2TTt--t77AY.340.000679
ORF7b13F13del2TTt--t77AY.4.2.10.001043
ORF7b13F13del2tTTt--77B.1.4240.056452
ORF7b13F13del2TTt--t77B.1.5240.009845
ORF7b13F13del2TTt--t66AY.1100.000676
ORF7b13F13del2TTt--t56AY.1170.000423
ORF7b13F13del2tTTt--16AY.1170.000085
ORF7b13F13del2TTt--t66AY.120.10.001926
ORF7b13F13del2TTt--t66AY.98.10.000291
ORF7b13F13del2TTt--t66B.1.1.2400.028169
ORF7b13F13del2TTt--t55AY.1070.00233
ORF7b13F13del2TTt--t55AY.90.000338
ORF7b13F13del2TTt--t55B.1.6100.01773
ORF7b13F13del2TTt--t34AY.1000.000138
ORF7b13F13del2tTTt--14AY.1000.000046
ORF7b13F13del2TTt--t44AY.60.000165
ORF7b13F13del2tTTt--44AY.660.004278
ORF7b13F13del2TTt--t44B.1.1.3060.001754
ORF7b13F13del2TTt--t44B.1.1.3180.001207
ORF7b13F13del2TTt--t44B.1.2100.008529
ORF7b13F13del2TTt--t44B.1.910.008299
ORF7b13F13del2TTt--t44C.360.003643
ORF7b13F13del2TTt--t44K.30.024691
ORF7b13F13del2TTt--t33AY.3.10.000256
ORF7b13F13del2TTt--t33AY.330.0002
ORF7b13F13del2TTt--t33AY.360.000445
ORF7b13F13del2TTt--t33AY.4.50.000322
ORF7b13F13del2TTt--t33AY.620.001307
ORF7b13F13del2TTt--t33AY.75.10.000541
ORF7b13F13del2tTTt--33B.1.1.1590.014019
ORF7b13F13del2TTt--t33B.1.1.2320.005445
ORF7b13F13del2TTt--t33B.1.1.3110.001074
ORF7b13F13del2TTt--t33B.1.1.700.001023
ORF7b13F13del2TTt--t33B.1.3690.000856
ORF7b13F13del2TTt--t33B.1.5670.01
ORF7b13F13del2tTTt--33B.1.5680.003333
ORF7b13F13del2TTt--t33B.1.9.50.017045
ORF7b13F13del2TTt--t22A0.000774
ORF7b13F13del2TTt--t22A.20.001324
ORF7b13F13del2TTt--t22AY.1090.001479
ORF7b13F13del2tTTt--22AY.120.20.002571
ORF7b13F13del2TTt--t12AY.1210.000135
ORF7b13F13del2tTTt--12AY.1210.000135
ORF7b13F13del2tTTt--12AY.160.00038
ORF7b13F13del2TTt--t12AY.160.00038
ORF7b13F13del2TTt--t22AY.230.000139
ORF7b13F13del2tTTt--12AY.39.10.00004
ORF7b13F13del2TTt--t12AY.39.10.00004
ORF7b13F13del2TTt--t22AY.450.000243
ORF7b13F13del2TTt--t22AY.550.001835
ORF7b13F13del2TTt--t22AY.610.00021
ORF7b13F13del2TTt--t22AY.730.001331
ORF7b13F13del2tTTt--12AY.740.000116
ORF7b13F13del2TTt--t12AY.740.000116
ORF7b13F13del2tTTt--12AY.750.000056
ORF7b13F13del2TTt--t12AY.750.000056
ORF7b13F13del2TTt--t22AY.880.001768
ORF7b13F13del2TTt--t22B.1.1.1920.004619
ORF7b13F13del2TTt--t22B.1.1.280.000622
ORF7b13F13del2TTt--t12B.1.1.2840.000107
ORF7b13F13del2tTTt--12B.1.1.2840.000107
ORF7b13F13del2TTt--t22B.1.1.3040.005618
ORF7b13F13del2tTTt--12B.1.1600.000031
ORF7b13F13del2TTt--t12B.1.1600.000031
ORF7b13F13del2TTt--t22B.1.177.50.002484
ORF7b13F13del2TTt--t22B.1.177.770.001452
ORF7b13F13del2TTt--t12B.1.3510.00003
ORF7b13F13del2TTT--N12B.1.3510.00003
ORF7b13F13del2TTt--t22B.1.351.20.000605
ORF7b13F13del2TTt--t22B.1.3660.009756
ORF7b13F13del2TTt--t22B.1.4270.000101
ORF7b13F13del2TTt--t12B.1.466.20.000391
ORF7b13F13del2tTTt--12B.1.466.20.000391
ORF7b13F13del2TTt--t22C.36.3.10.005435
ORF7b13F13del2TTt--t22C.370.000232
ORF7b13F13del2TTt--t22P.1.170.000324
ORF7b13F13del2TTt--t22P.20.000373
ORF7b13F13del2TTt--t11A.10.000282
ORF7b13F13del2TTt--t11A.2.50.000499
ORF7b13F13del2TTt--t11AY.1010.00049
ORF7b13F13del2TTt--t11AY.1050.000643
ORF7b13F13del2tTTt--11AY.1110.000183
ORF7b13F13del2TTt--t11AY.1180.000063
ORF7b13F13del2TTt--t11AY.120.000316
ORF7b13F13del2TTt--t11AY.120.2.10.000498
ORF7b13F13del2tTTt--11AY.20.000356
ORF7b13F13del2TTt--t11AY.240.000431
ORF7b13F13del2TTt--t11AY.34.10.00051
ORF7b13F13del2TTt--t11AY.4.10.000737
ORF7b13F13del2TTt--t11AY.4.40.000409
ORF7b13F13del2TTt--t11AY.46.50.000198
ORF7b13F13del2TTt--t11AY.5.30.000337
ORF7b13F13del2TTt--t11AY.520.000814
ORF7b13F13del2TTt--t11AY.670.000464
ORF7b13F13del2TTt--t11AY.7.10.000113
ORF7b13F13del2TTt--t11AY.810.001992
ORF7b13F13del2TTt--t11AY.840.000437
ORF7b13F13del2TTt--t11AY.9.20.000037
ORF7b13F13del2TTt--t11AZ.10.000867
ORF7b13F13del2TTt--t11B.1.1.1700.001247
ORF7b13F13del2TTt--t11B.1.1.2140.000055
ORF7b13F13del2TTt--t11B.1.1.2190.005
ORF7b13F13del2TTt--t11B.1.1.2220.000204
ORF7b13F13del2TTt--t11B.1.1.2340.012048
ORF7b13F13del2TTt--t11B.1.1.2430.004082
ORF7b13F13del2TTt--t11B.1.1.3010.001179
ORF7b13F13del2TTt--t11B.1.1.4200.001006
ORF7b13F13del2TTt--t11B.1.1.4860.001577
ORF7b13F13del2TTt--t11B.1.177.40.000211
ORF7b13F13del2TTt--t11B.1.177.410.0025
ORF7b13F13del2TTt--t11B.1.177.580.001332
ORF7b13F13del2TTt--t11B.1.177.730.000566
ORF7b13F13del2TTt--t11B.1.177.750.001041
ORF7b13F13del2TTt--t11B.1.214.30.007143
ORF7b13F13del2TTt--t11B.1.2190.009434
ORF7b13F13del2TTt--t11B.1.2340.000132
ORF7b13F13del2TTT--N11B.1.2400.000216
ORF7b13F13del2TTt--t11B.1.2980.002114
ORF7b13F13del2TTt--t11B.1.3400.004292
ORF7b13F13del2tTTt--11B.1.36.100.004785
ORF7b13F13del2TTt--t11B.1.36.310.001751
ORF7b13F13del2TTt--t11B.1.36.390.002217
ORF7b13F13del2TTt--t11B.1.3610.001289
ORF7b13F13del2TTt--t11B.1.416.10.001563
ORF7b13F13del2TTt--t11B.1.5210.004975
ORF7b13F13del2TTt--t11B.1.5610.000397
ORF7b13F13del2TTt--t11B.1.617.10.000129
ORF7b13F13del2TTt--t11B.1.6200.000946
ORF7b13F13del2TTt--t11B.1.6210.000089
ORF7b13F13del2TTt--t11B.1.621.10.000506
ORF7b13F13del2TTt--t11B.1.6230.000536
ORF7b13F13del2TTt--t11B.1.6280.000352
ORF7b13F13del2TTt--t11B.1.88.10.004808
ORF7b13F13del2TTt--t11B.30.000831
ORF7b13F13del2TTt--t11B.400.000364
ORF7b13F13del2TTt--t11N.50.001767
ORF7b13F13del2TTt--t11P.1.10.000318
ORF7b13F13del2TTt--t11P.1.70.000319
ORF7b13F13del2TTt--t11Q.10.000126
ORF7b13F13del2TTt--t11Q.40.000455
ORF7b13F13del2TTt--t11W.10.008696